Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5FFY9

Protein Details
Accession C5FFY9    Localization Confidence High Confidence Score 20
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
125-152EIWCLAAQPRWRPRRKKDGKPAAPAEEGHydrophilic
301-324QRTVVYRLKRREKHMKTRRWAEVMHydrophilic
751-789EAQRIHPSPHKRKRLDYEEQSNGCDRKKKKINTGAGDKMHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
134-145RWRPRRKKDGKP
310-314RREKH
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 9.5, mito 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011047  Quinoprotein_ADH-like_supfam  
IPR046351  UTP4  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0030686  C:90S preribosome  
GO:0000462  P:maturation of SSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
Pfam View protein in Pfam  
PF00400  WD40  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50082  WD_REPEATS_2  
Amino Acid Sequences MDIHRCRFVPYNPQTINALAFSHPPSNEIQGRGFPTLRLAIGRANGDIEIWNPLRGVWFQESILRGGKDRSIEGLAWTLDPSETIDGKEVAGKLRLFSIGYSSVVTEWDLASGRPARHSSGNYGEIWCLAAQPRWRPRRKKDGKPAAPAEEGYTGQHLAVGCADGTIVILSTEDGDLTYLKTIRSSTKRARVLSITFQNRHTVVAGYADSSIRVFDIRNGNLLRTVSLGKGQAKDTKELLVWSVKCLPDGSIVSGDSAGEVRVYDAKNYSLVQRLQGHQADVLDVAVSADGESIVSGGADQRTVVYRLKRREKHMKTRRWAEVMHRRYHTHDVKALAVFETTNMSIVVSGGLDTTPVVLPLKEFGKEHHRKLPNLPQVPQLASSGTSRLLMSWWDREVNIWRVAGSFRSDTEQHKLVGKVLFQGDEHLTSAALSRDGTILVAATISEVRVFTLTPDEVDGLPSLRVHKVDLPPQLAAQGAKNVAISPDCNWLCIVRPSNDIYMAKITRDRESEESLQLLPKLQRMPRLPRQARADKPLHGTLGPYERTVRCISFSGDSQIFACGDLAGFVDVWLLQDNKATSAPIKDTENVEASPSDKDSDSDSDSDSDDEGSSLAGERWKHAPLGANLPRLNSSVLLMSFRPAVPTSSTLGNKQSSLSDAVNSSESSTPDDRLMVLTAEHHLTEFNVLQGNLSDWSRRNPKACMPAEFTIIKDRAMGAIWDVAGGRNRLWLHGPAWLWMFDLSQDYPSGEAQRIHPSPHKRKRLDYEEQSNGCDRKKKKINTGAGDKMILGEASVGFGGTVKKVVGANGTDAQLLSLEEKKYGNAKPGDGDDWDDEVDELTLANEATLASLRRQQFPSGNEQTPNGDHIPNGVKDENQIAKLSTPEPESDHNPESQRQRQWWSIFKYRDILGIVPLSHNSPSTESTELSEAEDTSSVPLEVVVVERPIWDVELPGRYIRDYE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.52
2 0.47
3 0.44
4 0.34
5 0.29
6 0.19
7 0.21
8 0.22
9 0.25
10 0.24
11 0.23
12 0.25
13 0.3
14 0.34
15 0.33
16 0.32
17 0.33
18 0.37
19 0.4
20 0.38
21 0.31
22 0.3
23 0.3
24 0.28
25 0.24
26 0.22
27 0.21
28 0.24
29 0.25
30 0.22
31 0.2
32 0.19
33 0.18
34 0.17
35 0.14
36 0.18
37 0.17
38 0.17
39 0.16
40 0.16
41 0.18
42 0.18
43 0.23
44 0.2
45 0.21
46 0.21
47 0.26
48 0.27
49 0.27
50 0.32
51 0.28
52 0.25
53 0.25
54 0.28
55 0.26
56 0.26
57 0.26
58 0.24
59 0.23
60 0.23
61 0.25
62 0.22
63 0.2
64 0.19
65 0.16
66 0.13
67 0.13
68 0.13
69 0.13
70 0.13
71 0.14
72 0.16
73 0.16
74 0.16
75 0.2
76 0.19
77 0.17
78 0.22
79 0.21
80 0.2
81 0.21
82 0.22
83 0.19
84 0.18
85 0.19
86 0.16
87 0.17
88 0.17
89 0.15
90 0.14
91 0.15
92 0.15
93 0.11
94 0.09
95 0.1
96 0.1
97 0.09
98 0.14
99 0.19
100 0.19
101 0.23
102 0.25
103 0.27
104 0.32
105 0.35
106 0.36
107 0.38
108 0.4
109 0.37
110 0.37
111 0.33
112 0.28
113 0.26
114 0.2
115 0.15
116 0.13
117 0.16
118 0.2
119 0.3
120 0.39
121 0.49
122 0.59
123 0.67
124 0.75
125 0.82
126 0.87
127 0.89
128 0.9
129 0.91
130 0.91
131 0.9
132 0.87
133 0.81
134 0.73
135 0.62
136 0.54
137 0.45
138 0.36
139 0.27
140 0.22
141 0.17
142 0.14
143 0.15
144 0.12
145 0.1
146 0.1
147 0.1
148 0.08
149 0.07
150 0.07
151 0.05
152 0.05
153 0.05
154 0.04
155 0.03
156 0.04
157 0.04
158 0.05
159 0.05
160 0.05
161 0.05
162 0.05
163 0.06
164 0.07
165 0.09
166 0.1
167 0.1
168 0.11
169 0.13
170 0.22
171 0.28
172 0.36
173 0.42
174 0.51
175 0.58
176 0.58
177 0.61
178 0.58
179 0.56
180 0.57
181 0.57
182 0.55
183 0.51
184 0.5
185 0.5
186 0.45
187 0.41
188 0.33
189 0.25
190 0.17
191 0.17
192 0.16
193 0.13
194 0.13
195 0.12
196 0.11
197 0.1
198 0.1
199 0.07
200 0.08
201 0.07
202 0.12
203 0.2
204 0.2
205 0.26
206 0.27
207 0.27
208 0.29
209 0.29
210 0.24
211 0.18
212 0.19
213 0.14
214 0.16
215 0.19
216 0.2
217 0.22
218 0.25
219 0.29
220 0.3
221 0.32
222 0.3
223 0.28
224 0.25
225 0.23
226 0.23
227 0.24
228 0.22
229 0.22
230 0.27
231 0.24
232 0.24
233 0.24
234 0.23
235 0.2
236 0.21
237 0.2
238 0.16
239 0.16
240 0.16
241 0.15
242 0.14
243 0.1
244 0.09
245 0.07
246 0.05
247 0.05
248 0.05
249 0.1
250 0.11
251 0.12
252 0.13
253 0.14
254 0.15
255 0.16
256 0.18
257 0.19
258 0.2
259 0.24
260 0.27
261 0.28
262 0.33
263 0.33
264 0.32
265 0.26
266 0.26
267 0.21
268 0.17
269 0.15
270 0.08
271 0.06
272 0.06
273 0.04
274 0.04
275 0.03
276 0.03
277 0.03
278 0.03
279 0.03
280 0.03
281 0.03
282 0.03
283 0.03
284 0.04
285 0.05
286 0.05
287 0.05
288 0.06
289 0.08
290 0.11
291 0.15
292 0.21
293 0.28
294 0.37
295 0.48
296 0.53
297 0.6
298 0.69
299 0.75
300 0.79
301 0.82
302 0.83
303 0.82
304 0.85
305 0.82
306 0.75
307 0.67
308 0.66
309 0.66
310 0.63
311 0.61
312 0.55
313 0.5
314 0.51
315 0.58
316 0.53
317 0.46
318 0.43
319 0.38
320 0.38
321 0.37
322 0.33
323 0.23
324 0.18
325 0.14
326 0.11
327 0.11
328 0.08
329 0.08
330 0.07
331 0.06
332 0.06
333 0.06
334 0.06
335 0.04
336 0.04
337 0.04
338 0.04
339 0.04
340 0.03
341 0.05
342 0.04
343 0.05
344 0.05
345 0.05
346 0.06
347 0.08
348 0.1
349 0.1
350 0.1
351 0.12
352 0.23
353 0.3
354 0.33
355 0.41
356 0.44
357 0.45
358 0.52
359 0.6
360 0.58
361 0.56
362 0.54
363 0.49
364 0.46
365 0.45
366 0.39
367 0.29
368 0.2
369 0.17
370 0.16
371 0.12
372 0.1
373 0.1
374 0.09
375 0.08
376 0.08
377 0.09
378 0.1
379 0.12
380 0.13
381 0.13
382 0.13
383 0.14
384 0.19
385 0.21
386 0.21
387 0.19
388 0.17
389 0.17
390 0.18
391 0.17
392 0.15
393 0.11
394 0.1
395 0.13
396 0.15
397 0.16
398 0.2
399 0.21
400 0.19
401 0.22
402 0.22
403 0.22
404 0.22
405 0.2
406 0.18
407 0.17
408 0.17
409 0.13
410 0.15
411 0.13
412 0.12
413 0.12
414 0.09
415 0.08
416 0.08
417 0.09
418 0.07
419 0.06
420 0.06
421 0.05
422 0.06
423 0.06
424 0.06
425 0.05
426 0.04
427 0.04
428 0.04
429 0.03
430 0.03
431 0.03
432 0.03
433 0.03
434 0.03
435 0.04
436 0.04
437 0.04
438 0.04
439 0.07
440 0.07
441 0.07
442 0.07
443 0.08
444 0.08
445 0.08
446 0.08
447 0.06
448 0.07
449 0.07
450 0.08
451 0.08
452 0.08
453 0.09
454 0.14
455 0.16
456 0.21
457 0.24
458 0.25
459 0.24
460 0.24
461 0.23
462 0.19
463 0.16
464 0.11
465 0.09
466 0.08
467 0.08
468 0.08
469 0.07
470 0.07
471 0.07
472 0.07
473 0.07
474 0.15
475 0.14
476 0.15
477 0.15
478 0.15
479 0.16
480 0.2
481 0.21
482 0.15
483 0.17
484 0.19
485 0.2
486 0.23
487 0.21
488 0.18
489 0.19
490 0.18
491 0.17
492 0.18
493 0.19
494 0.18
495 0.2
496 0.21
497 0.2
498 0.24
499 0.26
500 0.23
501 0.23
502 0.2
503 0.2
504 0.17
505 0.17
506 0.13
507 0.14
508 0.17
509 0.17
510 0.24
511 0.28
512 0.37
513 0.43
514 0.53
515 0.53
516 0.55
517 0.62
518 0.63
519 0.62
520 0.61
521 0.55
522 0.47
523 0.49
524 0.45
525 0.37
526 0.29
527 0.26
528 0.21
529 0.23
530 0.2
531 0.16
532 0.18
533 0.18
534 0.21
535 0.22
536 0.2
537 0.16
538 0.17
539 0.18
540 0.16
541 0.16
542 0.17
543 0.16
544 0.16
545 0.14
546 0.14
547 0.12
548 0.11
549 0.1
550 0.05
551 0.05
552 0.05
553 0.05
554 0.04
555 0.04
556 0.04
557 0.04
558 0.04
559 0.04
560 0.05
561 0.05
562 0.05
563 0.07
564 0.07
565 0.09
566 0.09
567 0.09
568 0.09
569 0.11
570 0.12
571 0.13
572 0.14
573 0.15
574 0.16
575 0.18
576 0.19
577 0.17
578 0.17
579 0.15
580 0.14
581 0.13
582 0.12
583 0.11
584 0.09
585 0.1
586 0.12
587 0.14
588 0.15
589 0.15
590 0.15
591 0.15
592 0.15
593 0.15
594 0.12
595 0.1
596 0.08
597 0.07
598 0.06
599 0.05
600 0.05
601 0.05
602 0.05
603 0.08
604 0.08
605 0.1
606 0.12
607 0.13
608 0.14
609 0.15
610 0.19
611 0.19
612 0.29
613 0.32
614 0.35
615 0.35
616 0.35
617 0.35
618 0.31
619 0.29
620 0.19
621 0.15
622 0.11
623 0.11
624 0.12
625 0.11
626 0.1
627 0.11
628 0.11
629 0.12
630 0.11
631 0.12
632 0.12
633 0.14
634 0.15
635 0.19
636 0.21
637 0.21
638 0.24
639 0.24
640 0.23
641 0.22
642 0.2
643 0.16
644 0.19
645 0.17
646 0.14
647 0.14
648 0.15
649 0.15
650 0.14
651 0.14
652 0.13
653 0.13
654 0.16
655 0.17
656 0.17
657 0.16
658 0.17
659 0.15
660 0.14
661 0.14
662 0.1
663 0.08
664 0.08
665 0.09
666 0.1
667 0.09
668 0.08
669 0.08
670 0.08
671 0.1
672 0.09
673 0.08
674 0.1
675 0.1
676 0.1
677 0.1
678 0.11
679 0.1
680 0.11
681 0.13
682 0.12
683 0.19
684 0.27
685 0.31
686 0.33
687 0.35
688 0.41
689 0.48
690 0.51
691 0.49
692 0.48
693 0.45
694 0.46
695 0.43
696 0.37
697 0.34
698 0.32
699 0.26
700 0.2
701 0.19
702 0.15
703 0.15
704 0.14
705 0.08
706 0.09
707 0.08
708 0.08
709 0.08
710 0.09
711 0.11
712 0.12
713 0.11
714 0.15
715 0.15
716 0.16
717 0.19
718 0.2
719 0.18
720 0.22
721 0.23
722 0.2
723 0.21
724 0.2
725 0.18
726 0.15
727 0.15
728 0.1
729 0.13
730 0.11
731 0.11
732 0.11
733 0.11
734 0.11
735 0.13
736 0.14
737 0.14
738 0.15
739 0.17
740 0.25
741 0.26
742 0.29
743 0.36
744 0.44
745 0.53
746 0.62
747 0.69
748 0.66
749 0.73
750 0.79
751 0.81
752 0.8
753 0.78
754 0.77
755 0.76
756 0.73
757 0.67
758 0.62
759 0.56
760 0.49
761 0.48
762 0.41
763 0.43
764 0.51
765 0.57
766 0.62
767 0.69
768 0.75
769 0.76
770 0.83
771 0.79
772 0.71
773 0.64
774 0.53
775 0.43
776 0.33
777 0.24
778 0.15
779 0.09
780 0.06
781 0.06
782 0.06
783 0.05
784 0.05
785 0.06
786 0.07
787 0.07
788 0.08
789 0.07
790 0.09
791 0.1
792 0.11
793 0.14
794 0.14
795 0.18
796 0.19
797 0.2
798 0.18
799 0.17
800 0.17
801 0.14
802 0.13
803 0.11
804 0.13
805 0.13
806 0.15
807 0.15
808 0.17
809 0.23
810 0.25
811 0.3
812 0.29
813 0.3
814 0.31
815 0.34
816 0.34
817 0.3
818 0.31
819 0.25
820 0.24
821 0.22
822 0.19
823 0.16
824 0.14
825 0.13
826 0.09
827 0.07
828 0.05
829 0.06
830 0.05
831 0.05
832 0.05
833 0.04
834 0.05
835 0.07
836 0.09
837 0.1
838 0.17
839 0.2
840 0.26
841 0.29
842 0.33
843 0.37
844 0.4
845 0.48
846 0.49
847 0.5
848 0.46
849 0.45
850 0.44
851 0.39
852 0.4
853 0.33
854 0.25
855 0.21
856 0.24
857 0.28
858 0.26
859 0.3
860 0.27
861 0.24
862 0.25
863 0.33
864 0.32
865 0.28
866 0.28
867 0.24
868 0.24
869 0.27
870 0.26
871 0.22
872 0.2
873 0.2
874 0.23
875 0.26
876 0.31
877 0.35
878 0.36
879 0.37
880 0.39
881 0.44
882 0.49
883 0.53
884 0.55
885 0.54
886 0.58
887 0.62
888 0.65
889 0.67
890 0.67
891 0.69
892 0.65
893 0.63
894 0.61
895 0.53
896 0.51
897 0.44
898 0.36
899 0.3
900 0.29
901 0.26
902 0.23
903 0.23
904 0.21
905 0.2
906 0.2
907 0.18
908 0.18
909 0.2
910 0.22
911 0.23
912 0.22
913 0.23
914 0.25
915 0.23
916 0.22
917 0.21
918 0.17
919 0.16
920 0.16
921 0.14
922 0.13
923 0.13
924 0.11
925 0.09
926 0.09
927 0.08
928 0.08
929 0.09
930 0.09
931 0.09
932 0.1
933 0.1
934 0.12
935 0.12
936 0.13
937 0.12
938 0.12
939 0.16
940 0.2
941 0.22
942 0.23
943 0.24