Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5FTH5

Protein Details
Accession C5FTH5    Localization Confidence High Confidence Score 19.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
8-74IDSISSPEKKRKEKSESKKRKRHEQTGDSVVVDDSEKKKKKKKKDKHSKDEKGSKKNDDKKEEKEEVBasic
402-434EILPSTVEKKKEKKEKKKSKKEKTSSSSKGSKVBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
15-30EKKRKEKSESKKRKRH
44-79KKKKKKKKDKHSKDEKGSKKNDDKKEEKEEVAASRK
410-426KKKEKKEKKKSKKEKTS
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 13.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036898  RNA_pol_Rpb7-like_N_sf  
IPR041178  RPA43_OB  
IPR045113  Rpb7-like  
Gene Ontology GO:0000428  C:DNA-directed RNA polymerase complex  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006352  P:DNA-templated transcription initiation  
Pfam View protein in Pfam  
PF17875  RPA43_OB  
Amino Acid Sequences MSVDAMDIDSISSPEKKRKEKSESKKRKRHEQTGDSVVVDDSEKKKKKKKKDKHSKDEKGSKKNDDKKEEKEEVAASRKPLSKSTSRDKDTHTHSSSTADQLPSFHRVTTTLYLPLSPIAISPTHAVSSLLAEHISPLLLTYYPPVRGVVLAYSNPSVSATKPTLDSTSTCTPNPEPLTLAKTAGEYGVLHIYLTLTFLVFRPERGQTLEGWINVQSEDFLGAIVFNLFSIGIERRRLPADWKWIAPGQQPDKPSTNTTTTTTSPTSSKDEEDEDEDEADSDKENFKPLASNSEASQFEDAASAETGYFQTRSGKRVRGTIRFRVRDVDVIPGSERDKGFLSLEGTMLSREDEEKLVAEERSKALGAGRAKAGDNYHDPTSRERGEEEAADVDVSMSGAIDEILPSTVEKKKEKKEKKKSKKEKTSSSSKGSKVVSLQLFDEAIDDDLNIAQTRQHEI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.29
2 0.38
3 0.47
4 0.56
5 0.65
6 0.73
7 0.78
8 0.86
9 0.88
10 0.91
11 0.93
12 0.94
13 0.92
14 0.93
15 0.92
16 0.92
17 0.91
18 0.89
19 0.87
20 0.85
21 0.79
22 0.68
23 0.58
24 0.47
25 0.36
26 0.28
27 0.25
28 0.22
29 0.3
30 0.38
31 0.46
32 0.56
33 0.65
34 0.75
35 0.81
36 0.86
37 0.87
38 0.91
39 0.94
40 0.95
41 0.97
42 0.97
43 0.96
44 0.95
45 0.94
46 0.93
47 0.89
48 0.88
49 0.87
50 0.86
51 0.85
52 0.84
53 0.82
54 0.79
55 0.81
56 0.76
57 0.67
58 0.6
59 0.55
60 0.51
61 0.5
62 0.45
63 0.37
64 0.38
65 0.43
66 0.41
67 0.42
68 0.41
69 0.43
70 0.48
71 0.57
72 0.6
73 0.59
74 0.62
75 0.62
76 0.64
77 0.64
78 0.66
79 0.58
80 0.5
81 0.46
82 0.46
83 0.43
84 0.39
85 0.36
86 0.27
87 0.24
88 0.24
89 0.27
90 0.28
91 0.26
92 0.22
93 0.18
94 0.18
95 0.22
96 0.23
97 0.22
98 0.21
99 0.2
100 0.2
101 0.2
102 0.19
103 0.15
104 0.11
105 0.09
106 0.08
107 0.08
108 0.09
109 0.1
110 0.11
111 0.11
112 0.11
113 0.11
114 0.09
115 0.1
116 0.1
117 0.09
118 0.08
119 0.07
120 0.07
121 0.07
122 0.07
123 0.05
124 0.05
125 0.05
126 0.05
127 0.05
128 0.08
129 0.1
130 0.11
131 0.12
132 0.12
133 0.11
134 0.11
135 0.12
136 0.11
137 0.11
138 0.11
139 0.12
140 0.12
141 0.12
142 0.12
143 0.12
144 0.11
145 0.09
146 0.14
147 0.13
148 0.14
149 0.15
150 0.17
151 0.17
152 0.17
153 0.17
154 0.19
155 0.24
156 0.25
157 0.24
158 0.26
159 0.25
160 0.3
161 0.31
162 0.26
163 0.21
164 0.2
165 0.23
166 0.21
167 0.21
168 0.15
169 0.13
170 0.13
171 0.11
172 0.1
173 0.07
174 0.07
175 0.07
176 0.07
177 0.06
178 0.06
179 0.06
180 0.06
181 0.06
182 0.05
183 0.04
184 0.04
185 0.05
186 0.09
187 0.09
188 0.1
189 0.12
190 0.13
191 0.15
192 0.16
193 0.17
194 0.13
195 0.18
196 0.2
197 0.17
198 0.17
199 0.16
200 0.14
201 0.13
202 0.12
203 0.07
204 0.05
205 0.05
206 0.04
207 0.04
208 0.03
209 0.03
210 0.03
211 0.03
212 0.03
213 0.02
214 0.03
215 0.03
216 0.03
217 0.04
218 0.06
219 0.08
220 0.1
221 0.11
222 0.12
223 0.14
224 0.15
225 0.18
226 0.21
227 0.29
228 0.29
229 0.29
230 0.3
231 0.3
232 0.31
233 0.3
234 0.32
235 0.27
236 0.28
237 0.29
238 0.3
239 0.32
240 0.32
241 0.31
242 0.28
243 0.27
244 0.26
245 0.27
246 0.27
247 0.25
248 0.26
249 0.25
250 0.23
251 0.2
252 0.21
253 0.23
254 0.21
255 0.2
256 0.18
257 0.19
258 0.19
259 0.21
260 0.2
261 0.16
262 0.15
263 0.14
264 0.12
265 0.11
266 0.1
267 0.07
268 0.07
269 0.08
270 0.08
271 0.11
272 0.1
273 0.1
274 0.14
275 0.14
276 0.19
277 0.2
278 0.21
279 0.19
280 0.25
281 0.25
282 0.23
283 0.23
284 0.17
285 0.14
286 0.14
287 0.13
288 0.08
289 0.08
290 0.07
291 0.06
292 0.07
293 0.07
294 0.07
295 0.08
296 0.07
297 0.15
298 0.17
299 0.21
300 0.27
301 0.32
302 0.33
303 0.41
304 0.47
305 0.49
306 0.54
307 0.6
308 0.65
309 0.63
310 0.62
311 0.58
312 0.53
313 0.47
314 0.41
315 0.38
316 0.28
317 0.26
318 0.26
319 0.24
320 0.23
321 0.23
322 0.22
323 0.16
324 0.17
325 0.18
326 0.18
327 0.18
328 0.18
329 0.15
330 0.15
331 0.14
332 0.13
333 0.11
334 0.11
335 0.09
336 0.08
337 0.08
338 0.1
339 0.1
340 0.1
341 0.1
342 0.12
343 0.14
344 0.14
345 0.14
346 0.15
347 0.16
348 0.17
349 0.16
350 0.15
351 0.14
352 0.2
353 0.21
354 0.21
355 0.22
356 0.22
357 0.23
358 0.25
359 0.25
360 0.23
361 0.25
362 0.26
363 0.28
364 0.3
365 0.31
366 0.33
367 0.39
368 0.37
369 0.34
370 0.31
371 0.3
372 0.3
373 0.29
374 0.26
375 0.2
376 0.18
377 0.16
378 0.15
379 0.12
380 0.09
381 0.08
382 0.05
383 0.04
384 0.04
385 0.04
386 0.04
387 0.04
388 0.04
389 0.04
390 0.05
391 0.06
392 0.06
393 0.11
394 0.16
395 0.23
396 0.3
397 0.39
398 0.49
399 0.6
400 0.71
401 0.78
402 0.84
403 0.89
404 0.93
405 0.96
406 0.97
407 0.97
408 0.97
409 0.96
410 0.96
411 0.93
412 0.92
413 0.89
414 0.87
415 0.84
416 0.75
417 0.72
418 0.62
419 0.57
420 0.5
421 0.5
422 0.45
423 0.38
424 0.37
425 0.32
426 0.3
427 0.26
428 0.24
429 0.16
430 0.13
431 0.11
432 0.1
433 0.08
434 0.09
435 0.1
436 0.1
437 0.09
438 0.1