Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q75B93

Protein Details
Accession Q75B93    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
93-112KEGSTKKKKSEDRSIINRNMHydrophilic
320-341KLSRKPVITGTLRKKKKKKVTKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
329-341GTLRKKKKKKVTK
Subcellular Location(s) cyto 11, cyto_nucl 11, nucl 9, mito 2, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR004600  TFIIH_Tfb4/GTF2H3  
IPR036465  vWFA_dom_sf  
Gene Ontology GO:0000112  C:nucleotide-excision repair factor 3 complex  
GO:0000439  C:transcription factor TFIIH core complex  
GO:0005675  C:transcription factor TFIIH holo complex  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0006289  P:nucleotide-excision repair  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
GO:0006367  P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter  
KEGG ago:AGOS_ADL323C  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF03850  Tfb4  
Amino Acid Sequences MDAIADSTFQINKSKVQLVEETPSLLTLVIDTNPKLWAEFDREVGKKGQLMQVLKSTIVFLNAHLSFNNSNQVSVIAACSRGIKYLYPQADDKEGSTKKKKSEDRSIINRNMYRGFRNVDEAVVEELYRVFQQESKQLEDGVPQPFRSTLSGAMSAGLTYINRITHETEGVSLKSRLLVITCGSSASKDEVFQYIPIMNCIFSATKMKCPIDVVKVGGVKESTFLQQATDATNGNYLHVANTDGLIQYLSTAMFIDPSLRQWVVKPNQSSVDFRTSCYLTGKVVAIGFVCSVCLCVLSIIPPGNKCPACDSEFDEKVVAKLSRKPVITGTLRKKKKKKVTK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.33
2 0.32
3 0.34
4 0.38
5 0.37
6 0.41
7 0.37
8 0.34
9 0.27
10 0.26
11 0.22
12 0.17
13 0.13
14 0.09
15 0.09
16 0.09
17 0.12
18 0.13
19 0.13
20 0.15
21 0.15
22 0.15
23 0.15
24 0.17
25 0.22
26 0.23
27 0.27
28 0.33
29 0.34
30 0.36
31 0.37
32 0.35
33 0.29
34 0.31
35 0.32
36 0.3
37 0.31
38 0.31
39 0.34
40 0.33
41 0.31
42 0.28
43 0.25
44 0.19
45 0.2
46 0.17
47 0.12
48 0.18
49 0.19
50 0.19
51 0.17
52 0.21
53 0.19
54 0.2
55 0.27
56 0.2
57 0.19
58 0.19
59 0.19
60 0.16
61 0.15
62 0.15
63 0.08
64 0.09
65 0.09
66 0.11
67 0.11
68 0.12
69 0.13
70 0.12
71 0.16
72 0.23
73 0.25
74 0.26
75 0.27
76 0.28
77 0.31
78 0.3
79 0.27
80 0.28
81 0.3
82 0.34
83 0.41
84 0.44
85 0.47
86 0.56
87 0.63
88 0.62
89 0.69
90 0.72
91 0.73
92 0.78
93 0.8
94 0.76
95 0.76
96 0.68
97 0.6
98 0.55
99 0.48
100 0.41
101 0.35
102 0.32
103 0.26
104 0.29
105 0.27
106 0.22
107 0.2
108 0.18
109 0.16
110 0.13
111 0.12
112 0.07
113 0.07
114 0.07
115 0.07
116 0.07
117 0.06
118 0.08
119 0.1
120 0.16
121 0.19
122 0.22
123 0.22
124 0.22
125 0.21
126 0.21
127 0.23
128 0.22
129 0.2
130 0.17
131 0.17
132 0.17
133 0.18
134 0.17
135 0.14
136 0.11
137 0.12
138 0.13
139 0.12
140 0.12
141 0.11
142 0.1
143 0.08
144 0.07
145 0.04
146 0.04
147 0.05
148 0.05
149 0.06
150 0.08
151 0.09
152 0.1
153 0.11
154 0.1
155 0.11
156 0.11
157 0.11
158 0.12
159 0.1
160 0.1
161 0.1
162 0.1
163 0.08
164 0.08
165 0.08
166 0.07
167 0.08
168 0.08
169 0.08
170 0.07
171 0.08
172 0.08
173 0.09
174 0.09
175 0.08
176 0.09
177 0.1
178 0.1
179 0.1
180 0.11
181 0.11
182 0.1
183 0.11
184 0.1
185 0.09
186 0.08
187 0.1
188 0.09
189 0.08
190 0.15
191 0.15
192 0.19
193 0.25
194 0.25
195 0.24
196 0.27
197 0.29
198 0.27
199 0.27
200 0.24
201 0.22
202 0.24
203 0.23
204 0.22
205 0.19
206 0.14
207 0.13
208 0.13
209 0.11
210 0.1
211 0.1
212 0.09
213 0.1
214 0.11
215 0.12
216 0.12
217 0.11
218 0.1
219 0.14
220 0.14
221 0.13
222 0.13
223 0.11
224 0.1
225 0.1
226 0.11
227 0.07
228 0.08
229 0.08
230 0.07
231 0.07
232 0.07
233 0.06
234 0.05
235 0.05
236 0.05
237 0.04
238 0.05
239 0.05
240 0.05
241 0.05
242 0.08
243 0.07
244 0.1
245 0.14
246 0.13
247 0.14
248 0.16
249 0.26
250 0.3
251 0.37
252 0.38
253 0.37
254 0.43
255 0.46
256 0.47
257 0.42
258 0.45
259 0.38
260 0.37
261 0.38
262 0.32
263 0.31
264 0.31
265 0.27
266 0.18
267 0.21
268 0.2
269 0.17
270 0.17
271 0.16
272 0.13
273 0.12
274 0.12
275 0.09
276 0.08
277 0.07
278 0.07
279 0.07
280 0.07
281 0.06
282 0.06
283 0.07
284 0.08
285 0.12
286 0.15
287 0.18
288 0.19
289 0.22
290 0.3
291 0.31
292 0.3
293 0.32
294 0.34
295 0.34
296 0.35
297 0.39
298 0.4
299 0.41
300 0.41
301 0.37
302 0.32
303 0.3
304 0.33
305 0.29
306 0.24
307 0.3
308 0.36
309 0.41
310 0.42
311 0.44
312 0.41
313 0.47
314 0.52
315 0.55
316 0.58
317 0.62
318 0.71
319 0.79
320 0.85
321 0.87