Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5FFH4

Protein Details
Accession C5FFH4    Localization Confidence High Confidence Score 19.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
67-86GEIPKQKKSRTEKTETKPTQHydrophilic
99-127KPDGPAPKANKKAKKTKLEKSSKKGQQTSHydrophilic
377-403RASIGQVRKDKSKKKKKNENEEEDGGEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
71-122KQKKSRTEKTETKPTQGNGKKSGGSENIKPDGPAPKANKKAKKTKLEKSSKK
366-393RFGKANKHKSARASIGQVRKDKSKKKKK
Subcellular Location(s) nucl 17.5, mito_nucl 10.333, cyto 7.5, cyto_mito 5.333
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007823  RRP8  
IPR042036  RRP8_N  
IPR029063  SAM-dependent_MTases_sf  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0008168  F:methyltransferase activity  
GO:0032259  P:methylation  
GO:0006364  P:rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF05148  Methyltransf_8  
CDD cd02440  AdoMet_MTases  
Amino Acid Sequences MFAVPGWSVSSSELKLQTEPSTAKDVSKPQVTENSFGKRKRERGADSDGGKVTKSNVNEMWKRYIEGEIPKQKKSRTEKTETKPTQGNGKKSGGSENIKPDGPAPKANKKAKKTKLEKSSKKGQQTSSNMTPLGTREPGAASSDNATSIKSTSFPPPPPPLPENPNLTPLQQSMRQKLLSARFRHLNETLYTTPSTEAMELFTSNPEMFAEYHAGFSRQVKESWPSNPVDEYIQSVKTRGEVRPQHNGQGKKPAQNSLSLQPLPRKTQGLCTIADMGCGDAKFARALAPSKKSLKLKIHSFDLHAPDSVITKADIANVPLEDGKVDIAIFCLSLMGTNWVSFVEEAWRVLRSDGKGECWVSEVKSRFGKANKHKSARASIGQVRKDKSKKKKKNENEEEDGGEEIFAEDQLKRAEDDDQTDISAFAEVFASRGFVLKQETVDKSNKMFVKMEFIKHGVPKKGKWANVNGPVEPKKTYKKWGSSIPEDTGMTAEEESKVLKPCVYKLR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.26
2 0.27
3 0.29
4 0.29
5 0.3
6 0.31
7 0.29
8 0.32
9 0.31
10 0.33
11 0.35
12 0.4
13 0.41
14 0.47
15 0.44
16 0.42
17 0.51
18 0.5
19 0.5
20 0.49
21 0.52
22 0.52
23 0.55
24 0.6
25 0.6
26 0.64
27 0.67
28 0.71
29 0.68
30 0.67
31 0.73
32 0.72
33 0.65
34 0.63
35 0.57
36 0.48
37 0.41
38 0.35
39 0.3
40 0.26
41 0.25
42 0.25
43 0.28
44 0.37
45 0.42
46 0.46
47 0.5
48 0.46
49 0.46
50 0.42
51 0.4
52 0.36
53 0.38
54 0.44
55 0.47
56 0.5
57 0.55
58 0.58
59 0.59
60 0.63
61 0.64
62 0.65
63 0.64
64 0.7
65 0.74
66 0.77
67 0.85
68 0.79
69 0.75
70 0.71
71 0.63
72 0.64
73 0.61
74 0.59
75 0.54
76 0.55
77 0.51
78 0.46
79 0.5
80 0.47
81 0.45
82 0.43
83 0.44
84 0.43
85 0.41
86 0.4
87 0.37
88 0.36
89 0.35
90 0.37
91 0.37
92 0.43
93 0.53
94 0.62
95 0.68
96 0.7
97 0.77
98 0.79
99 0.83
100 0.83
101 0.82
102 0.84
103 0.86
104 0.87
105 0.84
106 0.85
107 0.82
108 0.82
109 0.79
110 0.74
111 0.73
112 0.7
113 0.71
114 0.66
115 0.61
116 0.52
117 0.45
118 0.4
119 0.32
120 0.29
121 0.22
122 0.16
123 0.15
124 0.15
125 0.16
126 0.18
127 0.16
128 0.13
129 0.14
130 0.14
131 0.14
132 0.13
133 0.13
134 0.1
135 0.1
136 0.1
137 0.1
138 0.12
139 0.16
140 0.22
141 0.24
142 0.3
143 0.36
144 0.38
145 0.43
146 0.45
147 0.44
148 0.44
149 0.47
150 0.47
151 0.42
152 0.44
153 0.38
154 0.35
155 0.32
156 0.27
157 0.26
158 0.25
159 0.28
160 0.27
161 0.3
162 0.3
163 0.29
164 0.34
165 0.4
166 0.42
167 0.41
168 0.42
169 0.44
170 0.46
171 0.48
172 0.44
173 0.38
174 0.31
175 0.33
176 0.3
177 0.25
178 0.24
179 0.2
180 0.19
181 0.17
182 0.16
183 0.1
184 0.09
185 0.08
186 0.08
187 0.08
188 0.08
189 0.08
190 0.08
191 0.08
192 0.08
193 0.07
194 0.07
195 0.07
196 0.08
197 0.11
198 0.1
199 0.11
200 0.11
201 0.12
202 0.12
203 0.14
204 0.17
205 0.15
206 0.16
207 0.16
208 0.2
209 0.22
210 0.24
211 0.26
212 0.22
213 0.22
214 0.22
215 0.21
216 0.18
217 0.15
218 0.16
219 0.14
220 0.15
221 0.14
222 0.15
223 0.14
224 0.16
225 0.18
226 0.16
227 0.23
228 0.29
229 0.33
230 0.42
231 0.43
232 0.47
233 0.5
234 0.52
235 0.44
236 0.47
237 0.46
238 0.43
239 0.43
240 0.41
241 0.36
242 0.36
243 0.37
244 0.3
245 0.32
246 0.27
247 0.27
248 0.27
249 0.29
250 0.29
251 0.29
252 0.28
253 0.23
254 0.29
255 0.34
256 0.32
257 0.29
258 0.27
259 0.28
260 0.26
261 0.25
262 0.19
263 0.12
264 0.11
265 0.1
266 0.09
267 0.05
268 0.06
269 0.06
270 0.06
271 0.07
272 0.08
273 0.11
274 0.16
275 0.2
276 0.24
277 0.28
278 0.33
279 0.35
280 0.41
281 0.46
282 0.47
283 0.51
284 0.5
285 0.52
286 0.47
287 0.47
288 0.45
289 0.41
290 0.35
291 0.28
292 0.24
293 0.19
294 0.19
295 0.16
296 0.11
297 0.07
298 0.07
299 0.07
300 0.09
301 0.09
302 0.09
303 0.1
304 0.09
305 0.1
306 0.1
307 0.09
308 0.07
309 0.07
310 0.06
311 0.05
312 0.05
313 0.04
314 0.05
315 0.05
316 0.05
317 0.04
318 0.04
319 0.04
320 0.04
321 0.05
322 0.07
323 0.07
324 0.07
325 0.08
326 0.08
327 0.08
328 0.08
329 0.08
330 0.08
331 0.09
332 0.1
333 0.1
334 0.11
335 0.11
336 0.12
337 0.16
338 0.14
339 0.19
340 0.19
341 0.21
342 0.25
343 0.25
344 0.24
345 0.22
346 0.22
347 0.19
348 0.24
349 0.23
350 0.24
351 0.27
352 0.29
353 0.32
354 0.36
355 0.44
356 0.48
357 0.57
358 0.62
359 0.65
360 0.68
361 0.68
362 0.69
363 0.65
364 0.59
365 0.54
366 0.52
367 0.54
368 0.57
369 0.57
370 0.53
371 0.57
372 0.61
373 0.64
374 0.68
375 0.72
376 0.76
377 0.81
378 0.89
379 0.91
380 0.94
381 0.95
382 0.93
383 0.89
384 0.82
385 0.72
386 0.62
387 0.52
388 0.4
389 0.28
390 0.19
391 0.11
392 0.08
393 0.06
394 0.06
395 0.06
396 0.08
397 0.1
398 0.11
399 0.11
400 0.12
401 0.15
402 0.16
403 0.2
404 0.21
405 0.21
406 0.21
407 0.21
408 0.2
409 0.16
410 0.15
411 0.1
412 0.07
413 0.08
414 0.07
415 0.07
416 0.07
417 0.08
418 0.07
419 0.09
420 0.08
421 0.09
422 0.14
423 0.16
424 0.18
425 0.24
426 0.27
427 0.31
428 0.36
429 0.37
430 0.34
431 0.4
432 0.4
433 0.38
434 0.38
435 0.33
436 0.39
437 0.41
438 0.43
439 0.4
440 0.39
441 0.41
442 0.44
443 0.51
444 0.49
445 0.5
446 0.49
447 0.55
448 0.6
449 0.61
450 0.62
451 0.64
452 0.65
453 0.69
454 0.7
455 0.62
456 0.63
457 0.62
458 0.58
459 0.52
460 0.49
461 0.49
462 0.5
463 0.58
464 0.58
465 0.62
466 0.67
467 0.73
468 0.75
469 0.73
470 0.74
471 0.68
472 0.62
473 0.53
474 0.47
475 0.38
476 0.3
477 0.23
478 0.17
479 0.15
480 0.11
481 0.12
482 0.13
483 0.16
484 0.19
485 0.19
486 0.22
487 0.24