Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C3KSH0

Protein Details
Accession A0A5C3KSH0    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
358-390ADSEAKERKTKGKRPQSKRRKPKKTNGEEPAVPBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
363-381KERKTKGKRPQSKRRKPKK
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto_nucl 14, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039663  AIP/AIPL1/TTC9  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
IPR019734  TPR_repeat  
IPR000571  Znf_CCCH  
Gene Ontology GO:0046872  F:metal ion binding  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50005  TPR  
PS50103  ZF_C3H1  
Amino Acid Sequences MPAIMRNLESLEDITSDDSDSGAPILQPITKEELRATRAERRAVKAAEIHAKAEVFKRMGDELFAKERYQEAYIPYLEASQIWPSNIKYYLLLAAVYSKLEWYEEAAHAATRALTLDPKSVEARYLRALARLEQRLLTAAKIDLELIVGHDPSHKDAQASLAIVQQSFDDMDRLSSLQQGSSDVPSQPPQPTAHDLNLSYPNFDDEPLEVDSVSNSSDCHHRGNGVPCRFYNRGRCGKGIACPYSHAPDEKSVRDELGHNVCIYFLLETCKFGETKCVYSHTKDYLPSRGWWSDPEKTQKIKGIIELTEKTAKEQRALTQLLRKQQSKAGLAKLKGRSSRAPETATAKENGEEQGNDADSEAKERKTKGKRPQSKRRKPKKTNGEEPAVPVGEGAAPSSVPSTEAKVALEANGDNGKDTTPALNLAQVPQDAKSQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.13
2 0.13
3 0.12
4 0.11
5 0.1
6 0.09
7 0.09
8 0.09
9 0.08
10 0.08
11 0.08
12 0.1
13 0.11
14 0.12
15 0.14
16 0.21
17 0.21
18 0.23
19 0.26
20 0.32
21 0.33
22 0.37
23 0.39
24 0.42
25 0.47
26 0.54
27 0.55
28 0.54
29 0.59
30 0.56
31 0.54
32 0.49
33 0.5
34 0.51
35 0.46
36 0.41
37 0.35
38 0.34
39 0.33
40 0.32
41 0.31
42 0.23
43 0.22
44 0.24
45 0.24
46 0.24
47 0.24
48 0.23
49 0.22
50 0.27
51 0.28
52 0.26
53 0.24
54 0.26
55 0.26
56 0.25
57 0.23
58 0.19
59 0.23
60 0.23
61 0.23
62 0.21
63 0.19
64 0.17
65 0.15
66 0.13
67 0.13
68 0.14
69 0.14
70 0.16
71 0.17
72 0.21
73 0.22
74 0.21
75 0.17
76 0.18
77 0.19
78 0.17
79 0.16
80 0.11
81 0.12
82 0.11
83 0.11
84 0.1
85 0.08
86 0.07
87 0.08
88 0.08
89 0.09
90 0.12
91 0.12
92 0.14
93 0.14
94 0.14
95 0.13
96 0.13
97 0.11
98 0.07
99 0.08
100 0.07
101 0.09
102 0.1
103 0.13
104 0.14
105 0.16
106 0.18
107 0.17
108 0.2
109 0.19
110 0.2
111 0.19
112 0.23
113 0.21
114 0.23
115 0.24
116 0.25
117 0.32
118 0.32
119 0.3
120 0.27
121 0.26
122 0.25
123 0.25
124 0.2
125 0.14
126 0.11
127 0.11
128 0.1
129 0.1
130 0.07
131 0.07
132 0.07
133 0.07
134 0.07
135 0.06
136 0.06
137 0.09
138 0.1
139 0.12
140 0.15
141 0.14
142 0.13
143 0.14
144 0.16
145 0.15
146 0.15
147 0.13
148 0.13
149 0.13
150 0.12
151 0.12
152 0.1
153 0.08
154 0.08
155 0.07
156 0.06
157 0.05
158 0.06
159 0.06
160 0.07
161 0.07
162 0.09
163 0.09
164 0.09
165 0.09
166 0.1
167 0.11
168 0.12
169 0.13
170 0.11
171 0.12
172 0.14
173 0.16
174 0.15
175 0.17
176 0.17
177 0.18
178 0.22
179 0.24
180 0.24
181 0.23
182 0.22
183 0.23
184 0.28
185 0.25
186 0.21
187 0.18
188 0.18
189 0.16
190 0.16
191 0.13
192 0.07
193 0.1
194 0.1
195 0.1
196 0.09
197 0.08
198 0.08
199 0.08
200 0.08
201 0.05
202 0.04
203 0.05
204 0.08
205 0.1
206 0.12
207 0.12
208 0.13
209 0.17
210 0.26
211 0.33
212 0.33
213 0.34
214 0.32
215 0.39
216 0.4
217 0.4
218 0.41
219 0.41
220 0.46
221 0.47
222 0.48
223 0.44
224 0.44
225 0.44
226 0.42
227 0.35
228 0.27
229 0.26
230 0.27
231 0.26
232 0.25
233 0.21
234 0.16
235 0.2
236 0.24
237 0.23
238 0.24
239 0.21
240 0.21
241 0.21
242 0.21
243 0.2
244 0.21
245 0.2
246 0.18
247 0.17
248 0.17
249 0.16
250 0.15
251 0.1
252 0.06
253 0.09
254 0.09
255 0.11
256 0.12
257 0.13
258 0.12
259 0.12
260 0.2
261 0.18
262 0.21
263 0.22
264 0.26
265 0.27
266 0.31
267 0.35
268 0.31
269 0.31
270 0.32
271 0.34
272 0.35
273 0.35
274 0.34
275 0.35
276 0.32
277 0.3
278 0.3
279 0.33
280 0.33
281 0.37
282 0.43
283 0.44
284 0.45
285 0.47
286 0.49
287 0.47
288 0.42
289 0.4
290 0.35
291 0.32
292 0.34
293 0.32
294 0.3
295 0.32
296 0.3
297 0.29
298 0.31
299 0.3
300 0.28
301 0.29
302 0.29
303 0.31
304 0.34
305 0.35
306 0.37
307 0.4
308 0.45
309 0.5
310 0.47
311 0.43
312 0.44
313 0.47
314 0.45
315 0.46
316 0.46
317 0.46
318 0.47
319 0.52
320 0.54
321 0.54
322 0.52
323 0.52
324 0.5
325 0.51
326 0.57
327 0.53
328 0.5
329 0.47
330 0.49
331 0.49
332 0.46
333 0.4
334 0.32
335 0.29
336 0.27
337 0.25
338 0.22
339 0.17
340 0.16
341 0.17
342 0.17
343 0.16
344 0.15
345 0.16
346 0.14
347 0.2
348 0.21
349 0.21
350 0.24
351 0.28
352 0.37
353 0.45
354 0.54
355 0.6
356 0.68
357 0.75
358 0.82
359 0.9
360 0.92
361 0.93
362 0.95
363 0.95
364 0.96
365 0.95
366 0.96
367 0.96
368 0.95
369 0.94
370 0.91
371 0.88
372 0.78
373 0.72
374 0.66
375 0.55
376 0.44
377 0.33
378 0.25
379 0.18
380 0.16
381 0.13
382 0.07
383 0.07
384 0.07
385 0.09
386 0.08
387 0.08
388 0.1
389 0.14
390 0.16
391 0.18
392 0.18
393 0.18
394 0.19
395 0.18
396 0.19
397 0.15
398 0.16
399 0.18
400 0.18
401 0.17
402 0.17
403 0.17
404 0.15
405 0.17
406 0.15
407 0.13
408 0.16
409 0.15
410 0.19
411 0.2
412 0.21
413 0.23
414 0.23
415 0.23