FuNGI

A0A5C3LE42

Protein Details

Accession

A0A5C3LE42

Localization Confidence

Low

Confidence Score

9.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
238-260	LVPKASVRSKKPRAIQKRDWAHA	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
516-545	RLGAKAGAVQRGGQRGRGGPPARGRGGGGG

Subcellular Location(s)

cyto 14, cysk 10, nucl 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR011545 DEAD/DEAH_box_helicase_dom IPR014001 Helicase_ATP-bd IPR001650 Helicase_C IPR027417 P-loop_NTPase IPR025696 rRNA_proc-arch_dom IPR016438 SKI2-like IPR012961 Ski2/MTR4_C IPR040801 Ski2_N
Gene Ontology	GO:0005524 F:ATP binding GO:0016787 F:hydrolase activity GO:0003723 F:RNA binding GO:0003724 F:RNA helicase activity GO:0006401 P:RNA catabolic process
Pfam	View protein in Pfam PF00270 DEAD PF08148 DSHCT PF00271 Helicase_C PF13234 rRNA_proc-arch PF17911 Ski2_N
PROSITE	View protein in PROSITE PS51192 HELICASE_ATP_BIND_1 PS51194 HELICASE_CTER
CDD	cd18795 SF2_C_Ski2

Amino Acid Sequences

MGDTNSIAAIISRIGQNTDGSPVDDLPDYLTSSVNLAKVYEDIEREHLVPPISFPDQWLPLHQVHWDNPISIPNLLKPQLSEAPTTVTFVRAGIDGRIVGYTEVPNVKKSTGLTSSSLDRAPAPSKNFVRGKSGYVPFLPGGLDDIPLESLSSVAIDGSTRGLRTVAPGLSRGLRLPGEPVSDDILNLDSGDGFVNETQEHTEHDTLEEEADEEIMTPTATSTSNDIDSLLPISRSNLVPKASVRSKKPRAIQKRDWAHAIDVNAPFTNFHELVPDMAHKYPFELDTFQKHAVYRLEKGNSVFVAAHTSAGKTVVAEYAIALSEKHMTRAIYTSPIKALSNQKFRDFKQTFSAATVGILTGDVQINPEASCLIMTTEILRSMLYKGADLIRDVEFVIFDEVHYVNDAERGVVWEEVIIMLPEHVNIILLSATVPNSKEFADWVGNDRRTKKKDIYVISTPQRPVPLEHYLYANRNIFKIVDSKRNFLGQGYKDAGESLKRKQDKEREAAGLGPVQRLGAKAGAVQRGGQRGRGGPPARGRGGGGGPSAPRTMHTGADKNLYVHLVGLLKQKALLPVVVFTLSKKRCEENAGTLTNQDLCTAVEKSEVHVAIEKALSRLKGSDKKLPQITRMRDLLSRGIGIHHGGLLPLVKELVEILFARGLVKILFATETFAMGVNMPAKCVVFSSMRKHDGKSFRDISPGEYTQMAGRAGRRGLDPTGTVIIVAGDNLPEHTALQTMIIGTPGKLSSQFRLTYNMILNLLRVEALRVEEMIKRSFSENASQRLLPAQEKEVLEGEKRLAALPPMECDVCGEDIEGYYDDCFDVIKKNHNLLNFAVSKPQGSKILASGRVVVIQDGHFTSCTLAILLKTAPVATGDAGTLITMKSYFVLARVDQDTKAGRGEMDERSLPPKWPLSPEDLVIQNAVYELRAVPITSIVLVTDQTVKTDITAIVDRHVIRNMNEGIEALKMLLDEWLPSKRIPEVDWSRLRAFEFQETLNLRNSAGKRLDTYGCKLCPQFWEHFTRMHERKSLINQIARLRQFMSEQNLELIPDYEQRIAVLKDLRFIDENSTVLLKGRVACEINSASELILTELILENSFASYEPEEVVALLSCFVFQEKTEVEPLIPPKLEVGRDSIIAISDRVERIQTLHKVAVEDFRSQLKFGLVEVVYEWAKGMPFEQITSLTDVPEGTIVRVITRLDETCREVRDAARVIGDAELFKKMEDAQIKIKRDRRDVTYD

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.13
2	0.14
3	0.16
4	0.16
5	0.2
6	0.19
7	0.18
8	0.19
9	0.18
10	0.19
11	0.17
12	0.16
13	0.15
14	0.15
15	0.15
16	0.14
17	0.15
18	0.13
19	0.14
20	0.17
21	0.16
22	0.14
23	0.13
24	0.14
25	0.14
26	0.16
27	0.17
28	0.16
29	0.17
30	0.21
31	0.23
32	0.23
33	0.24
34	0.25
35	0.23
36	0.22
37	0.21
38	0.23
39	0.24
40	0.22
41	0.24
42	0.27
43	0.29
44	0.3
45	0.32
46	0.31
47	0.3
48	0.31
49	0.33
50	0.32
51	0.3
52	0.36
53	0.34
54	0.3
55	0.29
56	0.32
57	0.3
58	0.27
59	0.26
60	0.23
61	0.29
62	0.3
63	0.29
64	0.26
65	0.3
66	0.34
67	0.35
68	0.33
69	0.27
70	0.31
71	0.3
72	0.32
73	0.26
74	0.21
75	0.19
76	0.17
77	0.17
78	0.12
79	0.13
80	0.12
81	0.13
82	0.12
83	0.12
84	0.12
85	0.12
86	0.11
87	0.12
88	0.12
89	0.15
90	0.21
91	0.21
92	0.24
93	0.26
94	0.26
95	0.26
96	0.27
97	0.29
98	0.28
99	0.3
100	0.3
101	0.31
102	0.34
103	0.35
104	0.34
105	0.28
106	0.24
107	0.25
108	0.26
109	0.3
110	0.3
111	0.37
112	0.39
113	0.47
114	0.52
115	0.49
116	0.53
117	0.49
118	0.5
119	0.5
120	0.5
121	0.45
122	0.4
123	0.41
124	0.34
125	0.32
126	0.26
127	0.17
128	0.17
129	0.13
130	0.13
131	0.1
132	0.1
133	0.1
134	0.1
135	0.1
136	0.07
137	0.06
138	0.06
139	0.06
140	0.05
141	0.04
142	0.04
143	0.04
144	0.05
145	0.08
146	0.1
147	0.1
148	0.1
149	0.11
150	0.11
151	0.14
152	0.19
153	0.18
154	0.18
155	0.19
156	0.22
157	0.24
158	0.25
159	0.22
160	0.21
161	0.19
162	0.18
163	0.2
164	0.2
165	0.21
166	0.2
167	0.21
168	0.2
169	0.2
170	0.19
171	0.17
172	0.15
173	0.12
174	0.11
175	0.1
176	0.06
177	0.06
178	0.07
179	0.06
180	0.06
181	0.07
182	0.08
183	0.08
184	0.09
185	0.1
186	0.11
187	0.13
188	0.17
189	0.18
190	0.17
191	0.18
192	0.18
193	0.17
194	0.17
195	0.14
196	0.1
197	0.09
198	0.08
199	0.07
200	0.07
201	0.07
202	0.06
203	0.06
204	0.05
205	0.05
206	0.07
207	0.07
208	0.08
209	0.1
210	0.12
211	0.13
212	0.13
213	0.14
214	0.13
215	0.13
216	0.14
217	0.13
218	0.11
219	0.1
220	0.12
221	0.14
222	0.16
223	0.19
224	0.22
225	0.22
226	0.24
227	0.26
228	0.33
229	0.38
230	0.44
231	0.48
232	0.54
233	0.62
234	0.67
235	0.73
236	0.75
237	0.77
238	0.81
239	0.83
240	0.82
241	0.83
242	0.79
243	0.74
244	0.66
245	0.58
246	0.5
247	0.42
248	0.38
249	0.3
250	0.28
251	0.24
252	0.22
253	0.2
254	0.18
255	0.23
256	0.17
257	0.15
258	0.16
259	0.16
260	0.17
261	0.18
262	0.19
263	0.15
264	0.16
265	0.18
266	0.15
267	0.16
268	0.18
269	0.17
270	0.17
271	0.17
272	0.18
273	0.23
274	0.28
275	0.28
276	0.28
277	0.27
278	0.29
279	0.32
280	0.34
281	0.32
282	0.35
283	0.36
284	0.36
285	0.37
286	0.36
287	0.29
288	0.27
289	0.23
290	0.16
291	0.18
292	0.16
293	0.16
294	0.13
295	0.14
296	0.12
297	0.13
298	0.12
299	0.08
300	0.08
301	0.08
302	0.07
303	0.07
304	0.07
305	0.07
306	0.07
307	0.07
308	0.06
309	0.06
310	0.11
311	0.12
312	0.13
313	0.15
314	0.15
315	0.16
316	0.18
317	0.19
318	0.22
319	0.23
320	0.23
321	0.22
322	0.24
323	0.23
324	0.26
325	0.34
326	0.36
327	0.44
328	0.45
329	0.51
330	0.54
331	0.55
332	0.61
333	0.53
334	0.46
335	0.44
336	0.45
337	0.38
338	0.35
339	0.34
340	0.23
341	0.21
342	0.19
343	0.11
344	0.08
345	0.07
346	0.05
347	0.06
348	0.06
349	0.06
350	0.06
351	0.07
352	0.07
353	0.07
354	0.07
355	0.06
356	0.05
357	0.06
358	0.05
359	0.05
360	0.05
361	0.05
362	0.06
363	0.07
364	0.08
365	0.08
366	0.08
367	0.08
368	0.09
369	0.12
370	0.11
371	0.1
372	0.11
373	0.13
374	0.14
375	0.14
376	0.15
377	0.12
378	0.13
379	0.13
380	0.11
381	0.09
382	0.09
383	0.1
384	0.07
385	0.06
386	0.09
387	0.09
388	0.09
389	0.09
390	0.09
391	0.07
392	0.09
393	0.1
394	0.07
395	0.07
396	0.08
397	0.09
398	0.09
399	0.08
400	0.06
401	0.06
402	0.06
403	0.06
404	0.05
405	0.04
406	0.04
407	0.04
408	0.04
409	0.04
410	0.04
411	0.04
412	0.04
413	0.04
414	0.04
415	0.04
416	0.04
417	0.05
418	0.05
419	0.07
420	0.07
421	0.08
422	0.09
423	0.09
424	0.09
425	0.09
426	0.11
427	0.12
428	0.12
429	0.17
430	0.24
431	0.28
432	0.31
433	0.37
434	0.43
435	0.44
436	0.5
437	0.5
438	0.49
439	0.53
440	0.54
441	0.56
442	0.53
443	0.56
444	0.55
445	0.55
446	0.49
447	0.42
448	0.39
449	0.33
450	0.29
451	0.27
452	0.28
453	0.25
454	0.25
455	0.27
456	0.28
457	0.29
458	0.32
459	0.3
460	0.24
461	0.23
462	0.22
463	0.19
464	0.18
465	0.23
466	0.22
467	0.29
468	0.3
469	0.33
470	0.33
471	0.35
472	0.34
473	0.27
474	0.31
475	0.23
476	0.26
477	0.26
478	0.24
479	0.22
480	0.23
481	0.22
482	0.2
483	0.21
484	0.2
485	0.26
486	0.29
487	0.31
488	0.39
489	0.48
490	0.5
491	0.54
492	0.54
493	0.48
494	0.46
495	0.44
496	0.37
497	0.3
498	0.24
499	0.18
500	0.13
501	0.1
502	0.1
503	0.09
504	0.09
505	0.07
506	0.07
507	0.09
508	0.13
509	0.14
510	0.14
511	0.16
512	0.17
513	0.23
514	0.23
515	0.22
516	0.2
517	0.2
518	0.23
519	0.29
520	0.28
521	0.26
522	0.31
523	0.35
524	0.34
525	0.32
526	0.3
527	0.24
528	0.23
529	0.2
530	0.15
531	0.11
532	0.11
533	0.12
534	0.12
535	0.1
536	0.1
537	0.12
538	0.13
539	0.15
540	0.17
541	0.19
542	0.2
543	0.23
544	0.23
545	0.19
546	0.18
547	0.16
548	0.13
549	0.1
550	0.1
551	0.07
552	0.09
553	0.13
554	0.13
555	0.12
556	0.13
557	0.14
558	0.14
559	0.13
560	0.12
561	0.08
562	0.08
563	0.09
564	0.09
565	0.08
566	0.07
567	0.16
568	0.17
569	0.19
570	0.2
571	0.22
572	0.23
573	0.28
574	0.29
575	0.28
576	0.32
577	0.31
578	0.29
579	0.27
580	0.26
581	0.23
582	0.2
583	0.13
584	0.08
585	0.07
586	0.09
587	0.09
588	0.09
589	0.1
590	0.1
591	0.1
592	0.13
593	0.13
594	0.11
595	0.13
596	0.13
597	0.11
598	0.12
599	0.11
600	0.09
601	0.1
602	0.1
603	0.08
604	0.1
605	0.15
606	0.22
607	0.25
608	0.32
609	0.34
610	0.4
611	0.46
612	0.45
613	0.47
614	0.48
615	0.48
616	0.45
617	0.44
618	0.39
619	0.34
620	0.34
621	0.29
622	0.22
623	0.19
624	0.14
625	0.13
626	0.11
627	0.1
628	0.09
629	0.07
630	0.06
631	0.05
632	0.05
633	0.05
634	0.05
635	0.04
636	0.04
637	0.04
638	0.04
639	0.04
640	0.04
641	0.04
642	0.04
643	0.05
644	0.05
645	0.05
646	0.06
647	0.06
648	0.06
649	0.05
650	0.05
651	0.05
652	0.04
653	0.05
654	0.05
655	0.06
656	0.06
657	0.06
658	0.06
659	0.06
660	0.06
661	0.06
662	0.07
663	0.08
664	0.08
665	0.08
666	0.08
667	0.08
668	0.08
669	0.08
670	0.1
671	0.11
672	0.15
673	0.21
674	0.27
675	0.33
676	0.34
677	0.35
678	0.41
679	0.45
680	0.44
681	0.45
682	0.43
683	0.38
684	0.42
685	0.41
686	0.36
687	0.33
688	0.31
689	0.24
690	0.2
691	0.2
692	0.16
693	0.17
694	0.14
695	0.1
696	0.1
697	0.12
698	0.12
699	0.13
700	0.13
701	0.13
702	0.13
703	0.14
704	0.13
705	0.12
706	0.13
707	0.11
708	0.1
709	0.08
710	0.08
711	0.06
712	0.06
713	0.04
714	0.03
715	0.03
716	0.04
717	0.04
718	0.04
719	0.04
720	0.04
721	0.05
722	0.05
723	0.05
724	0.05
725	0.05
726	0.05
727	0.06
728	0.06
729	0.05
730	0.06
731	0.06
732	0.07
733	0.09
734	0.1
735	0.12
736	0.16
737	0.18
738	0.18
739	0.23
740	0.24
741	0.25
742	0.25
743	0.24
744	0.2
745	0.18
746	0.18
747	0.13
748	0.12
749	0.08
750	0.07
751	0.06
752	0.05
753	0.06
754	0.06
755	0.06
756	0.08
757	0.1
758	0.13
759	0.14
760	0.14
761	0.14
762	0.15
763	0.17
764	0.17
765	0.22
766	0.25
767	0.28
768	0.31
769	0.29
770	0.29
771	0.28
772	0.29
773	0.23
774	0.19
775	0.17
776	0.19
777	0.2
778	0.2
779	0.2
780	0.19
781	0.18
782	0.17
783	0.16
784	0.12
785	0.12
786	0.11
787	0.1
788	0.1
789	0.11
790	0.11
791	0.12
792	0.12
793	0.12
794	0.11
795	0.12
796	0.12
797	0.1
798	0.1
799	0.09
800	0.07
801	0.07
802	0.08
803	0.08
804	0.07
805	0.06
806	0.06
807	0.06
808	0.05
809	0.05
810	0.05
811	0.11
812	0.13
813	0.21
814	0.24
815	0.28
816	0.3
817	0.31
818	0.33
819	0.28
820	0.33
821	0.27
822	0.25
823	0.24
824	0.22
825	0.22
826	0.21
827	0.23
828	0.19
829	0.18
830	0.18
831	0.19
832	0.25
833	0.26
834	0.25
835	0.24
836	0.21
837	0.22
838	0.21
839	0.17
840	0.12
841	0.1
842	0.11
843	0.1
844	0.11
845	0.09
846	0.09
847	0.1
848	0.08
849	0.08
850	0.07
851	0.07
852	0.06
853	0.08
854	0.07
855	0.07
856	0.07
857	0.07
858	0.07
859	0.07
860	0.07
861	0.06
862	0.06
863	0.06
864	0.06
865	0.06
866	0.06
867	0.05
868	0.05
869	0.05
870	0.04
871	0.04
872	0.05
873	0.06
874	0.06
875	0.07
876	0.1
877	0.1
878	0.13
879	0.17
880	0.18
881	0.17
882	0.2
883	0.2
884	0.19
885	0.2
886	0.16
887	0.13
888	0.13
889	0.17
890	0.16
891	0.18
892	0.18
893	0.18
894	0.22
895	0.24
896	0.23
897	0.23
898	0.25
899	0.24
900	0.27
901	0.29
902	0.31
903	0.32
904	0.31
905	0.32
906	0.29
907	0.27
908	0.23
909	0.2
910	0.13
911	0.12
912	0.1
913	0.06
914	0.05
915	0.05
916	0.06
917	0.06
918	0.07
919	0.06
920	0.07
921	0.07
922	0.07
923	0.07
924	0.06
925	0.06
926	0.06
927	0.07
928	0.11
929	0.1
930	0.11
931	0.12
932	0.12
933	0.12
934	0.14
935	0.13
936	0.12
937	0.16
938	0.15
939	0.15
940	0.2
941	0.2
942	0.2
943	0.23
944	0.22
945	0.19
946	0.25
947	0.25
948	0.22
949	0.21
950	0.2
951	0.17
952	0.15
953	0.14
954	0.08
955	0.07
956	0.06
957	0.06
958	0.06
959	0.06
960	0.06
961	0.09
962	0.12
963	0.13
964	0.14
965	0.15
966	0.17
967	0.19
968	0.19
969	0.27
970	0.31
971	0.39
972	0.45
973	0.48
974	0.46
975	0.47
976	0.47
977	0.41
978	0.36
979	0.32
980	0.29
981	0.24
982	0.29
983	0.3
984	0.3
985	0.3
986	0.28
987	0.23
988	0.28
989	0.28
990	0.29
991	0.3
992	0.3
993	0.28
994	0.33
995	0.38
996	0.35
997	0.39
998	0.39
999	0.38
1000	0.4
1001	0.38
1002	0.36
1003	0.36
1004	0.37
1005	0.37
1006	0.35
1007	0.41
1008	0.39
1009	0.43
1010	0.44
1011	0.49
1012	0.49
1013	0.48
1014	0.48
1015	0.42
1016	0.46
1017	0.49
1018	0.55
1019	0.51
1020	0.5
1021	0.51
1022	0.53
1023	0.59
1024	0.54
1025	0.48
1026	0.4
1027	0.35
1028	0.34
1029	0.34
1030	0.34
1031	0.29
1032	0.28
1033	0.28
1034	0.27
1035	0.26
1036	0.24
1037	0.19
1038	0.14
1039	0.14
1040	0.16
1041	0.14
1042	0.14
1043	0.14
1044	0.17
1045	0.17
1046	0.2
1047	0.23
1048	0.21
1049	0.25
1050	0.26
1051	0.28
1052	0.27
1053	0.27
1054	0.28
1055	0.24
1056	0.24
1057	0.21
1058	0.21
1059	0.18
1060	0.18
1061	0.18
1062	0.14
1063	0.15
1064	0.15
1065	0.18
1066	0.19
1067	0.19
1068	0.23
1069	0.23
1070	0.23
1071	0.21
1072	0.2
1073	0.15
1074	0.15
1075	0.14
1076	0.1
1077	0.09
1078	0.07
1079	0.07
1080	0.08
1081	0.08
1082	0.08
1083	0.08
1084	0.07
1085	0.07
1086	0.08
1087	0.07
1088	0.08
1089	0.09
1090	0.1
1091	0.1
1092	0.1
1093	0.1
1094	0.1
1095	0.1
1096	0.09
1097	0.08
1098	0.07
1099	0.07
1100	0.06
1101	0.06
1102	0.07
1103	0.07
1104	0.07
1105	0.12
1106	0.13
1107	0.16
1108	0.18
1109	0.19
1110	0.18
1111	0.23
1112	0.26
1113	0.27
1114	0.26
1115	0.23
1116	0.25
1117	0.29
1118	0.3
1119	0.25
1120	0.28
1121	0.24
1122	0.24
1123	0.25
1124	0.22
1125	0.19
1126	0.18
1127	0.17
1128	0.13
1129	0.15
1130	0.15
1131	0.16
1132	0.16
1133	0.15
1134	0.18
1135	0.26
1136	0.29
1137	0.3
1138	0.33
1139	0.33
1140	0.34
1141	0.35
1142	0.4
1143	0.34
1144	0.32
1145	0.29
1146	0.32
1147	0.32
1148	0.3
1149	0.31
1150	0.25
1151	0.22
1152	0.2
1153	0.25
1154	0.19
1155	0.18
1156	0.18
1157	0.2
1158	0.18
1159	0.18
1160	0.18
1161	0.11
1162	0.11
1163	0.11
1164	0.11
1165	0.13
1166	0.14
1167	0.15
1168	0.16
1169	0.17
1170	0.19
1171	0.24
1172	0.24
1173	0.18
1174	0.18
1175	0.17
1176	0.16
1177	0.17
1178	0.16
1179	0.11
1180	0.14
1181	0.13
1182	0.14
1183	0.16
1184	0.16
1185	0.15
1186	0.19
1187	0.2
1188	0.22
1189	0.26
1190	0.31
1191	0.34
1192	0.36
1193	0.37
1194	0.35
1195	0.35
1196	0.38
1197	0.37
1198	0.34
1199	0.3
1200	0.28
1201	0.26
1202	0.25
1203	0.24
1204	0.18
1205	0.16
1206	0.18
1207	0.16
1208	0.15
1209	0.16
1210	0.15
1211	0.21
1212	0.24
1213	0.28
1214	0.34
1215	0.43
1216	0.5
1217	0.57
1218	0.63
1219	0.64
1220	0.69
1221	0.71

A0A5C3LE42

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer