Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C3KZL3

Protein Details
Accession A0A5C3KZL3    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
26-45ASKLKFVPTLPQRRKKEYEPHydrophilic
189-212APESLRRERKKVKKEKKTEEPGDVBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
57-83DGARGRGGGRGFEGRGRGSGRGRGRGG
194-205RRERKKVKKEKK
Subcellular Location(s) cyto 10.5, cyto_nucl 9.5, mito 9, nucl 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007811  RPC4  
Gene Ontology GO:0005666  C:RNA polymerase III complex  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006383  P:transcription by RNA polymerase III  
Pfam View protein in Pfam  
PF05132  RNA_pol_Rpc4  
Amino Acid Sequences MAGAPPPPKAIPSLAKKPSDVTRQGASKLKFVPTLPQRRKKEYEPTPAIVPSTASKDGARGRGGGRGFEGRGRGSGRGRGRGGAPPEVTMTASGPFAMGPTLAGSGASRRSTPRSNFAPSIASSNSGSSTLGAGLSQTAPPTLRKDLNDLKGKGKEVKVEDEDVEVYSDPDDGVEIIDIDQVRGMDYMAPESLRRERKKVKKEKKTEEPGDVDVANALDLSESEEEEEAELEDVIEDFAAQVNIDSGDELREEKLYLFQFPAPFPTFVQEAKSSETGGGDVEMSDSTKKVTFGPDVKPAADATPISRTASAVASDPNEPAVQPLDGVIGRLEIYRSGAVKIRLANDILLDVNPATQPSFLQQVVHVDMDQKRIVVLGEINKQFVASPNVDALLNALEQAEKKPQATGMEGEEKLLTMS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.52
2 0.55
3 0.55
4 0.57
5 0.59
6 0.59
7 0.56
8 0.5
9 0.5
10 0.51
11 0.55
12 0.59
13 0.52
14 0.49
15 0.48
16 0.47
17 0.43
18 0.4
19 0.44
20 0.47
21 0.56
22 0.6
23 0.66
24 0.7
25 0.76
26 0.81
27 0.79
28 0.79
29 0.78
30 0.78
31 0.76
32 0.72
33 0.66
34 0.61
35 0.54
36 0.44
37 0.35
38 0.27
39 0.25
40 0.23
41 0.21
42 0.2
43 0.24
44 0.29
45 0.32
46 0.31
47 0.28
48 0.28
49 0.32
50 0.33
51 0.28
52 0.26
53 0.25
54 0.25
55 0.25
56 0.27
57 0.22
58 0.25
59 0.26
60 0.27
61 0.27
62 0.33
63 0.36
64 0.41
65 0.41
66 0.4
67 0.4
68 0.42
69 0.43
70 0.41
71 0.36
72 0.3
73 0.3
74 0.28
75 0.26
76 0.2
77 0.17
78 0.11
79 0.1
80 0.09
81 0.08
82 0.07
83 0.07
84 0.06
85 0.05
86 0.04
87 0.05
88 0.05
89 0.05
90 0.06
91 0.06
92 0.08
93 0.12
94 0.13
95 0.14
96 0.16
97 0.22
98 0.3
99 0.33
100 0.39
101 0.4
102 0.46
103 0.46
104 0.44
105 0.42
106 0.35
107 0.36
108 0.28
109 0.24
110 0.19
111 0.18
112 0.17
113 0.14
114 0.14
115 0.09
116 0.09
117 0.08
118 0.07
119 0.06
120 0.05
121 0.06
122 0.07
123 0.07
124 0.06
125 0.07
126 0.08
127 0.1
128 0.14
129 0.18
130 0.21
131 0.21
132 0.28
133 0.35
134 0.43
135 0.49
136 0.48
137 0.48
138 0.48
139 0.5
140 0.48
141 0.42
142 0.39
143 0.33
144 0.37
145 0.34
146 0.32
147 0.3
148 0.26
149 0.25
150 0.19
151 0.17
152 0.11
153 0.09
154 0.07
155 0.07
156 0.05
157 0.05
158 0.04
159 0.04
160 0.04
161 0.03
162 0.03
163 0.03
164 0.05
165 0.05
166 0.05
167 0.06
168 0.06
169 0.06
170 0.06
171 0.06
172 0.05
173 0.06
174 0.07
175 0.06
176 0.07
177 0.07
178 0.09
179 0.16
180 0.24
181 0.26
182 0.33
183 0.42
184 0.52
185 0.62
186 0.71
187 0.75
188 0.77
189 0.85
190 0.88
191 0.88
192 0.89
193 0.82
194 0.76
195 0.68
196 0.58
197 0.5
198 0.4
199 0.29
200 0.19
201 0.15
202 0.09
203 0.06
204 0.05
205 0.03
206 0.03
207 0.05
208 0.05
209 0.05
210 0.05
211 0.05
212 0.06
213 0.06
214 0.06
215 0.04
216 0.04
217 0.04
218 0.03
219 0.03
220 0.03
221 0.03
222 0.03
223 0.03
224 0.02
225 0.03
226 0.03
227 0.03
228 0.03
229 0.03
230 0.04
231 0.04
232 0.04
233 0.04
234 0.04
235 0.05
236 0.06
237 0.06
238 0.06
239 0.07
240 0.07
241 0.11
242 0.12
243 0.12
244 0.13
245 0.15
246 0.16
247 0.16
248 0.21
249 0.19
250 0.19
251 0.18
252 0.19
253 0.19
254 0.17
255 0.2
256 0.17
257 0.16
258 0.19
259 0.19
260 0.17
261 0.16
262 0.15
263 0.12
264 0.1
265 0.09
266 0.06
267 0.05
268 0.06
269 0.05
270 0.06
271 0.06
272 0.06
273 0.07
274 0.08
275 0.09
276 0.1
277 0.13
278 0.18
279 0.22
280 0.26
281 0.33
282 0.33
283 0.33
284 0.33
285 0.3
286 0.25
287 0.22
288 0.18
289 0.13
290 0.15
291 0.16
292 0.16
293 0.16
294 0.15
295 0.15
296 0.16
297 0.15
298 0.11
299 0.12
300 0.13
301 0.14
302 0.14
303 0.13
304 0.12
305 0.11
306 0.12
307 0.11
308 0.09
309 0.08
310 0.09
311 0.1
312 0.09
313 0.1
314 0.09
315 0.08
316 0.08
317 0.09
318 0.09
319 0.07
320 0.09
321 0.11
322 0.12
323 0.13
324 0.17
325 0.19
326 0.21
327 0.24
328 0.25
329 0.25
330 0.25
331 0.23
332 0.19
333 0.19
334 0.16
335 0.13
336 0.12
337 0.09
338 0.09
339 0.09
340 0.09
341 0.09
342 0.08
343 0.09
344 0.1
345 0.15
346 0.14
347 0.15
348 0.15
349 0.19
350 0.22
351 0.23
352 0.21
353 0.22
354 0.24
355 0.27
356 0.27
357 0.22
358 0.19
359 0.19
360 0.19
361 0.15
362 0.17
363 0.19
364 0.27
365 0.29
366 0.3
367 0.29
368 0.29
369 0.27
370 0.27
371 0.26
372 0.19
373 0.2
374 0.2
375 0.22
376 0.21
377 0.2
378 0.18
379 0.13
380 0.12
381 0.1
382 0.09
383 0.09
384 0.1
385 0.14
386 0.2
387 0.21
388 0.22
389 0.24
390 0.27
391 0.29
392 0.31
393 0.31
394 0.3
395 0.35
396 0.34
397 0.34
398 0.31