Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C3L4Y0

Protein Details
Accession A0A5C3L4Y0    Localization Confidence High Confidence Score 22.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
4-33APALIFKRSGKSKPSRSRQKSPENDEKTGSHydrophilic
49-74PSTLAAKLKNKVKKSRTKSKLSFGAAHydrophilic
181-200ESSIKVAKEKRERLRKVQGTHydrophilic
459-488SPSYLRTQRRADRSRRRQQRLKSKPNLAEEHydrophilic
705-724IPSRRRFLVRRVKLLKNMLRHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
13-21GKSKPSRSR
57-66KNKVKKSRTK
253-265KKSRKVEAANRRK
467-480RRADRSRRRQQRLK
Subcellular Location(s) nucl 14, mito 11
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012890  GCFC2-like  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF15458  NTR2  
Amino Acid Sequences MDSAPALIFKRSGKSKPSRSRQKSPENDEKTGSARNGTPDEAETPAESPSTLAAKLKNKVKKSRTKSKLSFGAADEEEEGDGEVFQVKKSRLSTKISLGQSAAVPLNLDQATITPQRGPTYDQAYLNQLKASTPTARPKLAADPDSYDADVSMDVDAAVIRTVDVFDDESNSTPLSDIPSESSIKVAKEKRERLRKVQGTGEEDFISLSLTKRSEDAGPHPESRLMREEDELGEADDEFAEYTSAQERIALGKKSRKVEAANRRKAMKELIQDAEEEDEETIEWEQEQLRRGGHRVSEASSAPKAKEIYRAAPIPASTTIPTLPPVLSRLSQQLAQLTTSHANNAAALTNLALERDQVEEREKEMREMVVKAEDKRAWFGDFYDWIESVASFLDEKYPLMEKLEEEHISLLRERLELVVQRRRADDEDDLTAVYGPLPAPPEPDSDQVDELGRSIPKPSPSYLRTQRRADRSRRRQQRLKSKPNLAEEGYSTDSSLPPHDQSDFASAISSLKASSKDVLADVRAEEFRNPTGAKWNVWREKYAESYRNAWGGLGVVSVWEFWVRLEVVAWDCIEDKRSLDSFKWYQGLYNYSRPSIGNEEEEGEPELGPDGDLVGSMISTAVIPRICRMIEGGALDVYSERHIRRMVDLAEEVEASIDTENHTKFHTLLSAVASVFQNAVSDTEDLLDKFTSLRSGVQAFNPESIPSRRRFLVRRVKLLKNMLRWRKYTGERFGLDRLIGRLVDNTFVGVAEGGWEVGGEEVARTVASMLPPELTSTKLKQRLNL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.54
2 0.64
3 0.72
4 0.81
5 0.84
6 0.86
7 0.91
8 0.91
9 0.92
10 0.91
11 0.9
12 0.9
13 0.86
14 0.81
15 0.73
16 0.66
17 0.58
18 0.54
19 0.46
20 0.39
21 0.33
22 0.35
23 0.35
24 0.33
25 0.31
26 0.27
27 0.28
28 0.26
29 0.25
30 0.2
31 0.18
32 0.17
33 0.16
34 0.13
35 0.11
36 0.12
37 0.13
38 0.13
39 0.15
40 0.21
41 0.28
42 0.36
43 0.45
44 0.51
45 0.57
46 0.67
47 0.74
48 0.78
49 0.81
50 0.84
51 0.85
52 0.87
53 0.86
54 0.85
55 0.84
56 0.78
57 0.73
58 0.64
59 0.62
60 0.51
61 0.45
62 0.36
63 0.27
64 0.22
65 0.17
66 0.15
67 0.08
68 0.08
69 0.06
70 0.09
71 0.09
72 0.1
73 0.16
74 0.16
75 0.21
76 0.26
77 0.34
78 0.36
79 0.43
80 0.48
81 0.5
82 0.58
83 0.54
84 0.52
85 0.45
86 0.41
87 0.34
88 0.32
89 0.24
90 0.15
91 0.14
92 0.12
93 0.17
94 0.15
95 0.14
96 0.11
97 0.11
98 0.16
99 0.18
100 0.19
101 0.16
102 0.18
103 0.21
104 0.22
105 0.25
106 0.26
107 0.3
108 0.34
109 0.34
110 0.33
111 0.38
112 0.4
113 0.37
114 0.32
115 0.26
116 0.21
117 0.22
118 0.24
119 0.22
120 0.26
121 0.34
122 0.38
123 0.39
124 0.4
125 0.4
126 0.45
127 0.46
128 0.43
129 0.36
130 0.35
131 0.37
132 0.38
133 0.35
134 0.26
135 0.19
136 0.17
137 0.14
138 0.1
139 0.07
140 0.05
141 0.05
142 0.05
143 0.05
144 0.05
145 0.05
146 0.04
147 0.04
148 0.04
149 0.04
150 0.05
151 0.06
152 0.07
153 0.07
154 0.1
155 0.11
156 0.12
157 0.13
158 0.13
159 0.12
160 0.11
161 0.11
162 0.12
163 0.12
164 0.11
165 0.13
166 0.16
167 0.17
168 0.17
169 0.19
170 0.18
171 0.18
172 0.25
173 0.28
174 0.34
175 0.43
176 0.52
177 0.6
178 0.69
179 0.74
180 0.75
181 0.81
182 0.79
183 0.73
184 0.71
185 0.67
186 0.62
187 0.57
188 0.5
189 0.39
190 0.32
191 0.28
192 0.2
193 0.15
194 0.1
195 0.09
196 0.1
197 0.1
198 0.11
199 0.11
200 0.13
201 0.15
202 0.17
203 0.22
204 0.27
205 0.3
206 0.31
207 0.32
208 0.34
209 0.32
210 0.32
211 0.32
212 0.27
213 0.24
214 0.24
215 0.25
216 0.21
217 0.22
218 0.19
219 0.14
220 0.11
221 0.1
222 0.09
223 0.07
224 0.06
225 0.05
226 0.05
227 0.04
228 0.04
229 0.05
230 0.07
231 0.07
232 0.07
233 0.07
234 0.08
235 0.12
236 0.18
237 0.2
238 0.23
239 0.3
240 0.36
241 0.39
242 0.41
243 0.41
244 0.41
245 0.48
246 0.54
247 0.58
248 0.62
249 0.62
250 0.63
251 0.6
252 0.56
253 0.51
254 0.46
255 0.41
256 0.37
257 0.35
258 0.33
259 0.32
260 0.3
261 0.26
262 0.2
263 0.15
264 0.09
265 0.07
266 0.06
267 0.07
268 0.06
269 0.05
270 0.05
271 0.05
272 0.07
273 0.09
274 0.11
275 0.12
276 0.13
277 0.15
278 0.17
279 0.19
280 0.18
281 0.2
282 0.19
283 0.2
284 0.22
285 0.21
286 0.22
287 0.22
288 0.22
289 0.19
290 0.21
291 0.2
292 0.18
293 0.25
294 0.25
295 0.26
296 0.28
297 0.29
298 0.27
299 0.27
300 0.25
301 0.2
302 0.18
303 0.16
304 0.12
305 0.12
306 0.12
307 0.11
308 0.12
309 0.11
310 0.1
311 0.09
312 0.1
313 0.11
314 0.11
315 0.12
316 0.14
317 0.14
318 0.16
319 0.16
320 0.17
321 0.15
322 0.16
323 0.15
324 0.14
325 0.15
326 0.13
327 0.13
328 0.11
329 0.1
330 0.1
331 0.1
332 0.08
333 0.06
334 0.06
335 0.05
336 0.05
337 0.05
338 0.05
339 0.05
340 0.04
341 0.05
342 0.07
343 0.07
344 0.08
345 0.11
346 0.11
347 0.13
348 0.19
349 0.18
350 0.17
351 0.17
352 0.17
353 0.16
354 0.16
355 0.15
356 0.15
357 0.17
358 0.18
359 0.22
360 0.22
361 0.21
362 0.22
363 0.23
364 0.18
365 0.16
366 0.16
367 0.13
368 0.13
369 0.14
370 0.13
371 0.12
372 0.11
373 0.11
374 0.1
375 0.08
376 0.06
377 0.05
378 0.04
379 0.04
380 0.05
381 0.06
382 0.06
383 0.07
384 0.08
385 0.08
386 0.09
387 0.1
388 0.08
389 0.1
390 0.14
391 0.13
392 0.12
393 0.13
394 0.12
395 0.13
396 0.13
397 0.11
398 0.08
399 0.08
400 0.08
401 0.08
402 0.09
403 0.11
404 0.16
405 0.22
406 0.24
407 0.25
408 0.26
409 0.28
410 0.27
411 0.27
412 0.24
413 0.19
414 0.18
415 0.17
416 0.16
417 0.14
418 0.13
419 0.1
420 0.07
421 0.06
422 0.04
423 0.05
424 0.07
425 0.07
426 0.09
427 0.1
428 0.13
429 0.15
430 0.18
431 0.19
432 0.19
433 0.19
434 0.18
435 0.17
436 0.14
437 0.12
438 0.11
439 0.09
440 0.08
441 0.1
442 0.12
443 0.15
444 0.17
445 0.18
446 0.23
447 0.25
448 0.34
449 0.42
450 0.5
451 0.53
452 0.58
453 0.63
454 0.67
455 0.73
456 0.75
457 0.76
458 0.77
459 0.81
460 0.85
461 0.87
462 0.85
463 0.86
464 0.87
465 0.87
466 0.87
467 0.85
468 0.83
469 0.8
470 0.77
471 0.71
472 0.61
473 0.51
474 0.41
475 0.36
476 0.29
477 0.23
478 0.18
479 0.15
480 0.14
481 0.14
482 0.15
483 0.12
484 0.11
485 0.12
486 0.13
487 0.13
488 0.14
489 0.17
490 0.15
491 0.13
492 0.12
493 0.11
494 0.11
495 0.11
496 0.09
497 0.06
498 0.07
499 0.08
500 0.09
501 0.1
502 0.1
503 0.11
504 0.12
505 0.13
506 0.12
507 0.11
508 0.11
509 0.12
510 0.12
511 0.12
512 0.13
513 0.13
514 0.13
515 0.16
516 0.16
517 0.14
518 0.21
519 0.23
520 0.24
521 0.29
522 0.38
523 0.42
524 0.43
525 0.44
526 0.39
527 0.4
528 0.46
529 0.46
530 0.42
531 0.38
532 0.4
533 0.4
534 0.39
535 0.35
536 0.28
537 0.2
538 0.15
539 0.12
540 0.08
541 0.06
542 0.04
543 0.05
544 0.04
545 0.05
546 0.04
547 0.04
548 0.04
549 0.06
550 0.07
551 0.07
552 0.07
553 0.09
554 0.1
555 0.11
556 0.11
557 0.1
558 0.11
559 0.11
560 0.13
561 0.12
562 0.11
563 0.14
564 0.16
565 0.18
566 0.18
567 0.25
568 0.26
569 0.29
570 0.31
571 0.27
572 0.27
573 0.28
574 0.32
575 0.29
576 0.34
577 0.32
578 0.3
579 0.32
580 0.3
581 0.3
582 0.3
583 0.28
584 0.23
585 0.22
586 0.24
587 0.23
588 0.24
589 0.22
590 0.17
591 0.14
592 0.11
593 0.11
594 0.08
595 0.08
596 0.06
597 0.05
598 0.04
599 0.04
600 0.04
601 0.04
602 0.03
603 0.03
604 0.03
605 0.03
606 0.03
607 0.04
608 0.06
609 0.08
610 0.08
611 0.1
612 0.13
613 0.12
614 0.13
615 0.14
616 0.13
617 0.14
618 0.15
619 0.15
620 0.12
621 0.12
622 0.12
623 0.1
624 0.09
625 0.1
626 0.13
627 0.12
628 0.15
629 0.18
630 0.19
631 0.22
632 0.27
633 0.26
634 0.26
635 0.27
636 0.24
637 0.23
638 0.22
639 0.18
640 0.13
641 0.11
642 0.08
643 0.07
644 0.06
645 0.07
646 0.12
647 0.12
648 0.13
649 0.14
650 0.15
651 0.15
652 0.17
653 0.18
654 0.14
655 0.15
656 0.17
657 0.18
658 0.16
659 0.19
660 0.17
661 0.15
662 0.14
663 0.12
664 0.1
665 0.09
666 0.1
667 0.09
668 0.09
669 0.09
670 0.1
671 0.11
672 0.11
673 0.12
674 0.11
675 0.1
676 0.1
677 0.1
678 0.11
679 0.11
680 0.13
681 0.14
682 0.18
683 0.2
684 0.23
685 0.28
686 0.28
687 0.29
688 0.28
689 0.26
690 0.27
691 0.31
692 0.34
693 0.31
694 0.35
695 0.36
696 0.43
697 0.48
698 0.54
699 0.59
700 0.62
701 0.7
702 0.72
703 0.76
704 0.76
705 0.81
706 0.78
707 0.77
708 0.78
709 0.78
710 0.77
711 0.72
712 0.7
713 0.69
714 0.71
715 0.7
716 0.68
717 0.66
718 0.62
719 0.63
720 0.6
721 0.54
722 0.45
723 0.39
724 0.32
725 0.26
726 0.24
727 0.21
728 0.21
729 0.19
730 0.2
731 0.18
732 0.16
733 0.13
734 0.13
735 0.12
736 0.09
737 0.07
738 0.07
739 0.07
740 0.06
741 0.06
742 0.06
743 0.05
744 0.06
745 0.06
746 0.05
747 0.04
748 0.05
749 0.05
750 0.05
751 0.05
752 0.06
753 0.08
754 0.09
755 0.12
756 0.12
757 0.13
758 0.14
759 0.17
760 0.17
761 0.18
762 0.23
763 0.27
764 0.36
765 0.43