Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C3L5H8

Protein Details
Accession A0A5C3L5H8    Localization Confidence High Confidence Score 22.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
41-60EAKEAKEREQEKKRRLKILEBasic
339-376DRYSSSKSGLKKRQRSSSRSETPPPKRRQRSPAESDDLHydrophilic
431-456RAIEDQRRHEEEKRRRKKEKERAARGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
37-86RRQQEAKEAKEREQEKKRRLKILEDQKREDERRKRVEEAKKLAEQRARER
348-368LKKRQRSSSRSETPPPKRRQR
438-456RHEEEKRRRKKEKERAARG
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 11, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013256  Chromatin_SPT2  
Pfam View protein in Pfam  
PF08243  SPT2  
Amino Acid Sequences MSAFANLMALSATQTKQQESAVEMALRERQRKETELRRQQEAKEAKEREQEKKRRLKILEDQKREDERRKRVEEAKKLAEQRARERERDDALSYGSKQHTAKAGSSSKSKEPLRKPLNDDSTLSREELRQQRIQREMKRLYGDTNRSSPTRASTTQRTGRKLPGGAVNMTAADAGGQAANYKSVKARINATPNFLVKLNQNKRDTRTIDEIVQDRAKVKETKILHGEDARGFTDWFGSKKEPEKKTSRPSSVTPTSGTNTPSSSHPQSAQKRPPTASKPTTSAARLATSGSSSHLQRTSTIPPSRSDRNRVADKSKSSHSKATKNAYDDRYSGKSSYDDRYSSSKSGLKKRQRSSSRSETPPPKRRQRSPAESDDLDQDVSTTIWKMFGRDRRKYVSQDVFSDDDDMEADATALEREEQRSARLAALEDQRAIEDQRRHEEEKRRRKKEKERAARG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.21
3 0.22
4 0.24
5 0.24
6 0.23
7 0.26
8 0.24
9 0.23
10 0.22
11 0.23
12 0.29
13 0.32
14 0.35
15 0.35
16 0.39
17 0.43
18 0.49
19 0.56
20 0.59
21 0.65
22 0.69
23 0.71
24 0.72
25 0.73
26 0.69
27 0.7
28 0.67
29 0.63
30 0.62
31 0.61
32 0.58
33 0.61
34 0.65
35 0.65
36 0.68
37 0.71
38 0.71
39 0.78
40 0.8
41 0.81
42 0.78
43 0.77
44 0.77
45 0.78
46 0.79
47 0.76
48 0.74
49 0.73
50 0.79
51 0.75
52 0.75
53 0.73
54 0.73
55 0.74
56 0.74
57 0.73
58 0.74
59 0.78
60 0.78
61 0.77
62 0.75
63 0.72
64 0.71
65 0.7
66 0.65
67 0.61
68 0.61
69 0.63
70 0.6
71 0.57
72 0.55
73 0.54
74 0.54
75 0.52
76 0.43
77 0.34
78 0.32
79 0.32
80 0.3
81 0.3
82 0.27
83 0.27
84 0.26
85 0.27
86 0.3
87 0.29
88 0.3
89 0.32
90 0.37
91 0.35
92 0.41
93 0.42
94 0.41
95 0.47
96 0.5
97 0.51
98 0.53
99 0.6
100 0.63
101 0.66
102 0.68
103 0.7
104 0.71
105 0.65
106 0.6
107 0.54
108 0.51
109 0.45
110 0.39
111 0.3
112 0.24
113 0.3
114 0.36
115 0.36
116 0.38
117 0.42
118 0.48
119 0.56
120 0.63
121 0.61
122 0.63
123 0.61
124 0.6
125 0.6
126 0.54
127 0.51
128 0.5
129 0.5
130 0.44
131 0.44
132 0.41
133 0.37
134 0.38
135 0.34
136 0.3
137 0.29
138 0.29
139 0.3
140 0.35
141 0.43
142 0.49
143 0.54
144 0.54
145 0.52
146 0.53
147 0.52
148 0.46
149 0.41
150 0.39
151 0.36
152 0.31
153 0.29
154 0.24
155 0.19
156 0.18
157 0.14
158 0.08
159 0.05
160 0.04
161 0.04
162 0.03
163 0.03
164 0.04
165 0.04
166 0.07
167 0.07
168 0.08
169 0.09
170 0.14
171 0.17
172 0.18
173 0.23
174 0.26
175 0.35
176 0.36
177 0.38
178 0.37
179 0.34
180 0.34
181 0.3
182 0.25
183 0.2
184 0.3
185 0.33
186 0.38
187 0.42
188 0.44
189 0.48
190 0.55
191 0.53
192 0.47
193 0.46
194 0.4
195 0.37
196 0.37
197 0.34
198 0.29
199 0.28
200 0.23
201 0.18
202 0.17
203 0.19
204 0.17
205 0.17
206 0.2
207 0.21
208 0.25
209 0.28
210 0.28
211 0.26
212 0.25
213 0.27
214 0.21
215 0.21
216 0.17
217 0.13
218 0.12
219 0.11
220 0.12
221 0.11
222 0.11
223 0.12
224 0.13
225 0.15
226 0.24
227 0.33
228 0.34
229 0.39
230 0.46
231 0.51
232 0.6
233 0.65
234 0.62
235 0.57
236 0.56
237 0.57
238 0.54
239 0.48
240 0.39
241 0.33
242 0.3
243 0.29
244 0.27
245 0.2
246 0.17
247 0.16
248 0.17
249 0.21
250 0.21
251 0.21
252 0.23
253 0.31
254 0.38
255 0.46
256 0.52
257 0.53
258 0.55
259 0.55
260 0.59
261 0.56
262 0.57
263 0.54
264 0.48
265 0.46
266 0.44
267 0.45
268 0.38
269 0.35
270 0.28
271 0.23
272 0.2
273 0.18
274 0.15
275 0.13
276 0.12
277 0.11
278 0.12
279 0.12
280 0.15
281 0.16
282 0.16
283 0.17
284 0.21
285 0.24
286 0.3
287 0.34
288 0.32
289 0.33
290 0.38
291 0.46
292 0.48
293 0.49
294 0.48
295 0.51
296 0.58
297 0.59
298 0.6
299 0.58
300 0.58
301 0.55
302 0.55
303 0.55
304 0.51
305 0.54
306 0.55
307 0.56
308 0.58
309 0.63
310 0.6
311 0.57
312 0.61
313 0.57
314 0.54
315 0.47
316 0.45
317 0.4
318 0.38
319 0.33
320 0.27
321 0.26
322 0.27
323 0.3
324 0.3
325 0.27
326 0.28
327 0.33
328 0.36
329 0.34
330 0.35
331 0.33
332 0.36
333 0.46
334 0.53
335 0.58
336 0.63
337 0.7
338 0.76
339 0.81
340 0.8
341 0.79
342 0.79
343 0.78
344 0.75
345 0.76
346 0.76
347 0.78
348 0.82
349 0.83
350 0.83
351 0.84
352 0.86
353 0.87
354 0.87
355 0.86
356 0.84
357 0.83
358 0.79
359 0.71
360 0.63
361 0.56
362 0.47
363 0.37
364 0.28
365 0.19
366 0.13
367 0.12
368 0.11
369 0.09
370 0.08
371 0.11
372 0.12
373 0.15
374 0.22
375 0.31
376 0.4
377 0.48
378 0.54
379 0.58
380 0.64
381 0.67
382 0.69
383 0.7
384 0.64
385 0.59
386 0.58
387 0.52
388 0.46
389 0.43
390 0.32
391 0.23
392 0.18
393 0.15
394 0.11
395 0.08
396 0.08
397 0.05
398 0.06
399 0.06
400 0.06
401 0.07
402 0.09
403 0.12
404 0.17
405 0.18
406 0.2
407 0.24
408 0.25
409 0.26
410 0.25
411 0.25
412 0.27
413 0.33
414 0.33
415 0.3
416 0.29
417 0.28
418 0.28
419 0.28
420 0.29
421 0.28
422 0.32
423 0.4
424 0.46
425 0.51
426 0.57
427 0.66
428 0.69
429 0.74
430 0.79
431 0.81
432 0.85
433 0.9
434 0.93
435 0.93
436 0.94