Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C3KGK9

Protein Details
Accession A0A5C3KGK9    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
81-100VDDAPKPKHRKKDDARGGRGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
85-132PKPKHRKKDDARGGRGGAGGPRGGRGGGGDRGGRGRGRGGGRGRGRGF
Subcellular Location(s) nucl 14.5, cyto_nucl 11, cyto 6.5, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027141  LSm4/Sm_D1/D3  
IPR010920  LSM_dom_sf  
IPR047575  Sm  
IPR034102  Sm_D1  
IPR001163  Sm_dom_euk/arc  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
GO:0120114  C:Sm-like protein family complex  
GO:0006364  P:rRNA processing  
GO:0000387  P:spliceosomal snRNP assembly  
Pfam View protein in Pfam  
PF01423  LSM  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS52002  SM  
CDD cd01724  Sm_D1  
Amino Acid Sequences MKLVRFLMKLNNETVTIELKNGAIVHGTITGVDMQMNTFLKTVKMTLRNRDPTSLDSLSIRGNNIRYFILPDAIPLDTLLVDDAPKPKHRKKDDARGGRGGAGGPRGGRGGGGDRGGRGRGRGGGRGRGRGF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.3
2 0.26
3 0.19
4 0.17
5 0.15
6 0.13
7 0.14
8 0.13
9 0.12
10 0.08
11 0.08
12 0.08
13 0.08
14 0.08
15 0.07
16 0.07
17 0.07
18 0.07
19 0.07
20 0.06
21 0.05
22 0.09
23 0.1
24 0.1
25 0.1
26 0.1
27 0.11
28 0.11
29 0.13
30 0.15
31 0.24
32 0.27
33 0.35
34 0.44
35 0.51
36 0.52
37 0.53
38 0.49
39 0.42
40 0.45
41 0.37
42 0.29
43 0.21
44 0.21
45 0.19
46 0.18
47 0.16
48 0.11
49 0.12
50 0.12
51 0.13
52 0.12
53 0.11
54 0.12
55 0.12
56 0.12
57 0.1
58 0.1
59 0.1
60 0.09
61 0.09
62 0.07
63 0.07
64 0.05
65 0.05
66 0.05
67 0.04
68 0.04
69 0.05
70 0.09
71 0.12
72 0.18
73 0.26
74 0.32
75 0.42
76 0.49
77 0.59
78 0.64
79 0.73
80 0.77
81 0.8
82 0.8
83 0.75
84 0.69
85 0.59
86 0.51
87 0.4
88 0.31
89 0.22
90 0.18
91 0.13
92 0.13
93 0.12
94 0.11
95 0.1
96 0.1
97 0.13
98 0.15
99 0.18
100 0.17
101 0.18
102 0.21
103 0.24
104 0.23
105 0.2
106 0.2
107 0.24
108 0.27
109 0.33
110 0.36
111 0.44
112 0.48