Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C3L0C7

Protein Details
Accession A0A5C3L0C7    Localization Confidence High Confidence Score 17.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
555-579VPASPVTRRKPGRPRKKDDDSEPPSBasic
605-629ATKTKPALTTKPKSKSKPKSLGTTFHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
364-395SPRKATKGKGKAASKVTAKPATIIKRRGRPAK
423-451VRRGRGRPRKVQESVSVTKRLPGRPKKPD
460-471VTKRKLGRPKKS
484-507RRPGRPKKVSASPATTRRLGGPKK
542-571RKPGRPKKSDSESVPASPVTRRKPGRPRKK
590-598KRKRQATGR
606-623TKTKPALTTKPKSKSKPK
Subcellular Location(s) nucl 13, cyto_nucl 12, cyto 9, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017956  AT_hook_DNA-bd_motif  
IPR000305  GIY-YIG_endonuc  
IPR035901  GIY-YIG_endonuc_sf  
IPR027520  Slx1  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0033557  C:Slx1-Slx4 complex  
GO:0017108  F:5'-flap endonuclease activity  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0006281  P:DNA repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF01541  GIY-YIG  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50164  GIY_YIG  
CDD cd10455  GIY-YIG_SLX1  
Amino Acid Sequences MAPPHSFPAFYACYLLKSIQTPDSKTVYIGSTPSPIRRIRQHNGEVAAGAKKTKNGRPWVMQMLVHGFPSRSAALQFEWAWQHPSKSRYLRGEHGEPLFTRNAKSMNSCIRVVRAMIRTQPFSFWPLHVKLFTEEAVVVWGGCDKADKSESSIVEQDYLVNLGLVSKPANGKGKSKATLAPSPFPTGFTCVVELEGVDGRSGHKFGSGRVGPLEDTDEHFTSRILSKNTALIASGRAPPCSVCSIPVHDFGGKNALSTSLCPHDSCTSVSHLTCLSRVFIENEPSSSAFSLVPRGGDCPSCGKYTLWGDIVKGSYRRSRGNAVVPEEDEEEDDVHTEVDPEDLEQDVDDLENAMQGLRLGGEGSPRKATKGKGKAASKVTAKPATIIKRRGRPAKTAADSSSGEEFDFSGIRASSSSRSEGSVRRGRGRPRKVQESVSVTKRLPGRPKKPDSESVTSSPVTKRKLGRPKKSDSESVPSTPTTTRRPGRPKKVSASPATTRRLGGPKKSDSESVSASPMATRRLGRPKKSDSESVYASPATTRKPGRPKKSDSESVPASPVTRRKPGRPRKKDDDSEPPSESGASSATLEKRKRQATGRNPSSTGATKTKPALTTKPKSKSKPKSLGTTFEDLGPSGHSPDTSSDYDLVSALRALSTADSNTGMMSASAITPNRKRIQLEPSNAPQGMATTGTVRGYNTQASIVISSGPGSGGSDTSSSELEYLGMTPSRGIWESPVSALGSGYRIALQSASTNAKYDQEVIELSD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.26
3 0.22
4 0.22
5 0.26
6 0.29
7 0.34
8 0.36
9 0.39
10 0.42
11 0.4
12 0.38
13 0.36
14 0.31
15 0.28
16 0.26
17 0.22
18 0.24
19 0.27
20 0.3
21 0.34
22 0.36
23 0.41
24 0.49
25 0.56
26 0.59
27 0.66
28 0.68
29 0.68
30 0.67
31 0.61
32 0.52
33 0.46
34 0.4
35 0.31
36 0.28
37 0.22
38 0.25
39 0.31
40 0.37
41 0.43
42 0.49
43 0.55
44 0.59
45 0.65
46 0.67
47 0.63
48 0.57
49 0.51
50 0.47
51 0.41
52 0.35
53 0.29
54 0.22
55 0.18
56 0.21
57 0.19
58 0.15
59 0.15
60 0.15
61 0.15
62 0.2
63 0.2
64 0.21
65 0.24
66 0.24
67 0.28
68 0.27
69 0.31
70 0.32
71 0.35
72 0.4
73 0.44
74 0.51
75 0.54
76 0.58
77 0.6
78 0.62
79 0.64
80 0.61
81 0.56
82 0.51
83 0.44
84 0.42
85 0.4
86 0.33
87 0.29
88 0.27
89 0.27
90 0.26
91 0.29
92 0.33
93 0.37
94 0.4
95 0.41
96 0.39
97 0.38
98 0.38
99 0.36
100 0.35
101 0.3
102 0.3
103 0.35
104 0.38
105 0.4
106 0.39
107 0.39
108 0.34
109 0.33
110 0.31
111 0.26
112 0.28
113 0.28
114 0.3
115 0.29
116 0.29
117 0.28
118 0.28
119 0.26
120 0.2
121 0.17
122 0.13
123 0.14
124 0.12
125 0.09
126 0.07
127 0.08
128 0.06
129 0.06
130 0.08
131 0.07
132 0.11
133 0.14
134 0.15
135 0.18
136 0.24
137 0.25
138 0.27
139 0.3
140 0.26
141 0.25
142 0.25
143 0.2
144 0.15
145 0.15
146 0.11
147 0.08
148 0.07
149 0.07
150 0.07
151 0.07
152 0.07
153 0.09
154 0.11
155 0.16
156 0.24
157 0.25
158 0.29
159 0.36
160 0.43
161 0.43
162 0.44
163 0.44
164 0.43
165 0.48
166 0.47
167 0.45
168 0.41
169 0.43
170 0.41
171 0.38
172 0.33
173 0.3
174 0.27
175 0.23
176 0.21
177 0.16
178 0.17
179 0.14
180 0.13
181 0.1
182 0.1
183 0.09
184 0.08
185 0.08
186 0.09
187 0.11
188 0.11
189 0.09
190 0.12
191 0.12
192 0.13
193 0.23
194 0.22
195 0.22
196 0.23
197 0.24
198 0.2
199 0.2
200 0.22
201 0.14
202 0.16
203 0.19
204 0.18
205 0.18
206 0.18
207 0.17
208 0.16
209 0.19
210 0.2
211 0.18
212 0.2
213 0.2
214 0.23
215 0.24
216 0.21
217 0.19
218 0.15
219 0.14
220 0.15
221 0.2
222 0.18
223 0.17
224 0.17
225 0.17
226 0.19
227 0.21
228 0.18
229 0.15
230 0.17
231 0.22
232 0.24
233 0.26
234 0.25
235 0.24
236 0.23
237 0.21
238 0.25
239 0.19
240 0.17
241 0.15
242 0.14
243 0.12
244 0.13
245 0.16
246 0.14
247 0.15
248 0.15
249 0.17
250 0.18
251 0.19
252 0.19
253 0.18
254 0.18
255 0.2
256 0.2
257 0.18
258 0.18
259 0.17
260 0.16
261 0.15
262 0.12
263 0.11
264 0.12
265 0.14
266 0.15
267 0.19
268 0.18
269 0.19
270 0.19
271 0.19
272 0.19
273 0.15
274 0.14
275 0.1
276 0.1
277 0.12
278 0.11
279 0.11
280 0.1
281 0.12
282 0.12
283 0.12
284 0.13
285 0.15
286 0.17
287 0.17
288 0.18
289 0.17
290 0.2
291 0.22
292 0.23
293 0.2
294 0.19
295 0.18
296 0.19
297 0.2
298 0.18
299 0.17
300 0.17
301 0.2
302 0.22
303 0.25
304 0.26
305 0.3
306 0.31
307 0.37
308 0.39
309 0.38
310 0.36
311 0.33
312 0.32
313 0.28
314 0.24
315 0.17
316 0.13
317 0.09
318 0.08
319 0.08
320 0.06
321 0.05
322 0.05
323 0.05
324 0.05
325 0.05
326 0.05
327 0.04
328 0.05
329 0.05
330 0.05
331 0.04
332 0.04
333 0.04
334 0.04
335 0.03
336 0.03
337 0.03
338 0.03
339 0.03
340 0.03
341 0.03
342 0.03
343 0.03
344 0.03
345 0.03
346 0.03
347 0.04
348 0.09
349 0.1
350 0.12
351 0.15
352 0.15
353 0.17
354 0.2
355 0.24
356 0.29
357 0.36
358 0.41
359 0.46
360 0.49
361 0.53
362 0.53
363 0.55
364 0.49
365 0.44
366 0.42
367 0.37
368 0.34
369 0.3
370 0.31
371 0.34
372 0.36
373 0.41
374 0.42
375 0.46
376 0.52
377 0.59
378 0.56
379 0.54
380 0.55
381 0.55
382 0.52
383 0.47
384 0.42
385 0.38
386 0.36
387 0.32
388 0.27
389 0.18
390 0.15
391 0.13
392 0.11
393 0.08
394 0.08
395 0.06
396 0.06
397 0.05
398 0.06
399 0.06
400 0.07
401 0.09
402 0.1
403 0.12
404 0.11
405 0.13
406 0.15
407 0.19
408 0.26
409 0.29
410 0.31
411 0.36
412 0.4
413 0.48
414 0.56
415 0.61
416 0.63
417 0.64
418 0.7
419 0.66
420 0.65
421 0.62
422 0.6
423 0.57
424 0.51
425 0.47
426 0.38
427 0.39
428 0.4
429 0.39
430 0.41
431 0.45
432 0.51
433 0.58
434 0.65
435 0.67
436 0.68
437 0.71
438 0.68
439 0.64
440 0.59
441 0.52
442 0.48
443 0.41
444 0.38
445 0.34
446 0.31
447 0.28
448 0.29
449 0.32
450 0.38
451 0.49
452 0.57
453 0.64
454 0.67
455 0.72
456 0.76
457 0.75
458 0.71
459 0.64
460 0.61
461 0.54
462 0.48
463 0.42
464 0.33
465 0.31
466 0.28
467 0.27
468 0.25
469 0.3
470 0.33
471 0.4
472 0.51
473 0.59
474 0.67
475 0.73
476 0.75
477 0.74
478 0.78
479 0.76
480 0.7
481 0.67
482 0.63
483 0.61
484 0.57
485 0.52
486 0.44
487 0.41
488 0.45
489 0.41
490 0.42
491 0.42
492 0.44
493 0.47
494 0.48
495 0.47
496 0.4
497 0.39
498 0.35
499 0.28
500 0.25
501 0.21
502 0.19
503 0.17
504 0.16
505 0.15
506 0.15
507 0.15
508 0.2
509 0.31
510 0.39
511 0.45
512 0.51
513 0.57
514 0.62
515 0.65
516 0.66
517 0.6
518 0.57
519 0.53
520 0.46
521 0.4
522 0.32
523 0.28
524 0.23
525 0.2
526 0.17
527 0.2
528 0.22
529 0.29
530 0.4
531 0.49
532 0.58
533 0.65
534 0.7
535 0.73
536 0.78
537 0.78
538 0.72
539 0.69
540 0.63
541 0.55
542 0.49
543 0.4
544 0.33
545 0.29
546 0.32
547 0.3
548 0.35
549 0.38
550 0.46
551 0.57
552 0.66
553 0.73
554 0.77
555 0.82
556 0.83
557 0.89
558 0.87
559 0.83
560 0.83
561 0.78
562 0.74
563 0.66
564 0.57
565 0.47
566 0.39
567 0.32
568 0.21
569 0.16
570 0.1
571 0.09
572 0.12
573 0.17
574 0.24
575 0.27
576 0.33
577 0.4
578 0.43
579 0.47
580 0.52
581 0.58
582 0.61
583 0.69
584 0.72
585 0.69
586 0.66
587 0.62
588 0.58
589 0.51
590 0.46
591 0.41
592 0.34
593 0.33
594 0.35
595 0.38
596 0.38
597 0.39
598 0.43
599 0.47
600 0.55
601 0.61
602 0.68
603 0.72
604 0.77
605 0.83
606 0.84
607 0.85
608 0.86
609 0.82
610 0.82
611 0.78
612 0.78
613 0.72
614 0.66
615 0.56
616 0.47
617 0.42
618 0.32
619 0.27
620 0.21
621 0.17
622 0.13
623 0.13
624 0.11
625 0.12
626 0.14
627 0.19
628 0.19
629 0.2
630 0.19
631 0.19
632 0.19
633 0.18
634 0.16
635 0.11
636 0.1
637 0.08
638 0.07
639 0.06
640 0.06
641 0.07
642 0.09
643 0.09
644 0.1
645 0.11
646 0.11
647 0.11
648 0.1
649 0.09
650 0.07
651 0.07
652 0.06
653 0.06
654 0.1
655 0.12
656 0.19
657 0.23
658 0.32
659 0.36
660 0.4
661 0.43
662 0.45
663 0.53
664 0.56
665 0.59
666 0.59
667 0.6
668 0.62
669 0.59
670 0.53
671 0.43
672 0.34
673 0.29
674 0.21
675 0.16
676 0.11
677 0.13
678 0.14
679 0.14
680 0.14
681 0.15
682 0.17
683 0.19
684 0.18
685 0.17
686 0.17
687 0.17
688 0.17
689 0.15
690 0.13
691 0.11
692 0.1
693 0.1
694 0.09
695 0.08
696 0.08
697 0.08
698 0.08
699 0.09
700 0.09
701 0.1
702 0.11
703 0.12
704 0.11
705 0.1
706 0.1
707 0.09
708 0.09
709 0.09
710 0.1
711 0.1
712 0.1
713 0.1
714 0.11
715 0.15
716 0.15
717 0.15
718 0.16
719 0.19
720 0.21
721 0.22
722 0.23
723 0.2
724 0.19
725 0.19
726 0.16
727 0.13
728 0.12
729 0.12
730 0.11
731 0.11
732 0.11
733 0.11
734 0.11
735 0.12
736 0.17
737 0.22
738 0.21
739 0.23
740 0.24
741 0.26
742 0.27
743 0.28
744 0.24
745 0.2