Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C3LHD9

Protein Details
Accession A0A5C3LHD9    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
100-120KNTANRKKAAKQKQKEANEQSHydrophilic
139-183LKLNNGGGRKPKRKRNQTEEQEAMPRKKQRARQKKKGTNNGPQNEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
145-175GGRKPKRKRNQTEEQEAMPRKKQRARQKKKG
Subcellular Location(s) nucl 17, cyto_nucl 12, cyto 5, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
Amino Acid Sequences MAEQVKIPRPSNSWILYRQEKQPLWTKNPKLIPENVPQDLKHDCLKGPPKGRFSAWGRLIGWCWENCSDIEKAKYKAKADFLNEEHARLHPSYSFKQILKNTANRKKAAKQKQKEANEQSETAAAPSPGPGAQQAATNLKLNNGGGRKPKRKRNQTEEQEAMPRKKQRARQKKKGTNNGPQNETLAQPPVAQPSGSNTDTPASVSADKSELGEPVTPPDSLAEELTATPTDSDVQEPFVLSTVREQNTPALSYASSEDIEGHCEDLEDIPQAAYDYESGRMLPAKPWFDEDWNQAHGAYPAVIDDNLYDTNAFLDLLESL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.45
2 0.51
3 0.55
4 0.56
5 0.58
6 0.6
7 0.57
8 0.57
9 0.6
10 0.61
11 0.62
12 0.67
13 0.65
14 0.64
15 0.69
16 0.7
17 0.66
18 0.64
19 0.62
20 0.6
21 0.62
22 0.58
23 0.54
24 0.48
25 0.46
26 0.41
27 0.38
28 0.33
29 0.29
30 0.25
31 0.31
32 0.39
33 0.44
34 0.51
35 0.55
36 0.56
37 0.58
38 0.58
39 0.58
40 0.55
41 0.57
42 0.51
43 0.5
44 0.45
45 0.43
46 0.43
47 0.38
48 0.35
49 0.25
50 0.25
51 0.2
52 0.21
53 0.19
54 0.21
55 0.2
56 0.2
57 0.26
58 0.27
59 0.3
60 0.35
61 0.4
62 0.39
63 0.42
64 0.44
65 0.45
66 0.45
67 0.48
68 0.44
69 0.49
70 0.46
71 0.42
72 0.37
73 0.32
74 0.3
75 0.23
76 0.22
77 0.16
78 0.21
79 0.22
80 0.27
81 0.31
82 0.29
83 0.36
84 0.38
85 0.43
86 0.44
87 0.49
88 0.54
89 0.58
90 0.62
91 0.59
92 0.61
93 0.61
94 0.65
95 0.68
96 0.68
97 0.67
98 0.72
99 0.78
100 0.8
101 0.82
102 0.79
103 0.75
104 0.67
105 0.6
106 0.51
107 0.42
108 0.35
109 0.26
110 0.19
111 0.12
112 0.08
113 0.08
114 0.08
115 0.06
116 0.07
117 0.06
118 0.07
119 0.07
120 0.08
121 0.1
122 0.12
123 0.13
124 0.15
125 0.15
126 0.14
127 0.15
128 0.13
129 0.16
130 0.15
131 0.17
132 0.24
133 0.33
134 0.42
135 0.49
136 0.59
137 0.65
138 0.74
139 0.8
140 0.8
141 0.83
142 0.81
143 0.81
144 0.74
145 0.66
146 0.62
147 0.55
148 0.49
149 0.43
150 0.39
151 0.36
152 0.4
153 0.46
154 0.5
155 0.58
156 0.66
157 0.72
158 0.8
159 0.84
160 0.88
161 0.91
162 0.88
163 0.86
164 0.86
165 0.8
166 0.71
167 0.62
168 0.54
169 0.44
170 0.36
171 0.27
172 0.19
173 0.14
174 0.12
175 0.12
176 0.13
177 0.12
178 0.11
179 0.1
180 0.12
181 0.18
182 0.18
183 0.17
184 0.16
185 0.16
186 0.16
187 0.17
188 0.14
189 0.1
190 0.11
191 0.11
192 0.11
193 0.11
194 0.11
195 0.12
196 0.12
197 0.1
198 0.1
199 0.11
200 0.1
201 0.13
202 0.14
203 0.12
204 0.12
205 0.12
206 0.12
207 0.12
208 0.12
209 0.09
210 0.08
211 0.08
212 0.09
213 0.09
214 0.08
215 0.07
216 0.07
217 0.08
218 0.08
219 0.1
220 0.09
221 0.1
222 0.11
223 0.11
224 0.11
225 0.11
226 0.11
227 0.09
228 0.14
229 0.19
230 0.2
231 0.2
232 0.21
233 0.23
234 0.25
235 0.26
236 0.22
237 0.16
238 0.15
239 0.16
240 0.16
241 0.15
242 0.13
243 0.12
244 0.12
245 0.11
246 0.14
247 0.13
248 0.12
249 0.1
250 0.1
251 0.11
252 0.1
253 0.11
254 0.09
255 0.09
256 0.08
257 0.09
258 0.09
259 0.08
260 0.08
261 0.08
262 0.08
263 0.1
264 0.1
265 0.1
266 0.11
267 0.14
268 0.14
269 0.18
270 0.24
271 0.26
272 0.26
273 0.31
274 0.33
275 0.36
276 0.4
277 0.4
278 0.38
279 0.36
280 0.36
281 0.31
282 0.29
283 0.24
284 0.2
285 0.15
286 0.1
287 0.09
288 0.1
289 0.1
290 0.09
291 0.09
292 0.11
293 0.11
294 0.12
295 0.11
296 0.1
297 0.11
298 0.11
299 0.1
300 0.07