FuNGI

A0A5C3LAN0

Protein Details

Accession

A0A5C3LAN0

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
139-163	LAQNKENSGTKRKRRWDMSEPNDEN	Hydrophilic
168-192	KKETGEKDSAPKKRRSRWDATPAEV	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
177-182	APKKRR

Subcellular Location(s)

cyto 15.5, cyto_nucl 14, nucl 9.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR011989 ARM-like IPR016024 ARM-type_fold IPR015016 SF3b_su1 IPR038737 SF3b_su1-like
Gene Ontology	GO:0005681 C:spliceosomal complex GO:0003729 F:mRNA binding GO:0000245 P:spliceosomal complex assembly
Pfam	View protein in Pfam PF08920 SF3b1

Amino Acid Sequences

MSPPGSPRLVDSFTAPKEILDEFAQLAEEEDVDPFAETASKRQIAARQSDYHNRRFNRVAVESADAFKASENGEEVEGGYKEAMRLTRLEQEEQRVRRAIEEKQRRDRDDEKMKMDLDKTPPAAELDAVERELEAARELAQNKENSGTKRKRRWDMSEPNDENADPNKKETGEKDSAPKKRRSRWDATPAEVAEIAVTEAPKRSRWDQAPTIQEAPMQAIIMNAPGVMQEDKHNRYLSDEELDALLPTIGYSIVTPPPGYAPLIAPRKFMPTSVTQIEGFHIQESSDAAALAAAAGLAPELPTEIPGVGNLAFFKAEDAQYFAKILKEEDETELSVDEMKERKIMRLLLKIKNGTPPVRKTALRQITDKARDFGAGPLFDKILPLLMERTLEDQERHLLVKVIDRVLYKLDDLVRPYVHKILVVIEPLLIDEDYYARVEGREIISNLAKAAGLAHMISTMRPDIDHADEYVRNTTARAFSVVASALGIPSLLPFLKAVCRSKKSWQARHTGIRIVQQIAIMMGCAILPHLRNLVDCVAYGLSDEQQKVKTMTALALAALAEAAAPYGIESFDDVLKPLWLGIRLHRGKGLAAFLKAIGFIIPLMDPEYASYYTKEVTVILIREFQTSDEEMKKIVLKVVKQCAATEGVTPQYIKQDILPDFFKSFWVRRMALDRRNYKQVVETTVELAQKAGVSEIVGRIVNELKDEAEPYRKMVMETITKVVATLGASDIDERLEVRLIDGIIYSFQEQTTEDQVMLDGFGTVVNALGVRVKPYLTQIVSTILWRLNNKSAKVRQQAADLTTRLAVVIKQCGEDQLLSKLGLVLFEQLGEEYPDTLGSIIAAEGAIANVVGMTQMNPPVKDLLPRMTPILRNRHEKVQEASINLIGRIADRGAEFVPAREWMRICFELLDLLKAHKKGIRRAAVNSFGYIAKSLGPQDVLSVLLTNLRVQERQSRVCSTVAIAIVAETCGPFTCIPAILNEYRTAELNVRTGCLKALSFVFEYVGPQSAYYVDSVVTMLEDALTDRDLVHRQTASTIVKHLALGVAGLGCEESMMHLMNLVWPNCFETSPHVIGAVMEAIEAMRVTLGPGVLLSYTLQGLFHPARKVREVYWRIYNALYLGASDALVPFYPDLGELSEGQNVYDRHPLQVFI

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.37
2	0.34
3	0.27
4	0.27
5	0.27
6	0.25
7	0.18
8	0.18
9	0.15
10	0.15
11	0.16
12	0.13
13	0.14
14	0.11
15	0.1
16	0.09
17	0.09
18	0.09
19	0.08
20	0.09
21	0.07
22	0.07
23	0.1
24	0.11
25	0.15
26	0.23
27	0.25
28	0.25
29	0.3
30	0.36
31	0.39
32	0.47
33	0.48
34	0.47
35	0.52
36	0.62
37	0.64
38	0.68
39	0.7
40	0.65
41	0.65
42	0.63
43	0.61
44	0.59
45	0.56
46	0.5
47	0.44
48	0.46
49	0.41
50	0.38
51	0.34
52	0.25
53	0.22
54	0.18
55	0.17
56	0.13
57	0.13
58	0.13
59	0.13
60	0.14
61	0.14
62	0.14
63	0.15
64	0.15
65	0.13
66	0.12
67	0.11
68	0.11
69	0.14
70	0.15
71	0.13
72	0.15
73	0.18
74	0.26
75	0.29
76	0.35
77	0.36
78	0.44
79	0.51
80	0.52
81	0.55
82	0.5
83	0.47
84	0.48
85	0.49
86	0.48
87	0.5
88	0.57
89	0.62
90	0.69
91	0.77
92	0.74
93	0.77
94	0.74
95	0.74
96	0.74
97	0.72
98	0.65
99	0.62
100	0.59
101	0.56
102	0.52
103	0.48
104	0.43
105	0.42
106	0.39
107	0.35
108	0.35
109	0.32
110	0.3
111	0.24
112	0.2
113	0.16
114	0.16
115	0.16
116	0.14
117	0.12
118	0.13
119	0.13
120	0.11
121	0.09
122	0.08
123	0.09
124	0.14
125	0.16
126	0.19
127	0.24
128	0.25
129	0.25
130	0.31
131	0.34
132	0.35
133	0.44
134	0.5
135	0.55
136	0.65
137	0.73
138	0.77
139	0.81
140	0.84
141	0.84
142	0.85
143	0.83
144	0.84
145	0.77
146	0.7
147	0.63
148	0.54
149	0.45
150	0.41
151	0.4
152	0.3
153	0.3
154	0.31
155	0.31
156	0.34
157	0.35
158	0.37
159	0.35
160	0.37
161	0.44
162	0.5
163	0.58
164	0.62
165	0.68
166	0.69
167	0.73
168	0.81
169	0.8
170	0.79
171	0.8
172	0.83
173	0.8
174	0.75
175	0.72
176	0.61
177	0.54
178	0.45
179	0.35
180	0.24
181	0.17
182	0.13
183	0.08
184	0.08
185	0.07
186	0.11
187	0.13
188	0.16
189	0.21
190	0.25
191	0.33
192	0.38
193	0.45
194	0.49
195	0.55
196	0.57
197	0.57
198	0.56
199	0.47
200	0.43
201	0.35
202	0.29
203	0.22
204	0.16
205	0.11
206	0.09
207	0.09
208	0.09
209	0.08
210	0.05
211	0.05
212	0.05
213	0.07
214	0.07
215	0.08
216	0.14
217	0.22
218	0.26
219	0.31
220	0.32
221	0.3
222	0.33
223	0.35
224	0.31
225	0.26
226	0.23
227	0.19
228	0.19
229	0.19
230	0.15
231	0.12
232	0.09
233	0.05
234	0.05
235	0.05
236	0.04
237	0.04
238	0.04
239	0.07
240	0.09
241	0.1
242	0.1
243	0.1
244	0.12
245	0.13
246	0.13
247	0.12
248	0.12
249	0.2
250	0.28
251	0.29
252	0.29
253	0.29
254	0.34
255	0.33
256	0.32
257	0.27
258	0.23
259	0.29
260	0.29
261	0.31
262	0.25
263	0.25
264	0.26
265	0.25
266	0.2
267	0.15
268	0.13
269	0.1
270	0.1
271	0.1
272	0.1
273	0.07
274	0.07
275	0.06
276	0.06
277	0.05
278	0.05
279	0.04
280	0.03
281	0.02
282	0.02
283	0.02
284	0.02
285	0.02
286	0.02
287	0.03
288	0.03
289	0.04
290	0.05
291	0.05
292	0.05
293	0.05
294	0.07
295	0.07
296	0.07
297	0.07
298	0.07
299	0.07
300	0.07
301	0.08
302	0.09
303	0.09
304	0.09
305	0.13
306	0.13
307	0.14
308	0.14
309	0.14
310	0.14
311	0.14
312	0.14
313	0.13
314	0.14
315	0.15
316	0.17
317	0.19
318	0.17
319	0.17
320	0.16
321	0.14
322	0.12
323	0.11
324	0.11
325	0.11
326	0.12
327	0.16
328	0.16
329	0.18
330	0.21
331	0.26
332	0.28
333	0.36
334	0.43
335	0.45
336	0.51
337	0.51
338	0.49
339	0.51
340	0.5
341	0.47
342	0.47
343	0.45
344	0.44
345	0.47
346	0.46
347	0.44
348	0.5
349	0.52
350	0.48
351	0.46
352	0.46
353	0.5
354	0.56
355	0.53
356	0.44
357	0.35
358	0.33
359	0.31
360	0.29
361	0.24
362	0.18
363	0.17
364	0.16
365	0.16
366	0.16
367	0.15
368	0.11
369	0.09
370	0.08
371	0.08
372	0.08
373	0.08
374	0.09
375	0.1
376	0.12
377	0.12
378	0.13
379	0.13
380	0.13
381	0.16
382	0.16
383	0.16
384	0.14
385	0.15
386	0.14
387	0.18
388	0.2
389	0.18
390	0.19
391	0.19
392	0.19
393	0.19
394	0.19
395	0.14
396	0.14
397	0.15
398	0.15
399	0.16
400	0.18
401	0.17
402	0.18
403	0.2
404	0.2
405	0.17
406	0.16
407	0.14
408	0.14
409	0.15
410	0.14
411	0.13
412	0.1
413	0.09
414	0.09
415	0.09
416	0.06
417	0.05
418	0.04
419	0.05
420	0.05
421	0.06
422	0.06
423	0.05
424	0.06
425	0.06
426	0.08
427	0.1
428	0.12
429	0.12
430	0.14
431	0.15
432	0.15
433	0.14
434	0.12
435	0.1
436	0.07
437	0.07
438	0.05
439	0.05
440	0.05
441	0.04
442	0.05
443	0.05
444	0.05
445	0.06
446	0.06
447	0.06
448	0.06
449	0.07
450	0.08
451	0.11
452	0.11
453	0.11
454	0.14
455	0.14
456	0.16
457	0.17
458	0.15
459	0.12
460	0.12
461	0.13
462	0.12
463	0.11
464	0.12
465	0.11
466	0.11
467	0.12
468	0.12
469	0.1
470	0.08
471	0.08
472	0.06
473	0.05
474	0.04
475	0.03
476	0.03
477	0.04
478	0.03
479	0.04
480	0.04
481	0.05
482	0.09
483	0.13
484	0.19
485	0.25
486	0.28
487	0.31
488	0.38
489	0.48
490	0.54
491	0.59
492	0.6
493	0.61
494	0.64
495	0.68
496	0.63
497	0.57
498	0.49
499	0.45
500	0.41
501	0.34
502	0.28
503	0.21
504	0.19
505	0.15
506	0.12
507	0.07
508	0.05
509	0.04
510	0.03
511	0.03
512	0.03
513	0.04
514	0.04
515	0.05
516	0.07
517	0.07
518	0.07
519	0.09
520	0.1
521	0.09
522	0.09
523	0.09
524	0.08
525	0.07
526	0.07
527	0.06
528	0.07
529	0.08
530	0.09
531	0.09
532	0.1
533	0.12
534	0.12
535	0.12
536	0.12
537	0.1
538	0.1
539	0.1
540	0.09
541	0.08
542	0.07
543	0.06
544	0.05
545	0.04
546	0.04
547	0.02
548	0.02
549	0.02
550	0.02
551	0.02
552	0.02
553	0.02
554	0.02
555	0.02
556	0.03
557	0.04
558	0.04
559	0.05
560	0.05
561	0.05
562	0.05
563	0.05
564	0.05
565	0.05
566	0.07
567	0.07
568	0.1
569	0.2
570	0.21
571	0.21
572	0.22
573	0.22
574	0.2
575	0.21
576	0.22
577	0.13
578	0.13
579	0.12
580	0.11
581	0.11
582	0.1
583	0.09
584	0.06
585	0.04
586	0.03
587	0.04
588	0.03
589	0.04
590	0.05
591	0.05
592	0.05
593	0.05
594	0.08
595	0.08
596	0.09
597	0.1
598	0.09
599	0.09
600	0.1
601	0.09
602	0.07
603	0.07
604	0.08
605	0.09
606	0.09
607	0.12
608	0.12
609	0.13
610	0.13
611	0.12
612	0.12
613	0.12
614	0.15
615	0.13
616	0.13
617	0.12
618	0.13
619	0.14
620	0.12
621	0.14
622	0.14
623	0.16
624	0.22
625	0.27
626	0.3
627	0.29
628	0.29
629	0.27
630	0.27
631	0.24
632	0.19
633	0.14
634	0.12
635	0.12
636	0.12
637	0.11
638	0.12
639	0.12
640	0.11
641	0.11
642	0.16
643	0.17
644	0.19
645	0.2
646	0.19
647	0.19
648	0.19
649	0.2
650	0.17
651	0.17
652	0.19
653	0.23
654	0.22
655	0.23
656	0.32
657	0.36
658	0.4
659	0.47
660	0.49
661	0.48
662	0.54
663	0.53
664	0.45
665	0.43
666	0.38
667	0.34
668	0.3
669	0.26
670	0.22
671	0.25
672	0.24
673	0.19
674	0.16
675	0.12
676	0.1
677	0.1
678	0.08
679	0.04
680	0.04
681	0.05
682	0.05
683	0.07
684	0.07
685	0.06
686	0.07
687	0.09
688	0.09
689	0.09
690	0.09
691	0.08
692	0.09
693	0.1
694	0.1
695	0.14
696	0.14
697	0.16
698	0.18
699	0.18
700	0.18
701	0.18
702	0.2
703	0.19
704	0.21
705	0.21
706	0.18
707	0.17
708	0.17
709	0.15
710	0.13
711	0.08
712	0.07
713	0.06
714	0.06
715	0.06
716	0.06
717	0.06
718	0.06
719	0.06
720	0.05
721	0.05
722	0.06
723	0.06
724	0.06
725	0.07
726	0.07
727	0.07
728	0.07
729	0.07
730	0.06
731	0.07
732	0.07
733	0.06
734	0.06
735	0.07
736	0.07
737	0.1
738	0.12
739	0.12
740	0.11
741	0.1
742	0.11
743	0.1
744	0.09
745	0.07
746	0.04
747	0.03
748	0.03
749	0.03
750	0.03
751	0.03
752	0.03
753	0.03
754	0.03
755	0.05
756	0.06
757	0.07
758	0.08
759	0.08
760	0.09
761	0.12
762	0.17
763	0.15
764	0.16
765	0.15
766	0.18
767	0.18
768	0.18
769	0.17
770	0.14
771	0.16
772	0.17
773	0.19
774	0.24
775	0.29
776	0.31
777	0.38
778	0.43
779	0.49
780	0.54
781	0.56
782	0.49
783	0.49
784	0.5
785	0.44
786	0.42
787	0.33
788	0.28
789	0.23
790	0.21
791	0.16
792	0.14
793	0.12
794	0.09
795	0.13
796	0.13
797	0.14
798	0.14
799	0.15
800	0.16
801	0.15
802	0.15
803	0.13
804	0.14
805	0.13
806	0.13
807	0.13
808	0.12
809	0.12
810	0.1
811	0.09
812	0.07
813	0.07
814	0.07
815	0.06
816	0.07
817	0.07
818	0.07
819	0.06
820	0.06
821	0.06
822	0.06
823	0.06
824	0.06
825	0.04
826	0.04
827	0.04
828	0.04
829	0.03
830	0.03
831	0.03
832	0.03
833	0.03
834	0.02
835	0.02
836	0.02
837	0.02
838	0.02
839	0.03
840	0.04
841	0.05
842	0.11
843	0.13
844	0.13
845	0.15
846	0.18
847	0.18
848	0.21
849	0.22
850	0.23
851	0.23
852	0.24
853	0.27
854	0.28
855	0.33
856	0.36
857	0.44
858	0.45
859	0.5
860	0.52
861	0.58
862	0.58
863	0.57
864	0.53
865	0.52
866	0.49
867	0.43
868	0.41
869	0.35
870	0.32
871	0.27
872	0.24
873	0.15
874	0.12
875	0.12
876	0.1
877	0.08
878	0.08
879	0.1
880	0.09
881	0.13
882	0.12
883	0.12
884	0.13
885	0.15
886	0.16
887	0.18
888	0.18
889	0.16
890	0.22
891	0.23
892	0.22
893	0.19
894	0.18
895	0.2
896	0.2
897	0.21
898	0.15
899	0.18
900	0.21
901	0.21
902	0.24
903	0.21
904	0.26
905	0.33
906	0.42
907	0.47
908	0.46
909	0.51
910	0.56
911	0.61
912	0.56
913	0.49
914	0.41
915	0.33
916	0.3
917	0.25
918	0.18
919	0.12
920	0.12
921	0.13
922	0.12
923	0.13
924	0.12
925	0.12
926	0.12
927	0.12
928	0.1
929	0.09
930	0.08
931	0.09
932	0.1
933	0.1
934	0.13
935	0.14
936	0.15
937	0.17
938	0.26
939	0.31
940	0.37
941	0.41
942	0.41
943	0.41
944	0.41
945	0.4
946	0.32
947	0.29
948	0.23
949	0.19
950	0.14
951	0.12
952	0.12
953	0.11
954	0.1
955	0.05
956	0.05
957	0.05
958	0.07
959	0.07
960	0.08
961	0.1
962	0.11
963	0.11
964	0.13
965	0.18
966	0.19
967	0.2
968	0.22
969	0.22
970	0.22
971	0.23
972	0.23
973	0.21
974	0.21
975	0.24
976	0.22
977	0.22
978	0.22
979	0.21
980	0.2
981	0.18
982	0.16
983	0.13
984	0.14
985	0.16
986	0.16
987	0.16
988	0.16
989	0.14
990	0.16
991	0.15
992	0.16
993	0.13
994	0.11
995	0.12
996	0.11
997	0.12
998	0.11
999	0.1
1000	0.07
1001	0.08
1002	0.08
1003	0.07
1004	0.07
1005	0.06
1006	0.05
1007	0.05
1008	0.05
1009	0.05
1010	0.06
1011	0.07
1012	0.07
1013	0.07
1014	0.11
1015	0.14
1016	0.16
1017	0.2
1018	0.2
1019	0.2
1020	0.21
1021	0.28
1022	0.28
1023	0.26
1024	0.27
1025	0.25
1026	0.25
1027	0.24
1028	0.23
1029	0.17
1030	0.13
1031	0.11
1032	0.09
1033	0.07
1034	0.06
1035	0.06
1036	0.05
1037	0.04
1038	0.04
1039	0.04
1040	0.04
1041	0.06
1042	0.07
1043	0.07
1044	0.08
1045	0.08
1046	0.14
1047	0.2
1048	0.19
1049	0.19
1050	0.18
1051	0.21
1052	0.22
1053	0.22
1054	0.18
1055	0.19
1056	0.26
1057	0.27
1058	0.26
1059	0.24
1060	0.22
1061	0.22
1062	0.22
1063	0.17
1064	0.09
1065	0.07
1066	0.07
1067	0.06
1068	0.07
1069	0.06
1070	0.05
1071	0.04
1072	0.04
1073	0.05
1074	0.06
1075	0.06
1076	0.06
1077	0.06
1078	0.07
1079	0.07
1080	0.08
1081	0.08
1082	0.07
1083	0.08
1084	0.08
1085	0.09
1086	0.08
1087	0.15
1088	0.18
1089	0.23
1090	0.29
1091	0.33
1092	0.38
1093	0.43
1094	0.46
1095	0.44
1096	0.51
1097	0.51
1098	0.5
1099	0.55
1100	0.53
1101	0.5
1102	0.48
1103	0.44
1104	0.34
1105	0.31
1106	0.25
1107	0.16
1108	0.14
1109	0.12
1110	0.11
1111	0.1
1112	0.1
1113	0.08
1114	0.08
1115	0.09
1116	0.08
1117	0.08
1118	0.08
1119	0.08
1120	0.09
1121	0.1
1122	0.12
1123	0.12
1124	0.14
1125	0.17
1126	0.17
1127	0.17
1128	0.21
1129	0.2
1130	0.21
1131	0.29
1132	0.28
1133	0.29

A0A5C3LAN0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer