Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C3LQC9

Protein Details
Accession A0A5C3LQC9    Localization Confidence Medium Confidence Score 10
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-24MAVSGRPKLKKAFKKARVIAPLYTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
7-15PKLKKAFKK
253-260KPSKKSGK
Subcellular Location(s) mito 10.5cyto_mito 10.5, cyto 9.5, extr 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR020472  G-protein_beta_WD-40_rep  
IPR013934  Utp13_C  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR019775  WD40_repeat_CS  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0032040  C:small-subunit processome  
GO:0006364  P:rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF08625  Utp13  
PF00400  WD40  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00678  WD_REPEATS_1  
PS50082  WD_REPEATS_2  
PS50294  WD_REPEATS_REGION  
CDD cd00200  WD40  
Amino Acid Sequences MAVSGRPKLKKAFKKARVIAPLYTSGPVALTSDGKLLATCVGEEVVLTDISTGGELCRFAGDTEDITSLCITPSSKYLAIFTASLSLKIYEIPHSGPTTEKIKPIRTVSKAHESPVHVCTADPTSTLLASGSADGIVKVWDLAHGYITHVFRGHGGVVSALTFNYPQDPTSVAQSGPIRLVTGSVDTHIRIFNLTDGASTSSGGGKPEAVLDGHVSVPRGLDVSPDGKWLVSGGRDSVVLLWDLKPAGGASSKPSKKSGKGKNVEAGPQLVKTILALERVEAVGFIKDPSAFHQKLDELRFYVGGQKGVVTVRGADEEKDVVTLGEKRTRQLTEDEEEQRQIVNILYSPLAETLVSVHADQNIMVYSLQQQQLTKQLIGYNDEIVDATFVLSNTPEKTPLLALATNSSLIRVYSPETLDARLLEGHTDIVLALEKSVDGLFLASGSKDKSMRIWAPHQIGEASSSWSYSCVAVCNGHAESVGAVALSKVADDSTNKNLRFAFTGSQDRTIKMWDLSEVSLDTARNGDIVQCKSLTTHKAHEKDINALDVSPNDKLLVSGSQDRTAKVYAIEYSRSSNSVRGELQVLGTCKGHKRGVWSVRFCRSNRVLATGSGDKTVKLWNLDDFSCIKTFEGHTNSVLRVDFFNAGAQLVSTASDGLVKVWGIHDEECNATLDNHEDKVWALAISSDERTIVSGGADSMVTFWEDCTEETEVEQENQRAEFILKDQEFQNYVSLGDYKRAIQLALSLGQPGRLLKLFTDVISSVSDDKDSVSGNGLLDQVVRTLEGPDFVKLLAFVRTWNTSAKGSAVAQMVLNAIFKNLSADEILEYFKNEDALKAWQSGTKVKDVSAGGDPLREMVQALIPYSQRHLARMERLLQESYVVDFILGEMDNGMLGNGLDDDDSMEID
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.83
2 0.87
3 0.87
4 0.86
5 0.8
6 0.73
7 0.66
8 0.61
9 0.52
10 0.45
11 0.35
12 0.26
13 0.22
14 0.18
15 0.15
16 0.12
17 0.12
18 0.12
19 0.13
20 0.13
21 0.13
22 0.13
23 0.12
24 0.12
25 0.11
26 0.11
27 0.1
28 0.1
29 0.09
30 0.09
31 0.09
32 0.08
33 0.08
34 0.08
35 0.07
36 0.07
37 0.07
38 0.08
39 0.07
40 0.06
41 0.07
42 0.08
43 0.08
44 0.09
45 0.09
46 0.09
47 0.13
48 0.13
49 0.13
50 0.16
51 0.17
52 0.15
53 0.16
54 0.16
55 0.13
56 0.11
57 0.12
58 0.1
59 0.11
60 0.13
61 0.18
62 0.19
63 0.2
64 0.21
65 0.21
66 0.23
67 0.21
68 0.19
69 0.21
70 0.2
71 0.19
72 0.19
73 0.18
74 0.16
75 0.18
76 0.19
77 0.15
78 0.18
79 0.19
80 0.22
81 0.23
82 0.23
83 0.23
84 0.26
85 0.28
86 0.28
87 0.33
88 0.35
89 0.39
90 0.45
91 0.51
92 0.56
93 0.55
94 0.59
95 0.59
96 0.64
97 0.6
98 0.56
99 0.54
100 0.49
101 0.49
102 0.44
103 0.4
104 0.29
105 0.27
106 0.27
107 0.25
108 0.21
109 0.18
110 0.17
111 0.15
112 0.15
113 0.15
114 0.13
115 0.09
116 0.09
117 0.09
118 0.07
119 0.06
120 0.07
121 0.06
122 0.07
123 0.06
124 0.06
125 0.06
126 0.05
127 0.06
128 0.08
129 0.08
130 0.1
131 0.1
132 0.12
133 0.17
134 0.18
135 0.18
136 0.17
137 0.17
138 0.16
139 0.18
140 0.16
141 0.12
142 0.11
143 0.1
144 0.1
145 0.1
146 0.1
147 0.08
148 0.08
149 0.07
150 0.07
151 0.1
152 0.11
153 0.1
154 0.11
155 0.14
156 0.14
157 0.19
158 0.2
159 0.16
160 0.21
161 0.22
162 0.22
163 0.21
164 0.21
165 0.16
166 0.14
167 0.15
168 0.11
169 0.12
170 0.11
171 0.11
172 0.12
173 0.12
174 0.14
175 0.13
176 0.13
177 0.11
178 0.11
179 0.12
180 0.12
181 0.11
182 0.1
183 0.11
184 0.13
185 0.12
186 0.12
187 0.11
188 0.12
189 0.12
190 0.13
191 0.12
192 0.1
193 0.1
194 0.11
195 0.11
196 0.09
197 0.09
198 0.09
199 0.1
200 0.11
201 0.11
202 0.11
203 0.1
204 0.1
205 0.1
206 0.1
207 0.08
208 0.08
209 0.1
210 0.12
211 0.12
212 0.13
213 0.13
214 0.12
215 0.12
216 0.12
217 0.11
218 0.1
219 0.11
220 0.1
221 0.1
222 0.11
223 0.11
224 0.11
225 0.1
226 0.09
227 0.09
228 0.09
229 0.09
230 0.09
231 0.09
232 0.09
233 0.08
234 0.08
235 0.09
236 0.09
237 0.12
238 0.23
239 0.26
240 0.28
241 0.34
242 0.38
243 0.44
244 0.54
245 0.6
246 0.6
247 0.64
248 0.67
249 0.68
250 0.66
251 0.62
252 0.53
253 0.46
254 0.36
255 0.3
256 0.25
257 0.18
258 0.15
259 0.11
260 0.12
261 0.1
262 0.11
263 0.1
264 0.1
265 0.11
266 0.12
267 0.11
268 0.09
269 0.08
270 0.06
271 0.07
272 0.07
273 0.06
274 0.07
275 0.07
276 0.12
277 0.2
278 0.2
279 0.2
280 0.23
281 0.25
282 0.3
283 0.33
284 0.3
285 0.23
286 0.23
287 0.23
288 0.21
289 0.24
290 0.2
291 0.18
292 0.16
293 0.14
294 0.15
295 0.15
296 0.15
297 0.09
298 0.08
299 0.08
300 0.11
301 0.11
302 0.1
303 0.11
304 0.1
305 0.1
306 0.1
307 0.09
308 0.07
309 0.08
310 0.11
311 0.12
312 0.18
313 0.19
314 0.2
315 0.24
316 0.25
317 0.25
318 0.25
319 0.27
320 0.25
321 0.31
322 0.33
323 0.3
324 0.3
325 0.28
326 0.25
327 0.2
328 0.17
329 0.1
330 0.07
331 0.06
332 0.07
333 0.07
334 0.07
335 0.07
336 0.07
337 0.07
338 0.06
339 0.05
340 0.05
341 0.07
342 0.07
343 0.07
344 0.08
345 0.08
346 0.09
347 0.08
348 0.08
349 0.06
350 0.06
351 0.06
352 0.06
353 0.08
354 0.13
355 0.15
356 0.15
357 0.15
358 0.16
359 0.23
360 0.24
361 0.22
362 0.18
363 0.18
364 0.19
365 0.21
366 0.21
367 0.15
368 0.13
369 0.13
370 0.12
371 0.09
372 0.08
373 0.05
374 0.05
375 0.05
376 0.04
377 0.04
378 0.05
379 0.06
380 0.08
381 0.08
382 0.09
383 0.09
384 0.09
385 0.1
386 0.1
387 0.11
388 0.1
389 0.1
390 0.1
391 0.11
392 0.11
393 0.1
394 0.1
395 0.07
396 0.07
397 0.07
398 0.06
399 0.08
400 0.09
401 0.1
402 0.12
403 0.13
404 0.13
405 0.13
406 0.12
407 0.11
408 0.09
409 0.09
410 0.07
411 0.06
412 0.06
413 0.05
414 0.05
415 0.04
416 0.04
417 0.04
418 0.04
419 0.04
420 0.03
421 0.03
422 0.04
423 0.04
424 0.03
425 0.03
426 0.03
427 0.03
428 0.03
429 0.04
430 0.03
431 0.04
432 0.05
433 0.07
434 0.07
435 0.08
436 0.09
437 0.14
438 0.17
439 0.19
440 0.23
441 0.27
442 0.29
443 0.29
444 0.28
445 0.23
446 0.2
447 0.19
448 0.15
449 0.12
450 0.09
451 0.09
452 0.09
453 0.09
454 0.09
455 0.08
456 0.08
457 0.06
458 0.07
459 0.08
460 0.08
461 0.1
462 0.09
463 0.09
464 0.09
465 0.08
466 0.07
467 0.06
468 0.06
469 0.03
470 0.03
471 0.03
472 0.03
473 0.03
474 0.03
475 0.03
476 0.03
477 0.04
478 0.06
479 0.09
480 0.17
481 0.24
482 0.24
483 0.25
484 0.25
485 0.25
486 0.26
487 0.24
488 0.19
489 0.17
490 0.24
491 0.24
492 0.3
493 0.3
494 0.28
495 0.27
496 0.26
497 0.23
498 0.17
499 0.16
500 0.11
501 0.12
502 0.11
503 0.11
504 0.1
505 0.09
506 0.09
507 0.09
508 0.08
509 0.07
510 0.07
511 0.06
512 0.06
513 0.08
514 0.12
515 0.13
516 0.14
517 0.14
518 0.14
519 0.15
520 0.19
521 0.21
522 0.19
523 0.25
524 0.32
525 0.35
526 0.38
527 0.41
528 0.39
529 0.4
530 0.38
531 0.32
532 0.24
533 0.21
534 0.19
535 0.15
536 0.16
537 0.1
538 0.09
539 0.08
540 0.08
541 0.08
542 0.08
543 0.09
544 0.09
545 0.15
546 0.17
547 0.21
548 0.22
549 0.22
550 0.23
551 0.22
552 0.2
553 0.15
554 0.15
555 0.13
556 0.14
557 0.16
558 0.15
559 0.17
560 0.17
561 0.18
562 0.18
563 0.19
564 0.18
565 0.19
566 0.19
567 0.17
568 0.18
569 0.17
570 0.17
571 0.16
572 0.16
573 0.14
574 0.14
575 0.15
576 0.16
577 0.2
578 0.22
579 0.2
580 0.25
581 0.33
582 0.42
583 0.48
584 0.53
585 0.55
586 0.6
587 0.65
588 0.59
589 0.59
590 0.53
591 0.51
592 0.45
593 0.44
594 0.38
595 0.32
596 0.37
597 0.32
598 0.29
599 0.25
600 0.24
601 0.19
602 0.19
603 0.21
604 0.18
605 0.16
606 0.16
607 0.16
608 0.19
609 0.19
610 0.21
611 0.19
612 0.19
613 0.18
614 0.17
615 0.15
616 0.14
617 0.16
618 0.2
619 0.22
620 0.22
621 0.23
622 0.24
623 0.25
624 0.25
625 0.23
626 0.17
627 0.14
628 0.15
629 0.14
630 0.12
631 0.12
632 0.1
633 0.1
634 0.09
635 0.08
636 0.06
637 0.06
638 0.06
639 0.05
640 0.05
641 0.04
642 0.06
643 0.06
644 0.06
645 0.07
646 0.06
647 0.06
648 0.07
649 0.09
650 0.09
651 0.11
652 0.11
653 0.12
654 0.13
655 0.13
656 0.14
657 0.13
658 0.11
659 0.11
660 0.13
661 0.14
662 0.14
663 0.13
664 0.13
665 0.12
666 0.13
667 0.13
668 0.09
669 0.07
670 0.07
671 0.09
672 0.11
673 0.12
674 0.11
675 0.1
676 0.1
677 0.11
678 0.11
679 0.09
680 0.07
681 0.06
682 0.06
683 0.07
684 0.06
685 0.05
686 0.05
687 0.05
688 0.06
689 0.05
690 0.05
691 0.07
692 0.08
693 0.08
694 0.11
695 0.13
696 0.12
697 0.12
698 0.15
699 0.14
700 0.15
701 0.18
702 0.16
703 0.16
704 0.16
705 0.16
706 0.15
707 0.14
708 0.13
709 0.12
710 0.2
711 0.19
712 0.21
713 0.22
714 0.24
715 0.25
716 0.25
717 0.25
718 0.16
719 0.16
720 0.15
721 0.17
722 0.14
723 0.15
724 0.16
725 0.15
726 0.17
727 0.18
728 0.16
729 0.13
730 0.16
731 0.16
732 0.17
733 0.16
734 0.15
735 0.14
736 0.15
737 0.16
738 0.14
739 0.14
740 0.13
741 0.14
742 0.12
743 0.18
744 0.18
745 0.17
746 0.2
747 0.17
748 0.17
749 0.17
750 0.18
751 0.14
752 0.14
753 0.14
754 0.11
755 0.11
756 0.11
757 0.12
758 0.11
759 0.12
760 0.13
761 0.13
762 0.15
763 0.14
764 0.13
765 0.12
766 0.12
767 0.1
768 0.08
769 0.09
770 0.07
771 0.09
772 0.09
773 0.12
774 0.13
775 0.13
776 0.13
777 0.13
778 0.13
779 0.12
780 0.12
781 0.12
782 0.11
783 0.12
784 0.15
785 0.18
786 0.2
787 0.22
788 0.24
789 0.22
790 0.23
791 0.23
792 0.22
793 0.2
794 0.23
795 0.21
796 0.19
797 0.18
798 0.17
799 0.17
800 0.14
801 0.15
802 0.1
803 0.09
804 0.08
805 0.08
806 0.1
807 0.09
808 0.1
809 0.09
810 0.1
811 0.11
812 0.12
813 0.14
814 0.12
815 0.13
816 0.13
817 0.13
818 0.15
819 0.14
820 0.14
821 0.14
822 0.19
823 0.2
824 0.22
825 0.22
826 0.22
827 0.25
828 0.3
829 0.31
830 0.33
831 0.31
832 0.29
833 0.34
834 0.32
835 0.33
836 0.3
837 0.31
838 0.25
839 0.25
840 0.25
841 0.2
842 0.2
843 0.17
844 0.13
845 0.1
846 0.14
847 0.13
848 0.14
849 0.17
850 0.18
851 0.19
852 0.22
853 0.28
854 0.25
855 0.26
856 0.3
857 0.33
858 0.39
859 0.44
860 0.48
861 0.47
862 0.49
863 0.48
864 0.43
865 0.39
866 0.32
867 0.28
868 0.21
869 0.15
870 0.12
871 0.1
872 0.1
873 0.1
874 0.09
875 0.07
876 0.07
877 0.07
878 0.07
879 0.07
880 0.06
881 0.04
882 0.04
883 0.05
884 0.05
885 0.05
886 0.05
887 0.05
888 0.07