Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C3LD71

Protein Details
Accession A0A5C3LD71    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
136-164QYPTYKFTPAPRKTRKKSKKTDENDARCAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
146-155PRKTRKKSKK
Subcellular Location(s) nucl 10, cyto_nucl 10, cyto 8, mito 3, plas 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00505  HMG_box  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
CDD cd01389  HMG-box_ROX1-like  
Amino Acid Sequences MYSISSCVHPNLWEMPSIAYDMIPSGGGYHCSSSANSTKSVSPLSPPSTSSPTFSTSSLRIGQSKKGKSHISRPPNAFLLFRSEFWAREKQKKNPVERDHRDISRIAAHCWRSLDDTAKQVYYQRASKLREQHQIQYPTYKFTPAPRKTRKKSKKTDENDARCALLASQLMPEYVPSYSPPLPIVNATDWNRLPILQPTPRLPEQPNPIIGFESAFGDNNSSTIPFSAYPVSLFFLIFAFAGI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.21
2 0.21
3 0.2
4 0.2
5 0.17
6 0.12
7 0.11
8 0.1
9 0.09
10 0.08
11 0.07
12 0.07
13 0.08
14 0.11
15 0.12
16 0.12
17 0.13
18 0.14
19 0.15
20 0.18
21 0.24
22 0.23
23 0.24
24 0.24
25 0.25
26 0.26
27 0.28
28 0.24
29 0.22
30 0.26
31 0.29
32 0.28
33 0.29
34 0.31
35 0.34
36 0.34
37 0.33
38 0.29
39 0.28
40 0.29
41 0.27
42 0.26
43 0.22
44 0.25
45 0.26
46 0.25
47 0.27
48 0.27
49 0.35
50 0.4
51 0.45
52 0.45
53 0.47
54 0.53
55 0.53
56 0.6
57 0.62
58 0.63
59 0.65
60 0.65
61 0.62
62 0.58
63 0.55
64 0.46
65 0.36
66 0.35
67 0.28
68 0.25
69 0.25
70 0.22
71 0.22
72 0.25
73 0.34
74 0.3
75 0.39
76 0.45
77 0.5
78 0.58
79 0.65
80 0.7
81 0.7
82 0.75
83 0.76
84 0.75
85 0.74
86 0.7
87 0.63
88 0.56
89 0.47
90 0.39
91 0.35
92 0.3
93 0.25
94 0.25
95 0.25
96 0.24
97 0.25
98 0.24
99 0.19
100 0.2
101 0.22
102 0.18
103 0.2
104 0.19
105 0.19
106 0.18
107 0.18
108 0.19
109 0.19
110 0.19
111 0.2
112 0.26
113 0.28
114 0.33
115 0.4
116 0.44
117 0.49
118 0.49
119 0.51
120 0.52
121 0.55
122 0.5
123 0.49
124 0.43
125 0.39
126 0.37
127 0.32
128 0.25
129 0.28
130 0.38
131 0.38
132 0.48
133 0.55
134 0.65
135 0.72
136 0.83
137 0.85
138 0.85
139 0.89
140 0.89
141 0.89
142 0.85
143 0.88
144 0.87
145 0.84
146 0.78
147 0.69
148 0.58
149 0.47
150 0.41
151 0.29
152 0.21
153 0.14
154 0.1
155 0.1
156 0.09
157 0.09
158 0.09
159 0.09
160 0.08
161 0.07
162 0.07
163 0.07
164 0.12
165 0.13
166 0.14
167 0.16
168 0.16
169 0.16
170 0.17
171 0.19
172 0.16
173 0.23
174 0.25
175 0.29
176 0.28
177 0.29
178 0.28
179 0.25
180 0.25
181 0.23
182 0.27
183 0.27
184 0.31
185 0.33
186 0.39
187 0.41
188 0.44
189 0.42
190 0.42
191 0.46
192 0.47
193 0.48
194 0.43
195 0.42
196 0.39
197 0.35
198 0.28
199 0.21
200 0.18
201 0.14
202 0.13
203 0.12
204 0.13
205 0.13
206 0.13
207 0.13
208 0.11
209 0.1
210 0.1
211 0.12
212 0.1
213 0.13
214 0.15
215 0.15
216 0.15
217 0.16
218 0.17
219 0.16
220 0.15
221 0.13
222 0.11
223 0.11