Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C3LBS7

Protein Details
Accession A0A5C3LBS7    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
8-34LDPSSPAYKKARRQFYKATKNRPDTINHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 17, mito 4, cyto 4, cyto_mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR004574  Alkb  
IPR027450  AlkB-like  
IPR037151  AlkB-like_sf  
IPR005123  Oxoglu/Fe-dep_dioxygenase  
IPR001931  Ribosomal_S21e  
IPR018279  Ribosomal_S21e_CS  
IPR038579  Ribosomal_S21e_sf  
Gene Ontology GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
GO:0005840  C:ribosome  
GO:0051213  F:dioxygenase activity  
GO:0003735  F:structural constituent of ribosome  
GO:0006281  P:DNA repair  
GO:0006412  P:translation  
Pfam View protein in Pfam  
PF13532  2OG-FeII_Oxy_2  
PF01249  Ribosomal_S21e  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51471  FE2OG_OXY  
PS00996  RIBOSOMAL_S21E  
Amino Acid Sequences MSSVSDLLDPSSPAYKKARRQFYKATKNRPDTINNDWTPFRAAEKRYKARFPPPDLASLLDLAQYDSQRSNEIADGVWRGSLDSVSHTRLNSKVDAYAIPDIPGLVILPSFLSHSEQHDLVRWSLERQACYPNPTNLDVHYHLPREGLWTRSLQDPDSLILPKSLDSDTIDTPSYGPRQLVNNAPISVDNYKKLADEPKPPPAPSATVSAASAVTLIPKLRWANIGWYYHWGTKQYDFSQGKGEIDKQLRTICKRAVLSVDWKDVYGGLELDWEQPDDPEWKHWPDMYDPDAGIVNFYQTKDTLMAHVDRSEVCATSPLVSISLGSAAVFLIGGKTRDSEPIPVLLRSGDAVIMSGPVARRAYHGVPRVLESSLPSHLSNREDDPEWEPFAAYLRTTRININVRQHTLDDTMENDAGVLVDLYVPRKCSATNRLITSKDHASVQIVIADVDANGRALSTNTTFAFSGQVRSQGEGDDSLNRLATKAGLLRNVWSYQK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.33
2 0.4
3 0.48
4 0.58
5 0.67
6 0.66
7 0.74
8 0.81
9 0.83
10 0.86
11 0.85
12 0.87
13 0.86
14 0.86
15 0.85
16 0.8
17 0.76
18 0.7
19 0.7
20 0.69
21 0.6
22 0.57
23 0.51
24 0.46
25 0.42
26 0.38
27 0.34
28 0.32
29 0.35
30 0.41
31 0.51
32 0.59
33 0.63
34 0.7
35 0.71
36 0.74
37 0.79
38 0.76
39 0.75
40 0.68
41 0.66
42 0.59
43 0.54
44 0.45
45 0.36
46 0.28
47 0.2
48 0.18
49 0.14
50 0.16
51 0.14
52 0.15
53 0.16
54 0.16
55 0.17
56 0.17
57 0.18
58 0.16
59 0.17
60 0.15
61 0.15
62 0.16
63 0.15
64 0.14
65 0.12
66 0.11
67 0.11
68 0.11
69 0.09
70 0.12
71 0.16
72 0.19
73 0.22
74 0.22
75 0.24
76 0.27
77 0.3
78 0.27
79 0.25
80 0.23
81 0.22
82 0.23
83 0.23
84 0.25
85 0.22
86 0.2
87 0.18
88 0.16
89 0.14
90 0.13
91 0.1
92 0.05
93 0.04
94 0.04
95 0.04
96 0.05
97 0.05
98 0.06
99 0.09
100 0.1
101 0.14
102 0.17
103 0.18
104 0.18
105 0.22
106 0.24
107 0.21
108 0.23
109 0.2
110 0.19
111 0.25
112 0.27
113 0.24
114 0.24
115 0.32
116 0.31
117 0.37
118 0.4
119 0.38
120 0.38
121 0.39
122 0.37
123 0.3
124 0.34
125 0.3
126 0.29
127 0.29
128 0.27
129 0.25
130 0.24
131 0.23
132 0.23
133 0.24
134 0.22
135 0.2
136 0.2
137 0.21
138 0.26
139 0.27
140 0.22
141 0.21
142 0.19
143 0.18
144 0.19
145 0.18
146 0.14
147 0.13
148 0.13
149 0.11
150 0.13
151 0.12
152 0.1
153 0.11
154 0.14
155 0.14
156 0.16
157 0.16
158 0.14
159 0.14
160 0.16
161 0.16
162 0.14
163 0.14
164 0.14
165 0.17
166 0.19
167 0.24
168 0.24
169 0.25
170 0.24
171 0.24
172 0.22
173 0.22
174 0.23
175 0.19
176 0.17
177 0.15
178 0.15
179 0.15
180 0.17
181 0.21
182 0.22
183 0.29
184 0.33
185 0.41
186 0.44
187 0.43
188 0.43
189 0.37
190 0.35
191 0.28
192 0.28
193 0.2
194 0.18
195 0.17
196 0.17
197 0.15
198 0.12
199 0.11
200 0.06
201 0.05
202 0.05
203 0.06
204 0.05
205 0.09
206 0.09
207 0.1
208 0.12
209 0.12
210 0.17
211 0.22
212 0.24
213 0.21
214 0.24
215 0.26
216 0.26
217 0.27
218 0.23
219 0.2
220 0.21
221 0.25
222 0.22
223 0.3
224 0.28
225 0.28
226 0.31
227 0.3
228 0.28
229 0.24
230 0.24
231 0.2
232 0.22
233 0.22
234 0.19
235 0.22
236 0.24
237 0.26
238 0.28
239 0.24
240 0.26
241 0.26
242 0.25
243 0.24
244 0.23
245 0.26
246 0.26
247 0.27
248 0.22
249 0.22
250 0.21
251 0.18
252 0.17
253 0.11
254 0.08
255 0.05
256 0.06
257 0.06
258 0.07
259 0.07
260 0.07
261 0.06
262 0.06
263 0.08
264 0.1
265 0.1
266 0.12
267 0.15
268 0.17
269 0.18
270 0.19
271 0.19
272 0.19
273 0.23
274 0.21
275 0.2
276 0.18
277 0.17
278 0.17
279 0.15
280 0.13
281 0.09
282 0.08
283 0.08
284 0.09
285 0.09
286 0.08
287 0.09
288 0.1
289 0.1
290 0.1
291 0.11
292 0.12
293 0.12
294 0.13
295 0.13
296 0.12
297 0.14
298 0.14
299 0.11
300 0.1
301 0.11
302 0.11
303 0.12
304 0.12
305 0.09
306 0.09
307 0.09
308 0.09
309 0.07
310 0.07
311 0.05
312 0.05
313 0.04
314 0.04
315 0.04
316 0.04
317 0.03
318 0.04
319 0.05
320 0.06
321 0.06
322 0.08
323 0.09
324 0.12
325 0.14
326 0.15
327 0.15
328 0.2
329 0.22
330 0.2
331 0.2
332 0.17
333 0.16
334 0.13
335 0.13
336 0.07
337 0.06
338 0.06
339 0.05
340 0.05
341 0.05
342 0.06
343 0.06
344 0.09
345 0.1
346 0.1
347 0.12
348 0.17
349 0.21
350 0.26
351 0.32
352 0.32
353 0.32
354 0.34
355 0.34
356 0.3
357 0.26
358 0.21
359 0.18
360 0.17
361 0.19
362 0.17
363 0.18
364 0.2
365 0.22
366 0.23
367 0.23
368 0.25
369 0.24
370 0.26
371 0.28
372 0.28
373 0.27
374 0.24
375 0.21
376 0.18
377 0.19
378 0.17
379 0.14
380 0.13
381 0.14
382 0.17
383 0.19
384 0.21
385 0.26
386 0.32
387 0.38
388 0.45
389 0.49
390 0.49
391 0.5
392 0.49
393 0.44
394 0.39
395 0.34
396 0.25
397 0.2
398 0.2
399 0.18
400 0.17
401 0.13
402 0.11
403 0.1
404 0.09
405 0.07
406 0.04
407 0.05
408 0.06
409 0.09
410 0.11
411 0.12
412 0.13
413 0.14
414 0.16
415 0.22
416 0.3
417 0.37
418 0.42
419 0.47
420 0.52
421 0.54
422 0.55
423 0.54
424 0.5
425 0.42
426 0.37
427 0.32
428 0.29
429 0.28
430 0.26
431 0.22
432 0.17
433 0.14
434 0.13
435 0.12
436 0.09
437 0.08
438 0.08
439 0.06
440 0.06
441 0.06
442 0.06
443 0.07
444 0.11
445 0.12
446 0.16
447 0.16
448 0.19
449 0.19
450 0.19
451 0.23
452 0.2
453 0.24
454 0.22
455 0.28
456 0.26
457 0.29
458 0.29
459 0.25
460 0.26
461 0.23
462 0.23
463 0.21
464 0.21
465 0.2
466 0.22
467 0.2
468 0.18
469 0.17
470 0.16
471 0.16
472 0.2
473 0.23
474 0.26
475 0.27
476 0.3
477 0.34