Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C3L9X1

Protein Details
Accession A0A5C3L9X1    Localization Confidence High Confidence Score 20
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
100-131IAKPAEQKDQEKKERKAKRRPGRRGGKAVPGEBasic
150-179ITTDGEGKAKRKKRKSPRKKRSTDPAAPVEBasic
194-217ADANKKAPRVRKPRTPRPARPAGEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
110-127EKKERKAKRRPGRRGGKA
156-171GKAKRKKRKSPRKKRS
197-214NKKAPRVRKPRTPRPARP
Subcellular Location(s) cyto_nucl 12.5, nucl 12, cyto 11, pero 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR025239  DUF4187  
IPR039249  GPATCH11  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF13821  DUF4187  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MSDAPAAQVTENGAPVVEQQQETPGFKVFAGNLSYTTTDEGLKAFFAPVQSDILSVQVILRGTRSAGYGFVALATQEAAQKAADTLNKQELDGRQVIVEIAKPAEQKDQEKKERKAKRRPGRRGGKAVPGEVTEAEANGEAPKAEAEAAITTDGEGKAKRKKRKSPRKKRSTDPAAPVEGEAAPADANPGADGADANKKAPRVRKPRTPRPARPAGEDPAGEPSKSVLFVANLGFTVDDEALAALFTDAGIEIVNARIVRRRWGQPRKSKGYGFVDVGTEENQKKAIAALEGKEVAGRPIAVKVAVNTPQENADDAADEAATPAAFLTELPDSKAAKTKTYSQIRKDAQKRSQVEQERHRLKSRRVLEQESREEGLSKSLFERAKEEEDAGIASGSSKAFSIMKKMGFKPGQSLGAPSASDSPPQLDQPGPPTAKLDDPSTDSPAARATANDSVSSSTTTWDKDTTSRSQFHRTEPLPLREWTGKRGIGLGKRARSPDATERLAKISKMAEEADHRDFRERARDDYHNRRAEGRLGPAQLTCATLDEQTGKEFNVLWLNPNNQNSFPSGLFDALAMHSNLIPGIRQQGNPSDLRKQMQADALQPIGEDDDMPQKKVVDPLDQYPTEVLEEATQFLRLQAQDRLRLVLSYLRARHHYCFWCGIKYDNEEEMEDQCPGSEEDDHD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.11
2 0.13
3 0.16
4 0.17
5 0.16
6 0.16
7 0.22
8 0.26
9 0.28
10 0.28
11 0.26
12 0.23
13 0.23
14 0.26
15 0.21
16 0.22
17 0.23
18 0.22
19 0.2
20 0.22
21 0.23
22 0.2
23 0.21
24 0.17
25 0.15
26 0.15
27 0.15
28 0.13
29 0.12
30 0.12
31 0.11
32 0.11
33 0.11
34 0.13
35 0.13
36 0.15
37 0.15
38 0.14
39 0.14
40 0.14
41 0.12
42 0.11
43 0.1
44 0.1
45 0.1
46 0.1
47 0.11
48 0.1
49 0.11
50 0.12
51 0.13
52 0.11
53 0.12
54 0.13
55 0.12
56 0.11
57 0.11
58 0.1
59 0.08
60 0.08
61 0.07
62 0.07
63 0.09
64 0.09
65 0.09
66 0.09
67 0.1
68 0.1
69 0.14
70 0.16
71 0.16
72 0.21
73 0.28
74 0.28
75 0.28
76 0.32
77 0.31
78 0.33
79 0.33
80 0.29
81 0.21
82 0.21
83 0.22
84 0.17
85 0.17
86 0.12
87 0.11
88 0.13
89 0.14
90 0.16
91 0.22
92 0.26
93 0.32
94 0.41
95 0.5
96 0.58
97 0.67
98 0.74
99 0.77
100 0.83
101 0.86
102 0.87
103 0.88
104 0.88
105 0.9
106 0.92
107 0.93
108 0.93
109 0.92
110 0.91
111 0.86
112 0.84
113 0.77
114 0.68
115 0.59
116 0.49
117 0.41
118 0.3
119 0.27
120 0.17
121 0.14
122 0.12
123 0.1
124 0.09
125 0.08
126 0.08
127 0.06
128 0.06
129 0.06
130 0.06
131 0.06
132 0.06
133 0.06
134 0.07
135 0.07
136 0.08
137 0.07
138 0.07
139 0.1
140 0.1
141 0.11
142 0.12
143 0.17
144 0.26
145 0.35
146 0.45
147 0.52
148 0.63
149 0.73
150 0.82
151 0.89
152 0.91
153 0.94
154 0.95
155 0.93
156 0.92
157 0.92
158 0.91
159 0.88
160 0.84
161 0.78
162 0.7
163 0.62
164 0.52
165 0.42
166 0.32
167 0.23
168 0.15
169 0.1
170 0.07
171 0.06
172 0.07
173 0.05
174 0.05
175 0.05
176 0.05
177 0.05
178 0.05
179 0.05
180 0.06
181 0.13
182 0.13
183 0.15
184 0.17
185 0.19
186 0.24
187 0.32
188 0.4
189 0.44
190 0.52
191 0.62
192 0.7
193 0.79
194 0.85
195 0.88
196 0.87
197 0.85
198 0.88
199 0.79
200 0.76
201 0.7
202 0.63
203 0.56
204 0.46
205 0.38
206 0.35
207 0.33
208 0.26
209 0.21
210 0.18
211 0.15
212 0.15
213 0.15
214 0.08
215 0.08
216 0.09
217 0.1
218 0.09
219 0.08
220 0.08
221 0.08
222 0.06
223 0.07
224 0.06
225 0.05
226 0.05
227 0.05
228 0.04
229 0.04
230 0.04
231 0.03
232 0.03
233 0.02
234 0.02
235 0.02
236 0.03
237 0.03
238 0.03
239 0.03
240 0.03
241 0.05
242 0.05
243 0.06
244 0.11
245 0.11
246 0.17
247 0.23
248 0.31
249 0.4
250 0.51
251 0.6
252 0.66
253 0.75
254 0.78
255 0.77
256 0.71
257 0.68
258 0.63
259 0.57
260 0.48
261 0.39
262 0.31
263 0.26
264 0.25
265 0.19
266 0.17
267 0.14
268 0.13
269 0.12
270 0.11
271 0.11
272 0.11
273 0.1
274 0.09
275 0.1
276 0.11
277 0.12
278 0.12
279 0.12
280 0.12
281 0.11
282 0.09
283 0.08
284 0.07
285 0.05
286 0.06
287 0.07
288 0.07
289 0.07
290 0.07
291 0.11
292 0.15
293 0.16
294 0.16
295 0.16
296 0.17
297 0.17
298 0.17
299 0.14
300 0.09
301 0.08
302 0.07
303 0.07
304 0.05
305 0.05
306 0.04
307 0.04
308 0.03
309 0.03
310 0.03
311 0.02
312 0.03
313 0.03
314 0.04
315 0.06
316 0.06
317 0.07
318 0.1
319 0.1
320 0.11
321 0.17
322 0.16
323 0.17
324 0.19
325 0.25
326 0.33
327 0.42
328 0.47
329 0.45
330 0.53
331 0.55
332 0.62
333 0.62
334 0.61
335 0.58
336 0.61
337 0.61
338 0.56
339 0.61
340 0.59
341 0.58
342 0.57
343 0.61
344 0.59
345 0.58
346 0.62
347 0.59
348 0.55
349 0.58
350 0.55
351 0.54
352 0.52
353 0.56
354 0.55
355 0.57
356 0.58
357 0.52
358 0.47
359 0.38
360 0.34
361 0.28
362 0.25
363 0.17
364 0.13
365 0.11
366 0.16
367 0.17
368 0.17
369 0.19
370 0.18
371 0.22
372 0.22
373 0.21
374 0.16
375 0.15
376 0.14
377 0.12
378 0.09
379 0.05
380 0.05
381 0.05
382 0.05
383 0.05
384 0.05
385 0.06
386 0.08
387 0.08
388 0.13
389 0.15
390 0.2
391 0.24
392 0.25
393 0.33
394 0.33
395 0.33
396 0.33
397 0.32
398 0.31
399 0.27
400 0.27
401 0.2
402 0.19
403 0.19
404 0.15
405 0.16
406 0.13
407 0.13
408 0.12
409 0.13
410 0.12
411 0.13
412 0.14
413 0.11
414 0.12
415 0.15
416 0.22
417 0.2
418 0.19
419 0.21
420 0.2
421 0.22
422 0.23
423 0.21
424 0.16
425 0.2
426 0.22
427 0.24
428 0.24
429 0.21
430 0.2
431 0.19
432 0.19
433 0.14
434 0.12
435 0.12
436 0.15
437 0.16
438 0.16
439 0.15
440 0.15
441 0.16
442 0.17
443 0.14
444 0.11
445 0.12
446 0.13
447 0.13
448 0.13
449 0.14
450 0.16
451 0.2
452 0.26
453 0.3
454 0.34
455 0.37
456 0.45
457 0.46
458 0.47
459 0.52
460 0.46
461 0.5
462 0.51
463 0.53
464 0.47
465 0.45
466 0.46
467 0.44
468 0.44
469 0.39
470 0.37
471 0.33
472 0.29
473 0.33
474 0.33
475 0.31
476 0.39
477 0.41
478 0.4
479 0.43
480 0.44
481 0.42
482 0.39
483 0.4
484 0.41
485 0.41
486 0.4
487 0.39
488 0.39
489 0.41
490 0.41
491 0.35
492 0.28
493 0.24
494 0.21
495 0.2
496 0.2
497 0.17
498 0.2
499 0.25
500 0.29
501 0.3
502 0.29
503 0.32
504 0.32
505 0.32
506 0.38
507 0.35
508 0.33
509 0.37
510 0.44
511 0.48
512 0.58
513 0.66
514 0.62
515 0.6
516 0.59
517 0.55
518 0.53
519 0.49
520 0.44
521 0.4
522 0.35
523 0.35
524 0.32
525 0.31
526 0.26
527 0.23
528 0.17
529 0.13
530 0.12
531 0.11
532 0.12
533 0.13
534 0.13
535 0.14
536 0.15
537 0.13
538 0.13
539 0.13
540 0.14
541 0.18
542 0.18
543 0.2
544 0.24
545 0.29
546 0.34
547 0.37
548 0.38
549 0.32
550 0.34
551 0.32
552 0.3
553 0.26
554 0.23
555 0.2
556 0.17
557 0.16
558 0.15
559 0.14
560 0.11
561 0.13
562 0.1
563 0.1
564 0.09
565 0.09
566 0.1
567 0.09
568 0.08
569 0.08
570 0.15
571 0.18
572 0.19
573 0.22
574 0.28
575 0.32
576 0.36
577 0.39
578 0.39
579 0.4
580 0.42
581 0.42
582 0.39
583 0.38
584 0.4
585 0.39
586 0.35
587 0.34
588 0.32
589 0.28
590 0.25
591 0.21
592 0.17
593 0.14
594 0.11
595 0.08
596 0.18
597 0.2
598 0.21
599 0.22
600 0.22
601 0.24
602 0.29
603 0.31
604 0.28
605 0.3
606 0.35
607 0.41
608 0.4
609 0.4
610 0.35
611 0.33
612 0.26
613 0.23
614 0.18
615 0.12
616 0.13
617 0.14
618 0.14
619 0.14
620 0.13
621 0.13
622 0.17
623 0.16
624 0.18
625 0.24
626 0.3
627 0.35
628 0.37
629 0.39
630 0.35
631 0.34
632 0.32
633 0.3
634 0.3
635 0.31
636 0.34
637 0.36
638 0.41
639 0.45
640 0.47
641 0.51
642 0.51
643 0.48
644 0.53
645 0.51
646 0.51
647 0.48
648 0.49
649 0.46
650 0.46
651 0.46
652 0.41
653 0.4
654 0.36
655 0.36
656 0.34
657 0.29
658 0.25
659 0.19
660 0.15
661 0.15
662 0.14
663 0.15