Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C3LDM4

Protein Details
Accession A0A5C3LDM4    Localization Confidence High Confidence Score 20.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
28-47KKALEEKKKLDQLRKEKEEEBasic
162-223QEQAGIKPKKDKKKEKEERKRLKHEEKERRRRKRHSDSRSPERHRSHRSRSRSPRPSRRDDDBasic
270-294PPTNGDRGKRPRSRSRSPRRDDAYSBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
167-228IKPKKDKKKEKEERKRLKHEEKERRRRKRHSDSRSPERHRSHRSRSRSPRPSRRDDDSPRRY
276-289RGKRPRSRSRSPRR
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto_nucl 13.5, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019339  CIR_N_dom  
IPR022209  CWC25  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006397  P:mRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF10197  Cir_N  
PF12542  CWC25  
Amino Acid Sequences MGGGDLNMKKSWHPLLLKNQERVWLEEKKALEEKKKLDQLRKEKEEERQLQELQRLQEEQTGKKRTEKLEWMYATPATGSSSNANDLEDYLLGKKRVDKILTADDNAKVGASHKNFIAIQNANNARDVAAKIREDPLFAIKQQEQAALQAVMNNPLRLRALQEQAGIKPKKDKKKEKEERKRLKHEEKERRRRKRHSDSRSPERHRSHRSRSRSPRPSRRDDDSPRRYRDDLSHRRSRSPVRDDSRRHSYPSRLPRSYDKASDQSSSPDPPTNGDRGKRPRSRSRSPRRDDAYSKRSRADYSPPRTTHERPSNDTRPSQPAANDRAARLAAMQSNASSMTVDRRERLALLLQKEKAELEEDERARRESKGMSSYLNYEQKRVFGGKGGLEDRIRRGRGGMVVDAD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.41
2 0.51
3 0.61
4 0.67
5 0.67
6 0.64
7 0.63
8 0.6
9 0.57
10 0.52
11 0.49
12 0.45
13 0.44
14 0.43
15 0.43
16 0.48
17 0.49
18 0.51
19 0.52
20 0.54
21 0.59
22 0.66
23 0.67
24 0.69
25 0.73
26 0.76
27 0.79
28 0.8
29 0.77
30 0.74
31 0.76
32 0.77
33 0.75
34 0.71
35 0.66
36 0.62
37 0.6
38 0.61
39 0.56
40 0.48
41 0.44
42 0.39
43 0.33
44 0.35
45 0.35
46 0.36
47 0.41
48 0.44
49 0.42
50 0.48
51 0.54
52 0.53
53 0.57
54 0.59
55 0.56
56 0.59
57 0.6
58 0.54
59 0.5
60 0.45
61 0.37
62 0.28
63 0.22
64 0.15
65 0.13
66 0.13
67 0.13
68 0.14
69 0.17
70 0.17
71 0.16
72 0.14
73 0.14
74 0.14
75 0.11
76 0.11
77 0.11
78 0.15
79 0.15
80 0.17
81 0.21
82 0.26
83 0.32
84 0.33
85 0.32
86 0.34
87 0.43
88 0.44
89 0.41
90 0.38
91 0.32
92 0.31
93 0.28
94 0.23
95 0.13
96 0.12
97 0.17
98 0.17
99 0.18
100 0.17
101 0.21
102 0.22
103 0.23
104 0.27
105 0.22
106 0.21
107 0.28
108 0.31
109 0.28
110 0.28
111 0.27
112 0.21
113 0.21
114 0.21
115 0.16
116 0.18
117 0.18
118 0.18
119 0.23
120 0.22
121 0.21
122 0.21
123 0.22
124 0.19
125 0.19
126 0.22
127 0.19
128 0.23
129 0.23
130 0.23
131 0.19
132 0.18
133 0.19
134 0.15
135 0.14
136 0.12
137 0.12
138 0.16
139 0.16
140 0.16
141 0.14
142 0.14
143 0.15
144 0.13
145 0.17
146 0.16
147 0.18
148 0.2
149 0.23
150 0.23
151 0.25
152 0.34
153 0.31
154 0.27
155 0.33
156 0.39
157 0.47
158 0.55
159 0.64
160 0.64
161 0.75
162 0.85
163 0.87
164 0.91
165 0.93
166 0.93
167 0.92
168 0.93
169 0.91
170 0.9
171 0.88
172 0.88
173 0.88
174 0.88
175 0.89
176 0.9
177 0.91
178 0.9
179 0.91
180 0.91
181 0.91
182 0.9
183 0.89
184 0.9
185 0.87
186 0.88
187 0.89
188 0.84
189 0.82
190 0.78
191 0.77
192 0.75
193 0.74
194 0.75
195 0.73
196 0.75
197 0.77
198 0.81
199 0.83
200 0.84
201 0.86
202 0.86
203 0.84
204 0.85
205 0.8
206 0.76
207 0.75
208 0.73
209 0.74
210 0.74
211 0.75
212 0.7
213 0.68
214 0.63
215 0.56
216 0.54
217 0.55
218 0.55
219 0.54
220 0.59
221 0.57
222 0.59
223 0.61
224 0.61
225 0.59
226 0.56
227 0.57
228 0.55
229 0.63
230 0.65
231 0.67
232 0.68
233 0.61
234 0.58
235 0.53
236 0.52
237 0.52
238 0.58
239 0.6
240 0.53
241 0.54
242 0.57
243 0.6
244 0.58
245 0.53
246 0.47
247 0.43
248 0.44
249 0.42
250 0.36
251 0.32
252 0.3
253 0.28
254 0.25
255 0.24
256 0.22
257 0.23
258 0.25
259 0.28
260 0.3
261 0.3
262 0.37
263 0.43
264 0.53
265 0.58
266 0.63
267 0.68
268 0.71
269 0.79
270 0.82
271 0.84
272 0.85
273 0.84
274 0.86
275 0.81
276 0.8
277 0.77
278 0.76
279 0.75
280 0.73
281 0.69
282 0.63
283 0.59
284 0.54
285 0.5
286 0.5
287 0.5
288 0.5
289 0.56
290 0.54
291 0.58
292 0.62
293 0.62
294 0.62
295 0.61
296 0.59
297 0.56
298 0.64
299 0.66
300 0.65
301 0.65
302 0.59
303 0.55
304 0.52
305 0.48
306 0.43
307 0.43
308 0.43
309 0.47
310 0.44
311 0.38
312 0.39
313 0.36
314 0.31
315 0.25
316 0.23
317 0.18
318 0.17
319 0.17
320 0.14
321 0.15
322 0.15
323 0.14
324 0.11
325 0.09
326 0.15
327 0.21
328 0.23
329 0.24
330 0.26
331 0.27
332 0.27
333 0.29
334 0.3
335 0.29
336 0.33
337 0.39
338 0.39
339 0.38
340 0.39
341 0.36
342 0.3
343 0.27
344 0.22
345 0.2
346 0.27
347 0.29
348 0.34
349 0.35
350 0.37
351 0.35
352 0.35
353 0.34
354 0.3
355 0.34
356 0.35
357 0.35
358 0.36
359 0.37
360 0.4
361 0.45
362 0.49
363 0.43
364 0.41
365 0.4
366 0.38
367 0.41
368 0.39
369 0.31
370 0.28
371 0.32
372 0.3
373 0.36
374 0.35
375 0.36
376 0.37
377 0.4
378 0.41
379 0.46
380 0.45
381 0.39
382 0.39
383 0.38
384 0.4
385 0.41