Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C3KMP6

Protein Details
Accession A0A5C3KMP6    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
26-64GYERDKDRDRERDRDRDRERDFDRERRDRDRDRDRDFDRAcidic
NLS Segment(s)
PositionSequence
51-52RR
412-438NPPRGGLRGFGGRGFGRGGGFGGGRGG
Subcellular Location(s) mito 7cyto_nucl 7, nucl 6.5, cyto 6.5, plas 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MDVDMKNKLDDGILPPASNGRDRDRGYERDKDRDRERDRDRDRERDFDRERRDRDRDRDRDFDRERRDLGPLQGRPRPRIGDHWEPERRNGEVASQAFSQPFALTLQASQRFSSRDRRGGGPGGFANDSFARSLGGPMNASIEEAAEFAKVSKRENRVYVGNLSYDVKYRDLMEFMRGVIIALDSHGRRGPPFALRWHRRKQAGMGCGEDIDGTFLLGLAAGEVLFAEVLVTPTGISKGCGIVEFASQEDAQRSIRELSEQALLGRPVFIREDRENEARFGATPVPGKIGMAMAGQGLHAAPPPRPPSHNYFGSGSNPGNQLYVGNLPYQAGWQDLKDLFRAAGSIVRADINIGVDGRPKGSGTVVFETSKDALQAVSMYHGFEWYGRILEVREDRYAGLTGPGFRGGLRGNPPRGGLRGFGGRGFGRGGGFGGGRGGGGGGGGGFGGGAGAGAGPGGAAGRDFGQDIYADYSGPESAAAAAAAGGPPPSGGSGGGAGFKMDPYFAPFGPNYVEPEPSQQIMVRNLPWSTANEDLVELFETTGQVELAEILFDGTRSKGCGVVQFGQVAEAETAIAKFQSYMYGGRPLDVRFNDRWHTFSPSAAKGGQIVPMQADA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.25
3 0.29
4 0.3
5 0.32
6 0.31
7 0.29
8 0.37
9 0.39
10 0.46
11 0.49
12 0.55
13 0.56
14 0.62
15 0.61
16 0.63
17 0.69
18 0.69
19 0.71
20 0.74
21 0.75
22 0.75
23 0.78
24 0.79
25 0.79
26 0.81
27 0.8
28 0.8
29 0.78
30 0.77
31 0.72
32 0.72
33 0.72
34 0.71
35 0.73
36 0.73
37 0.74
38 0.74
39 0.79
40 0.78
41 0.81
42 0.83
43 0.82
44 0.79
45 0.82
46 0.77
47 0.78
48 0.76
49 0.75
50 0.72
51 0.68
52 0.64
53 0.57
54 0.58
55 0.52
56 0.52
57 0.53
58 0.5
59 0.52
60 0.54
61 0.57
62 0.56
63 0.58
64 0.55
65 0.48
66 0.51
67 0.52
68 0.57
69 0.58
70 0.64
71 0.67
72 0.63
73 0.66
74 0.61
75 0.54
76 0.45
77 0.4
78 0.33
79 0.31
80 0.3
81 0.28
82 0.25
83 0.25
84 0.23
85 0.23
86 0.21
87 0.13
88 0.13
89 0.1
90 0.1
91 0.09
92 0.1
93 0.18
94 0.23
95 0.24
96 0.24
97 0.26
98 0.28
99 0.31
100 0.4
101 0.4
102 0.42
103 0.44
104 0.47
105 0.49
106 0.53
107 0.5
108 0.44
109 0.38
110 0.34
111 0.31
112 0.27
113 0.26
114 0.19
115 0.19
116 0.15
117 0.13
118 0.11
119 0.11
120 0.13
121 0.13
122 0.14
123 0.13
124 0.13
125 0.15
126 0.14
127 0.14
128 0.11
129 0.09
130 0.07
131 0.07
132 0.07
133 0.05
134 0.05
135 0.06
136 0.11
137 0.12
138 0.15
139 0.23
140 0.29
141 0.34
142 0.37
143 0.41
144 0.4
145 0.42
146 0.43
147 0.37
148 0.31
149 0.28
150 0.27
151 0.23
152 0.22
153 0.2
154 0.16
155 0.16
156 0.17
157 0.16
158 0.16
159 0.16
160 0.16
161 0.15
162 0.14
163 0.14
164 0.12
165 0.11
166 0.09
167 0.08
168 0.06
169 0.06
170 0.09
171 0.08
172 0.1
173 0.12
174 0.12
175 0.12
176 0.15
177 0.17
178 0.19
179 0.22
180 0.3
181 0.39
182 0.47
183 0.56
184 0.62
185 0.66
186 0.65
187 0.64
188 0.64
189 0.61
190 0.58
191 0.52
192 0.45
193 0.38
194 0.34
195 0.32
196 0.23
197 0.15
198 0.1
199 0.07
200 0.05
201 0.04
202 0.04
203 0.04
204 0.04
205 0.04
206 0.02
207 0.02
208 0.02
209 0.02
210 0.02
211 0.02
212 0.02
213 0.02
214 0.02
215 0.02
216 0.03
217 0.03
218 0.04
219 0.04
220 0.04
221 0.05
222 0.05
223 0.06
224 0.06
225 0.07
226 0.07
227 0.07
228 0.08
229 0.08
230 0.08
231 0.08
232 0.08
233 0.09
234 0.08
235 0.09
236 0.09
237 0.09
238 0.09
239 0.09
240 0.11
241 0.11
242 0.11
243 0.12
244 0.11
245 0.12
246 0.13
247 0.13
248 0.12
249 0.12
250 0.12
251 0.11
252 0.11
253 0.09
254 0.08
255 0.1
256 0.1
257 0.14
258 0.15
259 0.19
260 0.23
261 0.27
262 0.27
263 0.26
264 0.26
265 0.21
266 0.2
267 0.17
268 0.14
269 0.11
270 0.12
271 0.11
272 0.12
273 0.12
274 0.12
275 0.1
276 0.09
277 0.08
278 0.06
279 0.06
280 0.04
281 0.04
282 0.04
283 0.04
284 0.04
285 0.03
286 0.05
287 0.05
288 0.06
289 0.11
290 0.15
291 0.16
292 0.18
293 0.22
294 0.28
295 0.33
296 0.35
297 0.32
298 0.3
299 0.3
300 0.3
301 0.3
302 0.23
303 0.2
304 0.18
305 0.16
306 0.14
307 0.12
308 0.1
309 0.09
310 0.1
311 0.09
312 0.08
313 0.08
314 0.08
315 0.08
316 0.08
317 0.07
318 0.07
319 0.07
320 0.06
321 0.1
322 0.11
323 0.12
324 0.12
325 0.12
326 0.1
327 0.1
328 0.1
329 0.07
330 0.08
331 0.08
332 0.07
333 0.07
334 0.08
335 0.08
336 0.08
337 0.08
338 0.06
339 0.06
340 0.06
341 0.06
342 0.08
343 0.08
344 0.09
345 0.08
346 0.08
347 0.08
348 0.09
349 0.1
350 0.12
351 0.14
352 0.16
353 0.16
354 0.16
355 0.18
356 0.18
357 0.16
358 0.12
359 0.09
360 0.07
361 0.07
362 0.07
363 0.05
364 0.07
365 0.07
366 0.07
367 0.07
368 0.07
369 0.07
370 0.07
371 0.08
372 0.07
373 0.07
374 0.07
375 0.07
376 0.08
377 0.12
378 0.15
379 0.16
380 0.17
381 0.17
382 0.17
383 0.18
384 0.18
385 0.14
386 0.12
387 0.1
388 0.11
389 0.11
390 0.11
391 0.1
392 0.09
393 0.11
394 0.1
395 0.13
396 0.2
397 0.25
398 0.27
399 0.29
400 0.3
401 0.3
402 0.32
403 0.28
404 0.22
405 0.19
406 0.21
407 0.2
408 0.19
409 0.2
410 0.18
411 0.17
412 0.17
413 0.15
414 0.11
415 0.1
416 0.1
417 0.09
418 0.09
419 0.07
420 0.07
421 0.06
422 0.06
423 0.05
424 0.05
425 0.03
426 0.03
427 0.03
428 0.02
429 0.02
430 0.02
431 0.02
432 0.02
433 0.02
434 0.02
435 0.02
436 0.02
437 0.02
438 0.02
439 0.02
440 0.02
441 0.02
442 0.02
443 0.02
444 0.02
445 0.02
446 0.02
447 0.03
448 0.04
449 0.05
450 0.05
451 0.06
452 0.06
453 0.07
454 0.08
455 0.1
456 0.1
457 0.09
458 0.09
459 0.1
460 0.09
461 0.09
462 0.08
463 0.05
464 0.05
465 0.05
466 0.05
467 0.04
468 0.04
469 0.04
470 0.04
471 0.04
472 0.04
473 0.04
474 0.04
475 0.04
476 0.05
477 0.05
478 0.05
479 0.06
480 0.07
481 0.08
482 0.09
483 0.08
484 0.08
485 0.08
486 0.08
487 0.08
488 0.07
489 0.07
490 0.11
491 0.14
492 0.14
493 0.17
494 0.17
495 0.18
496 0.21
497 0.22
498 0.23
499 0.21
500 0.23
501 0.2
502 0.26
503 0.27
504 0.25
505 0.25
506 0.22
507 0.25
508 0.27
509 0.3
510 0.26
511 0.27
512 0.26
513 0.27
514 0.26
515 0.24
516 0.24
517 0.23
518 0.22
519 0.2
520 0.2
521 0.19
522 0.18
523 0.16
524 0.12
525 0.09
526 0.09
527 0.08
528 0.08
529 0.08
530 0.07
531 0.06
532 0.05
533 0.06
534 0.06
535 0.05
536 0.05
537 0.05
538 0.05
539 0.06
540 0.07
541 0.07
542 0.08
543 0.1
544 0.11
545 0.14
546 0.15
547 0.2
548 0.25
549 0.28
550 0.3
551 0.29
552 0.28
553 0.26
554 0.25
555 0.21
556 0.15
557 0.11
558 0.09
559 0.08
560 0.08
561 0.08
562 0.08
563 0.06
564 0.07
565 0.07
566 0.1
567 0.11
568 0.14
569 0.16
570 0.25
571 0.25
572 0.26
573 0.29
574 0.27
575 0.34
576 0.35
577 0.38
578 0.34
579 0.4
580 0.45
581 0.44
582 0.47
583 0.41
584 0.46
585 0.41
586 0.43
587 0.44
588 0.4
589 0.42
590 0.38
591 0.36
592 0.3
593 0.3
594 0.3
595 0.25
596 0.22