Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C3L8B4

Protein Details
Accession A0A5C3L8B4    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
432-456SEDADGQPKKKKKKEGPGVTARNMSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
439-447PKKKKKKEG
Subcellular Location(s) mito 9.5, nucl 9, cyto_mito 7.5, cyto 4.5, plas 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009072  Histone-fold  
IPR045144  TAF4  
IPR007900  TAF4_C  
Gene Ontology GO:0005669  C:transcription factor TFIID complex  
GO:0046982  F:protein heterodimerization activity  
GO:0006352  P:DNA-templated transcription initiation  
Pfam View protein in Pfam  
PF05236  TAF4  
CDD cd08045  TAF4  
Amino Acid Sequences MPPKDQATSMTTPITPVSTTTGTPVQMTAATTITAGTPVPTYPSPAHAQWAATGQIPIDPALQQQSTPQTPQNAAATTVAAPKPTHTTITPATATSAQAAAVQAYYSAFTQHYPHNYAQHYQQYMAAAISQAAQAQHSQQHTPAHSNAQAHTPTPIATPHRTSFSTATPTATTASTPVPTSHTPTATNIITPATATTITPATATTAMGSTAANNANQLDTSDVATLNDALGVAGVDLRAEEESLQRHDTHNTGYMQHGSLYMQNRPYEDRSRKQPIKPAFDARALGTTMRAIGTQHKVTKVPEDSVNYLALAVRARLQDLVTAMIKASKYRKESQYDRPVSFYETIANGGDGMDIDGIKREHDTQTPMWSVIVRNNIAKQLLVLERVEREEEMKIRKERKERSEMAAAHNAVLQAQAAGANGSDALAAAGGSEDADGQPKKKKKKEGPGVTARNMSEDVRKKMSNAVATQAAGLGKYAWMTAANANSATPSKKAGTPAAGSSGGASGGGTWARPYVPKKTTQPIAGVTSTTSTTESQKSETEDNGRVVVTLRDAMFVVEKERGHGGGRGSARGWT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.26
2 0.19
3 0.16
4 0.19
5 0.18
6 0.18
7 0.21
8 0.23
9 0.23
10 0.23
11 0.22
12 0.18
13 0.17
14 0.18
15 0.15
16 0.13
17 0.12
18 0.11
19 0.11
20 0.1
21 0.09
22 0.08
23 0.08
24 0.08
25 0.08
26 0.13
27 0.13
28 0.18
29 0.18
30 0.23
31 0.27
32 0.27
33 0.31
34 0.28
35 0.28
36 0.25
37 0.27
38 0.24
39 0.2
40 0.2
41 0.15
42 0.15
43 0.15
44 0.14
45 0.12
46 0.11
47 0.12
48 0.16
49 0.16
50 0.15
51 0.18
52 0.25
53 0.27
54 0.3
55 0.32
56 0.32
57 0.33
58 0.37
59 0.37
60 0.3
61 0.29
62 0.26
63 0.24
64 0.2
65 0.25
66 0.22
67 0.2
68 0.19
69 0.19
70 0.25
71 0.25
72 0.27
73 0.21
74 0.26
75 0.27
76 0.32
77 0.31
78 0.26
79 0.26
80 0.25
81 0.24
82 0.2
83 0.17
84 0.12
85 0.12
86 0.12
87 0.1
88 0.08
89 0.08
90 0.07
91 0.07
92 0.07
93 0.06
94 0.08
95 0.08
96 0.09
97 0.12
98 0.17
99 0.22
100 0.26
101 0.29
102 0.34
103 0.36
104 0.37
105 0.4
106 0.43
107 0.39
108 0.35
109 0.35
110 0.29
111 0.27
112 0.25
113 0.19
114 0.11
115 0.1
116 0.09
117 0.08
118 0.08
119 0.07
120 0.08
121 0.08
122 0.11
123 0.15
124 0.17
125 0.18
126 0.2
127 0.25
128 0.27
129 0.3
130 0.3
131 0.3
132 0.31
133 0.32
134 0.3
135 0.3
136 0.29
137 0.25
138 0.24
139 0.2
140 0.17
141 0.16
142 0.19
143 0.19
144 0.21
145 0.26
146 0.27
147 0.3
148 0.31
149 0.33
150 0.31
151 0.3
152 0.32
153 0.28
154 0.28
155 0.24
156 0.24
157 0.22
158 0.2
159 0.16
160 0.12
161 0.12
162 0.11
163 0.12
164 0.12
165 0.15
166 0.16
167 0.21
168 0.23
169 0.23
170 0.23
171 0.24
172 0.28
173 0.24
174 0.23
175 0.17
176 0.15
177 0.13
178 0.12
179 0.1
180 0.07
181 0.07
182 0.07
183 0.07
184 0.07
185 0.08
186 0.08
187 0.07
188 0.08
189 0.08
190 0.08
191 0.07
192 0.07
193 0.07
194 0.07
195 0.07
196 0.05
197 0.08
198 0.09
199 0.09
200 0.09
201 0.09
202 0.09
203 0.09
204 0.09
205 0.07
206 0.06
207 0.08
208 0.08
209 0.08
210 0.07
211 0.08
212 0.07
213 0.06
214 0.06
215 0.04
216 0.03
217 0.03
218 0.03
219 0.03
220 0.03
221 0.03
222 0.02
223 0.02
224 0.03
225 0.03
226 0.03
227 0.04
228 0.06
229 0.08
230 0.1
231 0.12
232 0.12
233 0.13
234 0.15
235 0.15
236 0.15
237 0.18
238 0.17
239 0.17
240 0.17
241 0.17
242 0.16
243 0.15
244 0.14
245 0.1
246 0.13
247 0.14
248 0.15
249 0.17
250 0.18
251 0.18
252 0.21
253 0.25
254 0.3
255 0.35
256 0.37
257 0.42
258 0.51
259 0.57
260 0.57
261 0.61
262 0.59
263 0.6
264 0.59
265 0.57
266 0.5
267 0.45
268 0.43
269 0.36
270 0.3
271 0.22
272 0.18
273 0.13
274 0.1
275 0.08
276 0.07
277 0.07
278 0.05
279 0.09
280 0.13
281 0.16
282 0.18
283 0.2
284 0.21
285 0.21
286 0.26
287 0.24
288 0.22
289 0.22
290 0.23
291 0.23
292 0.23
293 0.23
294 0.17
295 0.15
296 0.13
297 0.11
298 0.08
299 0.07
300 0.08
301 0.08
302 0.08
303 0.09
304 0.09
305 0.09
306 0.09
307 0.11
308 0.09
309 0.09
310 0.08
311 0.1
312 0.1
313 0.11
314 0.16
315 0.19
316 0.24
317 0.3
318 0.36
319 0.42
320 0.48
321 0.55
322 0.62
323 0.62
324 0.58
325 0.54
326 0.49
327 0.45
328 0.4
329 0.3
330 0.21
331 0.15
332 0.15
333 0.13
334 0.12
335 0.09
336 0.07
337 0.07
338 0.05
339 0.05
340 0.04
341 0.04
342 0.04
343 0.06
344 0.06
345 0.07
346 0.08
347 0.1
348 0.12
349 0.14
350 0.19
351 0.18
352 0.23
353 0.24
354 0.23
355 0.21
356 0.2
357 0.19
358 0.18
359 0.22
360 0.18
361 0.19
362 0.2
363 0.22
364 0.21
365 0.2
366 0.16
367 0.15
368 0.15
369 0.15
370 0.14
371 0.14
372 0.14
373 0.16
374 0.16
375 0.12
376 0.13
377 0.14
378 0.18
379 0.22
380 0.28
381 0.33
382 0.4
383 0.46
384 0.54
385 0.6
386 0.64
387 0.68
388 0.66
389 0.65
390 0.66
391 0.62
392 0.58
393 0.56
394 0.47
395 0.38
396 0.35
397 0.29
398 0.2
399 0.18
400 0.12
401 0.05
402 0.05
403 0.05
404 0.04
405 0.04
406 0.04
407 0.04
408 0.04
409 0.04
410 0.04
411 0.03
412 0.03
413 0.03
414 0.03
415 0.03
416 0.03
417 0.03
418 0.03
419 0.03
420 0.03
421 0.04
422 0.09
423 0.1
424 0.13
425 0.22
426 0.29
427 0.4
428 0.47
429 0.58
430 0.63
431 0.74
432 0.82
433 0.85
434 0.87
435 0.88
436 0.87
437 0.81
438 0.75
439 0.64
440 0.55
441 0.46
442 0.37
443 0.35
444 0.35
445 0.36
446 0.37
447 0.37
448 0.36
449 0.41
450 0.45
451 0.42
452 0.36
453 0.35
454 0.32
455 0.31
456 0.3
457 0.25
458 0.2
459 0.14
460 0.13
461 0.09
462 0.07
463 0.07
464 0.07
465 0.06
466 0.06
467 0.08
468 0.11
469 0.12
470 0.13
471 0.13
472 0.13
473 0.15
474 0.16
475 0.17
476 0.15
477 0.17
478 0.18
479 0.21
480 0.25
481 0.27
482 0.3
483 0.31
484 0.31
485 0.32
486 0.3
487 0.27
488 0.24
489 0.2
490 0.15
491 0.12
492 0.1
493 0.05
494 0.07
495 0.07
496 0.07
497 0.07
498 0.08
499 0.09
500 0.15
501 0.19
502 0.27
503 0.31
504 0.39
505 0.46
506 0.54
507 0.59
508 0.57
509 0.58
510 0.53
511 0.54
512 0.46
513 0.4
514 0.32
515 0.27
516 0.24
517 0.21
518 0.18
519 0.15
520 0.18
521 0.22
522 0.23
523 0.24
524 0.26
525 0.3
526 0.32
527 0.35
528 0.37
529 0.37
530 0.37
531 0.35
532 0.32
533 0.28
534 0.26
535 0.22
536 0.18
537 0.18
538 0.16
539 0.16
540 0.16
541 0.17
542 0.18
543 0.17
544 0.18
545 0.19
546 0.19
547 0.2
548 0.22
549 0.23
550 0.22
551 0.25
552 0.24
553 0.27
554 0.29
555 0.3