Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5FQ57

Protein Details
Accession C5FQ57    Localization Confidence High Confidence Score 16.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
8-31SIPTSHDPRSKRPVKRRALTPLSEHydrophilic
115-150EEARRRDEEKTERNRRKREKRKKGKGKKGKSGGEEGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
112-145KAREEARRRDEEKTERNRRKREKRKKGKGKKGKS
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 13
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009548  Prkrip1  
Gene Ontology GO:0003725  F:double-stranded RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF06658  DUF1168  
Amino Acid Sequences MSEPIPESIPTSHDPRSKRPVKRRALTPLSEQANEIKTLFKDPSKEIRLPEPSKPKTLAPPPEIIANVQGSSAGAGSGEFHVYKASRRREYERIKLMEEELKKEKDEEEFNKAREEARRRDEEKTERNRRKREKRKKGKGKKGKSGGEEGGDDNAGDLGVVDNGVAKGSSTDQGIKADGHENGEVPGVIIHDED
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.38
2 0.44
3 0.53
4 0.59
5 0.66
6 0.72
7 0.75
8 0.8
9 0.85
10 0.85
11 0.85
12 0.83
13 0.77
14 0.73
15 0.71
16 0.65
17 0.56
18 0.49
19 0.42
20 0.36
21 0.33
22 0.26
23 0.21
24 0.17
25 0.2
26 0.22
27 0.2
28 0.22
29 0.26
30 0.35
31 0.38
32 0.4
33 0.39
34 0.44
35 0.51
36 0.51
37 0.54
38 0.55
39 0.53
40 0.54
41 0.54
42 0.48
43 0.47
44 0.52
45 0.52
46 0.45
47 0.45
48 0.41
49 0.42
50 0.39
51 0.32
52 0.25
53 0.18
54 0.15
55 0.11
56 0.1
57 0.07
58 0.07
59 0.07
60 0.04
61 0.03
62 0.03
63 0.04
64 0.04
65 0.05
66 0.05
67 0.05
68 0.07
69 0.07
70 0.12
71 0.19
72 0.26
73 0.31
74 0.35
75 0.41
76 0.5
77 0.57
78 0.6
79 0.61
80 0.56
81 0.51
82 0.48
83 0.44
84 0.39
85 0.33
86 0.29
87 0.25
88 0.23
89 0.22
90 0.22
91 0.21
92 0.19
93 0.24
94 0.23
95 0.27
96 0.29
97 0.3
98 0.31
99 0.3
100 0.29
101 0.31
102 0.34
103 0.33
104 0.36
105 0.43
106 0.44
107 0.48
108 0.54
109 0.55
110 0.59
111 0.63
112 0.68
113 0.7
114 0.77
115 0.83
116 0.86
117 0.89
118 0.9
119 0.91
120 0.92
121 0.93
122 0.95
123 0.96
124 0.97
125 0.97
126 0.96
127 0.95
128 0.94
129 0.92
130 0.88
131 0.8
132 0.76
133 0.67
134 0.58
135 0.49
136 0.39
137 0.31
138 0.24
139 0.19
140 0.13
141 0.1
142 0.07
143 0.05
144 0.05
145 0.04
146 0.04
147 0.04
148 0.03
149 0.04
150 0.05
151 0.05
152 0.05
153 0.05
154 0.06
155 0.08
156 0.1
157 0.11
158 0.14
159 0.15
160 0.17
161 0.18
162 0.18
163 0.18
164 0.21
165 0.2
166 0.21
167 0.2
168 0.19
169 0.18
170 0.19
171 0.16
172 0.12
173 0.12
174 0.09