Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C3KPP6

Protein Details
Accession A0A5C3KPP6    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
49-70LSEYRGRKRKEFEERIRRTRGSBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
55-60RKRKEF
63-63R
Subcellular Location(s) nucl 12, cyto 10.5, cyto_mito 8, mito 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003107  HAT  
IPR045075  Syf1-like  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
IPR019734  TPR_repeat  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF02184  HAT  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50005  TPR  
Amino Acid Sequences MQDGRAPRIKNRAPAAIQITAEQLLREAQERQETAFRAPKQRVEDFEELSEYRGRKRKEFEERIRRTRGSIKEWLQYANWEASQNEFDRSRSVFERALDVDPRSIQLWLSYTEMELKNRNVQHARNLFDRAVTLLPRVDQLWYKYVYLEELLQNIPGARQVFERWMEWEPEDKAWQAYIKLEERYQEYDRASTIYERWIAIRPEPRVWVKWAKFEEDRGRLDKAREVFQTALEFFGDEEEQVEKAQAVFGAFAKMETRQKEFERARVIYKFALDRIPRSKSAGLYASYTKFEKQHGTRNTLESTVLGKRRIQYEEELSHDGRNYDVWFDYSRLEEDAYRDLRDEGATTEELETAAGRVREVYERAVSQVPPGGEKRHWRRYIFLWLNYALFEEIESKDYTRAREIYQTAVKLVPHKQFTFAKLWLMFAKFELRRLELPAARKILGAAIGMCPKEALFKGYIDMEIELREFDRVRTLYEKYLEFDPSNSPAWIKFAELEAQLQDFSRARAIFELGVSQSPLSMPEVLWKAYIDFEVEEGEREAARALYERLIALSGHVKVWISYATFEAEPIPVPRSEREEEEDEEEEGERKLAPGDPTLARGVFERAYRDLKSKGLQHERVALLEVWKTFEQTHGSDESLKKVEGMFPTVGKKRHLDQETGQMVEDWELVFPDDERENNPASFKFLQMAQAWRQKKLDVSKLALDSDDSDDDDEPADNSNGKQRAAQQDDDSDDSSSGEN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.62
2 0.61
3 0.55
4 0.5
5 0.42
6 0.39
7 0.31
8 0.29
9 0.21
10 0.16
11 0.13
12 0.14
13 0.15
14 0.16
15 0.18
16 0.25
17 0.26
18 0.29
19 0.33
20 0.34
21 0.38
22 0.44
23 0.46
24 0.47
25 0.51
26 0.54
27 0.56
28 0.6
29 0.58
30 0.58
31 0.58
32 0.52
33 0.49
34 0.46
35 0.39
36 0.36
37 0.36
38 0.29
39 0.32
40 0.37
41 0.39
42 0.42
43 0.5
44 0.58
45 0.64
46 0.74
47 0.76
48 0.8
49 0.86
50 0.87
51 0.88
52 0.79
53 0.72
54 0.7
55 0.67
56 0.63
57 0.63
58 0.6
59 0.58
60 0.59
61 0.56
62 0.48
63 0.43
64 0.39
65 0.33
66 0.29
67 0.24
68 0.23
69 0.23
70 0.27
71 0.25
72 0.26
73 0.24
74 0.23
75 0.25
76 0.26
77 0.28
78 0.26
79 0.29
80 0.28
81 0.27
82 0.32
83 0.31
84 0.33
85 0.32
86 0.31
87 0.29
88 0.26
89 0.27
90 0.23
91 0.2
92 0.16
93 0.15
94 0.15
95 0.14
96 0.16
97 0.15
98 0.14
99 0.21
100 0.23
101 0.25
102 0.27
103 0.28
104 0.34
105 0.36
106 0.43
107 0.41
108 0.42
109 0.49
110 0.51
111 0.51
112 0.48
113 0.5
114 0.42
115 0.37
116 0.35
117 0.27
118 0.23
119 0.2
120 0.18
121 0.15
122 0.15
123 0.16
124 0.16
125 0.16
126 0.17
127 0.19
128 0.22
129 0.23
130 0.23
131 0.22
132 0.22
133 0.21
134 0.19
135 0.18
136 0.15
137 0.15
138 0.15
139 0.14
140 0.14
141 0.13
142 0.12
143 0.13
144 0.12
145 0.11
146 0.12
147 0.14
148 0.18
149 0.2
150 0.21
151 0.21
152 0.22
153 0.24
154 0.23
155 0.26
156 0.24
157 0.24
158 0.25
159 0.22
160 0.2
161 0.19
162 0.2
163 0.16
164 0.17
165 0.2
166 0.22
167 0.23
168 0.24
169 0.25
170 0.27
171 0.32
172 0.31
173 0.31
174 0.28
175 0.27
176 0.27
177 0.25
178 0.23
179 0.19
180 0.18
181 0.17
182 0.17
183 0.17
184 0.18
185 0.22
186 0.22
187 0.26
188 0.31
189 0.31
190 0.32
191 0.37
192 0.38
193 0.36
194 0.4
195 0.44
196 0.4
197 0.45
198 0.44
199 0.45
200 0.43
201 0.48
202 0.51
203 0.47
204 0.49
205 0.44
206 0.46
207 0.43
208 0.42
209 0.4
210 0.34
211 0.32
212 0.29
213 0.3
214 0.27
215 0.26
216 0.27
217 0.22
218 0.2
219 0.15
220 0.14
221 0.1
222 0.11
223 0.09
224 0.06
225 0.07
226 0.07
227 0.07
228 0.07
229 0.07
230 0.06
231 0.06
232 0.07
233 0.06
234 0.05
235 0.06
236 0.06
237 0.08
238 0.07
239 0.08
240 0.08
241 0.11
242 0.16
243 0.17
244 0.2
245 0.24
246 0.25
247 0.35
248 0.36
249 0.39
250 0.41
251 0.41
252 0.42
253 0.39
254 0.4
255 0.31
256 0.32
257 0.27
258 0.21
259 0.26
260 0.22
261 0.25
262 0.29
263 0.32
264 0.3
265 0.33
266 0.34
267 0.28
268 0.31
269 0.29
270 0.24
271 0.23
272 0.25
273 0.22
274 0.22
275 0.22
276 0.2
277 0.19
278 0.2
279 0.25
280 0.25
281 0.33
282 0.37
283 0.42
284 0.42
285 0.44
286 0.43
287 0.36
288 0.32
289 0.24
290 0.22
291 0.21
292 0.22
293 0.2
294 0.21
295 0.22
296 0.26
297 0.27
298 0.26
299 0.24
300 0.28
301 0.29
302 0.3
303 0.31
304 0.28
305 0.26
306 0.25
307 0.21
308 0.15
309 0.14
310 0.11
311 0.09
312 0.08
313 0.09
314 0.09
315 0.1
316 0.11
317 0.11
318 0.11
319 0.1
320 0.11
321 0.1
322 0.11
323 0.15
324 0.15
325 0.15
326 0.14
327 0.14
328 0.14
329 0.13
330 0.12
331 0.08
332 0.09
333 0.08
334 0.08
335 0.09
336 0.08
337 0.08
338 0.07
339 0.07
340 0.05
341 0.06
342 0.06
343 0.05
344 0.05
345 0.07
346 0.08
347 0.09
348 0.1
349 0.1
350 0.1
351 0.12
352 0.14
353 0.13
354 0.12
355 0.13
356 0.12
357 0.12
358 0.14
359 0.14
360 0.15
361 0.24
362 0.32
363 0.4
364 0.45
365 0.43
366 0.45
367 0.47
368 0.55
369 0.51
370 0.45
371 0.38
372 0.33
373 0.32
374 0.29
375 0.26
376 0.15
377 0.09
378 0.08
379 0.07
380 0.07
381 0.08
382 0.09
383 0.09
384 0.12
385 0.13
386 0.14
387 0.15
388 0.16
389 0.16
390 0.21
391 0.21
392 0.23
393 0.25
394 0.24
395 0.22
396 0.22
397 0.21
398 0.2
399 0.25
400 0.25
401 0.26
402 0.26
403 0.29
404 0.3
405 0.33
406 0.34
407 0.29
408 0.27
409 0.24
410 0.25
411 0.22
412 0.21
413 0.18
414 0.14
415 0.21
416 0.17
417 0.21
418 0.22
419 0.22
420 0.22
421 0.25
422 0.29
423 0.25
424 0.28
425 0.29
426 0.29
427 0.27
428 0.26
429 0.23
430 0.19
431 0.16
432 0.13
433 0.09
434 0.08
435 0.11
436 0.11
437 0.1
438 0.1
439 0.09
440 0.11
441 0.1
442 0.11
443 0.09
444 0.1
445 0.11
446 0.12
447 0.12
448 0.1
449 0.11
450 0.09
451 0.08
452 0.08
453 0.07
454 0.06
455 0.08
456 0.07
457 0.07
458 0.12
459 0.12
460 0.14
461 0.18
462 0.2
463 0.22
464 0.25
465 0.26
466 0.22
467 0.24
468 0.25
469 0.21
470 0.21
471 0.19
472 0.19
473 0.2
474 0.18
475 0.16
476 0.14
477 0.16
478 0.15
479 0.13
480 0.11
481 0.1
482 0.13
483 0.13
484 0.14
485 0.12
486 0.12
487 0.11
488 0.11
489 0.12
490 0.1
491 0.1
492 0.13
493 0.13
494 0.13
495 0.13
496 0.15
497 0.13
498 0.12
499 0.14
500 0.1
501 0.11
502 0.1
503 0.09
504 0.08
505 0.07
506 0.08
507 0.08
508 0.08
509 0.07
510 0.12
511 0.15
512 0.15
513 0.15
514 0.15
515 0.14
516 0.14
517 0.14
518 0.1
519 0.08
520 0.08
521 0.09
522 0.09
523 0.09
524 0.09
525 0.1
526 0.09
527 0.09
528 0.09
529 0.07
530 0.07
531 0.08
532 0.09
533 0.09
534 0.1
535 0.1
536 0.1
537 0.11
538 0.1
539 0.1
540 0.12
541 0.12
542 0.11
543 0.12
544 0.12
545 0.11
546 0.12
547 0.12
548 0.09
549 0.09
550 0.1
551 0.12
552 0.12
553 0.12
554 0.12
555 0.11
556 0.11
557 0.12
558 0.13
559 0.12
560 0.14
561 0.16
562 0.22
563 0.24
564 0.26
565 0.29
566 0.31
567 0.33
568 0.35
569 0.34
570 0.28
571 0.26
572 0.24
573 0.19
574 0.15
575 0.13
576 0.09
577 0.08
578 0.09
579 0.12
580 0.13
581 0.14
582 0.18
583 0.19
584 0.22
585 0.23
586 0.22
587 0.19
588 0.19
589 0.2
590 0.18
591 0.19
592 0.2
593 0.22
594 0.26
595 0.27
596 0.3
597 0.3
598 0.32
599 0.35
600 0.38
601 0.44
602 0.5
603 0.53
604 0.51
605 0.56
606 0.53
607 0.48
608 0.44
609 0.35
610 0.27
611 0.26
612 0.23
613 0.2
614 0.19
615 0.2
616 0.17
617 0.2
618 0.22
619 0.2
620 0.23
621 0.21
622 0.22
623 0.27
624 0.28
625 0.3
626 0.29
627 0.27
628 0.25
629 0.23
630 0.27
631 0.23
632 0.26
633 0.22
634 0.22
635 0.3
636 0.36
637 0.38
638 0.37
639 0.39
640 0.4
641 0.48
642 0.49
643 0.47
644 0.44
645 0.52
646 0.52
647 0.49
648 0.44
649 0.34
650 0.31
651 0.26
652 0.23
653 0.13
654 0.09
655 0.08
656 0.09
657 0.09
658 0.08
659 0.11
660 0.13
661 0.14
662 0.16
663 0.2
664 0.22
665 0.23
666 0.26
667 0.22
668 0.27
669 0.27
670 0.25
671 0.24
672 0.23
673 0.27
674 0.28
675 0.33
676 0.35
677 0.43
678 0.44
679 0.47
680 0.47
681 0.44
682 0.48
683 0.51
684 0.53
685 0.51
686 0.53
687 0.55
688 0.55
689 0.54
690 0.47
691 0.38
692 0.32
693 0.29
694 0.25
695 0.19
696 0.18
697 0.17
698 0.18
699 0.17
700 0.15
701 0.11
702 0.13
703 0.13
704 0.13
705 0.14
706 0.22
707 0.25
708 0.25
709 0.28
710 0.33
711 0.43
712 0.47
713 0.51
714 0.47
715 0.49
716 0.53
717 0.53
718 0.46
719 0.37
720 0.31