Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C3LDT4

Protein Details
Accession A0A5C3LDT4    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
205-228APVAKKRGRPTKNEKTKRLRAHIGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
209-224KKRGRPTKNEKTKRLR
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 12, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019188  SNAPC1  
Pfam View protein in Pfam  
PF09808  SNAPC1  
Amino Acid Sequences MALYVAPSPTRPDPVLHPSYFTSSLYTESLRNDIKLLTSTFRTRFLQDTAKPAFPLFKDIWSSHGWKWIHLRVLNDKSRERSQHVTCRLLIENIVQSEDALTQAAALFALYSFYNTQPNDTTPSLWQLSYIPITTDDLIHIYSLPERLQAPNLRSARLSVLYILRQMDIKQTFLLLPESRTSPHSPTNLPRERYVPQGDVLLSEAPVAKKRGRPTKNEKTKRLRAHIGDLDGWLDQTEQLVETSSGATTLNPLDDYKRSKLALLSLIDPPDAGLSEGQVVIANANAQVLDRLKEARTLLSDGDTTMVPRDGTGGIERVENALQDMARGSGRGVLSLLDGSGQR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.4
2 0.46
3 0.41
4 0.41
5 0.39
6 0.43
7 0.42
8 0.36
9 0.3
10 0.23
11 0.25
12 0.24
13 0.23
14 0.2
15 0.2
16 0.26
17 0.25
18 0.24
19 0.23
20 0.21
21 0.22
22 0.23
23 0.23
24 0.21
25 0.24
26 0.3
27 0.31
28 0.35
29 0.35
30 0.35
31 0.36
32 0.37
33 0.41
34 0.38
35 0.44
36 0.44
37 0.44
38 0.42
39 0.39
40 0.38
41 0.3
42 0.33
43 0.26
44 0.25
45 0.28
46 0.27
47 0.3
48 0.29
49 0.34
50 0.29
51 0.36
52 0.32
53 0.3
54 0.37
55 0.39
56 0.42
57 0.39
58 0.43
59 0.44
60 0.53
61 0.56
62 0.55
63 0.54
64 0.53
65 0.58
66 0.58
67 0.54
68 0.53
69 0.54
70 0.59
71 0.61
72 0.59
73 0.53
74 0.52
75 0.48
76 0.4
77 0.33
78 0.25
79 0.22
80 0.19
81 0.19
82 0.14
83 0.13
84 0.12
85 0.12
86 0.09
87 0.06
88 0.05
89 0.05
90 0.05
91 0.05
92 0.04
93 0.04
94 0.03
95 0.03
96 0.04
97 0.04
98 0.05
99 0.07
100 0.08
101 0.13
102 0.13
103 0.16
104 0.16
105 0.18
106 0.22
107 0.21
108 0.22
109 0.18
110 0.22
111 0.21
112 0.19
113 0.19
114 0.14
115 0.15
116 0.15
117 0.14
118 0.1
119 0.1
120 0.11
121 0.11
122 0.1
123 0.08
124 0.08
125 0.08
126 0.07
127 0.07
128 0.06
129 0.07
130 0.08
131 0.07
132 0.08
133 0.09
134 0.1
135 0.14
136 0.18
137 0.19
138 0.26
139 0.27
140 0.26
141 0.25
142 0.25
143 0.23
144 0.2
145 0.18
146 0.12
147 0.13
148 0.12
149 0.14
150 0.13
151 0.12
152 0.11
153 0.11
154 0.16
155 0.14
156 0.14
157 0.13
158 0.13
159 0.13
160 0.13
161 0.15
162 0.1
163 0.1
164 0.11
165 0.12
166 0.12
167 0.15
168 0.17
169 0.17
170 0.21
171 0.22
172 0.24
173 0.29
174 0.38
175 0.42
176 0.42
177 0.4
178 0.39
179 0.38
180 0.41
181 0.39
182 0.29
183 0.23
184 0.23
185 0.21
186 0.18
187 0.18
188 0.12
189 0.09
190 0.08
191 0.09
192 0.08
193 0.11
194 0.13
195 0.15
196 0.19
197 0.27
198 0.37
199 0.41
200 0.5
201 0.58
202 0.66
203 0.74
204 0.8
205 0.82
206 0.82
207 0.86
208 0.85
209 0.82
210 0.79
211 0.7
212 0.69
213 0.62
214 0.55
215 0.46
216 0.38
217 0.31
218 0.23
219 0.2
220 0.12
221 0.09
222 0.06
223 0.05
224 0.05
225 0.05
226 0.05
227 0.06
228 0.06
229 0.06
230 0.07
231 0.06
232 0.06
233 0.06
234 0.06
235 0.07
236 0.07
237 0.07
238 0.08
239 0.09
240 0.11
241 0.16
242 0.21
243 0.23
244 0.27
245 0.27
246 0.27
247 0.28
248 0.29
249 0.3
250 0.27
251 0.26
252 0.25
253 0.25
254 0.23
255 0.22
256 0.18
257 0.13
258 0.11
259 0.09
260 0.06
261 0.06
262 0.07
263 0.07
264 0.07
265 0.07
266 0.07
267 0.06
268 0.06
269 0.06
270 0.05
271 0.05
272 0.05
273 0.05
274 0.08
275 0.09
276 0.1
277 0.11
278 0.14
279 0.15
280 0.19
281 0.19
282 0.2
283 0.21
284 0.22
285 0.22
286 0.22
287 0.21
288 0.18
289 0.18
290 0.15
291 0.13
292 0.13
293 0.13
294 0.11
295 0.1
296 0.12
297 0.11
298 0.13
299 0.15
300 0.15
301 0.15
302 0.16
303 0.16
304 0.16
305 0.16
306 0.15
307 0.14
308 0.14
309 0.13
310 0.12
311 0.13
312 0.12
313 0.12
314 0.12
315 0.11
316 0.14
317 0.14
318 0.14
319 0.14
320 0.12
321 0.13
322 0.13
323 0.13