Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C3LHI8

Protein Details
Accession A0A5C3LHI8    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
725-744FDVRWPSKKFKNTRRFCYVQHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 16, cyto 10
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003107  HAT  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR034397  Prp24_RRM1  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006396  P:RNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12296  RRM1_Prp24  
cd00590  RRM_SF  
Amino Acid Sequences MADAKSLKAIANILSGISENPLDISLHMRHIQLANTLDDLETQLSAFQMMSDLVAVGDDVWLPLLEAKTKSVDLDTEEGVEELLQLYERAEGDYLSIPILQQHLNFIIANHERYAAEESKPEALGEVFSTLWSLAHMQVVVSKGLNHLSQSRLLFDPYKDWIVEQLETATQEEKLVLIEQLEELLNQRLQQPHSNSDETFQAYSSFTTKYQPAAQYEPLMVAASKNRAASVKTYERREPLELLLESSNNSLDVYAQYVAYERKGRTIDPVAAPGIYERAIAEAANRRHKGEPGAEAALAAFWPGYLDTMRILDVELDTERELYTRALRSVPTSGEVWARYVRFLERASSAMEAPQELESIPDAYNRALLTGFFQSDMEQIIPLTLAYAGSEFRKVKAGEVDDSTLPTLIVAVESAMEVVQAVSKAGDPKFRLEKFLAGVYEAVGLVDSAIEVWSEASKKYKNGYSVWLNYTETLVKHQRFDEARQVFAEVHTKRIDWPEAIWEAWVTFEHLHGTLDDINAAIDKIEKAHHYLNDYRAKEMKKAYQAQAEAPGAQQAAQVESGPSNSGTQPPIAQDATPMEVDVAPAPASDSKKRRSGDDEQNEGNKRARFEPNPPSLKRDRENTTVFVAGLPSGVTEEELKQLFKDCGRVREVKTTQLPNNLVALVEFYERDSVPAALTKDKKKLHDQEIAVHLAWKSTLYVTNFPEFADDAYIRNMFGPYGTLFDVRWPSKKFKNTRRFCYVQYTSPQSAQQALELHGKELEPNLPLNVYISNPERRKERTDHDANEREIYVAGLSRFTNKEDLEKVFSTYGKVKDIRIAVEDGHAKGWAFIEYEDPQEARKALDANNYELKKRRIAVTLADPRVRARHRSETGLSRVAEARNRSVRVRNLPPNTQEGLLQQVFEKVSAVRRVEVFTDKNEAVVELENAAEAGKLLLRTEPLTFQDHVLSLSEEGKTSGPGTAPPAPKSMPFVPRKAGAPSRPKAGLGYTRGPTQAASAASSTPASGTNKGQDDFRKMLGGR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.14
2 0.14
3 0.12
4 0.13
5 0.11
6 0.08
7 0.09
8 0.1
9 0.1
10 0.1
11 0.14
12 0.15
13 0.2
14 0.22
15 0.22
16 0.25
17 0.27
18 0.28
19 0.28
20 0.28
21 0.25
22 0.24
23 0.24
24 0.2
25 0.18
26 0.18
27 0.14
28 0.11
29 0.09
30 0.09
31 0.09
32 0.09
33 0.08
34 0.07
35 0.07
36 0.07
37 0.07
38 0.06
39 0.06
40 0.06
41 0.06
42 0.06
43 0.05
44 0.05
45 0.05
46 0.04
47 0.05
48 0.05
49 0.05
50 0.08
51 0.1
52 0.14
53 0.15
54 0.17
55 0.19
56 0.2
57 0.21
58 0.2
59 0.2
60 0.2
61 0.22
62 0.2
63 0.18
64 0.18
65 0.17
66 0.15
67 0.14
68 0.1
69 0.07
70 0.07
71 0.06
72 0.06
73 0.06
74 0.08
75 0.09
76 0.1
77 0.09
78 0.09
79 0.11
80 0.13
81 0.13
82 0.11
83 0.11
84 0.1
85 0.12
86 0.14
87 0.14
88 0.12
89 0.15
90 0.15
91 0.17
92 0.17
93 0.16
94 0.21
95 0.23
96 0.25
97 0.22
98 0.23
99 0.21
100 0.23
101 0.29
102 0.24
103 0.22
104 0.23
105 0.24
106 0.26
107 0.26
108 0.24
109 0.18
110 0.16
111 0.15
112 0.13
113 0.13
114 0.09
115 0.09
116 0.1
117 0.09
118 0.08
119 0.08
120 0.09
121 0.08
122 0.1
123 0.1
124 0.09
125 0.12
126 0.14
127 0.14
128 0.12
129 0.12
130 0.12
131 0.15
132 0.16
133 0.15
134 0.17
135 0.19
136 0.24
137 0.24
138 0.26
139 0.24
140 0.27
141 0.28
142 0.26
143 0.27
144 0.26
145 0.28
146 0.24
147 0.23
148 0.25
149 0.24
150 0.24
151 0.21
152 0.18
153 0.17
154 0.18
155 0.18
156 0.15
157 0.12
158 0.12
159 0.11
160 0.09
161 0.09
162 0.09
163 0.08
164 0.07
165 0.08
166 0.07
167 0.09
168 0.09
169 0.08
170 0.09
171 0.11
172 0.12
173 0.12
174 0.16
175 0.2
176 0.23
177 0.3
178 0.33
179 0.36
180 0.42
181 0.44
182 0.4
183 0.37
184 0.37
185 0.32
186 0.28
187 0.22
188 0.18
189 0.15
190 0.16
191 0.17
192 0.15
193 0.13
194 0.16
195 0.17
196 0.19
197 0.24
198 0.28
199 0.3
200 0.33
201 0.34
202 0.32
203 0.31
204 0.28
205 0.23
206 0.19
207 0.15
208 0.12
209 0.13
210 0.14
211 0.16
212 0.16
213 0.17
214 0.18
215 0.19
216 0.22
217 0.27
218 0.34
219 0.38
220 0.43
221 0.47
222 0.49
223 0.52
224 0.51
225 0.45
226 0.36
227 0.37
228 0.32
229 0.29
230 0.27
231 0.23
232 0.21
233 0.19
234 0.17
235 0.1
236 0.1
237 0.07
238 0.07
239 0.07
240 0.09
241 0.08
242 0.08
243 0.08
244 0.1
245 0.11
246 0.14
247 0.19
248 0.17
249 0.22
250 0.23
251 0.24
252 0.28
253 0.32
254 0.34
255 0.3
256 0.32
257 0.27
258 0.26
259 0.25
260 0.19
261 0.16
262 0.1
263 0.09
264 0.06
265 0.07
266 0.07
267 0.07
268 0.1
269 0.17
270 0.23
271 0.32
272 0.33
273 0.35
274 0.36
275 0.39
276 0.4
277 0.36
278 0.34
279 0.29
280 0.3
281 0.27
282 0.25
283 0.22
284 0.18
285 0.13
286 0.09
287 0.04
288 0.03
289 0.03
290 0.03
291 0.04
292 0.04
293 0.05
294 0.06
295 0.07
296 0.07
297 0.07
298 0.07
299 0.07
300 0.06
301 0.08
302 0.07
303 0.08
304 0.08
305 0.08
306 0.08
307 0.08
308 0.09
309 0.08
310 0.12
311 0.13
312 0.15
313 0.16
314 0.16
315 0.18
316 0.2
317 0.19
318 0.17
319 0.16
320 0.16
321 0.17
322 0.17
323 0.17
324 0.17
325 0.17
326 0.15
327 0.16
328 0.16
329 0.16
330 0.17
331 0.17
332 0.15
333 0.16
334 0.17
335 0.16
336 0.15
337 0.13
338 0.13
339 0.11
340 0.1
341 0.1
342 0.08
343 0.07
344 0.08
345 0.07
346 0.08
347 0.08
348 0.08
349 0.09
350 0.09
351 0.11
352 0.1
353 0.1
354 0.08
355 0.08
356 0.09
357 0.1
358 0.11
359 0.09
360 0.09
361 0.09
362 0.1
363 0.1
364 0.08
365 0.07
366 0.06
367 0.06
368 0.06
369 0.05
370 0.05
371 0.04
372 0.03
373 0.03
374 0.04
375 0.05
376 0.06
377 0.11
378 0.11
379 0.11
380 0.17
381 0.17
382 0.18
383 0.23
384 0.24
385 0.22
386 0.24
387 0.25
388 0.2
389 0.2
390 0.18
391 0.14
392 0.11
393 0.08
394 0.07
395 0.04
396 0.04
397 0.03
398 0.03
399 0.03
400 0.03
401 0.03
402 0.03
403 0.03
404 0.03
405 0.03
406 0.03
407 0.03
408 0.03
409 0.04
410 0.05
411 0.09
412 0.09
413 0.14
414 0.15
415 0.19
416 0.28
417 0.28
418 0.31
419 0.28
420 0.29
421 0.26
422 0.28
423 0.23
424 0.16
425 0.15
426 0.12
427 0.11
428 0.09
429 0.07
430 0.04
431 0.04
432 0.03
433 0.03
434 0.02
435 0.02
436 0.02
437 0.02
438 0.02
439 0.03
440 0.04
441 0.05
442 0.06
443 0.09
444 0.11
445 0.13
446 0.16
447 0.19
448 0.22
449 0.23
450 0.28
451 0.3
452 0.33
453 0.33
454 0.31
455 0.29
456 0.25
457 0.25
458 0.2
459 0.14
460 0.15
461 0.2
462 0.19
463 0.21
464 0.21
465 0.26
466 0.26
467 0.29
468 0.34
469 0.29
470 0.29
471 0.27
472 0.28
473 0.22
474 0.21
475 0.25
476 0.16
477 0.18
478 0.18
479 0.18
480 0.18
481 0.21
482 0.21
483 0.14
484 0.14
485 0.14
486 0.15
487 0.15
488 0.13
489 0.1
490 0.09
491 0.09
492 0.08
493 0.06
494 0.05
495 0.05
496 0.06
497 0.06
498 0.07
499 0.06
500 0.08
501 0.07
502 0.07
503 0.06
504 0.06
505 0.05
506 0.05
507 0.05
508 0.04
509 0.03
510 0.03
511 0.04
512 0.06
513 0.06
514 0.09
515 0.12
516 0.14
517 0.17
518 0.2
519 0.27
520 0.34
521 0.34
522 0.33
523 0.35
524 0.35
525 0.35
526 0.35
527 0.33
528 0.33
529 0.37
530 0.38
531 0.38
532 0.38
533 0.35
534 0.36
535 0.31
536 0.24
537 0.18
538 0.16
539 0.12
540 0.11
541 0.11
542 0.06
543 0.06
544 0.06
545 0.06
546 0.06
547 0.06
548 0.06
549 0.06
550 0.06
551 0.07
552 0.07
553 0.09
554 0.09
555 0.09
556 0.1
557 0.1
558 0.13
559 0.12
560 0.11
561 0.1
562 0.11
563 0.12
564 0.11
565 0.1
566 0.08
567 0.07
568 0.08
569 0.07
570 0.06
571 0.05
572 0.05
573 0.05
574 0.08
575 0.11
576 0.17
577 0.22
578 0.26
579 0.33
580 0.34
581 0.37
582 0.4
583 0.47
584 0.51
585 0.54
586 0.54
587 0.5
588 0.55
589 0.54
590 0.49
591 0.45
592 0.36
593 0.3
594 0.3
595 0.34
596 0.31
597 0.36
598 0.44
599 0.48
600 0.54
601 0.53
602 0.55
603 0.54
604 0.57
605 0.53
606 0.51
607 0.47
608 0.46
609 0.48
610 0.44
611 0.4
612 0.35
613 0.31
614 0.24
615 0.19
616 0.12
617 0.09
618 0.07
619 0.05
620 0.04
621 0.04
622 0.04
623 0.05
624 0.06
625 0.09
626 0.1
627 0.1
628 0.1
629 0.12
630 0.13
631 0.13
632 0.21
633 0.2
634 0.25
635 0.29
636 0.35
637 0.35
638 0.44
639 0.45
640 0.43
641 0.47
642 0.48
643 0.47
644 0.48
645 0.47
646 0.37
647 0.37
648 0.3
649 0.24
650 0.17
651 0.15
652 0.09
653 0.08
654 0.07
655 0.06
656 0.08
657 0.08
658 0.09
659 0.09
660 0.08
661 0.08
662 0.12
663 0.13
664 0.17
665 0.23
666 0.27
667 0.34
668 0.38
669 0.42
670 0.48
671 0.55
672 0.56
673 0.59
674 0.56
675 0.54
676 0.54
677 0.52
678 0.42
679 0.36
680 0.28
681 0.2
682 0.19
683 0.13
684 0.09
685 0.08
686 0.12
687 0.13
688 0.18
689 0.2
690 0.22
691 0.22
692 0.21
693 0.21
694 0.17
695 0.15
696 0.14
697 0.12
698 0.11
699 0.13
700 0.13
701 0.12
702 0.12
703 0.12
704 0.09
705 0.08
706 0.09
707 0.07
708 0.09
709 0.1
710 0.1
711 0.1
712 0.13
713 0.2
714 0.2
715 0.26
716 0.28
717 0.33
718 0.41
719 0.5
720 0.57
721 0.61
722 0.7
723 0.73
724 0.78
725 0.8
726 0.76
727 0.7
728 0.71
729 0.64
730 0.59
731 0.56
732 0.54
733 0.48
734 0.46
735 0.44
736 0.35
737 0.34
738 0.28
739 0.25
740 0.2
741 0.2
742 0.24
743 0.23
744 0.22
745 0.2
746 0.2
747 0.18
748 0.17
749 0.16
750 0.11
751 0.12
752 0.12
753 0.11
754 0.11
755 0.11
756 0.11
757 0.09
758 0.12
759 0.16
760 0.24
761 0.26
762 0.3
763 0.34
764 0.38
765 0.44
766 0.46
767 0.49
768 0.5
769 0.57
770 0.6
771 0.64
772 0.67
773 0.62
774 0.58
775 0.52
776 0.42
777 0.33
778 0.27
779 0.17
780 0.12
781 0.11
782 0.1
783 0.1
784 0.14
785 0.15
786 0.17
787 0.21
788 0.19
789 0.24
790 0.26
791 0.29
792 0.3
793 0.3
794 0.31
795 0.28
796 0.28
797 0.27
798 0.28
799 0.28
800 0.28
801 0.29
802 0.28
803 0.31
804 0.33
805 0.32
806 0.28
807 0.27
808 0.21
809 0.25
810 0.26
811 0.22
812 0.2
813 0.19
814 0.16
815 0.15
816 0.16
817 0.12
818 0.1
819 0.09
820 0.13
821 0.14
822 0.16
823 0.17
824 0.17
825 0.16
826 0.18
827 0.18
828 0.14
829 0.15
830 0.16
831 0.17
832 0.25
833 0.26
834 0.29
835 0.37
836 0.38
837 0.39
838 0.44
839 0.44
840 0.42
841 0.42
842 0.42
843 0.38
844 0.4
845 0.42
846 0.45
847 0.52
848 0.52
849 0.52
850 0.48
851 0.45
852 0.51
853 0.48
854 0.44
855 0.42
856 0.46
857 0.48
858 0.54
859 0.58
860 0.57
861 0.59
862 0.59
863 0.52
864 0.44
865 0.44
866 0.41
867 0.41
868 0.36
869 0.39
870 0.4
871 0.42
872 0.44
873 0.48
874 0.53
875 0.56
876 0.62
877 0.64
878 0.64
879 0.68
880 0.67
881 0.65
882 0.59
883 0.51
884 0.42
885 0.34
886 0.34
887 0.28
888 0.25
889 0.19
890 0.2
891 0.2
892 0.19
893 0.19
894 0.13
895 0.19
896 0.25
897 0.27
898 0.26
899 0.27
900 0.29
901 0.31
902 0.36
903 0.32
904 0.28
905 0.33
906 0.3
907 0.3
908 0.28
909 0.25
910 0.19
911 0.18
912 0.16
913 0.1
914 0.1
915 0.09
916 0.09
917 0.08
918 0.07
919 0.05
920 0.05
921 0.06
922 0.07
923 0.08
924 0.09
925 0.11
926 0.13
927 0.15
928 0.18
929 0.19
930 0.23
931 0.24
932 0.24
933 0.24
934 0.23
935 0.22
936 0.2
937 0.19
938 0.16
939 0.17
940 0.16
941 0.14
942 0.15
943 0.14
944 0.14
945 0.14
946 0.14
947 0.12
948 0.14
949 0.19
950 0.26
951 0.3
952 0.31
953 0.34
954 0.34
955 0.35
956 0.4
957 0.41
958 0.43
959 0.44
960 0.47
961 0.48
962 0.51
963 0.52
964 0.54
965 0.55
966 0.54
967 0.58
968 0.58
969 0.6
970 0.58
971 0.56
972 0.49
973 0.48
974 0.46
975 0.43
976 0.46
977 0.42
978 0.43
979 0.43
980 0.42
981 0.35
982 0.29
983 0.27
984 0.21
985 0.2
986 0.18
987 0.18
988 0.19
989 0.19
990 0.16
991 0.12
992 0.16
993 0.18
994 0.2
995 0.23
996 0.29
997 0.34
998 0.35
999 0.4
1000 0.41
1001 0.45
1002 0.46
1003 0.43