FuNGI

A5DGK7

Protein Details

Accession

A5DGK7

Localization Confidence

High

Confidence Score

17.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
52-71	VKDFTKPVRLHRKDPQNIQF	Hydrophilic
106-130	APDGGGRKNKKNMFKRKTRQISLMD	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
112-122	RKNKKNMFKRK
336-338	GKK

Subcellular Location(s)

nucl 22.5, cyto_nucl 14, cyto 4.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter
KEGG	pgu:PGUG_02408 -
Pfam	View protein in Pfam PF05793 TFIIF_alpha

Amino Acid Sequences

MSASPVKKEGPVKSESNDGWQEIPLRCCTIEDVKDARFHIMKFQSKQDVNIVKDFTKPVRLHRKDPQNIQFQLTRKEIEEKRQQGAAQEVPVNGEGEEEMDLSQVAPDGGGRKNKKNMFKRKTRQISLMDESKRKLRFEEFYPWVIEDYDGKNIYVGNYEAGSSDTQQVLFVFDRDGFKMIPAEKVYRFTPRNKYTTLTLEEAEAKMEKKSAVPRWLMKRMEDNPAEASPDQRFGNISSSQSMSNSRSRMRTVMGGSTSNDRDSDHDDLDFDEEFADDEEAPIMDGDEEENKLSEQKVKKEQLKAAHFDGQSDADADDDLDDLFETEKSRKVDKEGKKLRKVLNKTEGGVYDSDDDDEDGLNPYLSRSDIENDDDDENDETAVKTEDDGSQSLSGRRAFYATDLGNSFVSIKAPVGFLSGFPKGDWNPQGFKRQAEMAAPSPSKKVKLEENKSVSPTPPSGVDLHSAGPNNDLVTVEEVLNIVRKEPLTTKQLLLVLKNRVYAHPDNKLRIINIVKQNLKLSNGMLVLKEEH

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.51
2	0.45
3	0.46
4	0.43
5	0.39
6	0.35
7	0.33
8	0.36
9	0.33
10	0.36
11	0.31
12	0.3
13	0.28
14	0.28
15	0.3
16	0.33
17	0.32
18	0.35
19	0.37
20	0.37
21	0.41
22	0.42
23	0.42
24	0.37
25	0.34
26	0.37
27	0.41
28	0.47
29	0.46
30	0.53
31	0.57
32	0.55
33	0.57
34	0.57
35	0.56
36	0.51
37	0.53
38	0.49
39	0.4
40	0.42
41	0.44
42	0.37
43	0.39
44	0.37
45	0.42
46	0.5
47	0.55
48	0.59
49	0.64
50	0.73
51	0.72
52	0.8
53	0.79
54	0.77
55	0.74
56	0.7
57	0.66
58	0.59
59	0.58
60	0.51
61	0.44
62	0.36
63	0.43
64	0.43
65	0.47
66	0.53
67	0.51
68	0.51
69	0.53
70	0.51
71	0.45
72	0.47
73	0.4
74	0.34
75	0.31
76	0.28
77	0.26
78	0.26
79	0.23
80	0.17
81	0.14
82	0.1
83	0.08
84	0.09
85	0.07
86	0.06
87	0.06
88	0.06
89	0.06
90	0.06
91	0.05
92	0.05
93	0.04
94	0.05
95	0.08
96	0.13
97	0.22
98	0.27
99	0.34
100	0.43
101	0.5
102	0.59
103	0.67
104	0.74
105	0.75
106	0.81
107	0.85
108	0.87
109	0.9
110	0.85
111	0.82
112	0.77
113	0.75
114	0.7
115	0.68
116	0.63
117	0.57
118	0.54
119	0.53
120	0.5
121	0.43
122	0.4
123	0.37
124	0.35
125	0.37
126	0.44
127	0.42
128	0.4
129	0.41
130	0.38
131	0.33
132	0.29
133	0.24
134	0.18
135	0.16
136	0.18
137	0.17
138	0.17
139	0.16
140	0.16
141	0.16
142	0.15
143	0.13
144	0.09
145	0.08
146	0.09
147	0.09
148	0.1
149	0.1
150	0.09
151	0.11
152	0.11
153	0.1
154	0.11
155	0.1
156	0.12
157	0.12
158	0.11
159	0.09
160	0.11
161	0.12
162	0.13
163	0.14
164	0.11
165	0.12
166	0.15
167	0.15
168	0.17
169	0.17
170	0.21
171	0.2
172	0.23
173	0.24
174	0.29
175	0.32
176	0.35
177	0.44
178	0.46
179	0.49
180	0.48
181	0.49
182	0.44
183	0.46
184	0.43
185	0.34
186	0.28
187	0.25
188	0.25
189	0.23
190	0.2
191	0.15
192	0.12
193	0.1
194	0.11
195	0.1
196	0.11
197	0.19
198	0.24
199	0.29
200	0.32
201	0.39
202	0.45
203	0.53
204	0.51
205	0.46
206	0.48
207	0.44
208	0.48
209	0.42
210	0.36
211	0.31
212	0.3
213	0.3
214	0.22
215	0.22
216	0.14
217	0.17
218	0.15
219	0.13
220	0.13
221	0.12
222	0.16
223	0.15
224	0.15
225	0.14
226	0.15
227	0.15
228	0.15
229	0.17
230	0.16
231	0.19
232	0.21
233	0.22
234	0.23
235	0.24
236	0.24
237	0.23
238	0.23
239	0.2
240	0.21
241	0.19
242	0.18
243	0.18
244	0.2
245	0.19
246	0.16
247	0.15
248	0.12
249	0.13
250	0.15
251	0.17
252	0.14
253	0.13
254	0.13
255	0.13
256	0.14
257	0.13
258	0.09
259	0.06
260	0.05
261	0.05
262	0.06
263	0.06
264	0.04
265	0.04
266	0.04
267	0.04
268	0.04
269	0.04
270	0.04
271	0.03
272	0.03
273	0.04
274	0.04
275	0.05
276	0.05
277	0.06
278	0.06
279	0.07
280	0.07
281	0.13
282	0.16
283	0.22
284	0.3
285	0.38
286	0.43
287	0.48
288	0.52
289	0.55
290	0.56
291	0.53
292	0.48
293	0.48
294	0.42
295	0.37
296	0.33
297	0.25
298	0.21
299	0.18
300	0.14
301	0.07
302	0.07
303	0.06
304	0.05
305	0.05
306	0.04
307	0.03
308	0.03
309	0.03
310	0.04
311	0.05
312	0.06
313	0.07
314	0.12
315	0.14
316	0.17
317	0.18
318	0.24
319	0.34
320	0.41
321	0.51
322	0.57
323	0.65
324	0.7
325	0.76
326	0.77
327	0.77
328	0.75
329	0.73
330	0.72
331	0.65
332	0.59
333	0.55
334	0.48
335	0.4
336	0.34
337	0.25
338	0.17
339	0.14
340	0.13
341	0.1
342	0.09
343	0.08
344	0.08
345	0.07
346	0.07
347	0.07
348	0.07
349	0.07
350	0.07
351	0.07
352	0.08
353	0.08
354	0.08
355	0.1
356	0.12
357	0.15
358	0.16
359	0.18
360	0.18
361	0.17
362	0.17
363	0.16
364	0.14
365	0.11
366	0.1
367	0.08
368	0.08
369	0.09
370	0.08
371	0.07
372	0.08
373	0.1
374	0.12
375	0.12
376	0.13
377	0.15
378	0.16
379	0.18
380	0.2
381	0.2
382	0.19
383	0.19
384	0.18
385	0.16
386	0.16
387	0.2
388	0.17
389	0.18
390	0.18
391	0.19
392	0.18
393	0.18
394	0.17
395	0.11
396	0.12
397	0.09
398	0.09
399	0.09
400	0.09
401	0.09
402	0.1
403	0.1
404	0.1
405	0.14
406	0.15
407	0.15
408	0.15
409	0.19
410	0.18
411	0.25
412	0.28
413	0.28
414	0.33
415	0.37
416	0.46
417	0.44
418	0.44
419	0.4
420	0.39
421	0.37
422	0.33
423	0.33
424	0.28
425	0.34
426	0.34
427	0.32
428	0.33
429	0.34
430	0.35
431	0.34
432	0.34
433	0.36
434	0.46
435	0.53
436	0.58
437	0.63
438	0.64
439	0.65
440	0.64
441	0.55
442	0.48
443	0.42
444	0.33
445	0.28
446	0.26
447	0.23
448	0.22
449	0.23
450	0.2
451	0.2
452	0.22
453	0.21
454	0.19
455	0.19
456	0.18
457	0.16
458	0.15
459	0.14
460	0.12
461	0.13
462	0.14
463	0.13
464	0.12
465	0.12
466	0.12
467	0.16
468	0.14
469	0.12
470	0.14
471	0.14
472	0.17
473	0.22
474	0.28
475	0.29
476	0.33
477	0.33
478	0.35
479	0.39
480	0.38
481	0.39
482	0.4
483	0.42
484	0.41
485	0.45
486	0.41
487	0.39
488	0.44
489	0.48
490	0.48
491	0.51
492	0.55
493	0.55
494	0.59
495	0.6
496	0.53
497	0.52
498	0.5
499	0.49
500	0.51
501	0.55
502	0.54
503	0.54
504	0.59
505	0.55
506	0.52
507	0.45
508	0.37
509	0.33
510	0.32
511	0.29
512	0.25

A5DGK7

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer