Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C3LCW9

Protein Details
Accession A0A5C3LCW9    Localization Confidence High Confidence Score 17.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
254-273GKAKSAPKLKSKKEDKVYLDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
46-50RGGPA
52-52R
82-106RKSDGGRGGRGPRGRGRGGNTGGRG
257-266KSAPKLKSKK
278-310FERPDRGGRGRGRGGDRGERRGARGAGRGGRGQ
Subcellular Location(s) nucl 14, cyto 11
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039764  HABP4/SERBP1  
IPR006861  HABP4_PAIRBP1-bd  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF04774  HABP4_PAI-RBP1  
Amino Acid Sequences MSVASKNPFALLDAEDNSRPASPPAKKAPVAPQAAAPANRGQQKTRGGPASRAGKYYARGGKPSPNDASTPAGAEEPGVDGRKSDGGRGGRGPRGRGRGGNTGGRGRQFDRHSATGKTDSQKKVHQGWGGDEGNSELKTEQAAAADAAAEPATGEWAADAIAPAEWGTVEADAAAPADAEGKPESKPRKEREEREEEEDNTLTLDQYLAQQKDKDTVIPKLDGVRQANEGAGEEIWKGVVPLAKNEEEEAYFVGKAKSAPKLKSKKEDKVYLDFEGRFERPDRGGRGRGRGGDRGERRGARGAGRGGRGQRQGGNAQTPNVDDQNAFPSLA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.23
2 0.23
3 0.23
4 0.23
5 0.22
6 0.2
7 0.19
8 0.26
9 0.28
10 0.36
11 0.44
12 0.51
13 0.51
14 0.56
15 0.62
16 0.62
17 0.61
18 0.53
19 0.47
20 0.45
21 0.48
22 0.44
23 0.36
24 0.32
25 0.33
26 0.39
27 0.39
28 0.36
29 0.38
30 0.45
31 0.48
32 0.51
33 0.53
34 0.49
35 0.5
36 0.56
37 0.58
38 0.52
39 0.48
40 0.44
41 0.39
42 0.39
43 0.44
44 0.44
45 0.38
46 0.4
47 0.41
48 0.46
49 0.47
50 0.52
51 0.47
52 0.41
53 0.39
54 0.38
55 0.39
56 0.31
57 0.27
58 0.21
59 0.17
60 0.15
61 0.13
62 0.11
63 0.09
64 0.11
65 0.11
66 0.11
67 0.1
68 0.12
69 0.17
70 0.17
71 0.17
72 0.21
73 0.21
74 0.25
75 0.3
76 0.34
77 0.34
78 0.37
79 0.4
80 0.4
81 0.44
82 0.44
83 0.42
84 0.43
85 0.45
86 0.46
87 0.46
88 0.43
89 0.42
90 0.41
91 0.39
92 0.37
93 0.31
94 0.34
95 0.32
96 0.34
97 0.35
98 0.37
99 0.37
100 0.36
101 0.37
102 0.35
103 0.37
104 0.36
105 0.39
106 0.39
107 0.4
108 0.43
109 0.45
110 0.46
111 0.46
112 0.44
113 0.37
114 0.35
115 0.39
116 0.35
117 0.3
118 0.24
119 0.2
120 0.19
121 0.18
122 0.15
123 0.08
124 0.07
125 0.07
126 0.08
127 0.07
128 0.05
129 0.06
130 0.05
131 0.05
132 0.05
133 0.05
134 0.05
135 0.04
136 0.03
137 0.03
138 0.03
139 0.03
140 0.03
141 0.03
142 0.02
143 0.03
144 0.03
145 0.03
146 0.03
147 0.03
148 0.03
149 0.03
150 0.03
151 0.03
152 0.03
153 0.03
154 0.03
155 0.03
156 0.03
157 0.03
158 0.03
159 0.03
160 0.03
161 0.03
162 0.03
163 0.03
164 0.04
165 0.04
166 0.06
167 0.06
168 0.07
169 0.08
170 0.15
171 0.21
172 0.27
173 0.35
174 0.39
175 0.5
176 0.57
177 0.64
178 0.67
179 0.71
180 0.67
181 0.66
182 0.65
183 0.54
184 0.49
185 0.41
186 0.32
187 0.23
188 0.19
189 0.13
190 0.08
191 0.07
192 0.05
193 0.08
194 0.14
195 0.15
196 0.16
197 0.18
198 0.18
199 0.22
200 0.22
201 0.22
202 0.2
203 0.24
204 0.25
205 0.25
206 0.25
207 0.25
208 0.27
209 0.29
210 0.28
211 0.25
212 0.24
213 0.23
214 0.23
215 0.19
216 0.17
217 0.12
218 0.1
219 0.09
220 0.07
221 0.06
222 0.06
223 0.06
224 0.05
225 0.06
226 0.08
227 0.08
228 0.12
229 0.17
230 0.18
231 0.19
232 0.19
233 0.19
234 0.17
235 0.17
236 0.15
237 0.12
238 0.11
239 0.12
240 0.11
241 0.11
242 0.13
243 0.15
244 0.23
245 0.28
246 0.33
247 0.42
248 0.52
249 0.59
250 0.68
251 0.73
252 0.75
253 0.77
254 0.81
255 0.76
256 0.75
257 0.71
258 0.65
259 0.61
260 0.51
261 0.44
262 0.41
263 0.36
264 0.3
265 0.28
266 0.27
267 0.26
268 0.32
269 0.37
270 0.39
271 0.47
272 0.49
273 0.56
274 0.57
275 0.6
276 0.58
277 0.58
278 0.56
279 0.58
280 0.58
281 0.57
282 0.6
283 0.55
284 0.53
285 0.54
286 0.52
287 0.46
288 0.46
289 0.47
290 0.45
291 0.46
292 0.48
293 0.46
294 0.51
295 0.51
296 0.49
297 0.45
298 0.45
299 0.46
300 0.46
301 0.5
302 0.44
303 0.42
304 0.4
305 0.37
306 0.37
307 0.33
308 0.29
309 0.21
310 0.21
311 0.23