FuNGI

A0A5C3LDH3

Protein Details

Accession

A0A5C3LDH3

Localization Confidence

High

Confidence Score

16.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
2-22	APTNLSKNKIKASKNRPTSTA	Hydrophilic
93-121	AESQPDTPSPSKKKRKKRQSLAAEETQSP	Hydrophilic
496-519	NDDPQSKSSKKRKGPKRDVSSIPA	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
103-110	SKKKRKKR
503-512	SSKKRKGPKR

Subcellular Location(s)

mito 16, cyto 6, nucl 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007148 SSU_processome_Utp12 IPR015943 WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf IPR001680 WD40_repeat IPR019775 WD40_repeat_CS IPR036322 WD40_repeat_dom_sf
Gene Ontology	GO:0005730 C:nucleolus
Pfam	View protein in Pfam PF04003 Utp12
PROSITE	View protein in PROSITE PS00678 WD_REPEATS_1 PS50082 WD_REPEATS_2

Amino Acid Sequences

MAPTNLSKNKIKASKNRPTSTATISQPVVEDASTLTSLSAFSQDGHLFAYLHLAVDKHRLTVYNTTSNHLLADYTVDSARVSALVWGTLNFSAESQPDTPSPSKKKRKKRQSLAAEETQSPTGTQVVILGLTDGTISFFSPSHGRVLRTLSHPSSSTPILALATSEHIQSPVLWSSSADGTVRAWNVQTSAAVDTWKTDDRIPYTSLTIRPNNEDGRTDLLVAHHNLRLVSRASEGVSAKTIQLASFTGHASSIKSSKWADSRPQPNRFVTMAEGDRFLYIWDVEDGTSSQGKASASVPLDSDSRTFAISTASGKATLASLSASGRVSIYPIPEELSPPASNNNTTHKIPTLLPRSNIVAPSKNSASVSPVVNIAFIPTDAASLRVVRLAKGVRPVFTTVNFLDDSGSYATDITLEELDLSVVKEDEPGVTTQRYVEGSAAVVGSGLDLGIKETGEDVPMRDVDGDLEVDLAELSLGQRLTALNDGEVRKDSDSENDDPQSKSSKKRKGPKRDVSSIPANSLTRTLIQALHSSDSRLLEACLSHSDATLIQNTVKRLPPQLAVPLVIACTERLGRGGRAANMKGSGGGASAQRGTGLITWIKIALAVHAGHLMTIPDLVARLSGLYTTINARLALHENLLALNGKLDMVLSQVEMRSSAAPAPLTVKEKKGKGKAVPTSVAKHYVEGESDSSDAEDDGDVDVESGDDEGSIEDVELGGESDEEGSEDDADDMDSEEDSEDGGSLNGFIDDEAEEWSDEDEDEDEFSE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.76
2	0.81
3	0.8
4	0.74
5	0.72
6	0.68
7	0.65
8	0.62
9	0.55
10	0.5
11	0.45
12	0.42
13	0.37
14	0.33
15	0.27
16	0.18
17	0.15
18	0.1
19	0.13
20	0.12
21	0.11
22	0.1
23	0.09
24	0.1
25	0.1
26	0.11
27	0.09
28	0.09
29	0.14
30	0.15
31	0.15
32	0.16
33	0.16
34	0.14
35	0.14
36	0.18
37	0.13
38	0.13
39	0.14
40	0.13
41	0.13
42	0.2
43	0.21
44	0.18
45	0.2
46	0.21
47	0.25
48	0.33
49	0.38
50	0.39
51	0.4
52	0.42
53	0.42
54	0.4
55	0.36
56	0.27
57	0.21
58	0.12
59	0.14
60	0.12
61	0.12
62	0.12
63	0.12
64	0.11
65	0.11
66	0.11
67	0.08
68	0.08
69	0.08
70	0.08
71	0.09
72	0.1
73	0.1
74	0.12
75	0.12
76	0.13
77	0.11
78	0.11
79	0.12
80	0.12
81	0.16
82	0.14
83	0.16
84	0.16
85	0.22
86	0.25
87	0.33
88	0.42
89	0.5
90	0.6
91	0.68
92	0.78
93	0.83
94	0.91
95	0.93
96	0.94
97	0.94
98	0.94
99	0.95
100	0.91
101	0.88
102	0.81
103	0.71
104	0.62
105	0.53
106	0.42
107	0.31
108	0.24
109	0.16
110	0.12
111	0.1
112	0.09
113	0.08
114	0.08
115	0.07
116	0.07
117	0.06
118	0.05
119	0.05
120	0.04
121	0.05
122	0.05
123	0.05
124	0.06
125	0.06
126	0.09
127	0.11
128	0.12
129	0.18
130	0.21
131	0.22
132	0.24
133	0.28
134	0.31
135	0.33
136	0.39
137	0.34
138	0.34
139	0.33
140	0.33
141	0.32
142	0.29
143	0.25
144	0.18
145	0.17
146	0.14
147	0.13
148	0.12
149	0.09
150	0.11
151	0.11
152	0.11
153	0.1
154	0.1
155	0.11
156	0.11
157	0.13
158	0.12
159	0.12
160	0.12
161	0.12
162	0.14
163	0.14
164	0.15
165	0.12
166	0.1
167	0.11
168	0.14
169	0.15
170	0.13
171	0.13
172	0.12
173	0.13
174	0.13
175	0.12
176	0.1
177	0.11
178	0.11
179	0.11
180	0.11
181	0.11
182	0.14
183	0.16
184	0.16
185	0.16
186	0.19
187	0.22
188	0.25
189	0.26
190	0.24
191	0.25
192	0.27
193	0.3
194	0.32
195	0.33
196	0.32
197	0.34
198	0.38
199	0.38
200	0.36
201	0.33
202	0.29
203	0.29
204	0.28
205	0.24
206	0.2
207	0.18
208	0.2
209	0.2
210	0.21
211	0.16
212	0.17
213	0.17
214	0.16
215	0.17
216	0.15
217	0.15
218	0.13
219	0.13
220	0.13
221	0.17
222	0.17
223	0.15
224	0.16
225	0.15
226	0.14
227	0.14
228	0.14
229	0.1
230	0.1
231	0.1
232	0.09
233	0.1
234	0.11
235	0.09
236	0.09
237	0.1
238	0.1
239	0.11
240	0.12
241	0.11
242	0.14
243	0.15
244	0.19
245	0.23
246	0.26
247	0.31
248	0.38
249	0.49
250	0.55
251	0.61
252	0.62
253	0.58
254	0.58
255	0.52
256	0.44
257	0.35
258	0.31
259	0.26
260	0.22
261	0.21
262	0.17
263	0.17
264	0.15
265	0.13
266	0.09
267	0.07
268	0.07
269	0.06
270	0.06
271	0.06
272	0.07
273	0.07
274	0.08
275	0.09
276	0.08
277	0.07
278	0.09
279	0.09
280	0.1
281	0.1
282	0.13
283	0.13
284	0.14
285	0.14
286	0.13
287	0.14
288	0.13
289	0.13
290	0.1
291	0.1
292	0.1
293	0.09
294	0.08
295	0.08
296	0.09
297	0.09
298	0.1
299	0.1
300	0.1
301	0.1
302	0.1
303	0.09
304	0.08
305	0.07
306	0.05
307	0.05
308	0.05
309	0.07
310	0.07
311	0.07
312	0.07
313	0.07
314	0.08
315	0.08
316	0.09
317	0.08
318	0.08
319	0.09
320	0.09
321	0.1
322	0.1
323	0.13
324	0.12
325	0.12
326	0.15
327	0.14
328	0.16
329	0.17
330	0.22
331	0.23
332	0.23
333	0.24
334	0.22
335	0.23
336	0.23
337	0.29
338	0.3
339	0.29
340	0.29
341	0.29
342	0.31
343	0.3
344	0.31
345	0.26
346	0.22
347	0.21
348	0.23
349	0.22
350	0.21
351	0.2
352	0.17
353	0.18
354	0.16
355	0.16
356	0.12
357	0.13
358	0.12
359	0.11
360	0.11
361	0.09
362	0.06
363	0.05
364	0.05
365	0.04
366	0.05
367	0.04
368	0.05
369	0.05
370	0.06
371	0.06
372	0.08
373	0.08
374	0.08
375	0.11
376	0.12
377	0.13
378	0.2
379	0.21
380	0.19
381	0.21
382	0.23
383	0.21
384	0.21
385	0.23
386	0.15
387	0.16
388	0.15
389	0.14
390	0.12
391	0.11
392	0.12
393	0.09
394	0.08
395	0.06
396	0.06
397	0.06
398	0.06
399	0.06
400	0.05
401	0.04
402	0.04
403	0.04
404	0.04
405	0.04
406	0.04
407	0.04
408	0.04
409	0.04
410	0.04
411	0.04
412	0.04
413	0.05
414	0.05
415	0.06
416	0.08
417	0.08
418	0.08
419	0.08
420	0.1
421	0.1
422	0.1
423	0.09
424	0.08
425	0.08
426	0.08
427	0.08
428	0.05
429	0.05
430	0.04
431	0.04
432	0.03
433	0.03
434	0.02
435	0.02
436	0.03
437	0.03
438	0.03
439	0.03
440	0.04
441	0.05
442	0.06
443	0.06
444	0.06
445	0.07
446	0.08
447	0.08
448	0.07
449	0.07
450	0.07
451	0.07
452	0.07
453	0.05
454	0.05
455	0.05
456	0.05
457	0.04
458	0.04
459	0.03
460	0.03
461	0.03
462	0.05
463	0.05
464	0.04
465	0.05
466	0.05
467	0.07
468	0.09
469	0.09
470	0.08
471	0.13
472	0.13
473	0.14
474	0.15
475	0.16
476	0.14
477	0.15
478	0.15
479	0.15
480	0.2
481	0.21
482	0.24
483	0.24
484	0.26
485	0.26
486	0.27
487	0.3
488	0.28
489	0.35
490	0.42
491	0.49
492	0.55
493	0.65
494	0.74
495	0.78
496	0.86
497	0.87
498	0.87
499	0.85
500	0.81
501	0.77
502	0.75
503	0.64
504	0.55
505	0.48
506	0.39
507	0.31
508	0.28
509	0.23
510	0.15
511	0.15
512	0.14
513	0.12
514	0.13
515	0.16
516	0.16
517	0.17
518	0.17
519	0.17
520	0.17
521	0.16
522	0.16
523	0.13
524	0.12
525	0.1
526	0.1
527	0.11
528	0.11
529	0.12
530	0.11
531	0.11
532	0.11
533	0.11
534	0.13
535	0.13
536	0.12
537	0.13
538	0.16
539	0.17
540	0.2
541	0.23
542	0.24
543	0.24
544	0.26
545	0.26
546	0.26
547	0.29
548	0.26
549	0.24
550	0.22
551	0.2
552	0.17
553	0.16
554	0.13
555	0.08
556	0.09
557	0.08
558	0.08
559	0.1
560	0.12
561	0.12
562	0.17
563	0.2
564	0.22
565	0.27
566	0.28
567	0.28
568	0.27
569	0.26
570	0.21
571	0.19
572	0.14
573	0.09
574	0.1
575	0.09
576	0.09
577	0.1
578	0.09
579	0.09
580	0.09
581	0.09
582	0.08
583	0.11
584	0.1
585	0.1
586	0.11
587	0.11
588	0.11
589	0.11
590	0.1
591	0.08
592	0.1
593	0.09
594	0.09
595	0.11
596	0.11
597	0.1
598	0.1
599	0.09
600	0.07
601	0.06
602	0.06
603	0.05
604	0.05
605	0.05
606	0.05
607	0.05
608	0.05
609	0.05
610	0.05
611	0.06
612	0.06
613	0.07
614	0.09
615	0.11
616	0.12
617	0.12
618	0.13
619	0.15
620	0.19
621	0.19
622	0.17
623	0.16
624	0.15
625	0.15
626	0.15
627	0.13
628	0.09
629	0.09
630	0.08
631	0.07
632	0.07
633	0.07
634	0.05
635	0.06
636	0.06
637	0.07
638	0.08
639	0.09
640	0.09
641	0.1
642	0.11
643	0.1
644	0.11
645	0.12
646	0.13
647	0.12
648	0.13
649	0.16
650	0.19
651	0.24
652	0.26
653	0.32
654	0.36
655	0.43
656	0.51
657	0.56
658	0.6
659	0.62
660	0.69
661	0.7
662	0.7
663	0.71
664	0.66
665	0.63
666	0.59
667	0.58
668	0.48
669	0.41
670	0.37
671	0.31
672	0.28
673	0.25
674	0.23
675	0.18
676	0.18
677	0.16
678	0.14
679	0.13
680	0.11
681	0.09
682	0.08
683	0.07
684	0.07
685	0.07
686	0.07
687	0.06
688	0.06
689	0.06
690	0.06
691	0.05
692	0.05
693	0.04
694	0.04
695	0.04
696	0.05
697	0.05
698	0.05
699	0.05
700	0.05
701	0.05
702	0.05
703	0.05
704	0.04
705	0.04
706	0.05
707	0.05
708	0.05
709	0.06
710	0.06
711	0.07
712	0.07
713	0.08
714	0.08
715	0.07
716	0.08
717	0.07
718	0.08
719	0.08
720	0.07
721	0.07
722	0.07
723	0.07
724	0.07
725	0.07
726	0.06
727	0.06
728	0.06
729	0.05
730	0.05
731	0.06
732	0.06
733	0.06
734	0.05
735	0.06
736	0.07
737	0.07
738	0.09
739	0.1
740	0.1
741	0.1
742	0.11
743	0.11
744	0.1
745	0.1
746	0.09
747	0.09

A0A5C3LDH3

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer