FuNGI

A0A5C3KI61

Protein Details

Accession

A0A5C3KI61

Localization Confidence

High

Confidence Score

18.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
6-33	LSLLFVTKKKPVPKPKPKLKPPAAGAVP	Hydrophilic
160-185	VKTIAGDKQKQKKKLQKKPRQVFTVP	Hydrophilic
365-386	KEDEDRLKRRYRQHNKQRETGV	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
13-27	KKKPVPKPKPKLKPP
167-179	KQKQKKKLQKKPR
550-554	RKKIK

Subcellular Location(s)

mito 17.5, cyto_mito 9.833, nucl 7.5, cyto_nucl 4.833

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter

Amino Acid Sequences

MAPQTLSLLFVTKKKPVPKPKPKLKPPAAGAVPTISSASTAAAPPTEAKTTVTDFTDPEDRLKLPNSQYIEYPLLSSIHHGWKYNMMRFETRSKPIEILKWTEPVKLNRKDLLGAARLRANAAAANVPRAVKLMLGPDGEPVIGPDGNQVMVDADGRPIVKTIAGDKQKQKKKLQKKPRQVFTVPEKVLHLRQDERYPWVLEDSNPQLPEHWISQLDSDSTKSQTCAVLMPHAGETFKVVLTHRWYKFQKKINHNLPTNSKEMEAEFAKSQKKEYLANQAALAMLKQEEAVDDNGICGPGWRTLRTVSRTNFYQDWKDEDDDFGNVRRTQARMGQDAGHDEDVFEEDFADDDEGQAPHEDDEEGKEDEDRLKRRYRQHNKQRETGVDESDEEEEDAPQVNGYTNKIQKMIFNREGNSSYDTDEESNPYLSDGEISEEEVLEEVLTGPAVQVQPQQRGLKPTAANGPSSSIPAGASSSTPVVSNPEKLKVGGDVQSFGDGPKRMKLEIGPSDDLKAMGRKGPGDRAGTAPQVRYIDRAKRNAEDGIGGDARKKIKIDEGGGTGRTGKRA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.46
2	0.56
3	0.64
4	0.72
5	0.78
6	0.85
7	0.89
8	0.93
9	0.94
10	0.95
11	0.93
12	0.91
13	0.84
14	0.84
15	0.76
16	0.67
17	0.58
18	0.49
19	0.4
20	0.31
21	0.27
22	0.16
23	0.13
24	0.11
25	0.11
26	0.1
27	0.1
28	0.1
29	0.1
30	0.11
31	0.13
32	0.16
33	0.17
34	0.16
35	0.17
36	0.2
37	0.23
38	0.25
39	0.25
40	0.23
41	0.21
42	0.25
43	0.3
44	0.27
45	0.27
46	0.27
47	0.26
48	0.27
49	0.3
50	0.33
51	0.3
52	0.35
53	0.37
54	0.35
55	0.36
56	0.38
57	0.38
58	0.31
59	0.28
60	0.23
61	0.19
62	0.18
63	0.2
64	0.2
65	0.25
66	0.27
67	0.27
68	0.27
69	0.36
70	0.43
71	0.46
72	0.46
73	0.42
74	0.44
75	0.46
76	0.53
77	0.51
78	0.5
79	0.48
80	0.44
81	0.44
82	0.44
83	0.47
84	0.43
85	0.42
86	0.39
87	0.42
88	0.4
89	0.43
90	0.44
91	0.47
92	0.52
93	0.54
94	0.55
95	0.53
96	0.53
97	0.49
98	0.46
99	0.44
100	0.4
101	0.34
102	0.32
103	0.31
104	0.3
105	0.29
106	0.25
107	0.2
108	0.14
109	0.14
110	0.16
111	0.14
112	0.16
113	0.17
114	0.17
115	0.16
116	0.16
117	0.15
118	0.11
119	0.12
120	0.13
121	0.14
122	0.15
123	0.15
124	0.15
125	0.15
126	0.14
127	0.12
128	0.1
129	0.09
130	0.08
131	0.08
132	0.08
133	0.09
134	0.09
135	0.09
136	0.08
137	0.06
138	0.07
139	0.07
140	0.06
141	0.06
142	0.07
143	0.08
144	0.08
145	0.08
146	0.08
147	0.08
148	0.09
149	0.12
150	0.19
151	0.24
152	0.31
153	0.39
154	0.49
155	0.56
156	0.63
157	0.7
158	0.72
159	0.78
160	0.82
161	0.85
162	0.86
163	0.9
164	0.91
165	0.91
166	0.88
167	0.79
168	0.76
169	0.73
170	0.72
171	0.61
172	0.52
173	0.45
174	0.4
175	0.41
176	0.36
177	0.32
178	0.25
179	0.28
180	0.33
181	0.32
182	0.34
183	0.34
184	0.31
185	0.28
186	0.27
187	0.24
188	0.19
189	0.23
190	0.23
191	0.23
192	0.23
193	0.22
194	0.2
195	0.21
196	0.22
197	0.18
198	0.15
199	0.13
200	0.13
201	0.14
202	0.14
203	0.13
204	0.12
205	0.12
206	0.12
207	0.13
208	0.13
209	0.12
210	0.13
211	0.13
212	0.13
213	0.13
214	0.12
215	0.13
216	0.12
217	0.13
218	0.12
219	0.12
220	0.11
221	0.09
222	0.1
223	0.08
224	0.08
225	0.08
226	0.08
227	0.11
228	0.17
229	0.26
230	0.26
231	0.33
232	0.37
233	0.44
234	0.51
235	0.56
236	0.59
237	0.6
238	0.69
239	0.71
240	0.76
241	0.71
242	0.68
243	0.66
244	0.6
245	0.53
246	0.43
247	0.34
248	0.26
249	0.23
250	0.21
251	0.15
252	0.14
253	0.12
254	0.16
255	0.19
256	0.19
257	0.19
258	0.19
259	0.2
260	0.21
261	0.23
262	0.3
263	0.29
264	0.3
265	0.28
266	0.26
267	0.24
268	0.21
269	0.18
270	0.07
271	0.05
272	0.04
273	0.04
274	0.04
275	0.04
276	0.05
277	0.06
278	0.06
279	0.06
280	0.06
281	0.06
282	0.06
283	0.06
284	0.05
285	0.05
286	0.09
287	0.11
288	0.11
289	0.13
290	0.16
291	0.21
292	0.25
293	0.31
294	0.29
295	0.31
296	0.32
297	0.34
298	0.34
299	0.31
300	0.31
301	0.26
302	0.29
303	0.28
304	0.28
305	0.25
306	0.23
307	0.21
308	0.18
309	0.17
310	0.15
311	0.16
312	0.14
313	0.15
314	0.16
315	0.16
316	0.17
317	0.22
318	0.23
319	0.22
320	0.24
321	0.24
322	0.23
323	0.24
324	0.24
325	0.19
326	0.15
327	0.12
328	0.11
329	0.1
330	0.1
331	0.07
332	0.06
333	0.05
334	0.05
335	0.05
336	0.06
337	0.05
338	0.05
339	0.07
340	0.06
341	0.07
342	0.07
343	0.07
344	0.07
345	0.07
346	0.07
347	0.06
348	0.08
349	0.1
350	0.11
351	0.1
352	0.11
353	0.11
354	0.16
355	0.22
356	0.25
357	0.27
358	0.34
359	0.41
360	0.51
361	0.61
362	0.67
363	0.72
364	0.79
365	0.85
366	0.83
367	0.84
368	0.79
369	0.72
370	0.67
371	0.59
372	0.5
373	0.4
374	0.34
375	0.29
376	0.24
377	0.2
378	0.14
379	0.11
380	0.09
381	0.08
382	0.08
383	0.07
384	0.06
385	0.06
386	0.07
387	0.08
388	0.11
389	0.18
390	0.2
391	0.22
392	0.24
393	0.25
394	0.27
395	0.34
396	0.41
397	0.42
398	0.42
399	0.42
400	0.44
401	0.45
402	0.43
403	0.38
404	0.3
405	0.23
406	0.21
407	0.2
408	0.18
409	0.17
410	0.18
411	0.16
412	0.16
413	0.14
414	0.14
415	0.13
416	0.1
417	0.11
418	0.08
419	0.09
420	0.09
421	0.1
422	0.1
423	0.09
424	0.09
425	0.08
426	0.08
427	0.05
428	0.05
429	0.04
430	0.04
431	0.04
432	0.04
433	0.04
434	0.07
435	0.07
436	0.08
437	0.14
438	0.18
439	0.23
440	0.3
441	0.35
442	0.34
443	0.39
444	0.41
445	0.43
446	0.4
447	0.39
448	0.42
449	0.39
450	0.38
451	0.33
452	0.33
453	0.26
454	0.27
455	0.23
456	0.14
457	0.13
458	0.12
459	0.13
460	0.1
461	0.1
462	0.1
463	0.1
464	0.1
465	0.1
466	0.1
467	0.15
468	0.16
469	0.23
470	0.24
471	0.28
472	0.29
473	0.29
474	0.3
475	0.27
476	0.29
477	0.28
478	0.26
479	0.23
480	0.22
481	0.23
482	0.22
483	0.2
484	0.22
485	0.19
486	0.2
487	0.24
488	0.26
489	0.24
490	0.27
491	0.29
492	0.33
493	0.38
494	0.43
495	0.41
496	0.39
497	0.41
498	0.39
499	0.37
500	0.3
501	0.26
502	0.21
503	0.21
504	0.23
505	0.25
506	0.29
507	0.36
508	0.39
509	0.39
510	0.39
511	0.41
512	0.42
513	0.45
514	0.44
515	0.38
516	0.37
517	0.36
518	0.35
519	0.35
520	0.38
521	0.41
522	0.46
523	0.53
524	0.54
525	0.54
526	0.57
527	0.55
528	0.49
529	0.41
530	0.34
531	0.33
532	0.3
533	0.26
534	0.25
535	0.27
536	0.28
537	0.28
538	0.28
539	0.24
540	0.3
541	0.37
542	0.39
543	0.4
544	0.43
545	0.44
546	0.44
547	0.42
548	0.4

A0A5C3KI61

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer