FuNGI

A0A5C3LDM5

Protein Details

Accession

A0A5C3LDM5

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
851-871	GVFGGRPAVKKKPAKRRVGGF	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
856-869	RPAVKKKPAKRRVG

Subcellular Location(s)

nucl 15.5, cyto_nucl 11, cyto 5.5, pero 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR019350 RNA_pol_I-sp_TIF_RRN6-like

Amino Acid Sequences

MDAWPQDTRDSRITSSTYIRSKGDRSEYIGNAYPHIRQGMAGAATLVKKAGRLEWSFLKDPTAKARSWKLTETHNIFPCTRAPPFSKPTQTIKQRAEHGANFLRTHLADLDIPAEVIRDQLVEEAALESQLQKFDPQVGSLLAVMSRPVAAKSVSGCLAFAMGEVLNELNILNFSIHKDKPIVLRPTAESKISYNTPIRQLVAGGDSILAVRTLSDTHVLRVGKSTNTRLAETLATYPSGDLSNRNVFDIKLTKSELITVDHSGVIHVRDFGFSKKPIATVTPFEDQLHRSERFWRLGLDSNLRNGFLVSSDQLWSFDWREKGALRRDFSLQTPDYITSVEDGRGDNIVRLCSTSSLLWLDQRQMRRPLLSLKHYREFDRYLQIKTVGDTSPVTFLSTRKNKLISVYDASRGADHFFHSQSTPWELLPQSEDSQTSIGDAILSYPFELEPSNAVFFRLSEQAGLYAHKINSGDQSSDFPVQIISSNEIDNLALKSKKLSSTLGPLDGREYSEVDFSGVYEKLFRQYNENAEKFEESEAQEVYDLLDNMPSYFQRLEVPNEHLLSTYDVAFRAGEEPKSASRSDFLTGSILNSRRGYRGFQQGRLDSQTLSKGVAWHAKLDEIVERLDRNLASDMDETGKNLARYEVADYEQRPVESLRLEKANREQLTLDLALSQDVYSNHPLIETFDVDHALETMTEALTLGEEPPAVDFSFLKPSRRDHYNRAEATKGIALGTATRLLLKEWDIGTNPDSYRYRNPYTAGNEIAREPPPSKFAFPYPTPQSEPAPTPRPPQVVIGKTANPHDMFPKSSSQPQVQQPMAGGSQQLGAAPRWQDESQTQGAPMASTQVLPGVFGGRPAVKKKPAKRRVGGF

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.39
2	0.42
3	0.44
4	0.44
5	0.43
6	0.45
7	0.45
8	0.46
9	0.5
10	0.51
11	0.47
12	0.48
13	0.52
14	0.51
15	0.51
16	0.53
17	0.46
18	0.41
19	0.39
20	0.34
21	0.29
22	0.29
23	0.24
24	0.18
25	0.18
26	0.21
27	0.19
28	0.17
29	0.15
30	0.16
31	0.16
32	0.17
33	0.17
34	0.11
35	0.12
36	0.14
37	0.18
38	0.23
39	0.25
40	0.3
41	0.38
42	0.44
43	0.46
44	0.45
45	0.46
46	0.42
47	0.42
48	0.46
49	0.42
50	0.37
51	0.4
52	0.49
53	0.52
54	0.53
55	0.56
56	0.49
57	0.53
58	0.62
59	0.61
60	0.6
61	0.58
62	0.57
63	0.52
64	0.51
65	0.47
66	0.43
67	0.4
68	0.37
69	0.36
70	0.4
71	0.46
72	0.53
73	0.57
74	0.57
75	0.62
76	0.67
77	0.71
78	0.72
79	0.73
80	0.7
81	0.69
82	0.7
83	0.69
84	0.61
85	0.59
86	0.57
87	0.54
88	0.48
89	0.42
90	0.38
91	0.31
92	0.31
93	0.24
94	0.19
95	0.15
96	0.15
97	0.16
98	0.13
99	0.13
100	0.1
101	0.1
102	0.08
103	0.07
104	0.07
105	0.06
106	0.06
107	0.07
108	0.07
109	0.06
110	0.07
111	0.07
112	0.07
113	0.07
114	0.07
115	0.07
116	0.09
117	0.1
118	0.1
119	0.1
120	0.11
121	0.16
122	0.17
123	0.16
124	0.17
125	0.16
126	0.16
127	0.16
128	0.15
129	0.1
130	0.09
131	0.08
132	0.07
133	0.07
134	0.07
135	0.07
136	0.09
137	0.09
138	0.1
139	0.12
140	0.15
141	0.16
142	0.16
143	0.15
144	0.14
145	0.14
146	0.12
147	0.1
148	0.08
149	0.06
150	0.06
151	0.06
152	0.06
153	0.05
154	0.06
155	0.05
156	0.04
157	0.04
158	0.05
159	0.05
160	0.06
161	0.1
162	0.16
163	0.16
164	0.18
165	0.2
166	0.23
167	0.29
168	0.37
169	0.4
170	0.36
171	0.39
172	0.4
173	0.45
174	0.44
175	0.39
176	0.31
177	0.28
178	0.31
179	0.29
180	0.31
181	0.28
182	0.3
183	0.34
184	0.34
185	0.34
186	0.29
187	0.27
188	0.24
189	0.2
190	0.16
191	0.11
192	0.09
193	0.08
194	0.08
195	0.07
196	0.06
197	0.04
198	0.04
199	0.05
200	0.05
201	0.06
202	0.11
203	0.11
204	0.12
205	0.18
206	0.18
207	0.17
208	0.2
209	0.21
210	0.22
211	0.26
212	0.29
213	0.31
214	0.33
215	0.34
216	0.31
217	0.31
218	0.27
219	0.24
220	0.23
221	0.16
222	0.14
223	0.13
224	0.13
225	0.12
226	0.12
227	0.11
228	0.1
229	0.14
230	0.2
231	0.21
232	0.22
233	0.22
234	0.21
235	0.24
236	0.28
237	0.24
238	0.21
239	0.23
240	0.23
241	0.22
242	0.25
243	0.22
244	0.19
245	0.19
246	0.17
247	0.16
248	0.16
249	0.16
250	0.13
251	0.13
252	0.11
253	0.09
254	0.09
255	0.08
256	0.09
257	0.11
258	0.13
259	0.17
260	0.17
261	0.2
262	0.2
263	0.2
264	0.2
265	0.22
266	0.23
267	0.22
268	0.25
269	0.25
270	0.25
271	0.25
272	0.26
273	0.24
274	0.25
275	0.26
276	0.23
277	0.21
278	0.27
279	0.32
280	0.33
281	0.32
282	0.3
283	0.27
284	0.33
285	0.36
286	0.35
287	0.31
288	0.33
289	0.32
290	0.31
291	0.27
292	0.21
293	0.17
294	0.12
295	0.12
296	0.08
297	0.09
298	0.09
299	0.1
300	0.1
301	0.11
302	0.12
303	0.13
304	0.16
305	0.16
306	0.16
307	0.18
308	0.19
309	0.25
310	0.32
311	0.36
312	0.34
313	0.35
314	0.37
315	0.37
316	0.36
317	0.36
318	0.28
319	0.23
320	0.23
321	0.21
322	0.18
323	0.17
324	0.16
325	0.1
326	0.1
327	0.09
328	0.09
329	0.08
330	0.08
331	0.09
332	0.09
333	0.1
334	0.11
335	0.11
336	0.1
337	0.1
338	0.1
339	0.09
340	0.11
341	0.09
342	0.09
343	0.1
344	0.1
345	0.12
346	0.12
347	0.16
348	0.19
349	0.22
350	0.26
351	0.3
352	0.31
353	0.3
354	0.3
355	0.34
356	0.36
357	0.41
358	0.44
359	0.44
360	0.49
361	0.5
362	0.5
363	0.46
364	0.44
365	0.39
366	0.4
367	0.37
368	0.31
369	0.31
370	0.31
371	0.27
372	0.24
373	0.24
374	0.15
375	0.14
376	0.13
377	0.12
378	0.12
379	0.12
380	0.12
381	0.1
382	0.11
383	0.19
384	0.25
385	0.27
386	0.27
387	0.29
388	0.29
389	0.31
390	0.34
391	0.29
392	0.27
393	0.26
394	0.25
395	0.24
396	0.24
397	0.2
398	0.17
399	0.14
400	0.11
401	0.11
402	0.11
403	0.1
404	0.11
405	0.11
406	0.12
407	0.12
408	0.14
409	0.14
410	0.11
411	0.13
412	0.12
413	0.12
414	0.13
415	0.14
416	0.12
417	0.12
418	0.12
419	0.11
420	0.11
421	0.1
422	0.09
423	0.07
424	0.06
425	0.05
426	0.04
427	0.04
428	0.04
429	0.05
430	0.04
431	0.04
432	0.04
433	0.05
434	0.05
435	0.04
436	0.05
437	0.07
438	0.08
439	0.08
440	0.08
441	0.08
442	0.08
443	0.1
444	0.1
445	0.09
446	0.08
447	0.08
448	0.09
449	0.09
450	0.1
451	0.09
452	0.1
453	0.1
454	0.11
455	0.12
456	0.11
457	0.15
458	0.15
459	0.15
460	0.12
461	0.14
462	0.15
463	0.16
464	0.15
465	0.12
466	0.11
467	0.1
468	0.11
469	0.1
470	0.1
471	0.09
472	0.1
473	0.1
474	0.1
475	0.09
476	0.09
477	0.08
478	0.09
479	0.09
480	0.09
481	0.11
482	0.13
483	0.15
484	0.16
485	0.17
486	0.16
487	0.22
488	0.24
489	0.27
490	0.25
491	0.24
492	0.23
493	0.22
494	0.21
495	0.14
496	0.14
497	0.09
498	0.1
499	0.1
500	0.08
501	0.08
502	0.07
503	0.09
504	0.08
505	0.07
506	0.08
507	0.08
508	0.12
509	0.15
510	0.15
511	0.17
512	0.21
513	0.29
514	0.36
515	0.37
516	0.34
517	0.33
518	0.33
519	0.29
520	0.27
521	0.21
522	0.14
523	0.14
524	0.13
525	0.12
526	0.11
527	0.1
528	0.1
529	0.09
530	0.08
531	0.06
532	0.08
533	0.07
534	0.08
535	0.08
536	0.07
537	0.09
538	0.08
539	0.09
540	0.12
541	0.14
542	0.18
543	0.2
544	0.25
545	0.26
546	0.26
547	0.26
548	0.23
549	0.21
550	0.19
551	0.17
552	0.13
553	0.11
554	0.1
555	0.1
556	0.1
557	0.1
558	0.11
559	0.12
560	0.11
561	0.11
562	0.13
563	0.15
564	0.18
565	0.18
566	0.15
567	0.15
568	0.16
569	0.17
570	0.15
571	0.14
572	0.13
573	0.12
574	0.13
575	0.17
576	0.17
577	0.18
578	0.2
579	0.21
580	0.22
581	0.23
582	0.25
583	0.26
584	0.35
585	0.37
586	0.41
587	0.46
588	0.45
589	0.47
590	0.47
591	0.42
592	0.32
593	0.29
594	0.26
595	0.2
596	0.2
597	0.17
598	0.14
599	0.16
600	0.22
601	0.2
602	0.2
603	0.2
604	0.19
605	0.18
606	0.18
607	0.18
608	0.13
609	0.14
610	0.13
611	0.13
612	0.12
613	0.15
614	0.14
615	0.13
616	0.14
617	0.13
618	0.14
619	0.15
620	0.15
621	0.16
622	0.16
623	0.14
624	0.15
625	0.17
626	0.15
627	0.15
628	0.14
629	0.12
630	0.13
631	0.16
632	0.16
633	0.15
634	0.19
635	0.19
636	0.22
637	0.23
638	0.22
639	0.2
640	0.18
641	0.18
642	0.18
643	0.19
644	0.2
645	0.25
646	0.26
647	0.29
648	0.35
649	0.42
650	0.4
651	0.39
652	0.36
653	0.3
654	0.33
655	0.3
656	0.22
657	0.14
658	0.13
659	0.11
660	0.11
661	0.1
662	0.08
663	0.09
664	0.12
665	0.14
666	0.15
667	0.14
668	0.14
669	0.15
670	0.15
671	0.16
672	0.14
673	0.13
674	0.13
675	0.14
676	0.14
677	0.13
678	0.11
679	0.09
680	0.07
681	0.07
682	0.06
683	0.05
684	0.05
685	0.05
686	0.05
687	0.05
688	0.06
689	0.06
690	0.05
691	0.05
692	0.06
693	0.06
694	0.08
695	0.08
696	0.08
697	0.08
698	0.1
699	0.21
700	0.23
701	0.27
702	0.29
703	0.34
704	0.4
705	0.48
706	0.52
707	0.51
708	0.6
709	0.65
710	0.67
711	0.66
712	0.62
713	0.53
714	0.5
715	0.43
716	0.33
717	0.22
718	0.18
719	0.14
720	0.13
721	0.14
722	0.12
723	0.1
724	0.11
725	0.11
726	0.11
727	0.13
728	0.14
729	0.17
730	0.16
731	0.18
732	0.19
733	0.21
734	0.22
735	0.25
736	0.24
737	0.26
738	0.27
739	0.29
740	0.36
741	0.41
742	0.45
743	0.44
744	0.45
745	0.46
746	0.5
747	0.5
748	0.46
749	0.41
750	0.37
751	0.36
752	0.38
753	0.32
754	0.3
755	0.26
756	0.24
757	0.26
758	0.28
759	0.29
760	0.29
761	0.32
762	0.36
763	0.37
764	0.44
765	0.47
766	0.49
767	0.5
768	0.5
769	0.49
770	0.46
771	0.48
772	0.47
773	0.46
774	0.44
775	0.45
776	0.49
777	0.48
778	0.45
779	0.48
780	0.49
781	0.46
782	0.49
783	0.48
784	0.45
785	0.44
786	0.46
787	0.45
788	0.37
789	0.34
790	0.34
791	0.33
792	0.32
793	0.32
794	0.36
795	0.34
796	0.41
797	0.45
798	0.45
799	0.5
800	0.54
801	0.59
802	0.53
803	0.5
804	0.44
805	0.42
806	0.37
807	0.3
808	0.22
809	0.15
810	0.15
811	0.14
812	0.14
813	0.12
814	0.13
815	0.16
816	0.18
817	0.19
818	0.23
819	0.23
820	0.25
821	0.25
822	0.31
823	0.31
824	0.31
825	0.29
826	0.26
827	0.26
828	0.23
829	0.21
830	0.18
831	0.14
832	0.13
833	0.13
834	0.13
835	0.13
836	0.13
837	0.13
838	0.12
839	0.12
840	0.12
841	0.16
842	0.18
843	0.24
844	0.29
845	0.37
846	0.44
847	0.54
848	0.63
849	0.71
850	0.76
851	0.81

A0A5C3LDM5

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer