FuNGI

A0A5C3L397

Protein Details

Accession

A0A5C3L397

Localization Confidence

High

Confidence Score

18.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
263-401	EDEHDSRSRKKRKHGSDDEHERKRSKRKRSKKVNSDDESSDDHPSKKSRRKRGRSADSSSDSESEADVKKKKRKGKKIKDESDSSDNDDDARLKNKKRKKKRSRSSDSDSSSDSESEHRSRRSSKKSSKRSPSPFDYSG	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
269-295	RSRKKRKHGSDDEHERKRSKRKRSKKV
306-317	PSKKSRRKRGRS
330-341	VKKKKRKGKKIK
354-366	RLKNKKRKKKRSR
382-392	SRRSSKKSSKR

Subcellular Location(s)

nucl 24, cyto_nucl 14

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007832 RNA_pol_Rpc34 IPR016049 RNA_pol_Rpc34-like IPR036388 WH-like_DNA-bd_sf IPR036390 WH_DNA-bd_sf
Gene Ontology	GO:0005666 C:RNA polymerase III complex GO:0006383 P:transcription by RNA polymerase III
Pfam	View protein in Pfam PF05158 RNA_pol_Rpc34

Amino Acid Sequences

MSKRPPNEQESRLHQAALSAPKQELSPKQIEALIPESKDRQNAINFLLAVGLLKTLKDAKGNLVFRAVSKGELIAVKDLSGEENLVLGHIKSSGNEGIWTKHLKAKTNLHQTVIDRCLKTLIQKQLIKRVPSVQHPTRKIYMLSSIEPSIALTGGPWYTDNELDTEFIQHLTDACYKFICDISFPKRREGAEGALYPISNAPEYPSAQQIRNSLRKARLTETDLSVEHVESLLNVLVLDGKIEALPSFGTSLWDSNAINEESEDEHDSRSRKKRKHGSDDEHERKRSKRKRSKKVNSDDESSDDHPSKKSRRKRGRSADSSSDSESEADVKKKKRKGKKIKDESDSSDNDDDARLKNKKRKKKRSRSSDSDSSSDSESEHRSRRSSKKSSKRSPSPFDYSGYDNFDAGGGLVYRALKEEAPLVAWYQAPCALCPSFDFCKESGPVNPRECAYFEEWLETKPMTSLPDSGVV

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.47
2	0.41
3	0.41
4	0.41
5	0.35
6	0.29
7	0.28
8	0.29
9	0.3
10	0.34
11	0.33
12	0.32
13	0.35
14	0.34
15	0.36
16	0.38
17	0.37
18	0.35
19	0.33
20	0.31
21	0.27
22	0.28
23	0.31
24	0.31
25	0.34
26	0.32
27	0.33
28	0.33
29	0.36
30	0.35
31	0.35
32	0.32
33	0.28
34	0.26
35	0.2
36	0.16
37	0.12
38	0.11
39	0.07
40	0.07
41	0.09
42	0.12
43	0.14
44	0.17
45	0.18
46	0.24
47	0.33
48	0.35
49	0.34
50	0.35
51	0.34
52	0.31
53	0.36
54	0.29
55	0.21
56	0.19
57	0.19
58	0.17
59	0.19
60	0.19
61	0.16
62	0.15
63	0.14
64	0.14
65	0.14
66	0.13
67	0.11
68	0.1
69	0.07
70	0.08
71	0.07
72	0.07
73	0.08
74	0.06
75	0.06
76	0.08
77	0.08
78	0.08
79	0.12
80	0.13
81	0.13
82	0.16
83	0.16
84	0.17
85	0.21
86	0.24
87	0.23
88	0.26
89	0.3
90	0.33
91	0.4
92	0.47
93	0.53
94	0.6
95	0.61
96	0.58
97	0.59
98	0.54
99	0.55
100	0.51
101	0.47
102	0.36
103	0.34
104	0.34
105	0.31
106	0.35
107	0.35
108	0.37
109	0.4
110	0.44
111	0.47
112	0.55
113	0.6
114	0.56
115	0.51
116	0.5
117	0.46
118	0.49
119	0.56
120	0.54
121	0.57
122	0.59
123	0.61
124	0.56
125	0.54
126	0.47
127	0.39
128	0.38
129	0.32
130	0.3
131	0.28
132	0.25
133	0.23
134	0.22
135	0.2
136	0.13
137	0.09
138	0.07
139	0.04
140	0.05
141	0.05
142	0.06
143	0.06
144	0.07
145	0.09
146	0.1
147	0.1
148	0.1
149	0.1
150	0.11
151	0.1
152	0.1
153	0.09
154	0.09
155	0.08
156	0.07
157	0.07
158	0.09
159	0.14
160	0.14
161	0.14
162	0.14
163	0.14
164	0.15
165	0.16
166	0.13
167	0.1
168	0.16
169	0.23
170	0.31
171	0.33
172	0.36
173	0.38
174	0.38
175	0.4
176	0.37
177	0.33
178	0.3
179	0.29
180	0.27
181	0.23
182	0.23
183	0.18
184	0.16
185	0.13
186	0.08
187	0.07
188	0.07
189	0.09
190	0.11
191	0.12
192	0.16
193	0.18
194	0.2
195	0.22
196	0.26
197	0.3
198	0.36
199	0.37
200	0.37
201	0.4
202	0.43
203	0.43
204	0.42
205	0.39
206	0.36
207	0.36
208	0.33
209	0.3
210	0.25
211	0.24
212	0.21
213	0.17
214	0.12
215	0.1
216	0.08
217	0.05
218	0.06
219	0.04
220	0.04
221	0.03
222	0.03
223	0.04
224	0.04
225	0.04
226	0.03
227	0.03
228	0.03
229	0.04
230	0.04
231	0.03
232	0.04
233	0.04
234	0.05
235	0.05
236	0.06
237	0.07
238	0.07
239	0.07
240	0.09
241	0.08
242	0.08
243	0.11
244	0.1
245	0.09
246	0.09
247	0.09
248	0.08
249	0.1
250	0.12
251	0.09
252	0.1
253	0.13
254	0.15
255	0.22
256	0.31
257	0.39
258	0.42
259	0.52
260	0.62
261	0.69
262	0.78
263	0.81
264	0.8
265	0.81
266	0.87
267	0.86
268	0.83
269	0.77
270	0.69
271	0.65
272	0.67
273	0.65
274	0.66
275	0.68
276	0.72
277	0.79
278	0.87
279	0.92
280	0.92
281	0.94
282	0.93
283	0.86
284	0.8
285	0.7
286	0.62
287	0.55
288	0.46
289	0.39
290	0.3
291	0.27
292	0.25
293	0.3
294	0.36
295	0.41
296	0.49
297	0.57
298	0.66
299	0.75
300	0.83
301	0.88
302	0.89
303	0.88
304	0.86
305	0.84
306	0.77
307	0.7
308	0.61
309	0.5
310	0.4
311	0.31
312	0.24
313	0.19
314	0.17
315	0.19
316	0.24
317	0.31
318	0.39
319	0.47
320	0.56
321	0.63
322	0.72
323	0.78
324	0.83
325	0.87
326	0.9
327	0.92
328	0.9
329	0.85
330	0.8
331	0.75
332	0.65
333	0.59
334	0.48
335	0.39
336	0.32
337	0.27
338	0.23
339	0.18
340	0.24
341	0.26
342	0.33
343	0.42
344	0.51
345	0.61
346	0.71
347	0.8
348	0.84
349	0.88
350	0.92
351	0.94
352	0.95
353	0.94
354	0.91
355	0.9
356	0.83
357	0.74
358	0.65
359	0.56
360	0.47
361	0.37
362	0.29
363	0.23
364	0.23
365	0.26
366	0.31
367	0.32
368	0.36
369	0.44
370	0.53
371	0.6
372	0.66
373	0.71
374	0.75
375	0.83
376	0.89
377	0.91
378	0.92
379	0.91
380	0.89
381	0.86
382	0.84
383	0.75
384	0.68
385	0.6
386	0.53
387	0.47
388	0.45
389	0.37
390	0.29
391	0.26
392	0.23
393	0.2
394	0.16
395	0.13
396	0.07
397	0.06
398	0.08
399	0.08
400	0.08
401	0.1
402	0.12
403	0.1
404	0.11
405	0.14
406	0.13
407	0.14
408	0.15
409	0.14
410	0.15
411	0.17
412	0.16
413	0.15
414	0.18
415	0.16
416	0.16
417	0.2
418	0.18
419	0.17
420	0.19
421	0.24
422	0.25
423	0.28
424	0.31
425	0.26
426	0.32
427	0.33
428	0.34
429	0.35
430	0.38
431	0.43
432	0.43
433	0.46
434	0.41
435	0.42
436	0.4
437	0.38
438	0.35
439	0.32
440	0.29
441	0.32
442	0.32
443	0.31
444	0.32
445	0.27
446	0.23
447	0.19
448	0.2
449	0.17
450	0.18
451	0.2

A0A5C3L397

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer