Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A5DEQ1

Protein Details
Accession A5DEQ1    Localization Confidence High Confidence Score 21.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
143-170KTESYSFKAPKKQKKPKAKNQNTDQKAKHydrophilic
174-233SEKDKDTKETTKKPKKKSKKPKTPKDKDVSKEPNDPKIVEKKKKKKKPKAPQNAPGTAKQBasic
261-296GENDVKAPKINQKKKPKPPKKKPKGKPPASSPSNPQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
121-124RKKK
150-228KAPKKQKKPKAKNQNTDQKAKNKSSEKDKDTKETTKKPKKKSKKPKTPKDKDVSKEPNDPKIVEKKKKKKKPKAPQNAP
266-288KAPKINQKKKPKPPKKKPKGKPP
Subcellular Location(s) nucl 15, cyto_nucl 9.5, mito 8, cyto 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR005120  UPF3_dom  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
KEGG pgu:PGUG_01752  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF03467  Smg4_UPF3  
CDD cd12455  RRM_like_Smg4_UPF3  
Amino Acid Sequences MSSPSNKHTEAVRLVIRLLPPGLTQDQFEAQITQYTTQWHLVNNYYYVAGAYPEKPYELPTYSRAYFVVPDADTATKVQAELRAKAFSDGESNGASVPIIGKALYENKEYAAVPRTILKERKKKKTIEQLAQFQRFVAFLDGKTESYSFKAPKKQKKPKAKNQNTDQKAKNKSSEKDKDTKETTKKPKKKSKKPKTPKDKDVSKEPNDPKIVEKKKKKKKPKAPQNAPGTAKQGNKAPQPNKDSVSGEQSGQQSNQNSHKGENDVKAPKINQKKKPKPPKKKPKGKPPASSPSNPQGPAGSQTQPTNATS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.34
2 0.35
3 0.33
4 0.28
5 0.24
6 0.19
7 0.16
8 0.2
9 0.23
10 0.2
11 0.2
12 0.21
13 0.22
14 0.22
15 0.23
16 0.19
17 0.16
18 0.19
19 0.2
20 0.18
21 0.18
22 0.19
23 0.21
24 0.23
25 0.24
26 0.22
27 0.24
28 0.26
29 0.28
30 0.26
31 0.24
32 0.2
33 0.19
34 0.17
35 0.14
36 0.12
37 0.11
38 0.12
39 0.14
40 0.14
41 0.15
42 0.15
43 0.18
44 0.21
45 0.22
46 0.23
47 0.24
48 0.3
49 0.29
50 0.3
51 0.28
52 0.24
53 0.22
54 0.2
55 0.21
56 0.15
57 0.15
58 0.16
59 0.16
60 0.16
61 0.15
62 0.15
63 0.11
64 0.11
65 0.11
66 0.15
67 0.18
68 0.2
69 0.22
70 0.23
71 0.23
72 0.24
73 0.23
74 0.18
75 0.18
76 0.15
77 0.14
78 0.13
79 0.13
80 0.11
81 0.11
82 0.1
83 0.07
84 0.06
85 0.05
86 0.05
87 0.04
88 0.04
89 0.06
90 0.12
91 0.14
92 0.15
93 0.15
94 0.15
95 0.17
96 0.17
97 0.18
98 0.17
99 0.15
100 0.14
101 0.18
102 0.21
103 0.24
104 0.32
105 0.39
106 0.45
107 0.54
108 0.64
109 0.67
110 0.7
111 0.73
112 0.77
113 0.78
114 0.76
115 0.74
116 0.73
117 0.75
118 0.72
119 0.62
120 0.51
121 0.42
122 0.32
123 0.26
124 0.19
125 0.11
126 0.08
127 0.12
128 0.12
129 0.12
130 0.13
131 0.12
132 0.11
133 0.11
134 0.15
135 0.15
136 0.19
137 0.28
138 0.36
139 0.45
140 0.56
141 0.65
142 0.72
143 0.8
144 0.86
145 0.88
146 0.91
147 0.91
148 0.9
149 0.89
150 0.89
151 0.82
152 0.79
153 0.74
154 0.71
155 0.67
156 0.61
157 0.58
158 0.55
159 0.55
160 0.57
161 0.6
162 0.58
163 0.6
164 0.59
165 0.58
166 0.57
167 0.61
168 0.59
169 0.6
170 0.65
171 0.68
172 0.74
173 0.78
174 0.83
175 0.86
176 0.9
177 0.91
178 0.92
179 0.92
180 0.95
181 0.95
182 0.96
183 0.95
184 0.94
185 0.92
186 0.89
187 0.82
188 0.81
189 0.8
190 0.73
191 0.73
192 0.66
193 0.64
194 0.57
195 0.54
196 0.48
197 0.5
198 0.54
199 0.54
200 0.62
201 0.65
202 0.74
203 0.84
204 0.9
205 0.91
206 0.92
207 0.94
208 0.94
209 0.95
210 0.95
211 0.94
212 0.91
213 0.88
214 0.8
215 0.72
216 0.65
217 0.59
218 0.5
219 0.43
220 0.4
221 0.37
222 0.41
223 0.47
224 0.48
225 0.51
226 0.55
227 0.57
228 0.54
229 0.53
230 0.49
231 0.42
232 0.42
233 0.35
234 0.3
235 0.3
236 0.3
237 0.28
238 0.26
239 0.28
240 0.25
241 0.29
242 0.36
243 0.37
244 0.36
245 0.36
246 0.38
247 0.39
248 0.41
249 0.4
250 0.41
251 0.41
252 0.42
253 0.45
254 0.44
255 0.48
256 0.54
257 0.6
258 0.61
259 0.68
260 0.76
261 0.83
262 0.91
263 0.93
264 0.93
265 0.95
266 0.97
267 0.97
268 0.97
269 0.96
270 0.96
271 0.96
272 0.95
273 0.94
274 0.92
275 0.91
276 0.88
277 0.82
278 0.78
279 0.76
280 0.73
281 0.63
282 0.55
283 0.46
284 0.41
285 0.4
286 0.37
287 0.31
288 0.28
289 0.29
290 0.32