Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C3LB25

Protein Details
Accession A0A5C3LB25    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
82-108SNLNSNFRREHRKRRRPPSPESPKPYVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
89-102RREHRKRRRPPSPE
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 13, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR021627  Mediator_Med27  
Gene Ontology GO:0016592  C:mediator complex  
Pfam View protein in Pfam  
PF11571  Med27  
Amino Acid Sequences MSDSIEMLQARIASLSDLYSHIQAVRVIPSSILKRKPDPGLAPTRTVGSDFQQLRDFAGLVRSEPIQSALLDADERISADSSNLNSNFRREHRKRRRPPSPESPKPYVPGEKQRTSFFASSESLPRVTLDGLTVYTREFNQAQKEAKKPCRLHIWERTKGKGREQRPQTMRFTIPDVLTAYIKLGYTGADSVAIVQMLTAFGPRESKPPHKQSDFAVFRLLSQEIAKKIRSEEEVTLAAMVDLLCSYEDLFIQACTTCKYMLSAEGHVPPVVRLFKAGVREARHVTCQDESK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.09
2 0.09
3 0.09
4 0.11
5 0.12
6 0.13
7 0.13
8 0.13
9 0.14
10 0.15
11 0.16
12 0.17
13 0.18
14 0.17
15 0.17
16 0.22
17 0.28
18 0.34
19 0.4
20 0.41
21 0.44
22 0.51
23 0.55
24 0.57
25 0.54
26 0.55
27 0.58
28 0.56
29 0.55
30 0.49
31 0.45
32 0.38
33 0.35
34 0.28
35 0.21
36 0.27
37 0.24
38 0.26
39 0.28
40 0.28
41 0.27
42 0.26
43 0.23
44 0.15
45 0.18
46 0.16
47 0.13
48 0.14
49 0.14
50 0.13
51 0.13
52 0.15
53 0.12
54 0.11
55 0.11
56 0.1
57 0.1
58 0.1
59 0.09
60 0.08
61 0.07
62 0.07
63 0.07
64 0.07
65 0.06
66 0.07
67 0.09
68 0.1
69 0.16
70 0.16
71 0.19
72 0.19
73 0.22
74 0.27
75 0.29
76 0.39
77 0.41
78 0.52
79 0.6
80 0.71
81 0.79
82 0.84
83 0.9
84 0.87
85 0.88
86 0.88
87 0.87
88 0.86
89 0.83
90 0.78
91 0.7
92 0.65
93 0.6
94 0.55
95 0.49
96 0.5
97 0.5
98 0.49
99 0.49
100 0.48
101 0.47
102 0.45
103 0.4
104 0.3
105 0.26
106 0.22
107 0.21
108 0.22
109 0.2
110 0.16
111 0.15
112 0.15
113 0.12
114 0.11
115 0.1
116 0.07
117 0.06
118 0.07
119 0.07
120 0.07
121 0.06
122 0.07
123 0.07
124 0.09
125 0.1
126 0.11
127 0.15
128 0.19
129 0.23
130 0.27
131 0.32
132 0.38
133 0.44
134 0.5
135 0.48
136 0.48
137 0.54
138 0.55
139 0.56
140 0.59
141 0.61
142 0.61
143 0.63
144 0.63
145 0.62
146 0.59
147 0.61
148 0.58
149 0.53
150 0.55
151 0.57
152 0.62
153 0.59
154 0.62
155 0.57
156 0.54
157 0.51
158 0.42
159 0.4
160 0.33
161 0.27
162 0.23
163 0.21
164 0.17
165 0.16
166 0.15
167 0.12
168 0.1
169 0.09
170 0.08
171 0.07
172 0.06
173 0.06
174 0.06
175 0.06
176 0.05
177 0.05
178 0.05
179 0.06
180 0.05
181 0.04
182 0.04
183 0.04
184 0.04
185 0.04
186 0.04
187 0.04
188 0.05
189 0.08
190 0.09
191 0.16
192 0.21
193 0.31
194 0.4
195 0.48
196 0.56
197 0.56
198 0.58
199 0.55
200 0.61
201 0.55
202 0.47
203 0.43
204 0.34
205 0.31
206 0.32
207 0.28
208 0.18
209 0.16
210 0.19
211 0.19
212 0.23
213 0.23
214 0.22
215 0.24
216 0.27
217 0.29
218 0.29
219 0.27
220 0.28
221 0.27
222 0.26
223 0.24
224 0.2
225 0.16
226 0.12
227 0.1
228 0.06
229 0.04
230 0.05
231 0.05
232 0.05
233 0.06
234 0.06
235 0.06
236 0.07
237 0.07
238 0.07
239 0.08
240 0.09
241 0.1
242 0.12
243 0.13
244 0.12
245 0.12
246 0.14
247 0.15
248 0.2
249 0.22
250 0.23
251 0.26
252 0.28
253 0.29
254 0.28
255 0.27
256 0.21
257 0.24
258 0.23
259 0.19
260 0.18
261 0.19
262 0.22
263 0.27
264 0.33
265 0.33
266 0.36
267 0.42
268 0.46
269 0.47
270 0.49
271 0.45
272 0.43