FuNGI

A5DNH1

Protein Details

Accession

A5DNH1

Localization Confidence

Low

Confidence Score

5.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1070-1096	VTLDRQFQERRRLNQRRNRPKHALYGF	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

cyto 8.5, cyto_nucl 6, extr 5, E.R. 5, mito 3, nucl 2.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR026847 VPS13 IPR031645 VPS13_DH-like IPR009543 VPS13_VAB
KEGG	pgu:PGUG_04822 -
Pfam	View protein in Pfam PF06650 SHR-BD PF16909 VPS13_C

Amino Acid Sequences

MDPKPSMTIDVVSRQLAEITVSSRSVALLSQMLSLITDEGQMKSRENDDPYRIRNGTGFDIEVWSSHEPETKKVLKNNDTTSWSFEDWRAIRENLDSDNSRGQLAVKLLGSDYGTIDTIPVTGEGEELYVLTPSKVGYHNRLCADVSLGDDNIKTIWLRSTLKVQNDTDIAIVILLSGKAPGSGDSYVVQANEVQALPIDKIYESEIQIRPQVDVTYNWSDKKISWSQLLERSASLKCSAAQKQDVSTFNFEINAKYDQSEPLAKIYPHLTMVVSAPVEIENLLPYDFTYRIYDKKTKSDWSGLIQKGVKSYVHIVSLANLLMLSVEPIDCGFEKSEFAIINTPAKSEFNREHTISLRHKITGQHLKLRIHYPRKDGKAGIKLQVFSPYVILNKTNQSIRVSERNNIMHSNNSTLETSQPCMFSYDKFGDRQNRALLKIGDSNWTSPLSLDAIGQNNAVTAQIPNKQMGMDVAVSIEEGTGRYILTKVVTIAPRFILKNLLDEDLTFVETGSTKQFTLKKGEMQPLYGLRNVEEKSLSVKFTHNAKGWSSAFAISDIGQMFLKVGKEGVGQILLKVNILTENGTVFIQVENSNNHWPFSIRNFSDCDFYIYQADPNVNDRGEVVKRDTPYKPIYYKVPAKSVMPYAYDYPNAVIKELIIRCRGMERNVNLAEIGNLKPFRLPASQDQEHVIVDLNVVADGPTQSLILSNYDPSVSLYKLKGGTSSTVNVSQNFEANEVDENYHTRIVTRFEGFGISLINTRLQELCYVTLRGLEVRYNESDLYQNLSLKLKWIQVDNQLYGGIFPIVIYPTVVPKSGKEMNNHPSFSASVCKVKDDSHGVLFIKYATTLLQEMTIEIDEDFLFALLDFAKFPGASWNKKIEDKLCDDKLDLPEPASLSESSDVYFEALHLQPALTNLSFMRTERVNAEEKAPSQNTLMFFFNVLTMAIGNINDAPIKLNALFIENIRVPLPILIESIETHYGQAFLYQVHKILGSADFLGNPVGLFKNISSGVLDIFYEPYQGVVINDRPQELGIGIAKGGLSFVKKTVFGFSDSFAKVTGSLAKGLSVVTLDRQFQERRRLNQRRNRPKHALYGFASGANSFFESVSSGVTGFATAPMEGAANSGASGFFKGLGKGVVGLPTKTAIGFFDLASNVSEGIRNTTTVFDTDALDKVRLPRYISVDHVIRPYSQREAQGQFWLKSIDGGSCMNEQYLAHLVLPGEEKCILVTFRFIVLFAINTLKTNWMVHFEDISAITVEATGISIGLKKRNGPFIPIPEKANKSFLYNKIGLAVEKFNKKCQVEL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.24
2	0.23
3	0.19
4	0.17
5	0.13
6	0.12
7	0.14
8	0.14
9	0.14
10	0.14
11	0.14
12	0.13
13	0.11
14	0.12
15	0.12
16	0.12
17	0.13
18	0.13
19	0.12
20	0.12
21	0.12
22	0.11
23	0.09
24	0.11
25	0.11
26	0.13
27	0.18
28	0.19
29	0.21
30	0.23
31	0.27
32	0.3
33	0.34
34	0.4
35	0.44
36	0.5
37	0.52
38	0.58
39	0.55
40	0.5
41	0.47
42	0.44
43	0.41
44	0.35
45	0.33
46	0.24
47	0.26
48	0.25
49	0.22
50	0.22
51	0.19
52	0.18
53	0.18
54	0.22
55	0.21
56	0.25
57	0.34
58	0.38
59	0.42
60	0.47
61	0.56
62	0.59
63	0.66
64	0.68
65	0.67
66	0.64
67	0.6
68	0.59
69	0.53
70	0.47
71	0.41
72	0.36
73	0.38
74	0.33
75	0.35
76	0.35
77	0.31
78	0.31
79	0.31
80	0.33
81	0.27
82	0.32
83	0.3
84	0.29
85	0.34
86	0.33
87	0.3
88	0.28
89	0.25
90	0.23
91	0.23
92	0.23
93	0.17
94	0.18
95	0.17
96	0.19
97	0.18
98	0.15
99	0.14
100	0.12
101	0.11
102	0.1
103	0.1
104	0.09
105	0.08
106	0.08
107	0.07
108	0.06
109	0.06
110	0.07
111	0.06
112	0.07
113	0.06
114	0.06
115	0.06
116	0.06
117	0.07
118	0.07
119	0.07
120	0.07
121	0.1
122	0.16
123	0.2
124	0.29
125	0.36
126	0.42
127	0.44
128	0.46
129	0.43
130	0.38
131	0.37
132	0.29
133	0.24
134	0.2
135	0.18
136	0.17
137	0.16
138	0.16
139	0.13
140	0.13
141	0.1
142	0.09
143	0.11
144	0.16
145	0.2
146	0.22
147	0.31
148	0.36
149	0.43
150	0.48
151	0.46
152	0.45
153	0.42
154	0.41
155	0.31
156	0.25
157	0.19
158	0.12
159	0.11
160	0.06
161	0.06
162	0.05
163	0.05
164	0.05
165	0.05
166	0.05
167	0.06
168	0.07
169	0.1
170	0.1
171	0.11
172	0.12
173	0.13
174	0.14
175	0.14
176	0.13
177	0.1
178	0.11
179	0.12
180	0.11
181	0.09
182	0.09
183	0.1
184	0.11
185	0.1
186	0.11
187	0.08
188	0.09
189	0.13
190	0.15
191	0.16
192	0.23
193	0.25
194	0.26
195	0.3
196	0.3
197	0.27
198	0.25
199	0.25
200	0.2
201	0.19
202	0.23
203	0.28
204	0.3
205	0.31
206	0.31
207	0.3
208	0.29
209	0.36
210	0.35
211	0.31
212	0.34
213	0.37
214	0.41
215	0.48
216	0.49
217	0.43
218	0.37
219	0.36
220	0.31
221	0.29
222	0.24
223	0.18
224	0.18
225	0.24
226	0.28
227	0.31
228	0.35
229	0.35
230	0.38
231	0.43
232	0.44
233	0.4
234	0.4
235	0.35
236	0.3
237	0.31
238	0.28
239	0.23
240	0.23
241	0.21
242	0.18
243	0.18
244	0.19
245	0.17
246	0.2
247	0.23
248	0.2
249	0.21
250	0.25
251	0.23
252	0.24
253	0.24
254	0.23
255	0.19
256	0.19
257	0.16
258	0.13
259	0.14
260	0.15
261	0.13
262	0.11
263	0.1
264	0.09
265	0.09
266	0.09
267	0.08
268	0.06
269	0.06
270	0.07
271	0.06
272	0.06
273	0.09
274	0.09
275	0.11
276	0.14
277	0.16
278	0.21
279	0.28
280	0.35
281	0.36
282	0.44
283	0.47
284	0.49
285	0.51
286	0.54
287	0.5
288	0.49
289	0.55
290	0.48
291	0.49
292	0.45
293	0.41
294	0.36
295	0.35
296	0.29
297	0.22
298	0.25
299	0.21
300	0.2
301	0.19
302	0.18
303	0.17
304	0.18
305	0.15
306	0.11
307	0.08
308	0.07
309	0.06
310	0.06
311	0.05
312	0.04
313	0.04
314	0.04
315	0.04
316	0.06
317	0.06
318	0.08
319	0.09
320	0.09
321	0.1
322	0.1
323	0.13
324	0.12
325	0.13
326	0.15
327	0.15
328	0.2
329	0.19
330	0.19
331	0.17
332	0.19
333	0.19
334	0.21
335	0.24
336	0.26
337	0.32
338	0.32
339	0.33
340	0.35
341	0.42
342	0.41
343	0.43
344	0.38
345	0.34
346	0.35
347	0.36
348	0.42
349	0.45
350	0.44
351	0.46
352	0.5
353	0.51
354	0.53
355	0.56
356	0.57
357	0.55
358	0.56
359	0.56
360	0.59
361	0.62
362	0.62
363	0.58
364	0.56
365	0.56
366	0.55
367	0.53
368	0.47
369	0.43
370	0.39
371	0.42
372	0.35
373	0.26
374	0.23
375	0.18
376	0.17
377	0.17
378	0.18
379	0.14
380	0.16
381	0.19
382	0.2
383	0.21
384	0.22
385	0.23
386	0.27
387	0.34
388	0.33
389	0.34
390	0.38
391	0.39
392	0.39
393	0.39
394	0.35
395	0.31
396	0.3
397	0.3
398	0.24
399	0.23
400	0.22
401	0.19
402	0.22
403	0.18
404	0.2
405	0.18
406	0.17
407	0.16
408	0.18
409	0.18
410	0.15
411	0.2
412	0.22
413	0.22
414	0.23
415	0.29
416	0.34
417	0.37
418	0.4
419	0.41
420	0.4
421	0.38
422	0.42
423	0.37
424	0.31
425	0.33
426	0.29
427	0.27
428	0.25
429	0.25
430	0.22
431	0.21
432	0.19
433	0.14
434	0.14
435	0.11
436	0.1
437	0.1
438	0.1
439	0.12
440	0.12
441	0.12
442	0.11
443	0.1
444	0.09
445	0.09
446	0.07
447	0.05
448	0.08
449	0.13
450	0.15
451	0.15
452	0.15
453	0.15
454	0.15
455	0.15
456	0.13
457	0.08
458	0.07
459	0.07
460	0.06
461	0.06
462	0.06
463	0.05
464	0.04
465	0.03
466	0.04
467	0.04
468	0.04
469	0.05
470	0.05
471	0.06
472	0.06
473	0.06
474	0.07
475	0.12
476	0.15
477	0.15
478	0.16
479	0.16
480	0.18
481	0.18
482	0.18
483	0.18
484	0.16
485	0.19
486	0.19
487	0.19
488	0.16
489	0.16
490	0.17
491	0.13
492	0.13
493	0.09
494	0.07
495	0.07
496	0.07
497	0.08
498	0.08
499	0.08
500	0.08
501	0.13
502	0.17
503	0.19
504	0.25
505	0.26
506	0.31
507	0.35
508	0.42
509	0.38
510	0.36
511	0.36
512	0.33
513	0.33
514	0.28
515	0.23
516	0.17
517	0.21
518	0.2
519	0.19
520	0.15
521	0.14
522	0.16
523	0.17
524	0.18
525	0.14
526	0.15
527	0.17
528	0.21
529	0.26
530	0.25
531	0.25
532	0.25
533	0.3
534	0.29
535	0.28
536	0.24
537	0.19
538	0.17
539	0.16
540	0.15
541	0.09
542	0.11
543	0.09
544	0.09
545	0.08
546	0.07
547	0.07
548	0.08
549	0.08
550	0.06
551	0.06
552	0.06
553	0.06
554	0.07
555	0.07
556	0.08
557	0.07
558	0.08
559	0.1
560	0.09
561	0.09
562	0.08
563	0.08
564	0.07
565	0.07
566	0.07
567	0.05
568	0.05
569	0.06
570	0.06
571	0.06
572	0.06
573	0.05
574	0.06
575	0.07
576	0.08
577	0.09
578	0.12
579	0.17
580	0.17
581	0.17
582	0.16
583	0.16
584	0.16
585	0.2
586	0.24
587	0.19
588	0.21
589	0.23
590	0.23
591	0.25
592	0.23
593	0.24
594	0.17
595	0.17
596	0.17
597	0.15
598	0.15
599	0.14
600	0.14
601	0.1
602	0.12
603	0.13
604	0.11
605	0.11
606	0.1
607	0.13
608	0.13
609	0.14
610	0.15
611	0.17
612	0.18
613	0.22
614	0.23
615	0.24
616	0.27
617	0.3
618	0.28
619	0.27
620	0.3
621	0.32
622	0.39
623	0.36
624	0.37
625	0.33
626	0.32
627	0.32
628	0.31
629	0.26
630	0.2
631	0.19
632	0.17
633	0.17
634	0.16
635	0.15
636	0.13
637	0.14
638	0.13
639	0.12
640	0.09
641	0.08
642	0.14
643	0.15
644	0.16
645	0.14
646	0.14
647	0.14
648	0.19
649	0.2
650	0.17
651	0.22
652	0.21
653	0.27
654	0.27
655	0.27
656	0.23
657	0.21
658	0.19
659	0.15
660	0.14
661	0.11
662	0.1
663	0.1
664	0.11
665	0.11
666	0.13
667	0.12
668	0.15
669	0.18
670	0.27
671	0.28
672	0.28
673	0.3
674	0.28
675	0.26
676	0.23
677	0.17
678	0.08
679	0.07
680	0.06
681	0.05
682	0.04
683	0.04
684	0.03
685	0.03
686	0.04
687	0.04
688	0.04
689	0.04
690	0.04
691	0.05
692	0.05
693	0.06
694	0.07
695	0.07
696	0.07
697	0.07
698	0.07
699	0.08
700	0.09
701	0.08
702	0.1
703	0.1
704	0.13
705	0.14
706	0.14
707	0.14
708	0.14
709	0.15
710	0.14
711	0.16
712	0.15
713	0.18
714	0.19
715	0.18
716	0.19
717	0.18
718	0.18
719	0.16
720	0.16
721	0.11
722	0.11
723	0.11
724	0.09
725	0.1
726	0.09
727	0.09
728	0.1
729	0.11
730	0.1
731	0.1
732	0.11
733	0.13
734	0.15
735	0.15
736	0.14
737	0.14
738	0.14
739	0.14
740	0.12
741	0.1
742	0.08
743	0.07
744	0.08
745	0.09
746	0.08
747	0.09
748	0.09
749	0.09
750	0.1
751	0.1
752	0.11
753	0.11
754	0.12
755	0.11
756	0.11
757	0.11
758	0.11
759	0.11
760	0.11
761	0.1
762	0.13
763	0.14
764	0.14
765	0.14
766	0.14
767	0.15
768	0.13
769	0.16
770	0.14
771	0.14
772	0.14
773	0.16
774	0.15
775	0.15
776	0.18
777	0.17
778	0.17
779	0.18
780	0.2
781	0.26
782	0.29
783	0.28
784	0.25
785	0.23
786	0.21
787	0.19
788	0.17
789	0.09
790	0.05
791	0.04
792	0.04
793	0.05
794	0.05
795	0.05
796	0.05
797	0.08
798	0.09
799	0.1
800	0.1
801	0.1
802	0.16
803	0.23
804	0.27
805	0.27
806	0.34
807	0.41
808	0.46
809	0.46
810	0.4
811	0.35
812	0.31
813	0.29
814	0.27
815	0.2
816	0.19
817	0.19
818	0.21
819	0.2
820	0.21
821	0.24
822	0.25
823	0.25
824	0.21
825	0.24
826	0.23
827	0.22
828	0.21
829	0.17
830	0.12
831	0.1
832	0.08
833	0.06
834	0.06
835	0.07
836	0.06
837	0.07
838	0.07
839	0.07
840	0.08
841	0.07
842	0.07
843	0.06
844	0.07
845	0.06
846	0.06
847	0.06
848	0.04
849	0.04
850	0.04
851	0.04
852	0.04
853	0.04
854	0.04
855	0.05
856	0.05
857	0.05
858	0.05
859	0.14
860	0.19
861	0.22
862	0.26
863	0.33
864	0.35
865	0.39
866	0.42
867	0.37
868	0.38
869	0.41
870	0.45
871	0.41
872	0.39
873	0.37
874	0.39
875	0.38
876	0.34
877	0.28
878	0.22
879	0.2
880	0.2
881	0.19
882	0.16
883	0.13
884	0.12
885	0.12
886	0.11
887	0.1
888	0.1
889	0.09
890	0.08
891	0.07
892	0.06
893	0.09
894	0.09
895	0.09
896	0.09
897	0.09
898	0.09
899	0.1
900	0.12
901	0.08
902	0.09
903	0.09
904	0.11
905	0.12
906	0.12
907	0.14
908	0.12
909	0.14
910	0.15
911	0.18
912	0.2
913	0.2
914	0.23
915	0.23
916	0.24
917	0.29
918	0.28
919	0.26
920	0.23
921	0.25
922	0.23
923	0.23
924	0.23
925	0.16
926	0.16
927	0.15
928	0.14
929	0.11
930	0.1
931	0.07
932	0.05
933	0.05
934	0.06
935	0.05
936	0.06
937	0.05
938	0.06
939	0.06
940	0.06
941	0.07
942	0.07
943	0.09
944	0.08
945	0.09
946	0.09
947	0.11
948	0.12
949	0.11
950	0.15
951	0.14
952	0.15
953	0.15
954	0.14
955	0.12
956	0.13
957	0.14
958	0.09
959	0.09
960	0.08
961	0.09
962	0.09
963	0.12
964	0.13
965	0.12
966	0.11
967	0.11
968	0.11
969	0.1
970	0.1
971	0.08
972	0.07
973	0.1
974	0.1
975	0.11
976	0.11
977	0.11
978	0.1
979	0.12
980	0.11
981	0.1
982	0.11
983	0.11
984	0.1
985	0.11
986	0.11
987	0.09
988	0.08
989	0.08
990	0.07
991	0.07
992	0.08
993	0.07
994	0.11
995	0.12
996	0.12
997	0.11
998	0.11
999	0.11
1000	0.11
1001	0.11
1002	0.08
1003	0.09
1004	0.09
1005	0.09
1006	0.08
1007	0.08
1008	0.08
1009	0.08
1010	0.08
1011	0.1
1012	0.13
1013	0.18
1014	0.19
1015	0.2
1016	0.2
1017	0.2
1018	0.2
1019	0.16
1020	0.15
1021	0.11
1022	0.1
1023	0.09
1024	0.09
1025	0.09
1026	0.08
1027	0.09
1028	0.07
1029	0.08
1030	0.08
1031	0.1
1032	0.12
1033	0.13
1034	0.14
1035	0.19
1036	0.19
1037	0.2
1038	0.21
1039	0.21
1040	0.25
1041	0.25
1042	0.25
1043	0.2
1044	0.19
1045	0.16
1046	0.16
1047	0.19
1048	0.13
1049	0.15
1050	0.15
1051	0.15
1052	0.15
1053	0.14
1054	0.13
1055	0.09
1056	0.08
1057	0.1
1058	0.13
1059	0.14
1060	0.15
1061	0.2
1062	0.25
1063	0.31
1064	0.41
1065	0.45
1066	0.51
1067	0.61
1068	0.7
1069	0.76
1070	0.81
1071	0.87
1072	0.87
1073	0.89
1074	0.9
1075	0.88
1076	0.83
1077	0.83
1078	0.77
1079	0.73
1080	0.64
1081	0.6
1082	0.51
1083	0.44
1084	0.38
1085	0.28
1086	0.24
1087	0.18
1088	0.15
1089	0.1
1090	0.09
1091	0.07
1092	0.09
1093	0.09
1094	0.09
1095	0.08
1096	0.08
1097	0.08
1098	0.08
1099	0.08
1100	0.07
1101	0.08
1102	0.08
1103	0.07
1104	0.07
1105	0.07
1106	0.07
1107	0.07
1108	0.07
1109	0.06
1110	0.05
1111	0.05
1112	0.06
1113	0.06
1114	0.06
1115	0.07
1116	0.06
1117	0.08
1118	0.09
1119	0.1
1120	0.11
1121	0.11
1122	0.11
1123	0.12
1124	0.13
1125	0.17
1126	0.18
1127	0.18
1128	0.17
1129	0.18
1130	0.18
1131	0.16
1132	0.16
1133	0.1
1134	0.12
1135	0.13
1136	0.12
1137	0.13
1138	0.14
1139	0.14
1140	0.15
1141	0.14
1142	0.11
1143	0.1
1144	0.12
1145	0.1
1146	0.15
1147	0.15
1148	0.15
1149	0.16
1150	0.17
1151	0.18
1152	0.17
1153	0.19
1154	0.14
1155	0.16
1156	0.17
1157	0.19
1158	0.19
1159	0.19
1160	0.2
1161	0.24
1162	0.29
1163	0.3
1164	0.31
1165	0.33
1166	0.37
1167	0.4
1168	0.42
1169	0.42
1170	0.4
1171	0.4
1172	0.4
1173	0.36
1174	0.32
1175	0.32
1176	0.32
1177	0.33
1178	0.34
1179	0.36
1180	0.39
1181	0.42
1182	0.42
1183	0.48
1184	0.51
1185	0.45
1186	0.43
1187	0.39
1188	0.33
1189	0.3
1190	0.28
1191	0.2
1192	0.16
1193	0.17
1194	0.17
1195	0.18
1196	0.19
1197	0.16
1198	0.17
1199	0.15
1200	0.16
1201	0.18
1202	0.17
1203	0.14
1204	0.16
1205	0.15
1206	0.17
1207	0.2
1208	0.17
1209	0.16
1210	0.15
1211	0.15
1212	0.14
1213	0.17
1214	0.16
1215	0.13
1216	0.16
1217	0.15
1218	0.16
1219	0.17
1220	0.16
1221	0.15
1222	0.14
1223	0.15
1224	0.13
1225	0.16
1226	0.14
1227	0.15
1228	0.16
1229	0.17
1230	0.18
1231	0.2
1232	0.2
1233	0.21
1234	0.24
1235	0.25
1236	0.25
1237	0.23
1238	0.24
1239	0.22
1240	0.22
1241	0.17
1242	0.14
1243	0.12
1244	0.1
1245	0.1
1246	0.07
1247	0.07
1248	0.05
1249	0.04
1250	0.05
1251	0.09
1252	0.12
1253	0.19
1254	0.21
1255	0.27
1256	0.33
1257	0.43
1258	0.44
1259	0.48
1260	0.53
1261	0.57
1262	0.62
1263	0.59
1264	0.59
1265	0.58
1266	0.62
1267	0.57
1268	0.56
1269	0.47
1270	0.45
1271	0.5
1272	0.51
1273	0.51
1274	0.47
1275	0.44
1276	0.43
1277	0.43
1278	0.37
1279	0.33
1280	0.35
1281	0.34
1282	0.42
1283	0.44
1284	0.46
1285	0.53

A5DNH1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer