Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A5C3KNW1

Protein Details
Accession A0A5C3KNW1    Localization Confidence High Confidence Score 18.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
543-564LANEKRRRRRESHNAVERRRRDBasic
769-791RKGHHKHSSSSSRPKPPRLPSMPBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
547-562KRRRRRESHNAVERRR
768-784ARKGHHKHSSSSSRPKP
Subcellular Location(s) nucl 26, cyto_nucl 14.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011598  bHLH_dom  
IPR036638  HLH_DNA-bd_sf  
Gene Ontology GO:0046983  F:protein dimerization activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF00010  HLH  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50888  BHLH  
CDD cd11387  bHLHzip_USF_MITF  
Amino Acid Sequences MSFFSAAPATTYKAQVRVEGFHLPSPGTPPGGTSGSNNAGGSNGNGSGNNMNDLFPQSFLPDAFRKFPPPAGSGEGSHDFNDDLVSLMGDRTSGPTQSGAGGGGGTGAGAGGGGGNGGAYDDGYHRTHNIFDVSSPIPVNTNPNGVPNGGNNGTGSQPSSLHSPSTSLHDYHNHPPPHFNSTLPALNSSMRYEPPPENNPLTPSSPQLGGNPPPSSYHNPHNGFARQTPSPSHTQPGSVPANGRPRSHSRPPSSTNATGSNPSAALSALNSGGVGPARTTRTRRGNSISGTSPPPLHGRPHAILIPGGGQRGAHGGIVGSPMSAGANPSNGNPWFMSQGQNQNSADYLPTPESLGSHQSVHSSLPSHHHSHSHSGYGPFSLSPPPQSSTGPNSDLSHHLPPLHHMAHSLPKSPLEQHLPHPHHHQHHLSGSGLPKSPLDHSYQSSYGFGSGNVNGSGSNGSPSGASPGSLPSVLGGGLGSSNGPNGMTALAAGGVPAAGSSYGMGNMGMGLSVGSAPGSGAQQSAIAAPAAPTPHVADKQALLANEKRRRRRESHNAVERRRRDNINEKISELATLIPECLLDGTGPPNAKDNGASITPPLTEDALVPKGPQDPALKLEKDDDGVPVNGVDGAAVVKANKGMILRKSVEYIRYLQQLVTAQGARNRELEQELRKFRGEPLSSESPDVDGGIGRNDSLEQMRKALSSLDDDEGSLEGDDSMSLGLGGGNDGEMVLHDEFLASPTLSSVGSGGGNSSANNGTAPIKGGVARKGHHKHSSSSSRPKPPRLPSMPEEDMEVDKGGEGNVNVNGTGSLSPESSGTHESANSNGQAGGEDDFERGRARGVRTGMGGPNFKEELMEDGGVDHSMGEIDSMFGMMNGHGHHQLHNHHQQHQQVGMW
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.32
2 0.35
3 0.37
4 0.36
5 0.37
6 0.39
7 0.38
8 0.35
9 0.35
10 0.31
11 0.28
12 0.3
13 0.28
14 0.23
15 0.21
16 0.19
17 0.22
18 0.24
19 0.23
20 0.21
21 0.25
22 0.26
23 0.29
24 0.27
25 0.23
26 0.21
27 0.21
28 0.2
29 0.16
30 0.13
31 0.12
32 0.12
33 0.15
34 0.17
35 0.18
36 0.19
37 0.18
38 0.17
39 0.17
40 0.21
41 0.19
42 0.17
43 0.17
44 0.15
45 0.16
46 0.16
47 0.2
48 0.22
49 0.25
50 0.29
51 0.31
52 0.35
53 0.36
54 0.41
55 0.4
56 0.37
57 0.37
58 0.38
59 0.38
60 0.34
61 0.38
62 0.36
63 0.32
64 0.31
65 0.27
66 0.21
67 0.19
68 0.18
69 0.12
70 0.09
71 0.08
72 0.08
73 0.07
74 0.07
75 0.07
76 0.07
77 0.07
78 0.1
79 0.12
80 0.13
81 0.13
82 0.14
83 0.15
84 0.16
85 0.16
86 0.12
87 0.1
88 0.09
89 0.07
90 0.07
91 0.06
92 0.04
93 0.03
94 0.03
95 0.02
96 0.02
97 0.02
98 0.02
99 0.02
100 0.02
101 0.02
102 0.02
103 0.02
104 0.03
105 0.03
106 0.03
107 0.04
108 0.06
109 0.1
110 0.11
111 0.13
112 0.14
113 0.16
114 0.17
115 0.18
116 0.2
117 0.16
118 0.16
119 0.2
120 0.19
121 0.2
122 0.19
123 0.17
124 0.16
125 0.17
126 0.22
127 0.18
128 0.22
129 0.2
130 0.23
131 0.24
132 0.24
133 0.24
134 0.2
135 0.24
136 0.21
137 0.21
138 0.18
139 0.18
140 0.18
141 0.17
142 0.17
143 0.12
144 0.11
145 0.12
146 0.16
147 0.16
148 0.16
149 0.16
150 0.17
151 0.17
152 0.23
153 0.24
154 0.21
155 0.23
156 0.28
157 0.33
158 0.38
159 0.46
160 0.43
161 0.41
162 0.46
163 0.46
164 0.48
165 0.44
166 0.37
167 0.31
168 0.33
169 0.36
170 0.31
171 0.29
172 0.23
173 0.24
174 0.25
175 0.24
176 0.22
177 0.19
178 0.2
179 0.23
180 0.26
181 0.31
182 0.35
183 0.38
184 0.39
185 0.39
186 0.41
187 0.39
188 0.38
189 0.32
190 0.31
191 0.27
192 0.25
193 0.24
194 0.24
195 0.26
196 0.27
197 0.31
198 0.29
199 0.27
200 0.28
201 0.32
202 0.37
203 0.36
204 0.39
205 0.43
206 0.46
207 0.47
208 0.51
209 0.49
210 0.44
211 0.43
212 0.4
213 0.32
214 0.31
215 0.32
216 0.3
217 0.32
218 0.31
219 0.32
220 0.28
221 0.29
222 0.28
223 0.32
224 0.31
225 0.27
226 0.27
227 0.28
228 0.37
229 0.39
230 0.39
231 0.37
232 0.42
233 0.48
234 0.56
235 0.6
236 0.57
237 0.62
238 0.66
239 0.68
240 0.67
241 0.62
242 0.55
243 0.5
244 0.45
245 0.39
246 0.35
247 0.28
248 0.21
249 0.18
250 0.15
251 0.11
252 0.09
253 0.07
254 0.07
255 0.06
256 0.06
257 0.06
258 0.05
259 0.06
260 0.06
261 0.06
262 0.05
263 0.08
264 0.12
265 0.17
266 0.21
267 0.29
268 0.38
269 0.41
270 0.46
271 0.49
272 0.51
273 0.5
274 0.51
275 0.44
276 0.38
277 0.37
278 0.33
279 0.27
280 0.23
281 0.24
282 0.22
283 0.22
284 0.23
285 0.26
286 0.26
287 0.29
288 0.28
289 0.25
290 0.23
291 0.2
292 0.2
293 0.16
294 0.15
295 0.11
296 0.1
297 0.09
298 0.11
299 0.11
300 0.07
301 0.06
302 0.06
303 0.06
304 0.07
305 0.07
306 0.05
307 0.04
308 0.04
309 0.05
310 0.05
311 0.05
312 0.05
313 0.06
314 0.07
315 0.08
316 0.12
317 0.12
318 0.13
319 0.13
320 0.13
321 0.15
322 0.15
323 0.18
324 0.18
325 0.26
326 0.27
327 0.32
328 0.31
329 0.28
330 0.28
331 0.25
332 0.21
333 0.13
334 0.13
335 0.09
336 0.09
337 0.09
338 0.09
339 0.09
340 0.1
341 0.12
342 0.12
343 0.12
344 0.12
345 0.12
346 0.13
347 0.13
348 0.12
349 0.11
350 0.11
351 0.15
352 0.19
353 0.21
354 0.22
355 0.25
356 0.26
357 0.31
358 0.31
359 0.29
360 0.27
361 0.25
362 0.24
363 0.21
364 0.19
365 0.13
366 0.12
367 0.13
368 0.11
369 0.12
370 0.14
371 0.15
372 0.16
373 0.18
374 0.19
375 0.21
376 0.24
377 0.24
378 0.23
379 0.22
380 0.22
381 0.24
382 0.25
383 0.22
384 0.19
385 0.18
386 0.17
387 0.18
388 0.22
389 0.2
390 0.16
391 0.15
392 0.16
393 0.22
394 0.23
395 0.24
396 0.19
397 0.19
398 0.2
399 0.21
400 0.23
401 0.21
402 0.22
403 0.26
404 0.35
405 0.37
406 0.38
407 0.43
408 0.45
409 0.43
410 0.46
411 0.42
412 0.35
413 0.35
414 0.34
415 0.28
416 0.25
417 0.23
418 0.2
419 0.19
420 0.16
421 0.14
422 0.14
423 0.15
424 0.14
425 0.16
426 0.16
427 0.17
428 0.2
429 0.21
430 0.2
431 0.19
432 0.17
433 0.14
434 0.12
435 0.1
436 0.09
437 0.08
438 0.08
439 0.08
440 0.08
441 0.07
442 0.07
443 0.07
444 0.06
445 0.06
446 0.05
447 0.05
448 0.05
449 0.06
450 0.08
451 0.07
452 0.07
453 0.07
454 0.08
455 0.08
456 0.08
457 0.08
458 0.05
459 0.06
460 0.05
461 0.05
462 0.04
463 0.03
464 0.03
465 0.03
466 0.03
467 0.03
468 0.03
469 0.03
470 0.03
471 0.03
472 0.03
473 0.03
474 0.03
475 0.03
476 0.03
477 0.03
478 0.03
479 0.03
480 0.03
481 0.02
482 0.02
483 0.02
484 0.02
485 0.02
486 0.02
487 0.02
488 0.03
489 0.03
490 0.03
491 0.03
492 0.03
493 0.03
494 0.03
495 0.03
496 0.02
497 0.02
498 0.02
499 0.02
500 0.02
501 0.02
502 0.02
503 0.02
504 0.03
505 0.04
506 0.04
507 0.04
508 0.04
509 0.04
510 0.05
511 0.05
512 0.05
513 0.05
514 0.04
515 0.05
516 0.06
517 0.06
518 0.06
519 0.06
520 0.08
521 0.1
522 0.11
523 0.12
524 0.11
525 0.12
526 0.15
527 0.16
528 0.15
529 0.15
530 0.19
531 0.28
532 0.35
533 0.42
534 0.48
535 0.54
536 0.61
537 0.64
538 0.69
539 0.71
540 0.74
541 0.78
542 0.79
543 0.81
544 0.81
545 0.84
546 0.8
547 0.74
548 0.69
549 0.61
550 0.58
551 0.59
552 0.61
553 0.6
554 0.56
555 0.51
556 0.47
557 0.44
558 0.37
559 0.27
560 0.18
561 0.1
562 0.09
563 0.08
564 0.06
565 0.06
566 0.06
567 0.05
568 0.05
569 0.04
570 0.04
571 0.06
572 0.09
573 0.09
574 0.1
575 0.13
576 0.13
577 0.14
578 0.14
579 0.13
580 0.13
581 0.13
582 0.13
583 0.11
584 0.11
585 0.11
586 0.11
587 0.1
588 0.08
589 0.08
590 0.08
591 0.11
592 0.12
593 0.12
594 0.12
595 0.13
596 0.15
597 0.15
598 0.19
599 0.18
600 0.17
601 0.21
602 0.27
603 0.26
604 0.25
605 0.27
606 0.23
607 0.22
608 0.21
609 0.18
610 0.14
611 0.14
612 0.13
613 0.11
614 0.1
615 0.08
616 0.08
617 0.06
618 0.04
619 0.04
620 0.04
621 0.04
622 0.04
623 0.04
624 0.05
625 0.05
626 0.07
627 0.08
628 0.12
629 0.15
630 0.21
631 0.23
632 0.24
633 0.27
634 0.28
635 0.29
636 0.27
637 0.28
638 0.26
639 0.27
640 0.27
641 0.23
642 0.24
643 0.24
644 0.22
645 0.22
646 0.19
647 0.17
648 0.2
649 0.22
650 0.21
651 0.21
652 0.21
653 0.19
654 0.21
655 0.25
656 0.29
657 0.36
658 0.39
659 0.4
660 0.4
661 0.39
662 0.39
663 0.43
664 0.37
665 0.32
666 0.35
667 0.4
668 0.39
669 0.39
670 0.36
671 0.27
672 0.26
673 0.23
674 0.15
675 0.09
676 0.08
677 0.09
678 0.09
679 0.08
680 0.08
681 0.08
682 0.09
683 0.13
684 0.17
685 0.16
686 0.18
687 0.19
688 0.19
689 0.19
690 0.19
691 0.17
692 0.16
693 0.18
694 0.18
695 0.18
696 0.17
697 0.18
698 0.16
699 0.15
700 0.11
701 0.08
702 0.06
703 0.05
704 0.05
705 0.05
706 0.04
707 0.04
708 0.03
709 0.03
710 0.04
711 0.04
712 0.04
713 0.04
714 0.04
715 0.04
716 0.04
717 0.03
718 0.03
719 0.07
720 0.07
721 0.07
722 0.07
723 0.07
724 0.08
725 0.09
726 0.1
727 0.07
728 0.06
729 0.07
730 0.08
731 0.08
732 0.08
733 0.07
734 0.07
735 0.07
736 0.07
737 0.07
738 0.08
739 0.08
740 0.08
741 0.11
742 0.1
743 0.1
744 0.1
745 0.11
746 0.11
747 0.12
748 0.14
749 0.12
750 0.12
751 0.16
752 0.19
753 0.23
754 0.26
755 0.28
756 0.36
757 0.42
758 0.49
759 0.54
760 0.53
761 0.53
762 0.59
763 0.68
764 0.67
765 0.71
766 0.73
767 0.75
768 0.8
769 0.84
770 0.83
771 0.81
772 0.82
773 0.79
774 0.77
775 0.7
776 0.72
777 0.66
778 0.56
779 0.51
780 0.42
781 0.36
782 0.3
783 0.26
784 0.17
785 0.14
786 0.13
787 0.11
788 0.1
789 0.09
790 0.1
791 0.11
792 0.12
793 0.11
794 0.11
795 0.11
796 0.11
797 0.11
798 0.1
799 0.1
800 0.1
801 0.1
802 0.1
803 0.12
804 0.13
805 0.15
806 0.15
807 0.15
808 0.17
809 0.17
810 0.19
811 0.22
812 0.2
813 0.18
814 0.17
815 0.16
816 0.15
817 0.15
818 0.13
819 0.12
820 0.12
821 0.12
822 0.12
823 0.13
824 0.14
825 0.13
826 0.16
827 0.19
828 0.23
829 0.28
830 0.31
831 0.33
832 0.34
833 0.39
834 0.4
835 0.4
836 0.4
837 0.35
838 0.38
839 0.35
840 0.32
841 0.28
842 0.23
843 0.22
844 0.22
845 0.21
846 0.15
847 0.15
848 0.16
849 0.15
850 0.15
851 0.1
852 0.06
853 0.06
854 0.06
855 0.05
856 0.05
857 0.05
858 0.05
859 0.06
860 0.05
861 0.05
862 0.06
863 0.06
864 0.08
865 0.09
866 0.12
867 0.16
868 0.17
869 0.2
870 0.24
871 0.3
872 0.38
873 0.47
874 0.49
875 0.52
876 0.57
877 0.6
878 0.6