Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C3KT16

Protein Details
Accession A0A5C3KT16    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
389-413SSSNGAKPAKRRRRAPSPSRWVPLSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
395-404KPAKRRRRAP
Subcellular Location(s) nucl 10.5, cyto_nucl 8, mito 5, cyto 4.5, extr 3, plas 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036236  Znf_C2H2_sf  
IPR013087  Znf_C2H2_type  
Pfam View protein in Pfam  
PF00096  zf-C2H2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00028  ZINC_FINGER_C2H2_1  
PS50157  ZINC_FINGER_C2H2_2  
Amino Acid Sequences MQTQYGAVVALHGQQQNQQQREAFGAYPSFYPPNYLAGVNFTHGFLGGSSQSYALAPDGLYRGGPAYRASATTSGEEFDATGLGFSGGSMSGSLFAGEDAAPGYFGDAGWSWAEEDQQQQEQAQGLAHGVVAPVPMLPAPPEVSFLAIKSKGSAAAAIVRSPGPPLPTPAAMAVLLNGRSRSDGGQGGYDDGSAGAAAAAAAMPVPVPVPAPQPSVVVPENSTSREKKHACTMCHKRFDRPSTLRKHLLVHTGEKGAWVGLKGAGERLMVAAVAVCLAFVCEICGRRFGVASNLNRHVKRCVLKPVNMAASSKSCSESASGGEDAGAGSSPQASPVATSPEMSPPAQKRPSVSLSASSSPPQRGRAPPSISSSASSPLFNDPIPTTTTSSSNGAKPAKRRRRAPSPSRWVPLSLLQFNLISDDFYRTVQVPMPPVRRCLPKEERDSWDENTSPRPYHPESWDGVLPGPGLPQNQGLKPREASKLNFGSGGSASAFMVGRILVF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.22
2 0.32
3 0.4
4 0.42
5 0.43
6 0.4
7 0.4
8 0.43
9 0.41
10 0.32
11 0.27
12 0.26
13 0.23
14 0.22
15 0.24
16 0.23
17 0.2
18 0.23
19 0.2
20 0.22
21 0.23
22 0.22
23 0.19
24 0.2
25 0.21
26 0.2
27 0.2
28 0.16
29 0.14
30 0.14
31 0.13
32 0.1
33 0.11
34 0.1
35 0.11
36 0.11
37 0.11
38 0.11
39 0.11
40 0.12
41 0.09
42 0.09
43 0.08
44 0.09
45 0.11
46 0.11
47 0.1
48 0.1
49 0.11
50 0.11
51 0.12
52 0.11
53 0.13
54 0.14
55 0.15
56 0.18
57 0.18
58 0.2
59 0.21
60 0.2
61 0.18
62 0.17
63 0.16
64 0.13
65 0.11
66 0.09
67 0.06
68 0.06
69 0.05
70 0.05
71 0.05
72 0.04
73 0.05
74 0.04
75 0.05
76 0.05
77 0.05
78 0.06
79 0.06
80 0.06
81 0.05
82 0.05
83 0.06
84 0.06
85 0.06
86 0.05
87 0.05
88 0.05
89 0.05
90 0.06
91 0.05
92 0.05
93 0.07
94 0.06
95 0.08
96 0.08
97 0.08
98 0.09
99 0.09
100 0.1
101 0.1
102 0.13
103 0.15
104 0.16
105 0.17
106 0.16
107 0.17
108 0.17
109 0.17
110 0.14
111 0.1
112 0.09
113 0.08
114 0.08
115 0.07
116 0.05
117 0.05
118 0.05
119 0.04
120 0.04
121 0.04
122 0.04
123 0.04
124 0.05
125 0.06
126 0.09
127 0.09
128 0.11
129 0.11
130 0.13
131 0.13
132 0.13
133 0.17
134 0.16
135 0.16
136 0.14
137 0.15
138 0.14
139 0.14
140 0.13
141 0.09
142 0.14
143 0.14
144 0.14
145 0.14
146 0.14
147 0.13
148 0.14
149 0.15
150 0.12
151 0.12
152 0.15
153 0.17
154 0.17
155 0.18
156 0.17
157 0.17
158 0.14
159 0.13
160 0.1
161 0.1
162 0.1
163 0.1
164 0.1
165 0.09
166 0.1
167 0.11
168 0.11
169 0.12
170 0.13
171 0.13
172 0.15
173 0.15
174 0.15
175 0.14
176 0.13
177 0.1
178 0.07
179 0.07
180 0.04
181 0.04
182 0.02
183 0.02
184 0.02
185 0.02
186 0.02
187 0.02
188 0.02
189 0.02
190 0.02
191 0.02
192 0.02
193 0.03
194 0.04
195 0.05
196 0.08
197 0.1
198 0.12
199 0.12
200 0.13
201 0.13
202 0.17
203 0.17
204 0.15
205 0.14
206 0.14
207 0.15
208 0.16
209 0.2
210 0.17
211 0.19
212 0.27
213 0.28
214 0.28
215 0.36
216 0.4
217 0.4
218 0.49
219 0.58
220 0.57
221 0.65
222 0.64
223 0.61
224 0.63
225 0.65
226 0.64
227 0.6
228 0.6
229 0.59
230 0.64
231 0.61
232 0.54
233 0.52
234 0.45
235 0.44
236 0.38
237 0.32
238 0.28
239 0.26
240 0.24
241 0.21
242 0.18
243 0.12
244 0.1
245 0.07
246 0.06
247 0.06
248 0.06
249 0.06
250 0.06
251 0.07
252 0.07
253 0.06
254 0.06
255 0.05
256 0.04
257 0.04
258 0.04
259 0.03
260 0.03
261 0.03
262 0.02
263 0.02
264 0.02
265 0.03
266 0.02
267 0.04
268 0.05
269 0.08
270 0.08
271 0.1
272 0.11
273 0.11
274 0.12
275 0.11
276 0.16
277 0.21
278 0.24
279 0.29
280 0.35
281 0.39
282 0.4
283 0.41
284 0.37
285 0.36
286 0.37
287 0.36
288 0.4
289 0.41
290 0.44
291 0.46
292 0.48
293 0.46
294 0.43
295 0.39
296 0.3
297 0.27
298 0.25
299 0.22
300 0.18
301 0.14
302 0.14
303 0.14
304 0.13
305 0.12
306 0.13
307 0.12
308 0.11
309 0.1
310 0.1
311 0.09
312 0.08
313 0.06
314 0.03
315 0.03
316 0.04
317 0.04
318 0.05
319 0.05
320 0.05
321 0.06
322 0.07
323 0.12
324 0.12
325 0.13
326 0.14
327 0.17
328 0.2
329 0.19
330 0.24
331 0.23
332 0.31
333 0.35
334 0.35
335 0.34
336 0.37
337 0.41
338 0.39
339 0.37
340 0.33
341 0.33
342 0.35
343 0.33
344 0.3
345 0.29
346 0.3
347 0.32
348 0.31
349 0.32
350 0.36
351 0.41
352 0.47
353 0.49
354 0.48
355 0.52
356 0.52
357 0.47
358 0.42
359 0.36
360 0.31
361 0.28
362 0.24
363 0.19
364 0.18
365 0.18
366 0.17
367 0.18
368 0.15
369 0.16
370 0.18
371 0.19
372 0.18
373 0.19
374 0.21
375 0.2
376 0.23
377 0.24
378 0.24
379 0.28
380 0.31
381 0.34
382 0.42
383 0.51
384 0.58
385 0.65
386 0.71
387 0.74
388 0.79
389 0.86
390 0.87
391 0.87
392 0.87
393 0.86
394 0.82
395 0.74
396 0.65
397 0.57
398 0.53
399 0.49
400 0.41
401 0.33
402 0.3
403 0.28
404 0.26
405 0.26
406 0.19
407 0.13
408 0.12
409 0.15
410 0.14
411 0.15
412 0.17
413 0.15
414 0.17
415 0.19
416 0.21
417 0.24
418 0.31
419 0.39
420 0.39
421 0.43
422 0.47
423 0.52
424 0.52
425 0.56
426 0.58
427 0.59
428 0.66
429 0.68
430 0.69
431 0.66
432 0.68
433 0.61
434 0.57
435 0.5
436 0.44
437 0.43
438 0.42
439 0.37
440 0.35
441 0.39
442 0.39
443 0.43
444 0.46
445 0.44
446 0.43
447 0.46
448 0.45
449 0.39
450 0.34
451 0.28
452 0.24
453 0.19
454 0.18
455 0.15
456 0.15
457 0.15
458 0.2
459 0.24
460 0.28
461 0.37
462 0.38
463 0.41
464 0.44
465 0.49
466 0.5
467 0.51
468 0.5
469 0.51
470 0.53
471 0.49
472 0.47
473 0.41
474 0.37
475 0.31
476 0.29
477 0.2
478 0.15
479 0.13
480 0.14
481 0.14
482 0.11
483 0.11