Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C3LBW5

Protein Details
Accession A0A5C3LBW5    Localization Confidence High Confidence Score 17
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
158-183APKVKDAKKKLVKKKSEPTKSKPERDBasic
369-396IVTRGAGFRKEKNKKKRGSYKGGEITMHHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
160-180KVKDAKKKLVKKKSEPTKSKP
376-386FRKEKNKKKRG
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 12, cyto 3.5, mito 1, pero 1, E.R. 1, cysk 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007718  Srp40_C  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
Pfam View protein in Pfam  
PF05022  SRP40_C  
Amino Acid Sequences MDHNLVSTYSLIYAFLQKQGASKAAEAVKKAAKDRVILKDSIELDGPSLDEIIQQWKKAQTKPDSDSDSSDSDSSDSDSSESSDDSDSSSSSSSSSSSSSSSSASSSSTKPKPKETNIPSTSVSEKASDDDDSSSSDSSDSSSSGSESDDESSDSSSAPKVKDAKKKLVKKKSEPTKSKPERDSSHTLSSKATNDSSSDDSSDDEKPVAKDKKQEASSSSSSDSSDDEKPPVKEQKKQASSDSSSDSPSDSSSDSDEDKKPVAKQKRQESSSDEASSSEDSGERRVTKKRRTDESGAAVATVTVDNSREGSSGTTHEETRKLSTKKIPGERFQRVKAEESHVKFKFDNRYEAKPGSTNDYGNKAHQDLIVTRGAGFRKEKNKKKRGSYKGGEITMHTNSFKFDD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.18
2 0.21
3 0.22
4 0.21
5 0.24
6 0.26
7 0.29
8 0.25
9 0.24
10 0.27
11 0.31
12 0.34
13 0.32
14 0.35
15 0.36
16 0.38
17 0.41
18 0.4
19 0.37
20 0.39
21 0.45
22 0.49
23 0.49
24 0.46
25 0.44
26 0.44
27 0.43
28 0.39
29 0.33
30 0.23
31 0.19
32 0.18
33 0.17
34 0.1
35 0.1
36 0.08
37 0.07
38 0.09
39 0.17
40 0.19
41 0.2
42 0.23
43 0.3
44 0.36
45 0.4
46 0.49
47 0.48
48 0.55
49 0.59
50 0.63
51 0.63
52 0.59
53 0.58
54 0.52
55 0.45
56 0.38
57 0.33
58 0.26
59 0.19
60 0.18
61 0.16
62 0.13
63 0.11
64 0.1
65 0.1
66 0.11
67 0.11
68 0.11
69 0.1
70 0.11
71 0.1
72 0.11
73 0.11
74 0.1
75 0.1
76 0.11
77 0.09
78 0.09
79 0.09
80 0.09
81 0.09
82 0.1
83 0.1
84 0.11
85 0.12
86 0.13
87 0.13
88 0.13
89 0.13
90 0.12
91 0.13
92 0.15
93 0.17
94 0.24
95 0.31
96 0.38
97 0.41
98 0.49
99 0.56
100 0.6
101 0.68
102 0.66
103 0.69
104 0.64
105 0.65
106 0.57
107 0.51
108 0.46
109 0.37
110 0.31
111 0.22
112 0.2
113 0.17
114 0.17
115 0.15
116 0.14
117 0.13
118 0.13
119 0.13
120 0.14
121 0.12
122 0.11
123 0.1
124 0.09
125 0.09
126 0.09
127 0.08
128 0.07
129 0.07
130 0.07
131 0.08
132 0.08
133 0.08
134 0.08
135 0.09
136 0.08
137 0.09
138 0.09
139 0.09
140 0.09
141 0.08
142 0.08
143 0.09
144 0.12
145 0.11
146 0.15
147 0.22
148 0.3
149 0.39
150 0.44
151 0.53
152 0.6
153 0.7
154 0.76
155 0.79
156 0.8
157 0.8
158 0.84
159 0.84
160 0.85
161 0.83
162 0.79
163 0.81
164 0.8
165 0.8
166 0.75
167 0.71
168 0.65
169 0.64
170 0.64
171 0.58
172 0.58
173 0.51
174 0.47
175 0.41
176 0.39
177 0.34
178 0.29
179 0.24
180 0.16
181 0.15
182 0.17
183 0.18
184 0.16
185 0.15
186 0.13
187 0.13
188 0.15
189 0.15
190 0.12
191 0.1
192 0.11
193 0.11
194 0.19
195 0.22
196 0.21
197 0.28
198 0.32
199 0.4
200 0.41
201 0.42
202 0.36
203 0.39
204 0.39
205 0.34
206 0.31
207 0.24
208 0.22
209 0.21
210 0.19
211 0.16
212 0.17
213 0.16
214 0.17
215 0.2
216 0.21
217 0.25
218 0.34
219 0.34
220 0.38
221 0.45
222 0.54
223 0.57
224 0.58
225 0.56
226 0.54
227 0.54
228 0.5
229 0.45
230 0.35
231 0.3
232 0.28
233 0.24
234 0.18
235 0.15
236 0.14
237 0.1
238 0.1
239 0.1
240 0.12
241 0.13
242 0.17
243 0.18
244 0.18
245 0.19
246 0.21
247 0.24
248 0.32
249 0.4
250 0.43
251 0.5
252 0.59
253 0.67
254 0.66
255 0.66
256 0.62
257 0.58
258 0.57
259 0.5
260 0.4
261 0.31
262 0.3
263 0.27
264 0.21
265 0.16
266 0.11
267 0.1
268 0.12
269 0.16
270 0.17
271 0.2
272 0.29
273 0.37
274 0.45
275 0.54
276 0.6
277 0.65
278 0.7
279 0.73
280 0.71
281 0.68
282 0.63
283 0.53
284 0.45
285 0.36
286 0.28
287 0.22
288 0.14
289 0.08
290 0.05
291 0.06
292 0.06
293 0.08
294 0.09
295 0.08
296 0.09
297 0.1
298 0.11
299 0.12
300 0.17
301 0.18
302 0.19
303 0.22
304 0.24
305 0.25
306 0.3
307 0.37
308 0.34
309 0.38
310 0.45
311 0.5
312 0.57
313 0.65
314 0.66
315 0.66
316 0.73
317 0.77
318 0.76
319 0.72
320 0.71
321 0.63
322 0.6
323 0.56
324 0.55
325 0.54
326 0.52
327 0.57
328 0.5
329 0.51
330 0.48
331 0.5
332 0.52
333 0.48
334 0.53
335 0.48
336 0.54
337 0.57
338 0.59
339 0.55
340 0.49
341 0.47
342 0.45
343 0.43
344 0.38
345 0.35
346 0.4
347 0.39
348 0.37
349 0.4
350 0.34
351 0.33
352 0.31
353 0.31
354 0.25
355 0.27
356 0.27
357 0.23
358 0.22
359 0.24
360 0.24
361 0.26
362 0.29
363 0.33
364 0.42
365 0.52
366 0.62
367 0.69
368 0.78
369 0.82
370 0.89
371 0.91
372 0.9
373 0.91
374 0.89
375 0.88
376 0.87
377 0.82
378 0.72
379 0.64
380 0.58
381 0.52
382 0.47
383 0.37
384 0.29