Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C3L7A9

Protein Details
Accession A0A5C3L7A9    Localization Confidence Medium Confidence Score 10
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
153-178SEWNVPKNSKRQQKRQQHHQRKDAGMHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 11, cyto 3.5, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR023251  Brr1  
IPR035426  Gemin2/Brr1  
Gene Ontology GO:0030532  C:small nuclear ribonucleoprotein complex  
GO:0000387  P:spliceosomal snRNP assembly  
Pfam View protein in Pfam  
PF04938  SIP1  
Amino Acid Sequences MDFDISIPIGSSSSKRKRNSYEDDSDDEVASYGKQILPVAALPYNFDGEPQDGLEYLFTVRRDAQRLPGITRVPNPYEGQNPLPDAVVLNGNHPSLPSKEWCDLLETRFKNLRTNLNQPTIFVGPTHEPNRRYMPDKKERDLWWAYLEGKAESEWNVPKNSKRQQKRQQHHQRKDAGMRAWADEPEEMVVPEMIIYESALLNDDEGEVEEALSIDPAEGLPTPSGTPGPSTESPPRLGQSSTATPTGPPRPREPSTTLLKLIDEPTALHLLMYFTHWMNTHVQNPEADIFPQREHHARWIFALLSRVDDYVSPDDMNLLRNVARACLALLKLLIEQRIMPRIGSSRSATIEDRMTERSCWILIAIIVHVWKQRDLWMDAESILSQFPVAIWS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.41
2 0.47
3 0.56
4 0.64
5 0.72
6 0.78
7 0.76
8 0.76
9 0.73
10 0.72
11 0.68
12 0.6
13 0.5
14 0.41
15 0.32
16 0.23
17 0.17
18 0.13
19 0.11
20 0.1
21 0.11
22 0.11
23 0.12
24 0.13
25 0.14
26 0.16
27 0.16
28 0.16
29 0.16
30 0.17
31 0.19
32 0.17
33 0.16
34 0.15
35 0.14
36 0.15
37 0.14
38 0.13
39 0.11
40 0.11
41 0.11
42 0.09
43 0.09
44 0.12
45 0.11
46 0.13
47 0.17
48 0.22
49 0.26
50 0.28
51 0.34
52 0.38
53 0.41
54 0.41
55 0.43
56 0.42
57 0.41
58 0.45
59 0.43
60 0.39
61 0.39
62 0.38
63 0.35
64 0.36
65 0.37
66 0.34
67 0.31
68 0.29
69 0.26
70 0.24
71 0.21
72 0.17
73 0.14
74 0.16
75 0.13
76 0.14
77 0.15
78 0.15
79 0.15
80 0.15
81 0.16
82 0.13
83 0.16
84 0.18
85 0.21
86 0.23
87 0.24
88 0.24
89 0.27
90 0.27
91 0.28
92 0.34
93 0.3
94 0.33
95 0.37
96 0.37
97 0.38
98 0.41
99 0.47
100 0.44
101 0.52
102 0.53
103 0.55
104 0.55
105 0.49
106 0.48
107 0.39
108 0.33
109 0.24
110 0.2
111 0.15
112 0.21
113 0.26
114 0.28
115 0.28
116 0.31
117 0.38
118 0.39
119 0.42
120 0.44
121 0.5
122 0.55
123 0.61
124 0.6
125 0.61
126 0.59
127 0.6
128 0.55
129 0.46
130 0.37
131 0.33
132 0.3
133 0.25
134 0.24
135 0.17
136 0.14
137 0.13
138 0.11
139 0.1
140 0.13
141 0.14
142 0.15
143 0.18
144 0.2
145 0.24
146 0.32
147 0.4
148 0.46
149 0.52
150 0.61
151 0.68
152 0.77
153 0.82
154 0.85
155 0.88
156 0.89
157 0.9
158 0.87
159 0.84
160 0.78
161 0.75
162 0.69
163 0.59
164 0.52
165 0.43
166 0.37
167 0.3
168 0.25
169 0.2
170 0.14
171 0.13
172 0.09
173 0.08
174 0.06
175 0.06
176 0.05
177 0.04
178 0.04
179 0.04
180 0.03
181 0.03
182 0.03
183 0.03
184 0.03
185 0.04
186 0.05
187 0.04
188 0.04
189 0.04
190 0.04
191 0.04
192 0.04
193 0.05
194 0.04
195 0.04
196 0.04
197 0.04
198 0.04
199 0.04
200 0.03
201 0.03
202 0.03
203 0.03
204 0.03
205 0.03
206 0.04
207 0.04
208 0.05
209 0.05
210 0.06
211 0.07
212 0.06
213 0.07
214 0.07
215 0.13
216 0.14
217 0.18
218 0.22
219 0.25
220 0.27
221 0.27
222 0.27
223 0.23
224 0.22
225 0.19
226 0.19
227 0.21
228 0.21
229 0.2
230 0.2
231 0.19
232 0.23
233 0.31
234 0.32
235 0.31
236 0.33
237 0.4
238 0.42
239 0.47
240 0.47
241 0.44
242 0.46
243 0.46
244 0.43
245 0.36
246 0.34
247 0.3
248 0.27
249 0.22
250 0.15
251 0.12
252 0.12
253 0.13
254 0.12
255 0.1
256 0.09
257 0.09
258 0.09
259 0.1
260 0.09
261 0.08
262 0.1
263 0.1
264 0.12
265 0.16
266 0.19
267 0.23
268 0.24
269 0.25
270 0.23
271 0.25
272 0.24
273 0.21
274 0.18
275 0.16
276 0.16
277 0.16
278 0.19
279 0.2
280 0.23
281 0.24
282 0.32
283 0.34
284 0.32
285 0.33
286 0.33
287 0.3
288 0.28
289 0.3
290 0.21
291 0.19
292 0.19
293 0.18
294 0.16
295 0.15
296 0.18
297 0.17
298 0.18
299 0.15
300 0.14
301 0.16
302 0.17
303 0.18
304 0.14
305 0.13
306 0.12
307 0.15
308 0.16
309 0.14
310 0.14
311 0.13
312 0.13
313 0.15
314 0.15
315 0.13
316 0.13
317 0.13
318 0.15
319 0.17
320 0.17
321 0.13
322 0.15
323 0.18
324 0.23
325 0.23
326 0.2
327 0.21
328 0.25
329 0.27
330 0.3
331 0.29
332 0.27
333 0.29
334 0.33
335 0.31
336 0.3
337 0.31
338 0.28
339 0.29
340 0.29
341 0.29
342 0.26
343 0.26
344 0.25
345 0.21
346 0.19
347 0.17
348 0.14
349 0.12
350 0.13
351 0.12
352 0.12
353 0.12
354 0.14
355 0.17
356 0.17
357 0.18
358 0.18
359 0.22
360 0.26
361 0.28
362 0.29
363 0.27
364 0.27
365 0.26
366 0.26
367 0.22
368 0.16
369 0.14
370 0.11
371 0.09
372 0.07