FuNGI

A0A5C3KR82

Protein Details

Accession

A0A5C3KR82

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
37-58	LPLPSIKGKKKSSQANQGLRFG	Hydrophilic
901-928	SALGLSKGSSRKRRRGKDVPSTPNPKAH	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
908-917	GSSRKRRRGK

Subcellular Location(s)

cyto 9.5, nucl 9, cyto_mito 8, mito 5.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR011044 Quino_amine_DH_bsu IPR046351 UTP4 IPR015943 WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf IPR001680 WD40_repeat IPR036322 WD40_repeat_dom_sf
Gene Ontology	GO:0030686 C:90S preribosome GO:0000462 P:maturation of SSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)
Pfam	View protein in Pfam PF00400 WD40
PROSITE	View protein in PROSITE PS50082 WD_REPEATS_2

Amino Acid Sequences

MTFEKKREGPTTTLAVHRCRFVDYAPSAITALAFPPLPLPSIKGKKKSSQANQGLRFGVLAVGHANGNIDLCEWTGSEQDRQSSQAWVVKQTLSGPYPSKVDSLAFVLRHPDDFEEDHVPKISDLRLFGTGGGSELIEWDIATSRIRQTINSQGGAIWSIAANPSSTMLALGCEDGTVRILSLENDTLTHIRRLGKVKSRMLSIAWGPPIPKASRTPKKTTNVSDSDDSDDDDDDEWVDSWLVTGCSDSSLRKWDVKTGQLLERMGTDKVRGERTLVWSVGVLGDGTIVSGDSMGVVKFWDSRTCTQLQSFQAHNADVLCLAISPEGTAVYTSGVDQKTVQFSLIKVQASTGASATKNVRWAQTSSKRMHSHDVRALAIWPPYTAIPPSFIKQQHKNRSYFPIDVAPVLASGGLDMNLVLAPAALPSSSVVKVVNPLNTSTVANFEDAYHRRVAYSLDGRVQVAKAARLVSCIREAGITIWRISKKPSSAALDVSGEDKMDEDQPGQDVPPAKESDSDKEPYAGGWERVLEMELSVTSNIVVHRISDDGSWLAVSDAYETKLFKLRTGADGQVTPKRVKNFGAILQPHIPPLPQMRGALKPQFRGTGSLALQFTPDSSKLVLSSTAPSCILIVDLTSEQPRVLRRFDHHLQVDSIVQDRVIAGGKVKSNATSTPKKPHVNGVQINGAVEDVEMKFASENESPTNEDEDSDDEKATSASRTRKLATIAVTHLAISPDGQWLASSSLCPPSSTSHASGPSSSSHHTSTKTHIYNLDSVAYHTTLPSFPLPIQHLAFASGTDSSSLGSGVKLTSSVLLLTFPNNSVQVYDVEQRQFPAWGKDLASVVERSRLAGMHDAVLGASFGSNPDTTDRFILFWSATWLAKISLDALGTVGLHPSSSSSSALGLSKGSSRKRRRGKDVPSTPNPKAHNAPASNVEGEKGAKVGATDAGADEDDGIGNIVKIISTYRPMLCAELLGPSELIVVERPLVDVLATLPPAYFKHRYGRS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.48
2	0.5
3	0.47
4	0.47
5	0.42
6	0.39
7	0.37
8	0.32
9	0.36
10	0.31
11	0.33
12	0.3
13	0.3
14	0.27
15	0.26
16	0.24
17	0.15
18	0.14
19	0.11
20	0.1
21	0.09
22	0.11
23	0.11
24	0.12
25	0.13
26	0.16
27	0.24
28	0.34
29	0.43
30	0.5
31	0.56
32	0.63
33	0.71
34	0.78
35	0.78
36	0.79
37	0.81
38	0.82
39	0.82
40	0.78
41	0.7
42	0.6
43	0.5
44	0.39
45	0.3
46	0.2
47	0.14
48	0.1
49	0.1
50	0.1
51	0.1
52	0.1
53	0.08
54	0.09
55	0.08
56	0.08
57	0.08
58	0.08
59	0.09
60	0.08
61	0.09
62	0.13
63	0.16
64	0.2
65	0.22
66	0.25
67	0.26
68	0.29
69	0.29
70	0.28
71	0.3
72	0.29
73	0.28
74	0.29
75	0.3
76	0.28
77	0.28
78	0.28
79	0.29
80	0.26
81	0.29
82	0.28
83	0.27
84	0.29
85	0.29
86	0.27
87	0.23
88	0.22
89	0.19
90	0.21
91	0.23
92	0.21
93	0.2
94	0.25
95	0.24
96	0.25
97	0.24
98	0.22
99	0.2
100	0.22
101	0.25
102	0.27
103	0.27
104	0.28
105	0.28
106	0.27
107	0.23
108	0.25
109	0.24
110	0.18
111	0.19
112	0.2
113	0.2
114	0.2
115	0.2
116	0.19
117	0.16
118	0.14
119	0.13
120	0.09
121	0.07
122	0.07
123	0.07
124	0.06
125	0.06
126	0.06
127	0.07
128	0.08
129	0.09
130	0.11
131	0.13
132	0.19
133	0.19
134	0.2
135	0.24
136	0.33
137	0.38
138	0.36
139	0.34
140	0.29
141	0.29
142	0.29
143	0.23
144	0.14
145	0.08
146	0.08
147	0.08
148	0.08
149	0.08
150	0.07
151	0.08
152	0.08
153	0.08
154	0.08
155	0.07
156	0.07
157	0.07
158	0.08
159	0.06
160	0.06
161	0.06
162	0.06
163	0.08
164	0.07
165	0.06
166	0.06
167	0.07
168	0.08
169	0.11
170	0.12
171	0.11
172	0.11
173	0.13
174	0.15
175	0.17
176	0.18
177	0.19
178	0.21
179	0.26
180	0.32
181	0.38
182	0.46
183	0.52
184	0.58
185	0.57
186	0.57
187	0.53
188	0.48
189	0.44
190	0.37
191	0.34
192	0.28
193	0.26
194	0.24
195	0.24
196	0.28
197	0.25
198	0.25
199	0.27
200	0.36
201	0.45
202	0.52
203	0.59
204	0.63
205	0.69
206	0.74
207	0.73
208	0.71
209	0.66
210	0.64
211	0.59
212	0.52
213	0.49
214	0.41
215	0.35
216	0.27
217	0.21
218	0.18
219	0.15
220	0.13
221	0.08
222	0.09
223	0.08
224	0.08
225	0.07
226	0.06
227	0.06
228	0.07
229	0.07
230	0.06
231	0.06
232	0.06
233	0.08
234	0.1
235	0.1
236	0.12
237	0.17
238	0.2
239	0.24
240	0.25
241	0.31
242	0.35
243	0.38
244	0.41
245	0.4
246	0.42
247	0.41
248	0.41
249	0.33
250	0.31
251	0.28
252	0.24
253	0.2
254	0.17
255	0.17
256	0.21
257	0.24
258	0.22
259	0.23
260	0.26
261	0.31
262	0.34
263	0.3
264	0.26
265	0.22
266	0.22
267	0.2
268	0.16
269	0.1
270	0.05
271	0.05
272	0.04
273	0.04
274	0.03
275	0.03
276	0.03
277	0.03
278	0.03
279	0.03
280	0.04
281	0.04
282	0.04
283	0.04
284	0.05
285	0.07
286	0.08
287	0.13
288	0.16
289	0.19
290	0.24
291	0.26
292	0.28
293	0.27
294	0.32
295	0.32
296	0.32
297	0.31
298	0.3
299	0.3
300	0.28
301	0.26
302	0.2
303	0.17
304	0.12
305	0.11
306	0.06
307	0.05
308	0.05
309	0.04
310	0.04
311	0.04
312	0.04
313	0.04
314	0.04
315	0.04
316	0.04
317	0.05
318	0.05
319	0.05
320	0.11
321	0.11
322	0.11
323	0.12
324	0.14
325	0.16
326	0.16
327	0.16
328	0.12
329	0.12
330	0.18
331	0.21
332	0.19
333	0.16
334	0.16
335	0.19
336	0.19
337	0.19
338	0.14
339	0.12
340	0.12
341	0.15
342	0.17
343	0.15
344	0.19
345	0.2
346	0.21
347	0.21
348	0.23
349	0.3
350	0.37
351	0.43
352	0.42
353	0.49
354	0.51
355	0.51
356	0.58
357	0.53
358	0.5
359	0.48
360	0.47
361	0.39
362	0.35
363	0.34
364	0.27
365	0.23
366	0.16
367	0.12
368	0.1
369	0.1
370	0.1
371	0.1
372	0.09
373	0.11
374	0.12
375	0.14
376	0.2
377	0.24
378	0.3
379	0.39
380	0.49
381	0.56
382	0.62
383	0.63
384	0.6
385	0.63
386	0.61
387	0.53
388	0.44
389	0.38
390	0.32
391	0.29
392	0.25
393	0.17
394	0.13
395	0.11
396	0.09
397	0.04
398	0.04
399	0.04
400	0.03
401	0.03
402	0.03
403	0.03
404	0.03
405	0.03
406	0.03
407	0.03
408	0.02
409	0.03
410	0.03
411	0.02
412	0.03
413	0.03
414	0.06
415	0.06
416	0.07
417	0.07
418	0.07
419	0.11
420	0.13
421	0.15
422	0.14
423	0.14
424	0.15
425	0.16
426	0.17
427	0.13
428	0.14
429	0.11
430	0.11
431	0.11
432	0.1
433	0.15
434	0.16
435	0.18
436	0.17
437	0.16
438	0.16
439	0.16
440	0.17
441	0.15
442	0.17
443	0.16
444	0.18
445	0.19
446	0.19
447	0.19
448	0.18
449	0.15
450	0.12
451	0.11
452	0.1
453	0.11
454	0.11
455	0.13
456	0.14
457	0.13
458	0.13
459	0.13
460	0.11
461	0.1
462	0.1
463	0.09
464	0.12
465	0.11
466	0.11
467	0.14
468	0.15
469	0.16
470	0.18
471	0.2
472	0.18
473	0.2
474	0.24
475	0.25
476	0.25
477	0.25
478	0.24
479	0.22
480	0.2
481	0.18
482	0.14
483	0.09
484	0.08
485	0.07
486	0.06
487	0.06
488	0.06
489	0.06
490	0.06
491	0.07
492	0.07
493	0.07
494	0.08
495	0.1
496	0.1
497	0.13
498	0.14
499	0.14
500	0.17
501	0.19
502	0.21
503	0.21
504	0.23
505	0.19
506	0.19
507	0.19
508	0.15
509	0.17
510	0.15
511	0.12
512	0.1
513	0.1
514	0.1
515	0.1
516	0.1
517	0.06
518	0.05
519	0.05
520	0.04
521	0.05
522	0.04
523	0.04
524	0.04
525	0.05
526	0.05
527	0.06
528	0.05
529	0.05
530	0.06
531	0.06
532	0.07
533	0.06
534	0.07
535	0.06
536	0.06
537	0.06
538	0.05
539	0.05
540	0.05
541	0.05
542	0.05
543	0.06
544	0.07
545	0.08
546	0.08
547	0.09
548	0.15
549	0.15
550	0.14
551	0.18
552	0.18
553	0.2
554	0.23
555	0.23
556	0.19
557	0.21
558	0.23
559	0.23
560	0.24
561	0.23
562	0.23
563	0.24
564	0.25
565	0.24
566	0.26
567	0.25
568	0.27
569	0.32
570	0.3
571	0.31
572	0.33
573	0.31
574	0.28
575	0.24
576	0.2
577	0.14
578	0.16
579	0.16
580	0.15
581	0.16
582	0.18
583	0.21
584	0.26
585	0.31
586	0.31
587	0.3
588	0.3
589	0.31
590	0.3
591	0.29
592	0.27
593	0.26
594	0.24
595	0.25
596	0.24
597	0.21
598	0.2
599	0.17
600	0.16
601	0.12
602	0.11
603	0.08
604	0.09
605	0.09
606	0.09
607	0.1
608	0.1
609	0.09
610	0.12
611	0.12
612	0.13
613	0.13
614	0.12
615	0.11
616	0.11
617	0.1
618	0.06
619	0.05
620	0.05
621	0.06
622	0.07
623	0.08
624	0.08
625	0.08
626	0.1
627	0.14
628	0.16
629	0.17
630	0.2
631	0.22
632	0.3
633	0.34
634	0.4
635	0.38
636	0.37
637	0.36
638	0.33
639	0.31
640	0.24
641	0.22
642	0.14
643	0.11
644	0.09
645	0.08
646	0.08
647	0.08
648	0.07
649	0.07
650	0.1
651	0.12
652	0.14
653	0.14
654	0.14
655	0.15
656	0.2
657	0.25
658	0.3
659	0.33
660	0.41
661	0.48
662	0.51
663	0.51
664	0.55
665	0.56
666	0.57
667	0.57
668	0.51
669	0.47
670	0.43
671	0.42
672	0.32
673	0.24
674	0.15
675	0.11
676	0.09
677	0.05
678	0.06
679	0.06
680	0.06
681	0.06
682	0.07
683	0.11
684	0.1
685	0.12
686	0.13
687	0.15
688	0.16
689	0.18
690	0.2
691	0.16
692	0.15
693	0.15
694	0.17
695	0.18
696	0.17
697	0.16
698	0.13
699	0.14
700	0.14
701	0.13
702	0.12
703	0.14
704	0.2
705	0.24
706	0.27
707	0.29
708	0.31
709	0.33
710	0.35
711	0.32
712	0.29
713	0.27
714	0.25
715	0.24
716	0.21
717	0.2
718	0.16
719	0.13
720	0.1
721	0.09
722	0.08
723	0.08
724	0.08
725	0.07
726	0.08
727	0.09
728	0.09
729	0.09
730	0.09
731	0.15
732	0.15
733	0.16
734	0.16
735	0.18
736	0.23
737	0.27
738	0.28
739	0.26
740	0.29
741	0.3
742	0.29
743	0.27
744	0.24
745	0.23
746	0.22
747	0.21
748	0.21
749	0.23
750	0.26
751	0.26
752	0.3
753	0.37
754	0.37
755	0.36
756	0.37
757	0.37
758	0.37
759	0.37
760	0.33
761	0.24
762	0.23
763	0.22
764	0.19
765	0.16
766	0.13
767	0.13
768	0.1
769	0.13
770	0.13
771	0.12
772	0.12
773	0.17
774	0.2
775	0.22
776	0.23
777	0.22
778	0.21
779	0.21
780	0.2
781	0.16
782	0.14
783	0.1
784	0.09
785	0.09
786	0.08
787	0.07
788	0.07
789	0.07
790	0.06
791	0.06
792	0.06
793	0.06
794	0.06
795	0.06
796	0.06
797	0.07
798	0.07
799	0.07
800	0.07
801	0.08
802	0.08
803	0.09
804	0.1
805	0.1
806	0.12
807	0.12
808	0.12
809	0.11
810	0.12
811	0.12
812	0.15
813	0.18
814	0.21
815	0.22
816	0.23
817	0.24
818	0.23
819	0.25
820	0.24
821	0.24
822	0.23
823	0.23
824	0.24
825	0.25
826	0.25
827	0.23
828	0.24
829	0.21
830	0.19
831	0.22
832	0.2
833	0.19
834	0.19
835	0.18
836	0.18
837	0.21
838	0.21
839	0.17
840	0.17
841	0.16
842	0.14
843	0.14
844	0.12
845	0.07
846	0.06
847	0.04
848	0.04
849	0.07
850	0.07
851	0.08
852	0.12
853	0.14
854	0.15
855	0.18
856	0.18
857	0.17
858	0.17
859	0.18
860	0.15
861	0.14
862	0.17
863	0.17
864	0.16
865	0.16
866	0.16
867	0.15
868	0.15
869	0.15
870	0.11
871	0.11
872	0.11
873	0.1
874	0.09
875	0.09
876	0.09
877	0.09
878	0.08
879	0.06
880	0.06
881	0.06
882	0.08
883	0.1
884	0.11
885	0.12
886	0.11
887	0.12
888	0.15
889	0.16
890	0.15
891	0.13
892	0.12
893	0.17
894	0.24
895	0.32
896	0.41
897	0.49
898	0.59
899	0.7
900	0.78
901	0.83
902	0.87
903	0.89
904	0.89
905	0.9
906	0.9
907	0.89
908	0.88
909	0.81
910	0.78
911	0.71
912	0.65
913	0.6
914	0.57
915	0.57
916	0.5
917	0.5
918	0.48
919	0.49
920	0.45
921	0.39
922	0.32
923	0.25
924	0.24
925	0.2
926	0.15
927	0.11
928	0.1
929	0.1
930	0.1
931	0.1
932	0.1
933	0.1
934	0.1
935	0.11
936	0.11
937	0.11
938	0.1
939	0.08
940	0.07
941	0.07
942	0.07
943	0.06
944	0.06
945	0.06
946	0.06
947	0.05
948	0.06
949	0.08
950	0.1
951	0.14
952	0.19
953	0.19
954	0.21
955	0.23
956	0.25
957	0.23
958	0.21
959	0.18
960	0.18
961	0.18
962	0.16
963	0.15
964	0.13
965	0.13
966	0.12
967	0.12
968	0.09
969	0.09
970	0.09
971	0.09
972	0.1
973	0.1
974	0.1
975	0.09
976	0.08
977	0.09
978	0.12
979	0.12
980	0.11
981	0.11
982	0.13
983	0.15
984	0.22
985	0.25
986	0.25

A0A5C3KR82

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer