FuNGI

A0A5C3L5X9

Protein Details

Accession

A0A5C3L5X9

Localization Confidence

High

Confidence Score

22.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
52-71	RETKKIQDRIAKVRNRRELN	Hydrophilic
85-112	EDDTLKWIKRSKKKEKELAKKRQQELEE	Basic
167-186	AEEERRKKNQDLRIKRREYT	Basic
267-292	EGDVGFKKPKTKKKRPSRRAALEADE	Basic
665-693	ETQPLQKGKTEKAKKKKEGKGQQQPEAGF	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
92-106	IKRSKKKEKELAKKR
273-285	KKPKTKKKRPSRR
326-332	RKAKLRK
595-619	KFHGKGSGKMKTEKRLKKIADEKKK
671-684	KGKTEKAKKKKEGK
766-772	SPPPKRR

Subcellular Location(s)

nucl 22.5, cyto_nucl 14, cyto 4.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR045347 HIND IPR005011 SNU66/SART1
Gene Ontology	GO:0046540 C:U4/U6 x U5 tri-snRNP complex GO:0000398 P:mRNA splicing, via spliceosome
Pfam	View protein in Pfam PF19252 HIND PF03343 SART-1

Amino Acid Sequences

MSMEQSISLEETNKIRISLGLKPLTDDKAPEDKEKVAEDNYAKVREQEVKDRETKKIQDRIAKVRNRRELNSSLKGATLGDADGEDDTLKWIKRSKKKEKELAKKRQQELEEMDKAAQDEYSERDLAGLKVSHDFDDLGEGEDRILTLKDSRILDNEEDELQNFEMAEEERRKKNQDLRIKRREYTGYDDDEFVEGAQGLMKRSILSKYDEEIEGSKQTEFRLGSSTTVSKKSKQEAELQQAAAAVNKSLLSIDYAKNLETADYVKEGDVGFKKPKTKKKRPSRRAALEADEDTMDVDAKQVPISRDLEANFVDDDDLQAALARSRKAKLRKSNKLTPEELAKRIAEQRLQETVETQEAEDAEGSGLVFDETSEFVQSVGLNPVVKPKQEPREVRLPQAQDARPSARSQSRDASLAPGDVPMSELEAGEVQVKEENEEEFDMEMLDAIEETFQELDGDVKKEEEEADLGVGTSSEQNFSAGMAATLNILKQQGVIHGVTSEQQQRENTQKQRDLWLAEQRFKIAKRELEKHQSRGGANRDQAQREYDNRLRELQEKRQAQDDFNGSYKPDVNIVYYDEFGRELTVKEAWKALSHKFHGKGSGKMKTEKRLKKIADEKKKLAMASGDTPLSMNRAFQQRQEKLGQAHFILSVGNRGAIPQAGDFMETQPLQKGKTEKAKKKKEGKGQQQPEAGFMTLPAPAIQAVTNGGSGPGSLAGSPAPRAGFSRISSTPVDTPSQSNGGTPGPTDRIKVTFGLKRKAGEELAGSPPPKRR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.21
2	0.2
3	0.23
4	0.25
5	0.3
6	0.36
7	0.37
8	0.36
9	0.39
10	0.43
11	0.43
12	0.4
13	0.35
14	0.32
15	0.36
16	0.4
17	0.41
18	0.41
19	0.4
20	0.42
21	0.43
22	0.4
23	0.33
24	0.36
25	0.33
26	0.38
27	0.4
28	0.4
29	0.37
30	0.35
31	0.38
32	0.4
33	0.43
34	0.45
35	0.46
36	0.49
37	0.57
38	0.59
39	0.62
40	0.62
41	0.65
42	0.65
43	0.67
44	0.68
45	0.68
46	0.72
47	0.76
48	0.77
49	0.77
50	0.77
51	0.79
52	0.82
53	0.79
54	0.75
55	0.71
56	0.7
57	0.7
58	0.68
59	0.61
60	0.52
61	0.46
62	0.42
63	0.36
64	0.28
65	0.2
66	0.13
67	0.09
68	0.09
69	0.09
70	0.08
71	0.08
72	0.07
73	0.06
74	0.09
75	0.13
76	0.13
77	0.16
78	0.22
79	0.32
80	0.42
81	0.53
82	0.62
83	0.69
84	0.79
85	0.86
86	0.9
87	0.92
88	0.93
89	0.93
90	0.92
91	0.91
92	0.87
93	0.85
94	0.75
95	0.71
96	0.67
97	0.65
98	0.58
99	0.5
100	0.44
101	0.37
102	0.36
103	0.29
104	0.22
105	0.13
106	0.11
107	0.13
108	0.16
109	0.16
110	0.15
111	0.16
112	0.17
113	0.17
114	0.19
115	0.16
116	0.14
117	0.18
118	0.19
119	0.19
120	0.18
121	0.18
122	0.14
123	0.17
124	0.16
125	0.14
126	0.13
127	0.13
128	0.12
129	0.11
130	0.11
131	0.09
132	0.09
133	0.07
134	0.09
135	0.11
136	0.17
137	0.19
138	0.2
139	0.22
140	0.26
141	0.26
142	0.26
143	0.25
144	0.22
145	0.21
146	0.2
147	0.18
148	0.15
149	0.14
150	0.11
151	0.09
152	0.09
153	0.09
154	0.15
155	0.21
156	0.26
157	0.32
158	0.36
159	0.41
160	0.46
161	0.54
162	0.57
163	0.61
164	0.67
165	0.72
166	0.79
167	0.8
168	0.75
169	0.73
170	0.69
171	0.62
172	0.59
173	0.54
174	0.49
175	0.44
176	0.43
177	0.38
178	0.33
179	0.28
180	0.19
181	0.14
182	0.08
183	0.06
184	0.08
185	0.08
186	0.08
187	0.09
188	0.1
189	0.09
190	0.11
191	0.14
192	0.14
193	0.18
194	0.19
195	0.21
196	0.23
197	0.23
198	0.23
199	0.22
200	0.21
201	0.19
202	0.18
203	0.17
204	0.15
205	0.15
206	0.18
207	0.17
208	0.16
209	0.17
210	0.17
211	0.18
212	0.2
213	0.23
214	0.22
215	0.29
216	0.3
217	0.32
218	0.37
219	0.42
220	0.46
221	0.45
222	0.51
223	0.51
224	0.57
225	0.56
226	0.5
227	0.44
228	0.38
229	0.35
230	0.27
231	0.2
232	0.11
233	0.07
234	0.07
235	0.07
236	0.06
237	0.06
238	0.07
239	0.1
240	0.11
241	0.14
242	0.15
243	0.15
244	0.15
245	0.15
246	0.13
247	0.11
248	0.11
249	0.09
250	0.09
251	0.1
252	0.09
253	0.1
254	0.1
255	0.14
256	0.15
257	0.17
258	0.21
259	0.24
260	0.33
261	0.39
262	0.5
263	0.56
264	0.65
265	0.72
266	0.79
267	0.87
268	0.89
269	0.93
270	0.93
271	0.91
272	0.88
273	0.81
274	0.74
275	0.66
276	0.56
277	0.46
278	0.35
279	0.26
280	0.18
281	0.14
282	0.1
283	0.06
284	0.06
285	0.05
286	0.06
287	0.07
288	0.09
289	0.1
290	0.13
291	0.15
292	0.15
293	0.17
294	0.17
295	0.19
296	0.16
297	0.16
298	0.13
299	0.11
300	0.1
301	0.08
302	0.08
303	0.06
304	0.05
305	0.04
306	0.05
307	0.05
308	0.06
309	0.09
310	0.1
311	0.11
312	0.14
313	0.21
314	0.29
315	0.37
316	0.46
317	0.55
318	0.64
319	0.71
320	0.77
321	0.79
322	0.76
323	0.69
324	0.61
325	0.59
326	0.52
327	0.46
328	0.39
329	0.31
330	0.27
331	0.29
332	0.29
333	0.23
334	0.2
335	0.21
336	0.22
337	0.23
338	0.21
339	0.18
340	0.17
341	0.16
342	0.15
343	0.12
344	0.09
345	0.08
346	0.09
347	0.08
348	0.06
349	0.05
350	0.04
351	0.04
352	0.03
353	0.03
354	0.03
355	0.03
356	0.02
357	0.03
358	0.04
359	0.04
360	0.04
361	0.04
362	0.04
363	0.05
364	0.05
365	0.06
366	0.06
367	0.07
368	0.07
369	0.07
370	0.14
371	0.14
372	0.15
373	0.16
374	0.21
375	0.29
376	0.37
377	0.39
378	0.38
379	0.47
380	0.48
381	0.5
382	0.48
383	0.42
384	0.38
385	0.42
386	0.39
387	0.31
388	0.32
389	0.31
390	0.27
391	0.26
392	0.26
393	0.24
394	0.26
395	0.26
396	0.27
397	0.26
398	0.26
399	0.25
400	0.24
401	0.19
402	0.17
403	0.14
404	0.1
405	0.09
406	0.07
407	0.08
408	0.05
409	0.06
410	0.05
411	0.05
412	0.05
413	0.05
414	0.06
415	0.07
416	0.07
417	0.06
418	0.08
419	0.08
420	0.09
421	0.09
422	0.09
423	0.08
424	0.08
425	0.09
426	0.07
427	0.07
428	0.06
429	0.05
430	0.05
431	0.04
432	0.04
433	0.03
434	0.03
435	0.03
436	0.03
437	0.03
438	0.03
439	0.03
440	0.03
441	0.03
442	0.05
443	0.07
444	0.08
445	0.08
446	0.08
447	0.08
448	0.09
449	0.09
450	0.08
451	0.07
452	0.06
453	0.06
454	0.06
455	0.06
456	0.05
457	0.05
458	0.04
459	0.05
460	0.05
461	0.06
462	0.06
463	0.06
464	0.06
465	0.07
466	0.07
467	0.05
468	0.05
469	0.05
470	0.05
471	0.05
472	0.05
473	0.05
474	0.05
475	0.06
476	0.05
477	0.06
478	0.06
479	0.07
480	0.1
481	0.1
482	0.09
483	0.09
484	0.09
485	0.09
486	0.12
487	0.16
488	0.15
489	0.17
490	0.18
491	0.22
492	0.3
493	0.38
494	0.42
495	0.44
496	0.49
497	0.48
498	0.52
499	0.52
500	0.47
501	0.43
502	0.46
503	0.42
504	0.42
505	0.41
506	0.38
507	0.39
508	0.37
509	0.38
510	0.33
511	0.35
512	0.37
513	0.43
514	0.48
515	0.55
516	0.59
517	0.57
518	0.56
519	0.55
520	0.49
521	0.5
522	0.49
523	0.45
524	0.42
525	0.45
526	0.45
527	0.43
528	0.43
529	0.4
530	0.38
531	0.35
532	0.41
533	0.38
534	0.38
535	0.37
536	0.39
537	0.38
538	0.41
539	0.45
540	0.45
541	0.5
542	0.5
543	0.49
544	0.53
545	0.52
546	0.46
547	0.46
548	0.4
549	0.33
550	0.31
551	0.3
552	0.23
553	0.23
554	0.24
555	0.18
556	0.17
557	0.15
558	0.15
559	0.15
560	0.18
561	0.17
562	0.16
563	0.16
564	0.14
565	0.13
566	0.12
567	0.12
568	0.1
569	0.09
570	0.1
571	0.14
572	0.14
573	0.15
574	0.17
575	0.16
576	0.2
577	0.22
578	0.26
579	0.31
580	0.34
581	0.41
582	0.42
583	0.44
584	0.49
585	0.49
586	0.51
587	0.51
588	0.55
589	0.51
590	0.56
591	0.59
592	0.6
593	0.67
594	0.68
595	0.67
596	0.68
597	0.66
598	0.68
599	0.73
600	0.74
601	0.75
602	0.75
603	0.72
604	0.7
605	0.7
606	0.6
607	0.51
608	0.43
609	0.36
610	0.32
611	0.31
612	0.24
613	0.21
614	0.21
615	0.19
616	0.19
617	0.16
618	0.13
619	0.14
620	0.23
621	0.24
622	0.31
623	0.41
624	0.42
625	0.47
626	0.5
627	0.5
628	0.46
629	0.49
630	0.45
631	0.35
632	0.33
633	0.27
634	0.24
635	0.2
636	0.15
637	0.14
638	0.11
639	0.12
640	0.1
641	0.1
642	0.11
643	0.11
644	0.12
645	0.09
646	0.11
647	0.1
648	0.11
649	0.12
650	0.12
651	0.16
652	0.15
653	0.16
654	0.19
655	0.2
656	0.21
657	0.25
658	0.28
659	0.32
660	0.42
661	0.52
662	0.58
663	0.67
664	0.77
665	0.82
666	0.89
667	0.9
668	0.9
669	0.9
670	0.91
671	0.92
672	0.89
673	0.87
674	0.83
675	0.74
676	0.65
677	0.56
678	0.45
679	0.34
680	0.25
681	0.18
682	0.13
683	0.13
684	0.1
685	0.08
686	0.08
687	0.09
688	0.09
689	0.08
690	0.09
691	0.1
692	0.1
693	0.09
694	0.09
695	0.08
696	0.08
697	0.08
698	0.07
699	0.07
700	0.07
701	0.07
702	0.08
703	0.1
704	0.11
705	0.13
706	0.12
707	0.13
708	0.16
709	0.2
710	0.24
711	0.24
712	0.3
713	0.29
714	0.32
715	0.33
716	0.34
717	0.34
718	0.32
719	0.33
720	0.28
721	0.3
722	0.3
723	0.32
724	0.29
725	0.25
726	0.25
727	0.24
728	0.22
729	0.21
730	0.21
731	0.23
732	0.24
733	0.26
734	0.27
735	0.27
736	0.28
737	0.3
738	0.33
739	0.35
740	0.41
741	0.48
742	0.48
743	0.49
744	0.48
745	0.5
746	0.44
747	0.4
748	0.36
749	0.32
750	0.34
751	0.37
752	0.36

A0A5C3L5X9

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer