Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C3KR26

Protein Details
Accession A0A5C3KR26    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
128-153VQLKALQNQKQKQKEKQKEERPGDARHydrophilic
783-812AVVAKSSKARKGKKESKGGEKKKPTNFFGDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
743-744KR
787-806KSSKARKGKKESKGGEKKKP
Subcellular Location(s) cyto 19.5, cyto_nucl 13, nucl 3.5, mito 2, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002562  3'-5'_exonuclease_dom  
IPR018247  EF_Hand_1_Ca_BS  
IPR012588  Exosome-assoc_fac_Rrp6_N  
IPR010997  HRDC-like_sf  
IPR002121  HRDC_dom  
IPR044876  HRDC_dom_sf  
IPR012337  RNaseH-like_sf  
IPR036397  RNaseH_sf  
IPR045092  Rrp6-like  
Gene Ontology GO:0000176  C:nuclear exosome (RNase complex)  
GO:0000175  F:3'-5'-RNA exonuclease activity  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0000166  F:nucleotide binding  
GO:0000467  P:exonucleolytic trimming to generate mature 3'-end of 5.8S rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
Pfam View protein in Pfam  
PF01612  DNA_pol_A_exo1  
PF00570  HRDC  
PF08066  PMC2NT  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00018  EF_HAND_1  
PS50967  HRDC  
Amino Acid Sequences MTSSSKSPLAPETFANFHNALQSIALKATKASAGLPPDIGFYKSVDGALKDEVEGLERRILRLVGRVVGFVDVKGKGRDQDRDRDRTVGAEDLVDDFHAAVVDSMDVLLERADICLDEFSGKLKRPVVQLKALQNQKQKQKEKQKEERPGDARGFLPPSLQHAAHLAKPQELFPRKPDNSDGARPQLAHKYNASVPLGYVLQKEDLALKYLGEGDEEISGHPYFYETTHLSYPKHVYEPPAEPQAPPPLSADPVAYVDSAEAFGALLDHLAGADVQEIAVDLEHHSYRTYRGFLCLMQITTRGGGPSRPPRDFVVDLLVPDVRARMQELNAVFTDPNKIKVFHGAESDIVWLQQDFGVYVVGLFDTFHASKLLELPRHSLSTLLSLYADFTPDKKYQQADWRIRPLPKEMLDYARSDTHWLLFIYDCVRGGLVDKGLARSRGGSPVEGVGGVEEVDRLVLLREVLFRSSLTSLRVWGVEGYDYARGGGSGGWDTLAKKWNKPGLMCANEDWRAVPVQRVQRAVYRGVHAWRDRVAREEDESTRYVLPNHWLFMLAESQPGDVAGLLGMFRGGVPGVVKKRARELLEVVRAGVREGLEEEKVVEVEEKVVEVEEKVVEEEKVVEEKAPMSIVAPTSRLFGGAKSDISVRTSSFFGEVLGHESAGSRDGAFRDLVAKIHGDLVIAPSVPKVVVEVKNDPAVGMQVDDEGPMAFVPAAERERRSGDDVRMMDDMGPIVVVGKKSVKRKRVVEAGSVTPPEDKKKKVEGEEEEETFDFAAAPNVLDAVVAKSSKARKGKKESKGGEKKKPTNFFGDFPAPPKAKSEVRSGNISKSFKS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.34
2 0.37
3 0.3
4 0.26
5 0.28
6 0.26
7 0.21
8 0.19
9 0.2
10 0.16
11 0.18
12 0.19
13 0.15
14 0.14
15 0.16
16 0.15
17 0.15
18 0.15
19 0.17
20 0.2
21 0.21
22 0.23
23 0.21
24 0.22
25 0.23
26 0.22
27 0.19
28 0.16
29 0.17
30 0.16
31 0.18
32 0.17
33 0.17
34 0.18
35 0.2
36 0.19
37 0.16
38 0.17
39 0.15
40 0.16
41 0.17
42 0.17
43 0.2
44 0.2
45 0.21
46 0.22
47 0.23
48 0.21
49 0.26
50 0.27
51 0.26
52 0.26
53 0.25
54 0.23
55 0.25
56 0.24
57 0.18
58 0.19
59 0.16
60 0.19
61 0.21
62 0.23
63 0.25
64 0.31
65 0.4
66 0.41
67 0.5
68 0.56
69 0.61
70 0.62
71 0.6
72 0.54
73 0.48
74 0.45
75 0.37
76 0.29
77 0.22
78 0.2
79 0.17
80 0.17
81 0.14
82 0.11
83 0.08
84 0.07
85 0.07
86 0.06
87 0.05
88 0.05
89 0.05
90 0.05
91 0.05
92 0.04
93 0.04
94 0.04
95 0.04
96 0.04
97 0.04
98 0.05
99 0.05
100 0.05
101 0.06
102 0.07
103 0.08
104 0.08
105 0.08
106 0.11
107 0.17
108 0.19
109 0.23
110 0.25
111 0.29
112 0.36
113 0.44
114 0.47
115 0.49
116 0.54
117 0.58
118 0.64
119 0.67
120 0.66
121 0.67
122 0.69
123 0.71
124 0.74
125 0.74
126 0.76
127 0.8
128 0.84
129 0.86
130 0.89
131 0.89
132 0.9
133 0.88
134 0.88
135 0.8
136 0.76
137 0.67
138 0.59
139 0.5
140 0.43
141 0.39
142 0.29
143 0.27
144 0.21
145 0.24
146 0.25
147 0.25
148 0.21
149 0.23
150 0.25
151 0.26
152 0.31
153 0.27
154 0.26
155 0.27
156 0.29
157 0.34
158 0.38
159 0.37
160 0.38
161 0.48
162 0.45
163 0.48
164 0.49
165 0.47
166 0.47
167 0.52
168 0.5
169 0.45
170 0.45
171 0.43
172 0.42
173 0.44
174 0.41
175 0.37
176 0.32
177 0.32
178 0.32
179 0.37
180 0.35
181 0.26
182 0.23
183 0.22
184 0.22
185 0.18
186 0.17
187 0.13
188 0.12
189 0.12
190 0.12
191 0.14
192 0.13
193 0.15
194 0.14
195 0.13
196 0.13
197 0.14
198 0.14
199 0.1
200 0.1
201 0.08
202 0.09
203 0.09
204 0.08
205 0.1
206 0.1
207 0.09
208 0.09
209 0.09
210 0.08
211 0.08
212 0.13
213 0.12
214 0.15
215 0.19
216 0.22
217 0.22
218 0.25
219 0.28
220 0.26
221 0.28
222 0.26
223 0.26
224 0.29
225 0.32
226 0.32
227 0.36
228 0.33
229 0.31
230 0.33
231 0.38
232 0.33
233 0.3
234 0.28
235 0.22
236 0.23
237 0.23
238 0.2
239 0.12
240 0.13
241 0.13
242 0.11
243 0.09
244 0.08
245 0.07
246 0.07
247 0.06
248 0.05
249 0.04
250 0.03
251 0.04
252 0.03
253 0.03
254 0.03
255 0.03
256 0.03
257 0.03
258 0.03
259 0.03
260 0.03
261 0.03
262 0.03
263 0.03
264 0.03
265 0.03
266 0.03
267 0.04
268 0.04
269 0.07
270 0.07
271 0.08
272 0.08
273 0.09
274 0.12
275 0.14
276 0.16
277 0.15
278 0.17
279 0.18
280 0.18
281 0.21
282 0.2
283 0.18
284 0.16
285 0.16
286 0.14
287 0.13
288 0.13
289 0.1
290 0.09
291 0.1
292 0.16
293 0.25
294 0.31
295 0.31
296 0.33
297 0.34
298 0.4
299 0.39
300 0.33
301 0.29
302 0.23
303 0.22
304 0.21
305 0.19
306 0.13
307 0.12
308 0.12
309 0.06
310 0.06
311 0.08
312 0.09
313 0.09
314 0.13
315 0.13
316 0.15
317 0.15
318 0.16
319 0.14
320 0.12
321 0.18
322 0.14
323 0.19
324 0.18
325 0.19
326 0.18
327 0.26
328 0.28
329 0.24
330 0.25
331 0.21
332 0.2
333 0.19
334 0.2
335 0.12
336 0.1
337 0.08
338 0.06
339 0.06
340 0.06
341 0.05
342 0.04
343 0.05
344 0.05
345 0.04
346 0.04
347 0.04
348 0.03
349 0.03
350 0.03
351 0.03
352 0.06
353 0.07
354 0.07
355 0.08
356 0.08
357 0.08
358 0.13
359 0.17
360 0.16
361 0.17
362 0.2
363 0.21
364 0.22
365 0.21
366 0.17
367 0.14
368 0.14
369 0.14
370 0.11
371 0.09
372 0.08
373 0.1
374 0.09
375 0.1
376 0.07
377 0.07
378 0.12
379 0.13
380 0.15
381 0.16
382 0.18
383 0.21
384 0.3
385 0.39
386 0.42
387 0.46
388 0.51
389 0.53
390 0.53
391 0.51
392 0.46
393 0.41
394 0.35
395 0.33
396 0.28
397 0.27
398 0.27
399 0.27
400 0.25
401 0.21
402 0.19
403 0.17
404 0.16
405 0.12
406 0.12
407 0.11
408 0.1
409 0.09
410 0.1
411 0.09
412 0.09
413 0.09
414 0.07
415 0.07
416 0.06
417 0.07
418 0.07
419 0.06
420 0.07
421 0.08
422 0.1
423 0.11
424 0.12
425 0.11
426 0.12
427 0.13
428 0.16
429 0.17
430 0.15
431 0.14
432 0.14
433 0.14
434 0.12
435 0.11
436 0.05
437 0.05
438 0.04
439 0.04
440 0.03
441 0.03
442 0.03
443 0.03
444 0.03
445 0.03
446 0.03
447 0.03
448 0.04
449 0.06
450 0.07
451 0.07
452 0.08
453 0.08
454 0.09
455 0.11
456 0.11
457 0.12
458 0.11
459 0.12
460 0.12
461 0.12
462 0.11
463 0.1
464 0.09
465 0.07
466 0.07
467 0.08
468 0.07
469 0.07
470 0.07
471 0.06
472 0.06
473 0.06
474 0.06
475 0.05
476 0.05
477 0.05
478 0.05
479 0.06
480 0.07
481 0.1
482 0.17
483 0.17
484 0.18
485 0.24
486 0.28
487 0.31
488 0.3
489 0.35
490 0.37
491 0.39
492 0.39
493 0.35
494 0.35
495 0.34
496 0.34
497 0.26
498 0.18
499 0.16
500 0.15
501 0.16
502 0.17
503 0.22
504 0.26
505 0.27
506 0.28
507 0.31
508 0.33
509 0.35
510 0.31
511 0.27
512 0.26
513 0.27
514 0.32
515 0.29
516 0.28
517 0.29
518 0.3
519 0.28
520 0.29
521 0.29
522 0.25
523 0.26
524 0.29
525 0.26
526 0.26
527 0.26
528 0.24
529 0.22
530 0.2
531 0.19
532 0.16
533 0.2
534 0.18
535 0.18
536 0.17
537 0.16
538 0.16
539 0.16
540 0.17
541 0.12
542 0.11
543 0.11
544 0.11
545 0.1
546 0.09
547 0.08
548 0.05
549 0.05
550 0.03
551 0.03
552 0.03
553 0.03
554 0.03
555 0.03
556 0.03
557 0.03
558 0.03
559 0.03
560 0.04
561 0.1
562 0.14
563 0.21
564 0.23
565 0.24
566 0.31
567 0.36
568 0.37
569 0.35
570 0.38
571 0.39
572 0.44
573 0.43
574 0.37
575 0.33
576 0.31
577 0.27
578 0.23
579 0.14
580 0.08
581 0.1
582 0.11
583 0.1
584 0.1
585 0.1
586 0.09
587 0.09
588 0.09
589 0.08
590 0.07
591 0.08
592 0.07
593 0.07
594 0.07
595 0.07
596 0.07
597 0.06
598 0.07
599 0.06
600 0.07
601 0.07
602 0.08
603 0.08
604 0.08
605 0.09
606 0.09
607 0.11
608 0.1
609 0.1
610 0.1
611 0.11
612 0.11
613 0.1
614 0.09
615 0.08
616 0.09
617 0.1
618 0.11
619 0.12
620 0.12
621 0.13
622 0.13
623 0.14
624 0.12
625 0.11
626 0.15
627 0.16
628 0.16
629 0.15
630 0.17
631 0.17
632 0.19
633 0.19
634 0.15
635 0.15
636 0.15
637 0.14
638 0.14
639 0.12
640 0.11
641 0.11
642 0.11
643 0.13
644 0.13
645 0.12
646 0.11
647 0.11
648 0.11
649 0.11
650 0.11
651 0.07
652 0.09
653 0.1
654 0.11
655 0.11
656 0.11
657 0.12
658 0.13
659 0.13
660 0.13
661 0.13
662 0.12
663 0.14
664 0.13
665 0.11
666 0.1
667 0.11
668 0.11
669 0.11
670 0.1
671 0.08
672 0.09
673 0.08
674 0.08
675 0.08
676 0.14
677 0.19
678 0.24
679 0.27
680 0.3
681 0.33
682 0.33
683 0.3
684 0.24
685 0.2
686 0.15
687 0.12
688 0.09
689 0.08
690 0.08
691 0.08
692 0.08
693 0.07
694 0.07
695 0.06
696 0.06
697 0.05
698 0.05
699 0.06
700 0.1
701 0.14
702 0.17
703 0.19
704 0.21
705 0.25
706 0.28
707 0.33
708 0.34
709 0.34
710 0.4
711 0.39
712 0.39
713 0.36
714 0.33
715 0.28
716 0.23
717 0.19
718 0.11
719 0.1
720 0.06
721 0.07
722 0.09
723 0.09
724 0.1
725 0.17
726 0.23
727 0.33
728 0.43
729 0.5
730 0.56
731 0.62
732 0.69
733 0.72
734 0.7
735 0.68
736 0.64
737 0.61
738 0.57
739 0.52
740 0.44
741 0.39
742 0.37
743 0.39
744 0.4
745 0.39
746 0.41
747 0.5
748 0.57
749 0.59
750 0.66
751 0.64
752 0.65
753 0.68
754 0.62
755 0.56
756 0.48
757 0.41
758 0.32
759 0.24
760 0.16
761 0.1
762 0.11
763 0.09
764 0.09
765 0.08
766 0.08
767 0.08
768 0.08
769 0.08
770 0.08
771 0.11
772 0.11
773 0.11
774 0.17
775 0.23
776 0.31
777 0.41
778 0.47
779 0.54
780 0.66
781 0.76
782 0.8
783 0.85
784 0.86
785 0.87
786 0.9
787 0.89
788 0.89
789 0.89
790 0.89
791 0.88
792 0.88
793 0.8
794 0.78
795 0.73
796 0.65
797 0.61
798 0.59
799 0.51
800 0.47
801 0.52
802 0.44
803 0.4
804 0.41
805 0.4
806 0.39
807 0.4
808 0.47
809 0.47
810 0.5
811 0.59
812 0.58
813 0.6
814 0.62