Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C3LDI6

Protein Details
Accession A0A5C3LDI6    Localization Confidence High Confidence Score 19.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
217-240DSDAPVLKTKRKRSRSKTATPDEGHydrophilic
303-322SNHAAWKQRNREKRTRMRAIHydrophilic
462-490AYVLPGRDRKSCKNKFKIEDKRNHARINYHydrophilic
534-560VITSEKPLLRPPTKRRRGKSSAMDDGVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
224-259KTKRKRSRSKTATPDEGEGEGEEPKKRSGRGRRSRG
545-551PTKRRRG
Subcellular Location(s) nucl 13.5, mito 11, cyto_nucl 8.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009057  Homeobox-like_sf  
IPR017930  Myb_dom  
IPR001005  SANT/Myb  
IPR017884  SANT_dom  
IPR039467  TFIIIB_B''_Myb  
Pfam View protein in Pfam  
PF15963  Myb_DNA-bind_7  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51294  HTH_MYB  
PS50090  MYB_LIKE  
PS51293  SANT  
CDD cd00167  SANT  
Amino Acid Sequences MSSRVQKGNAVFKPVTKARPRAPPGPGPTASRQASVVPTSGPQDASSSASTSKASMPPPSTVPLQTIPEMPTISPGIPVAVPTPAASIPIPSREPTVPRTFTTSRATIPVPNIVSPQRNVSQSTTPVSIPIPGSSRPQQVPILISTPSRVPVPSTTAPAKPIPTPAPTATFLTVPSNSAPPAPVLAPPASPSPPPVIQTPAQESSSSQPQGSHAQEDSDAPVLKTKRKRSRSKTATPDEGEGEGEEPKKRSGRGRRSRGPSLPPYDPNADPGEDIDPTVVTMATLCNDTGQGRVSSKAAEILSNHAAWKQRNREKRTRMRAIMEAKKYGRTDEEAELLADQADSTVPLPTPAPVVKTPSSNDNEENNPNFDYSQELAESRYNVQVRIGPNGETIIDEDSLVVNREETDETANYTHITESDHTKFVNSGTYGKRYRGSRWSAEETELFFEALSQFGENYELIAYVLPGRDRKSCKNKFKIEDKRNHARINYCLNNRKEVDIATLSRMTGKDFSGPVPEIRAPAPPPQITPETIEVITSEKPLLRPPTKRRRGKSSAMDDGVVIVGDIESMQLDNTED
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.52
2 0.55
3 0.54
4 0.58
5 0.58
6 0.68
7 0.71
8 0.7
9 0.72
10 0.71
11 0.7
12 0.7
13 0.66
14 0.61
15 0.6
16 0.61
17 0.55
18 0.47
19 0.41
20 0.35
21 0.36
22 0.32
23 0.28
24 0.2
25 0.2
26 0.22
27 0.23
28 0.21
29 0.17
30 0.17
31 0.18
32 0.2
33 0.19
34 0.18
35 0.17
36 0.18
37 0.18
38 0.18
39 0.21
40 0.22
41 0.24
42 0.28
43 0.3
44 0.32
45 0.34
46 0.36
47 0.34
48 0.31
49 0.32
50 0.29
51 0.3
52 0.28
53 0.28
54 0.27
55 0.26
56 0.26
57 0.22
58 0.21
59 0.2
60 0.18
61 0.16
62 0.15
63 0.13
64 0.12
65 0.13
66 0.11
67 0.1
68 0.1
69 0.09
70 0.11
71 0.1
72 0.12
73 0.11
74 0.13
75 0.15
76 0.19
77 0.21
78 0.19
79 0.24
80 0.25
81 0.29
82 0.32
83 0.39
84 0.37
85 0.37
86 0.44
87 0.41
88 0.44
89 0.46
90 0.42
91 0.35
92 0.35
93 0.35
94 0.31
95 0.31
96 0.32
97 0.28
98 0.26
99 0.28
100 0.29
101 0.31
102 0.28
103 0.32
104 0.29
105 0.3
106 0.32
107 0.33
108 0.33
109 0.33
110 0.35
111 0.32
112 0.28
113 0.27
114 0.24
115 0.23
116 0.19
117 0.18
118 0.17
119 0.17
120 0.23
121 0.26
122 0.32
123 0.3
124 0.33
125 0.32
126 0.31
127 0.31
128 0.28
129 0.25
130 0.2
131 0.19
132 0.17
133 0.16
134 0.16
135 0.15
136 0.13
137 0.13
138 0.14
139 0.21
140 0.22
141 0.26
142 0.28
143 0.28
144 0.31
145 0.31
146 0.31
147 0.25
148 0.28
149 0.26
150 0.25
151 0.28
152 0.26
153 0.28
154 0.28
155 0.29
156 0.25
157 0.22
158 0.21
159 0.2
160 0.18
161 0.15
162 0.15
163 0.14
164 0.13
165 0.13
166 0.13
167 0.1
168 0.11
169 0.1
170 0.1
171 0.12
172 0.12
173 0.12
174 0.13
175 0.15
176 0.15
177 0.15
178 0.15
179 0.17
180 0.18
181 0.19
182 0.19
183 0.21
184 0.22
185 0.25
186 0.28
187 0.27
188 0.26
189 0.24
190 0.24
191 0.23
192 0.28
193 0.26
194 0.21
195 0.18
196 0.2
197 0.26
198 0.26
199 0.25
200 0.18
201 0.18
202 0.18
203 0.18
204 0.17
205 0.14
206 0.13
207 0.11
208 0.15
209 0.17
210 0.23
211 0.3
212 0.39
213 0.47
214 0.56
215 0.67
216 0.71
217 0.8
218 0.83
219 0.85
220 0.85
221 0.82
222 0.79
223 0.7
224 0.63
225 0.53
226 0.44
227 0.34
228 0.24
229 0.18
230 0.12
231 0.12
232 0.12
233 0.12
234 0.14
235 0.16
236 0.18
237 0.26
238 0.34
239 0.44
240 0.53
241 0.62
242 0.68
243 0.74
244 0.79
245 0.75
246 0.71
247 0.67
248 0.62
249 0.56
250 0.49
251 0.46
252 0.42
253 0.37
254 0.33
255 0.27
256 0.22
257 0.18
258 0.17
259 0.14
260 0.1
261 0.1
262 0.07
263 0.06
264 0.05
265 0.05
266 0.04
267 0.03
268 0.03
269 0.03
270 0.04
271 0.04
272 0.04
273 0.04
274 0.05
275 0.05
276 0.06
277 0.07
278 0.08
279 0.08
280 0.09
281 0.09
282 0.09
283 0.09
284 0.12
285 0.1
286 0.1
287 0.1
288 0.13
289 0.14
290 0.14
291 0.14
292 0.13
293 0.17
294 0.18
295 0.25
296 0.31
297 0.37
298 0.46
299 0.54
300 0.62
301 0.69
302 0.77
303 0.8
304 0.79
305 0.76
306 0.7
307 0.69
308 0.68
309 0.65
310 0.58
311 0.52
312 0.45
313 0.45
314 0.41
315 0.36
316 0.29
317 0.24
318 0.24
319 0.21
320 0.21
321 0.17
322 0.17
323 0.16
324 0.14
325 0.11
326 0.07
327 0.05
328 0.04
329 0.03
330 0.03
331 0.04
332 0.05
333 0.04
334 0.05
335 0.06
336 0.06
337 0.08
338 0.09
339 0.12
340 0.12
341 0.17
342 0.18
343 0.2
344 0.21
345 0.26
346 0.29
347 0.28
348 0.3
349 0.28
350 0.31
351 0.34
352 0.34
353 0.29
354 0.27
355 0.24
356 0.21
357 0.18
358 0.18
359 0.13
360 0.13
361 0.11
362 0.11
363 0.13
364 0.14
365 0.15
366 0.13
367 0.18
368 0.17
369 0.17
370 0.18
371 0.2
372 0.2
373 0.24
374 0.23
375 0.18
376 0.18
377 0.18
378 0.17
379 0.14
380 0.13
381 0.1
382 0.09
383 0.08
384 0.08
385 0.08
386 0.08
387 0.09
388 0.08
389 0.06
390 0.07
391 0.08
392 0.09
393 0.09
394 0.12
395 0.11
396 0.13
397 0.13
398 0.14
399 0.12
400 0.12
401 0.12
402 0.09
403 0.11
404 0.11
405 0.17
406 0.2
407 0.21
408 0.2
409 0.21
410 0.21
411 0.19
412 0.22
413 0.17
414 0.2
415 0.23
416 0.3
417 0.32
418 0.34
419 0.39
420 0.37
421 0.42
422 0.45
423 0.47
424 0.46
425 0.51
426 0.56
427 0.52
428 0.52
429 0.48
430 0.41
431 0.37
432 0.31
433 0.23
434 0.15
435 0.14
436 0.11
437 0.1
438 0.09
439 0.06
440 0.06
441 0.06
442 0.08
443 0.07
444 0.07
445 0.07
446 0.07
447 0.07
448 0.07
449 0.07
450 0.07
451 0.09
452 0.11
453 0.13
454 0.16
455 0.24
456 0.3
457 0.4
458 0.49
459 0.58
460 0.67
461 0.75
462 0.82
463 0.83
464 0.88
465 0.89
466 0.88
467 0.88
468 0.86
469 0.86
470 0.84
471 0.81
472 0.74
473 0.68
474 0.64
475 0.64
476 0.64
477 0.62
478 0.64
479 0.61
480 0.64
481 0.61
482 0.56
483 0.48
484 0.4
485 0.37
486 0.32
487 0.32
488 0.28
489 0.27
490 0.25
491 0.27
492 0.26
493 0.23
494 0.21
495 0.2
496 0.2
497 0.21
498 0.22
499 0.25
500 0.26
501 0.24
502 0.27
503 0.27
504 0.25
505 0.24
506 0.28
507 0.25
508 0.3
509 0.37
510 0.33
511 0.33
512 0.37
513 0.39
514 0.36
515 0.38
516 0.34
517 0.31
518 0.29
519 0.27
520 0.22
521 0.22
522 0.21
523 0.18
524 0.16
525 0.15
526 0.16
527 0.23
528 0.32
529 0.38
530 0.47
531 0.56
532 0.66
533 0.74
534 0.83
535 0.85
536 0.85
537 0.86
538 0.86
539 0.86
540 0.84
541 0.83
542 0.76
543 0.68
544 0.57
545 0.5
546 0.4
547 0.29
548 0.19
549 0.09
550 0.06
551 0.05
552 0.05
553 0.04
554 0.04
555 0.04
556 0.05