Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C3LC08

Protein Details
Accession A0A5C3LC08    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
23-46RTWFDQPGRKLRRRTARKVKAAALHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
30-45GRKLRRRTARKVKAAA
129-134KAGKPK
189-208EGVRKLRAAKKEEEEAAKKK
Subcellular Location(s) mito 15, cyto 6, nucl 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001380  Ribosomal_L13e  
IPR018256  Ribosomal_L13e_CS  
Gene Ontology GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
GO:0005840  C:ribosome  
GO:0003735  F:structural constituent of ribosome  
GO:0006412  P:translation  
Pfam View protein in Pfam  
PF01294  Ribosomal_L13e  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS01104  RIBOSOMAL_L13E  
Amino Acid Sequences MGFAHNNVLHNNHFHKDWQRRVRTWFDQPGRKLRRRTARKVKAAALGVRPLSLLRPAVRGQTVRYNRKLREGRGFTLGELKEAGIGRKEAKTIGIVVDHRRRNLSEEGKKLNVDRLNEYKTRLIVFPRKAGKPKKGDSTGDDLKAATTRAALPLPSGAAAEPPRKITQADRDFNAFRTLRDARAWQRHEGVRKLRAAKKEEEEAAKKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.32
2 0.41
3 0.47
4 0.56
5 0.6
6 0.65
7 0.67
8 0.73
9 0.77
10 0.74
11 0.73
12 0.73
13 0.72
14 0.72
15 0.73
16 0.77
17 0.77
18 0.78
19 0.76
20 0.75
21 0.77
22 0.78
23 0.83
24 0.83
25 0.84
26 0.86
27 0.84
28 0.8
29 0.76
30 0.7
31 0.64
32 0.56
33 0.49
34 0.4
35 0.34
36 0.29
37 0.22
38 0.19
39 0.16
40 0.15
41 0.12
42 0.16
43 0.16
44 0.19
45 0.22
46 0.22
47 0.23
48 0.3
49 0.38
50 0.42
51 0.5
52 0.54
53 0.52
54 0.62
55 0.64
56 0.59
57 0.61
58 0.58
59 0.52
60 0.5
61 0.49
62 0.39
63 0.41
64 0.36
65 0.26
66 0.21
67 0.18
68 0.15
69 0.15
70 0.16
71 0.09
72 0.1
73 0.12
74 0.12
75 0.13
76 0.1
77 0.11
78 0.11
79 0.1
80 0.1
81 0.1
82 0.11
83 0.17
84 0.24
85 0.25
86 0.26
87 0.26
88 0.26
89 0.28
90 0.33
91 0.36
92 0.35
93 0.39
94 0.42
95 0.42
96 0.42
97 0.38
98 0.37
99 0.31
100 0.26
101 0.25
102 0.27
103 0.29
104 0.3
105 0.32
106 0.28
107 0.26
108 0.25
109 0.22
110 0.23
111 0.27
112 0.28
113 0.33
114 0.37
115 0.4
116 0.47
117 0.53
118 0.56
119 0.57
120 0.6
121 0.62
122 0.61
123 0.6
124 0.55
125 0.56
126 0.53
127 0.45
128 0.4
129 0.31
130 0.26
131 0.24
132 0.21
133 0.13
134 0.09
135 0.08
136 0.1
137 0.1
138 0.1
139 0.1
140 0.1
141 0.1
142 0.09
143 0.09
144 0.07
145 0.1
146 0.14
147 0.16
148 0.17
149 0.2
150 0.22
151 0.22
152 0.24
153 0.26
154 0.33
155 0.4
156 0.43
157 0.42
158 0.46
159 0.46
160 0.46
161 0.49
162 0.38
163 0.29
164 0.32
165 0.32
166 0.29
167 0.31
168 0.37
169 0.38
170 0.48
171 0.51
172 0.48
173 0.53
174 0.57
175 0.61
176 0.63
177 0.62
178 0.59
179 0.63
180 0.68
181 0.67
182 0.68
183 0.66
184 0.65
185 0.63
186 0.64
187 0.62
188 0.62