FuNGI

A0A5C3KBB4

Protein Details

Accession

A0A5C3KBB4

Localization Confidence

High

Confidence Score

19.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
496-534	AVSRPRSETKEEKKARKAAVKVAKQTRRVEKKTTQTQFD	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
270-271	KR
499-525	RPRSETKEEKKARKAAVKVAKQTRRVE

Subcellular Location(s)

nucl 24, cyto 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007307 Ltv1
Gene Ontology	GO:0042274 P:ribosomal small subunit biogenesis
Pfam	View protein in Pfam PF04180 LTV

Amino Acid Sequences

MPPKSKSIFRQPGTKHFQLVHRSQRDPLINDPEAGQHVLKAFERDNIKKGKSREELEDILGDELSSERPNAGEATLYGVYYDDTEYDYMQHLRTAGLQEDGVESVLLEAPSASKSKRQNKKAVSILDLPADSLPPTYELPRTYDSQQAVPESISGLQPDMDPHLRQVLEALEDDAFVDNGLEDDFFHDLVAEGERASDEELDFDFEEEEEEEEVDELDEEPREETWEDRFKTFKKEHNTEQSYDSDDDLASEGGDTVRSLLSISVIGGKKRRKGSSVASGYSMSSSSMTRHEGLQTLDEQFEQMMLKQYGDEEGDEEPRPDSEDDESDEAPELITSRDDFDGMISEFLNDYEILGRKLRPKLEGETGAEKLDTFRRAIGRDTDVTALEDDDSEENQFQYIEEEVKKDRWDCETVLSTYSNFENHPRLIRAIDSRPKSVPKIVLDPKTGLPSVESSSPLNQARERRVAKPRKSTLSNSEDSDESDSDTDTIEYRRAAVSRPRSETKEEKKARKAAVKVAKQTRRVEKKTTQTQFDAELRDQKQKLVGMQAKTRKL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.7
2	0.63
3	0.58
4	0.62
5	0.61
6	0.64
7	0.64
8	0.63
9	0.62
10	0.61
11	0.64
12	0.63
13	0.58
14	0.56
15	0.54
16	0.48
17	0.46
18	0.44
19	0.38
20	0.34
21	0.32
22	0.25
23	0.17
24	0.18
25	0.2
26	0.21
27	0.22
28	0.21
29	0.24
30	0.33
31	0.35
32	0.41
33	0.46
34	0.5
35	0.52
36	0.56
37	0.6
38	0.6
39	0.6
40	0.6
41	0.58
42	0.56
43	0.51
44	0.49
45	0.39
46	0.32
47	0.27
48	0.2
49	0.13
50	0.11
51	0.11
52	0.09
53	0.09
54	0.08
55	0.08
56	0.1
57	0.1
58	0.1
59	0.09
60	0.08
61	0.14
62	0.14
63	0.14
64	0.13
65	0.12
66	0.12
67	0.12
68	0.12
69	0.07
70	0.08
71	0.09
72	0.09
73	0.1
74	0.13
75	0.14
76	0.14
77	0.14
78	0.13
79	0.13
80	0.15
81	0.17
82	0.15
83	0.15
84	0.14
85	0.14
86	0.14
87	0.14
88	0.12
89	0.09
90	0.07
91	0.07
92	0.09
93	0.08
94	0.06
95	0.06
96	0.07
97	0.09
98	0.11
99	0.11
100	0.16
101	0.26
102	0.37
103	0.47
104	0.55
105	0.64
106	0.69
107	0.77
108	0.78
109	0.73
110	0.68
111	0.63
112	0.55
113	0.48
114	0.4
115	0.32
116	0.24
117	0.2
118	0.15
119	0.1
120	0.09
121	0.09
122	0.1
123	0.12
124	0.14
125	0.15
126	0.19
127	0.22
128	0.24
129	0.25
130	0.29
131	0.29
132	0.29
133	0.29
134	0.27
135	0.25
136	0.22
137	0.19
138	0.14
139	0.14
140	0.12
141	0.1
142	0.08
143	0.08
144	0.08
145	0.09
146	0.12
147	0.14
148	0.14
149	0.14
150	0.18
151	0.18
152	0.17
153	0.18
154	0.14
155	0.13
156	0.13
157	0.13
158	0.09
159	0.09
160	0.09
161	0.08
162	0.07
163	0.05
164	0.05
165	0.04
166	0.04
167	0.04
168	0.04
169	0.03
170	0.05
171	0.06
172	0.06
173	0.06
174	0.06
175	0.06
176	0.06
177	0.07
178	0.06
179	0.05
180	0.05
181	0.05
182	0.06
183	0.06
184	0.06
185	0.05
186	0.06
187	0.06
188	0.08
189	0.08
190	0.08
191	0.08
192	0.07
193	0.08
194	0.07
195	0.07
196	0.06
197	0.06
198	0.05
199	0.05
200	0.05
201	0.05
202	0.05
203	0.04
204	0.05
205	0.05
206	0.05
207	0.06
208	0.06
209	0.07
210	0.07
211	0.08
212	0.13
213	0.2
214	0.22
215	0.23
216	0.26
217	0.26
218	0.34
219	0.38
220	0.4
221	0.42
222	0.46
223	0.51
224	0.59
225	0.61
226	0.55
227	0.53
228	0.47
229	0.41
230	0.36
231	0.29
232	0.19
233	0.15
234	0.13
235	0.11
236	0.09
237	0.06
238	0.05
239	0.05
240	0.04
241	0.04
242	0.04
243	0.04
244	0.04
245	0.04
246	0.04
247	0.04
248	0.04
249	0.04
250	0.05
251	0.1
252	0.11
253	0.13
254	0.18
255	0.22
256	0.27
257	0.33
258	0.35
259	0.31
260	0.35
261	0.39
262	0.44
263	0.45
264	0.4
265	0.36
266	0.35
267	0.32
268	0.28
269	0.23
270	0.12
271	0.08
272	0.08
273	0.07
274	0.09
275	0.1
276	0.11
277	0.11
278	0.12
279	0.13
280	0.13
281	0.13
282	0.13
283	0.12
284	0.12
285	0.11
286	0.1
287	0.08
288	0.08
289	0.07
290	0.06
291	0.09
292	0.09
293	0.09
294	0.09
295	0.1
296	0.1
297	0.11
298	0.1
299	0.07
300	0.07
301	0.1
302	0.1
303	0.11
304	0.1
305	0.09
306	0.11
307	0.1
308	0.11
309	0.1
310	0.11
311	0.12
312	0.15
313	0.15
314	0.13
315	0.13
316	0.12
317	0.1
318	0.08
319	0.07
320	0.05
321	0.05
322	0.05
323	0.07
324	0.07
325	0.07
326	0.07
327	0.07
328	0.09
329	0.09
330	0.09
331	0.07
332	0.07
333	0.07
334	0.07
335	0.08
336	0.05
337	0.05
338	0.08
339	0.09
340	0.1
341	0.12
342	0.14
343	0.19
344	0.24
345	0.26
346	0.27
347	0.29
348	0.32
349	0.37
350	0.39
351	0.37
352	0.36
353	0.35
354	0.32
355	0.28
356	0.24
357	0.19
358	0.19
359	0.17
360	0.13
361	0.15
362	0.18
363	0.2
364	0.22
365	0.25
366	0.25
367	0.25
368	0.26
369	0.24
370	0.21
371	0.21
372	0.19
373	0.15
374	0.11
375	0.09
376	0.09
377	0.08
378	0.08
379	0.08
380	0.09
381	0.08
382	0.08
383	0.08
384	0.07
385	0.08
386	0.08
387	0.11
388	0.11
389	0.14
390	0.16
391	0.19
392	0.22
393	0.22
394	0.24
395	0.24
396	0.27
397	0.25
398	0.28
399	0.3
400	0.28
401	0.29
402	0.27
403	0.23
404	0.21
405	0.21
406	0.17
407	0.14
408	0.16
409	0.19
410	0.21
411	0.25
412	0.25
413	0.25
414	0.25
415	0.28
416	0.3
417	0.34
418	0.4
419	0.39
420	0.41
421	0.44
422	0.47
423	0.47
424	0.46
425	0.44
426	0.4
427	0.46
428	0.5
429	0.52
430	0.5
431	0.5
432	0.47
433	0.44
434	0.41
435	0.31
436	0.24
437	0.21
438	0.21
439	0.2
440	0.2
441	0.18
442	0.2
443	0.26
444	0.28
445	0.28
446	0.31
447	0.35
448	0.4
449	0.48
450	0.5
451	0.52
452	0.59
453	0.66
454	0.71
455	0.75
456	0.77
457	0.76
458	0.78
459	0.76
460	0.75
461	0.73
462	0.67
463	0.59
464	0.53
465	0.45
466	0.41
467	0.38
468	0.28
469	0.22
470	0.19
471	0.17
472	0.14
473	0.14
474	0.13
475	0.11
476	0.12
477	0.12
478	0.12
479	0.13
480	0.16
481	0.16
482	0.2
483	0.28
484	0.37
485	0.43
486	0.51
487	0.56
488	0.57
489	0.64
490	0.69
491	0.7
492	0.7
493	0.72
494	0.74
495	0.77
496	0.81
497	0.82
498	0.8
499	0.76
500	0.75
501	0.76
502	0.75
503	0.76
504	0.78
505	0.78
506	0.77
507	0.81
508	0.81
509	0.82
510	0.79
511	0.78
512	0.77
513	0.79
514	0.82
515	0.81
516	0.77
517	0.69
518	0.66
519	0.64
520	0.59
521	0.55
522	0.48
523	0.49
524	0.46
525	0.51
526	0.49
527	0.45
528	0.45
529	0.43
530	0.42
531	0.44
532	0.47
533	0.44
534	0.53

A0A5C3KBB4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer