Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C3KSX6

Protein Details
Accession A0A5C3KSX6    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
283-311YEPGNSSKSSKNRKASQESMKPVRKRNKIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
294-311NRKASQESMKPVRKRNKI
Subcellular Location(s) nucl 19, mito_nucl 13.166, cyto_nucl 12.166, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045237  COPS7/eIF3m  
IPR000717  PCI_dom  
Pfam View protein in Pfam  
PF01399  PCI  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50250  PCI  
Amino Acid Sequences MDLGSNFSAKLEPFLLMGKSMRGAAAAKLIQDATAAPGVLVFSELLELPNIRELEKNEQYSKFYSLLQLFAYKTYEDYLRSKDSLPPLTTNQITKLKHLSIVSLASERRILPYDLLLNSLDITTVRELEDLIIDAIYQDILRGKLDQKEKQLEVEYTMGRDVQPEKLDDLLDILRNWAQTTSQVLAALDNKIHTISSNAAAQKVYQIEYDEALQKTLKDVSEKGGRHDRDKDRTYDRENAGGAGGSGSGSLGAARRKLFDRGGREERSGREDRENSMDVDEPYEPGNSSKSSKNRKASQESMKPVRKRNKI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.16
3 0.16
4 0.17
5 0.15
6 0.15
7 0.15
8 0.14
9 0.13
10 0.14
11 0.12
12 0.18
13 0.18
14 0.17
15 0.18
16 0.18
17 0.16
18 0.15
19 0.15
20 0.11
21 0.11
22 0.1
23 0.09
24 0.09
25 0.09
26 0.08
27 0.09
28 0.06
29 0.04
30 0.05
31 0.06
32 0.06
33 0.07
34 0.08
35 0.08
36 0.13
37 0.13
38 0.13
39 0.16
40 0.2
41 0.28
42 0.35
43 0.39
44 0.39
45 0.41
46 0.43
47 0.42
48 0.42
49 0.34
50 0.28
51 0.29
52 0.25
53 0.24
54 0.22
55 0.23
56 0.2
57 0.2
58 0.2
59 0.15
60 0.14
61 0.15
62 0.15
63 0.16
64 0.18
65 0.22
66 0.24
67 0.26
68 0.26
69 0.29
70 0.33
71 0.36
72 0.35
73 0.34
74 0.33
75 0.37
76 0.38
77 0.34
78 0.34
79 0.35
80 0.33
81 0.33
82 0.35
83 0.3
84 0.32
85 0.31
86 0.26
87 0.21
88 0.21
89 0.19
90 0.18
91 0.17
92 0.14
93 0.15
94 0.14
95 0.14
96 0.15
97 0.14
98 0.12
99 0.14
100 0.17
101 0.15
102 0.17
103 0.15
104 0.13
105 0.12
106 0.12
107 0.1
108 0.06
109 0.07
110 0.06
111 0.07
112 0.07
113 0.06
114 0.06
115 0.07
116 0.07
117 0.06
118 0.05
119 0.04
120 0.04
121 0.04
122 0.04
123 0.03
124 0.03
125 0.03
126 0.04
127 0.05
128 0.05
129 0.07
130 0.09
131 0.15
132 0.21
133 0.25
134 0.29
135 0.34
136 0.34
137 0.34
138 0.34
139 0.29
140 0.25
141 0.24
142 0.18
143 0.14
144 0.13
145 0.11
146 0.09
147 0.11
148 0.1
149 0.1
150 0.11
151 0.11
152 0.12
153 0.13
154 0.13
155 0.11
156 0.11
157 0.09
158 0.09
159 0.09
160 0.09
161 0.09
162 0.09
163 0.09
164 0.08
165 0.07
166 0.07
167 0.1
168 0.1
169 0.1
170 0.1
171 0.1
172 0.11
173 0.12
174 0.12
175 0.09
176 0.08
177 0.08
178 0.08
179 0.08
180 0.07
181 0.07
182 0.08
183 0.1
184 0.13
185 0.14
186 0.14
187 0.14
188 0.14
189 0.16
190 0.15
191 0.14
192 0.11
193 0.12
194 0.12
195 0.13
196 0.14
197 0.16
198 0.15
199 0.15
200 0.15
201 0.13
202 0.14
203 0.16
204 0.16
205 0.14
206 0.14
207 0.19
208 0.27
209 0.28
210 0.31
211 0.38
212 0.39
213 0.41
214 0.5
215 0.53
216 0.54
217 0.58
218 0.58
219 0.57
220 0.61
221 0.62
222 0.61
223 0.55
224 0.5
225 0.46
226 0.4
227 0.33
228 0.26
229 0.2
230 0.12
231 0.1
232 0.05
233 0.05
234 0.04
235 0.04
236 0.03
237 0.04
238 0.07
239 0.09
240 0.13
241 0.14
242 0.17
243 0.2
244 0.24
245 0.3
246 0.34
247 0.4
248 0.46
249 0.53
250 0.54
251 0.56
252 0.57
253 0.54
254 0.54
255 0.52
256 0.46
257 0.47
258 0.46
259 0.45
260 0.47
261 0.45
262 0.39
263 0.36
264 0.35
265 0.26
266 0.27
267 0.24
268 0.18
269 0.17
270 0.17
271 0.15
272 0.14
273 0.16
274 0.16
275 0.19
276 0.27
277 0.36
278 0.45
279 0.54
280 0.63
281 0.69
282 0.76
283 0.81
284 0.82
285 0.83
286 0.83
287 0.83
288 0.84
289 0.84
290 0.82
291 0.82