Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C3L6Q0

Protein Details
Accession A0A5C3L6Q0    Localization Confidence High Confidence Score 19.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
346-373LNKGSRNRSQNDKRRRERGGRRRHGDGDBasic
422-442GEGDRRRGGRNERPKKTQEELBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
212-241EKRREGLSGPLRMRWARKDDVKKRGAKKES
351-369RNRSQNDKRRRERGGRRRH
401-437RKRRRDEGLTGDRRSHDAVGRGEGDRRRGGRNERPKK
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto_nucl 14.5, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019416  NCBP3  
Gene Ontology GO:0003729  F:mRNA binding  
GO:0000340  F:RNA 7-methylguanosine cap binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF10309  NCBP3  
Amino Acid Sequences MDMLADDSIAPESFGASEPAPTLLSYDDATPYEEQIAVDTESSRLADRIGRGKIYLLSESASAGSSGARASGKRKALDGPEEEDTMMEDDGLEEDPEIRSNALFLSGPPISHLPTTRIFAYATHFEAQPLGLEWVSDTSCVLVFPSSYLAKRGYAALQKQQDEDISIDDGSVTAKPIPVVIWPAEERISRTLGLALGKSTAGEPTSEDHEREKRREGLSGPLRMRWARKDDVKKRGAKKESEFYRKHGELAGKELVNGRDIPSVPGSRKRQRDDGLDDDAQRARLDEELDAFLAQDSDGSGDEAGAKDDQLLVDKFSNEDALPSPPASPPSKMRSDYIADDGRTMLNKGSRNRSQNDKRRRERGGRRRHGDGDSSFNSLSLSDRLGQPREERSTLEWGPERKRRRDEGLTGDRRSHDAVGRGEGDRRRGGRNERPKKTQEELDAELDAFLNEGTAV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.09
2 0.11
3 0.1
4 0.11
5 0.12
6 0.13
7 0.13
8 0.12
9 0.12
10 0.11
11 0.12
12 0.12
13 0.12
14 0.13
15 0.14
16 0.17
17 0.16
18 0.16
19 0.16
20 0.16
21 0.15
22 0.14
23 0.16
24 0.13
25 0.13
26 0.13
27 0.12
28 0.12
29 0.13
30 0.13
31 0.1
32 0.11
33 0.14
34 0.19
35 0.26
36 0.28
37 0.29
38 0.28
39 0.3
40 0.33
41 0.32
42 0.29
43 0.22
44 0.19
45 0.18
46 0.18
47 0.17
48 0.13
49 0.1
50 0.08
51 0.08
52 0.07
53 0.07
54 0.08
55 0.1
56 0.11
57 0.15
58 0.23
59 0.28
60 0.29
61 0.31
62 0.35
63 0.39
64 0.44
65 0.44
66 0.41
67 0.38
68 0.37
69 0.35
70 0.29
71 0.25
72 0.19
73 0.15
74 0.1
75 0.07
76 0.06
77 0.07
78 0.08
79 0.07
80 0.05
81 0.06
82 0.07
83 0.08
84 0.09
85 0.08
86 0.07
87 0.08
88 0.08
89 0.08
90 0.08
91 0.07
92 0.12
93 0.12
94 0.12
95 0.14
96 0.15
97 0.15
98 0.17
99 0.18
100 0.16
101 0.19
102 0.21
103 0.2
104 0.2
105 0.19
106 0.18
107 0.21
108 0.21
109 0.21
110 0.2
111 0.19
112 0.18
113 0.18
114 0.18
115 0.13
116 0.11
117 0.1
118 0.07
119 0.07
120 0.07
121 0.09
122 0.09
123 0.08
124 0.07
125 0.06
126 0.06
127 0.06
128 0.07
129 0.05
130 0.05
131 0.05
132 0.09
133 0.1
134 0.11
135 0.13
136 0.14
137 0.14
138 0.15
139 0.16
140 0.17
141 0.21
142 0.24
143 0.29
144 0.34
145 0.34
146 0.34
147 0.34
148 0.29
149 0.25
150 0.22
151 0.16
152 0.12
153 0.1
154 0.09
155 0.08
156 0.08
157 0.07
158 0.07
159 0.06
160 0.05
161 0.06
162 0.06
163 0.06
164 0.07
165 0.07
166 0.09
167 0.09
168 0.11
169 0.11
170 0.12
171 0.14
172 0.14
173 0.15
174 0.15
175 0.16
176 0.13
177 0.13
178 0.13
179 0.12
180 0.13
181 0.11
182 0.09
183 0.08
184 0.08
185 0.08
186 0.07
187 0.06
188 0.06
189 0.06
190 0.06
191 0.07
192 0.12
193 0.13
194 0.13
195 0.17
196 0.24
197 0.28
198 0.3
199 0.34
200 0.35
201 0.35
202 0.37
203 0.35
204 0.37
205 0.38
206 0.43
207 0.39
208 0.35
209 0.36
210 0.35
211 0.36
212 0.31
213 0.3
214 0.27
215 0.35
216 0.44
217 0.5
218 0.58
219 0.63
220 0.66
221 0.69
222 0.73
223 0.71
224 0.66
225 0.62
226 0.61
227 0.63
228 0.64
229 0.58
230 0.53
231 0.56
232 0.5
233 0.46
234 0.4
235 0.35
236 0.26
237 0.29
238 0.29
239 0.21
240 0.21
241 0.23
242 0.2
243 0.18
244 0.17
245 0.14
246 0.13
247 0.13
248 0.14
249 0.15
250 0.17
251 0.18
252 0.26
253 0.32
254 0.38
255 0.45
256 0.47
257 0.52
258 0.54
259 0.58
260 0.56
261 0.53
262 0.52
263 0.46
264 0.43
265 0.38
266 0.35
267 0.29
268 0.22
269 0.17
270 0.12
271 0.11
272 0.11
273 0.09
274 0.1
275 0.1
276 0.1
277 0.1
278 0.09
279 0.08
280 0.07
281 0.06
282 0.04
283 0.04
284 0.04
285 0.04
286 0.05
287 0.05
288 0.05
289 0.06
290 0.06
291 0.07
292 0.06
293 0.06
294 0.06
295 0.06
296 0.06
297 0.09
298 0.09
299 0.1
300 0.12
301 0.12
302 0.12
303 0.12
304 0.14
305 0.1
306 0.11
307 0.11
308 0.12
309 0.13
310 0.13
311 0.14
312 0.13
313 0.18
314 0.19
315 0.21
316 0.24
317 0.29
318 0.35
319 0.36
320 0.36
321 0.37
322 0.38
323 0.37
324 0.38
325 0.36
326 0.3
327 0.29
328 0.28
329 0.25
330 0.22
331 0.2
332 0.16
333 0.17
334 0.22
335 0.27
336 0.36
337 0.42
338 0.48
339 0.51
340 0.6
341 0.66
342 0.7
343 0.76
344 0.78
345 0.79
346 0.82
347 0.86
348 0.86
349 0.87
350 0.87
351 0.87
352 0.87
353 0.84
354 0.82
355 0.79
356 0.72
357 0.67
358 0.59
359 0.56
360 0.47
361 0.46
362 0.38
363 0.33
364 0.29
365 0.22
366 0.21
367 0.14
368 0.14
369 0.12
370 0.17
371 0.22
372 0.25
373 0.28
374 0.3
375 0.36
376 0.4
377 0.4
378 0.37
379 0.36
380 0.42
381 0.4
382 0.42
383 0.4
384 0.4
385 0.48
386 0.54
387 0.6
388 0.61
389 0.68
390 0.68
391 0.72
392 0.74
393 0.73
394 0.75
395 0.77
396 0.77
397 0.71
398 0.69
399 0.61
400 0.55
401 0.5
402 0.43
403 0.36
404 0.34
405 0.34
406 0.34
407 0.36
408 0.34
409 0.38
410 0.39
411 0.4
412 0.4
413 0.41
414 0.42
415 0.47
416 0.55
417 0.59
418 0.67
419 0.72
420 0.74
421 0.8
422 0.8
423 0.81
424 0.78
425 0.75
426 0.73
427 0.69
428 0.65
429 0.59
430 0.53
431 0.45
432 0.38
433 0.31
434 0.22
435 0.15
436 0.09