Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C3L4W0

Protein Details
Accession A0A5C3L4W0    Localization Confidence High Confidence Score 18.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-20NPTSPSMRKRQRTLDMHPGPHydrophilic
58-80DEDKPKTDKKAGRRKIKIEFIQDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
62-94PKTDKKAGRRKIKIEFIQDKSRRHITFSKRKAG
220-222RRR
Subcellular Location(s) nucl 25.5, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR033897  MADS_SRF-like  
IPR002100  TF_MADSbox  
IPR036879  TF_MADSbox_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0000987  F:cis-regulatory region sequence-specific DNA binding  
GO:0000981  F:DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific  
GO:0046983  F:protein dimerization activity  
GO:0045944  P:positive regulation of transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF00319  SRF-TF  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00350  MADS_BOX_1  
PS50066  MADS_BOX_2  
CDD cd00266  MADS_SRF_like  
Amino Acid Sequences NPTSPSMRKRQRTLDMHPGPANPADQHPPPPTGGQTVVDDAFINDHDAVDSGGEDDEDEDKPKTDKKAGRRKIKIEFIQDKSRRHITFSKRKAGIMKKAYELSTLTGTQVLLLVVSETGLVYTFTTAKLQPLVTQPEGKNLIQACLNAPHGTLPSSMPVGPPIGRSPMNIPSQPPPPSNLPGGLAIGNQPPGSLNKDDADDHDDDDAASHGGRPTAGDKRRRRASSTTGPPPASAGSRGQTSPHSPNASVPPPLNIPPGSQPGSQPHSSHPQPAPQSQIALGSPTSPQQQHPQVPASSQYSTTSYPHHPAAQPQQTHHQQHDAGMYGNHMMSPGGYSYPPGGTNAQGGPGQQQLGGLAAAAASHGHWGQAPQQPVGQSGHYGRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.81
2 0.77
3 0.75
4 0.7
5 0.62
6 0.54
7 0.48
8 0.42
9 0.33
10 0.3
11 0.3
12 0.29
13 0.35
14 0.35
15 0.35
16 0.35
17 0.36
18 0.34
19 0.32
20 0.31
21 0.26
22 0.25
23 0.26
24 0.24
25 0.22
26 0.2
27 0.16
28 0.15
29 0.13
30 0.13
31 0.1
32 0.1
33 0.09
34 0.09
35 0.09
36 0.08
37 0.08
38 0.06
39 0.06
40 0.06
41 0.06
42 0.07
43 0.09
44 0.09
45 0.12
46 0.12
47 0.13
48 0.16
49 0.21
50 0.24
51 0.31
52 0.37
53 0.46
54 0.56
55 0.65
56 0.74
57 0.78
58 0.81
59 0.81
60 0.84
61 0.8
62 0.79
63 0.79
64 0.74
65 0.76
66 0.74
67 0.69
68 0.65
69 0.67
70 0.57
71 0.54
72 0.56
73 0.56
74 0.61
75 0.65
76 0.69
77 0.62
78 0.64
79 0.67
80 0.67
81 0.66
82 0.63
83 0.58
84 0.52
85 0.54
86 0.51
87 0.44
88 0.37
89 0.29
90 0.24
91 0.21
92 0.17
93 0.15
94 0.14
95 0.12
96 0.11
97 0.09
98 0.06
99 0.05
100 0.05
101 0.04
102 0.04
103 0.04
104 0.03
105 0.03
106 0.03
107 0.04
108 0.04
109 0.05
110 0.06
111 0.06
112 0.08
113 0.09
114 0.1
115 0.12
116 0.12
117 0.13
118 0.18
119 0.23
120 0.23
121 0.29
122 0.28
123 0.32
124 0.36
125 0.33
126 0.32
127 0.27
128 0.26
129 0.21
130 0.21
131 0.16
132 0.15
133 0.17
134 0.13
135 0.13
136 0.12
137 0.12
138 0.12
139 0.11
140 0.09
141 0.09
142 0.1
143 0.1
144 0.09
145 0.1
146 0.1
147 0.1
148 0.11
149 0.11
150 0.13
151 0.13
152 0.14
153 0.16
154 0.21
155 0.24
156 0.23
157 0.24
158 0.24
159 0.3
160 0.32
161 0.29
162 0.26
163 0.26
164 0.28
165 0.27
166 0.24
167 0.19
168 0.17
169 0.17
170 0.14
171 0.1
172 0.09
173 0.09
174 0.09
175 0.08
176 0.07
177 0.07
178 0.08
179 0.11
180 0.1
181 0.11
182 0.11
183 0.13
184 0.13
185 0.14
186 0.16
187 0.14
188 0.14
189 0.13
190 0.12
191 0.1
192 0.1
193 0.09
194 0.05
195 0.05
196 0.05
197 0.05
198 0.05
199 0.05
200 0.06
201 0.09
202 0.17
203 0.23
204 0.33
205 0.39
206 0.48
207 0.57
208 0.59
209 0.6
210 0.58
211 0.6
212 0.61
213 0.63
214 0.61
215 0.58
216 0.56
217 0.51
218 0.46
219 0.38
220 0.29
221 0.22
222 0.17
223 0.13
224 0.14
225 0.15
226 0.15
227 0.16
228 0.2
229 0.22
230 0.26
231 0.27
232 0.25
233 0.28
234 0.33
235 0.33
236 0.3
237 0.26
238 0.23
239 0.23
240 0.24
241 0.24
242 0.19
243 0.18
244 0.19
245 0.24
246 0.25
247 0.24
248 0.24
249 0.27
250 0.32
251 0.33
252 0.3
253 0.29
254 0.34
255 0.34
256 0.39
257 0.35
258 0.37
259 0.39
260 0.41
261 0.43
262 0.35
263 0.35
264 0.29
265 0.29
266 0.22
267 0.19
268 0.17
269 0.12
270 0.11
271 0.12
272 0.16
273 0.15
274 0.17
275 0.24
276 0.32
277 0.35
278 0.39
279 0.41
280 0.38
281 0.38
282 0.4
283 0.36
284 0.3
285 0.26
286 0.24
287 0.22
288 0.24
289 0.24
290 0.24
291 0.24
292 0.27
293 0.28
294 0.31
295 0.3
296 0.35
297 0.43
298 0.47
299 0.46
300 0.45
301 0.52
302 0.56
303 0.59
304 0.55
305 0.51
306 0.43
307 0.43
308 0.43
309 0.34
310 0.27
311 0.23
312 0.21
313 0.17
314 0.16
315 0.13
316 0.1
317 0.08
318 0.07
319 0.08
320 0.08
321 0.08
322 0.09
323 0.1
324 0.11
325 0.13
326 0.14
327 0.15
328 0.16
329 0.15
330 0.19
331 0.18
332 0.19
333 0.18
334 0.18
335 0.18
336 0.19
337 0.19
338 0.15
339 0.15
340 0.12
341 0.12
342 0.12
343 0.09
344 0.06
345 0.05
346 0.05
347 0.05
348 0.05
349 0.04
350 0.06
351 0.06
352 0.07
353 0.08
354 0.1
355 0.17
356 0.23
357 0.26
358 0.25
359 0.28
360 0.29
361 0.31
362 0.32
363 0.26
364 0.25