Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A5DR65

Protein Details
Accession A5DR65    Localization Confidence High Confidence Score 17.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
78-98EDSIPLKKRHPNLKHHFPRYTBasic
159-179PMLPPKFKLRKNRHREPSPPPBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
166-173KLRKNRHR
293-309KYRRHEHGSGGKRARRQ
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 11, mito 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017862  SKI-int_prot_SKIP  
IPR004015  SKI-int_prot_SKIP_SNW-dom  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
KEGG pgu:PGUG_05766  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF02731  SKIP_SNW  
Amino Acid Sequences MLSSLLPKPKHSAYLQPVLVATTNISESSGGRLSWIEQTDKDSEKNNNSSRELNLYKSNQKVISATEVTTRKVQATYEDSIPLKKRHPNLKHHFPRYTWETCPDDSVQNCVSATKQVIDKLLGYNRDDSKKDQEVSIKYSTGDDQEERTIQIRTLQEDPMLPPKFKLRKNRHREPSPPPPILKDTSSATQKLTKEDREKWKIPAAVSNWKNNQGFALSLEDRISAATAGEEHSQDGLNVEKFSALSNALENADKEARVEISMRNKMRQEQALREQKEKEEKLRELAVLARNDKYRRHEHGSGGKRARRQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.53
2 0.51
3 0.47
4 0.44
5 0.38
6 0.36
7 0.26
8 0.19
9 0.12
10 0.12
11 0.1
12 0.11
13 0.1
14 0.1
15 0.14
16 0.15
17 0.13
18 0.13
19 0.14
20 0.15
21 0.2
22 0.23
23 0.21
24 0.2
25 0.25
26 0.29
27 0.31
28 0.31
29 0.31
30 0.35
31 0.4
32 0.48
33 0.5
34 0.51
35 0.51
36 0.52
37 0.49
38 0.51
39 0.46
40 0.4
41 0.42
42 0.42
43 0.45
44 0.46
45 0.49
46 0.41
47 0.4
48 0.38
49 0.32
50 0.33
51 0.27
52 0.25
53 0.27
54 0.27
55 0.28
56 0.3
57 0.29
58 0.23
59 0.23
60 0.23
61 0.2
62 0.24
63 0.25
64 0.24
65 0.27
66 0.26
67 0.3
68 0.34
69 0.32
70 0.32
71 0.35
72 0.42
73 0.48
74 0.56
75 0.63
76 0.68
77 0.76
78 0.81
79 0.82
80 0.78
81 0.69
82 0.67
83 0.63
84 0.58
85 0.49
86 0.45
87 0.41
88 0.37
89 0.39
90 0.33
91 0.3
92 0.26
93 0.28
94 0.23
95 0.2
96 0.19
97 0.16
98 0.15
99 0.13
100 0.14
101 0.12
102 0.13
103 0.13
104 0.14
105 0.15
106 0.15
107 0.17
108 0.19
109 0.2
110 0.19
111 0.23
112 0.25
113 0.28
114 0.29
115 0.29
116 0.32
117 0.35
118 0.34
119 0.32
120 0.34
121 0.32
122 0.36
123 0.34
124 0.28
125 0.23
126 0.23
127 0.21
128 0.17
129 0.16
130 0.12
131 0.12
132 0.12
133 0.13
134 0.13
135 0.13
136 0.12
137 0.1
138 0.15
139 0.14
140 0.15
141 0.17
142 0.16
143 0.16
144 0.16
145 0.17
146 0.21
147 0.22
148 0.19
149 0.18
150 0.26
151 0.33
152 0.38
153 0.47
154 0.5
155 0.59
156 0.68
157 0.78
158 0.8
159 0.8
160 0.82
161 0.79
162 0.79
163 0.77
164 0.71
165 0.62
166 0.55
167 0.51
168 0.46
169 0.39
170 0.3
171 0.24
172 0.25
173 0.27
174 0.25
175 0.23
176 0.26
177 0.26
178 0.3
179 0.32
180 0.34
181 0.38
182 0.46
183 0.54
184 0.57
185 0.59
186 0.56
187 0.58
188 0.54
189 0.48
190 0.46
191 0.4
192 0.42
193 0.43
194 0.46
195 0.43
196 0.47
197 0.46
198 0.4
199 0.36
200 0.27
201 0.24
202 0.18
203 0.21
204 0.15
205 0.16
206 0.16
207 0.15
208 0.14
209 0.14
210 0.12
211 0.06
212 0.06
213 0.05
214 0.05
215 0.07
216 0.08
217 0.08
218 0.09
219 0.09
220 0.09
221 0.09
222 0.1
223 0.11
224 0.11
225 0.11
226 0.11
227 0.1
228 0.1
229 0.11
230 0.12
231 0.1
232 0.09
233 0.09
234 0.11
235 0.12
236 0.13
237 0.12
238 0.15
239 0.16
240 0.15
241 0.15
242 0.15
243 0.14
244 0.14
245 0.16
246 0.17
247 0.25
248 0.34
249 0.36
250 0.4
251 0.43
252 0.47
253 0.52
254 0.55
255 0.53
256 0.53
257 0.6
258 0.65
259 0.66
260 0.65
261 0.62
262 0.61
263 0.65
264 0.61
265 0.59
266 0.58
267 0.57
268 0.58
269 0.58
270 0.51
271 0.42
272 0.43
273 0.41
274 0.38
275 0.38
276 0.37
277 0.4
278 0.43
279 0.48
280 0.49
281 0.52
282 0.54
283 0.6
284 0.61
285 0.63
286 0.7
287 0.73
288 0.76
289 0.77