Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C3L9J6

Protein Details
Accession A0A5C3L9J6    Localization Confidence Low Confidence Score 7.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
8-27GHYGGRRRQRDDYDDRRHQQBasic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito 11, nucl 8.5, cyto_nucl 6.5, pero 4, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR016024  ARM-type_fold  
IPR027159  CBP80  
IPR015172  MIF4G-like_typ-1  
IPR015174  MIF4G-like_typ-2  
Gene Ontology GO:0005846  C:nuclear cap binding complex  
GO:0000339  F:RNA cap binding  
GO:0006406  P:mRNA export from nucleus  
GO:0016070  P:RNA metabolic process  
Pfam View protein in Pfam  
PF09088  MIF4G_like  
PF09090  MIF4G_like_2  
Amino Acid Sequences MSYERRGGHYGGRRRQRDDYDDRRHQQQETPDEIIKNAIIKFGEVDANEELLRLEKQIRDHVPRSIPVLSEAFRVSVTEQPYKIPHYATLLRVLHNKSDAPTEDEIPLGRLILEDFWKGFQGYVDKLAWREARLCIHFFAHLTVAKLISADSMLALLQSFTAVLDEFGVSNGRAKKAALCAGEGLLIGGLVLKPHSPTSTNEIINAIQTYTDTTNSQKWLVAPITSLTSESTPLTPPETSIEFLEMLLTTLRKLDESDYVETGDCLPRPYEIYVPFSPDVLRPYDLPLVLVPPEAIEMDALSPITAEGETPVKKDEWPEFFIRLFPSDVSPDFTNPVGYMIRTTILDIVDIFEVNRKECARLLLEYPKWNLPGTFKPKPGSTVTVEPAPGKDWQLESTIIETIISTYLLLPESSRKSIYYISLITEICKLSPSTVGPAVGKSIRRLYSSLSEGLDVEAARKFAEWFSVHMSNFGFQWVWKEWVPDLSLPIQHPRRAFMRRAIEFEIRLAYHDRILKTLPEAMQSPEAYVIPESGPSPFFDYEDPTHPHHDAAQAILNLFRGRAKAEDVITHLDTLRTTLDSSEEEGHVGNVDSLVRSIAVQSLLHIGARSFSHLLNAIERYLPLLRALAGVNSSTSAAASSGTTSSSNPEARMEILSAAAAFWKHNRQMVAIVFDKLMQYQIVDPTDIVSWTFLNGAGVGQLSELGGPMNLSAFEWDLLRAAIDKANGRVVAARRKVMQLRKEADDKRAQDNAAVNHMDVDVEHKPEETPVDDPQLITALKAYSSLIKEQKMALSRTLEGFVESLAPPPTARHPNPQARTVVSESAWESRAAWERDEWNAWETWGWYKQFCRSYAPYLGTYAETLYTVSFARFDGVNDPGADALKRIWNIATGQDA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.69
2 0.76
3 0.75
4 0.75
5 0.75
6 0.76
7 0.77
8 0.81
9 0.8
10 0.8
11 0.75
12 0.69
13 0.65
14 0.63
15 0.61
16 0.57
17 0.58
18 0.53
19 0.5
20 0.47
21 0.43
22 0.35
23 0.3
24 0.24
25 0.22
26 0.18
27 0.17
28 0.18
29 0.19
30 0.21
31 0.17
32 0.2
33 0.18
34 0.2
35 0.19
36 0.17
37 0.15
38 0.14
39 0.14
40 0.13
41 0.16
42 0.17
43 0.22
44 0.31
45 0.38
46 0.45
47 0.47
48 0.53
49 0.54
50 0.53
51 0.54
52 0.47
53 0.4
54 0.35
55 0.36
56 0.29
57 0.27
58 0.25
59 0.21
60 0.18
61 0.19
62 0.17
63 0.18
64 0.23
65 0.26
66 0.26
67 0.29
68 0.32
69 0.35
70 0.36
71 0.32
72 0.29
73 0.3
74 0.35
75 0.33
76 0.39
77 0.37
78 0.38
79 0.43
80 0.43
81 0.4
82 0.38
83 0.37
84 0.3
85 0.34
86 0.33
87 0.31
88 0.31
89 0.3
90 0.28
91 0.27
92 0.26
93 0.21
94 0.19
95 0.14
96 0.11
97 0.09
98 0.09
99 0.1
100 0.12
101 0.12
102 0.13
103 0.13
104 0.15
105 0.15
106 0.14
107 0.14
108 0.16
109 0.17
110 0.2
111 0.21
112 0.22
113 0.22
114 0.28
115 0.28
116 0.26
117 0.27
118 0.26
119 0.32
120 0.34
121 0.35
122 0.31
123 0.3
124 0.3
125 0.27
126 0.25
127 0.21
128 0.2
129 0.2
130 0.19
131 0.18
132 0.16
133 0.16
134 0.14
135 0.1
136 0.09
137 0.07
138 0.05
139 0.05
140 0.05
141 0.05
142 0.05
143 0.04
144 0.04
145 0.04
146 0.04
147 0.04
148 0.04
149 0.04
150 0.04
151 0.05
152 0.06
153 0.06
154 0.07
155 0.08
156 0.07
157 0.13
158 0.16
159 0.17
160 0.17
161 0.18
162 0.21
163 0.25
164 0.3
165 0.26
166 0.24
167 0.24
168 0.23
169 0.23
170 0.19
171 0.14
172 0.08
173 0.06
174 0.05
175 0.05
176 0.04
177 0.04
178 0.04
179 0.05
180 0.07
181 0.08
182 0.1
183 0.12
184 0.15
185 0.22
186 0.29
187 0.28
188 0.28
189 0.29
190 0.27
191 0.26
192 0.24
193 0.17
194 0.09
195 0.09
196 0.11
197 0.11
198 0.12
199 0.12
200 0.14
201 0.18
202 0.2
203 0.21
204 0.2
205 0.19
206 0.22
207 0.22
208 0.2
209 0.17
210 0.16
211 0.17
212 0.16
213 0.16
214 0.12
215 0.11
216 0.12
217 0.12
218 0.13
219 0.12
220 0.12
221 0.15
222 0.13
223 0.14
224 0.16
225 0.16
226 0.16
227 0.15
228 0.16
229 0.14
230 0.13
231 0.13
232 0.1
233 0.08
234 0.08
235 0.08
236 0.06
237 0.07
238 0.08
239 0.08
240 0.08
241 0.1
242 0.15
243 0.19
244 0.21
245 0.21
246 0.21
247 0.21
248 0.2
249 0.2
250 0.17
251 0.13
252 0.12
253 0.11
254 0.11
255 0.14
256 0.15
257 0.18
258 0.18
259 0.24
260 0.23
261 0.28
262 0.27
263 0.26
264 0.25
265 0.22
266 0.22
267 0.18
268 0.18
269 0.14
270 0.17
271 0.19
272 0.18
273 0.17
274 0.15
275 0.14
276 0.13
277 0.13
278 0.09
279 0.06
280 0.07
281 0.06
282 0.06
283 0.04
284 0.04
285 0.04
286 0.05
287 0.05
288 0.04
289 0.04
290 0.04
291 0.04
292 0.04
293 0.04
294 0.05
295 0.09
296 0.1
297 0.11
298 0.12
299 0.13
300 0.13
301 0.17
302 0.22
303 0.22
304 0.26
305 0.28
306 0.29
307 0.28
308 0.29
309 0.27
310 0.23
311 0.19
312 0.15
313 0.14
314 0.14
315 0.14
316 0.16
317 0.16
318 0.15
319 0.15
320 0.15
321 0.14
322 0.12
323 0.13
324 0.1
325 0.09
326 0.09
327 0.08
328 0.09
329 0.08
330 0.09
331 0.09
332 0.08
333 0.08
334 0.07
335 0.08
336 0.07
337 0.07
338 0.07
339 0.09
340 0.1
341 0.1
342 0.13
343 0.13
344 0.14
345 0.15
346 0.18
347 0.16
348 0.17
349 0.2
350 0.24
351 0.27
352 0.29
353 0.3
354 0.29
355 0.28
356 0.27
357 0.25
358 0.21
359 0.27
360 0.32
361 0.35
362 0.37
363 0.38
364 0.38
365 0.41
366 0.39
367 0.34
368 0.29
369 0.28
370 0.26
371 0.26
372 0.26
373 0.23
374 0.21
375 0.18
376 0.16
377 0.12
378 0.12
379 0.11
380 0.11
381 0.13
382 0.13
383 0.12
384 0.12
385 0.12
386 0.1
387 0.09
388 0.08
389 0.06
390 0.06
391 0.05
392 0.04
393 0.04
394 0.05
395 0.05
396 0.05
397 0.05
398 0.09
399 0.12
400 0.13
401 0.14
402 0.13
403 0.15
404 0.16
405 0.17
406 0.15
407 0.13
408 0.13
409 0.15
410 0.15
411 0.14
412 0.15
413 0.13
414 0.11
415 0.11
416 0.1
417 0.08
418 0.09
419 0.09
420 0.1
421 0.11
422 0.12
423 0.11
424 0.11
425 0.12
426 0.13
427 0.13
428 0.13
429 0.16
430 0.17
431 0.18
432 0.18
433 0.19
434 0.21
435 0.22
436 0.22
437 0.18
438 0.16
439 0.15
440 0.15
441 0.13
442 0.09
443 0.08
444 0.07
445 0.06
446 0.06
447 0.06
448 0.06
449 0.06
450 0.1
451 0.09
452 0.1
453 0.15
454 0.18
455 0.18
456 0.19
457 0.19
458 0.16
459 0.15
460 0.14
461 0.1
462 0.06
463 0.1
464 0.1
465 0.13
466 0.13
467 0.14
468 0.14
469 0.15
470 0.17
471 0.13
472 0.14
473 0.12
474 0.14
475 0.14
476 0.21
477 0.22
478 0.24
479 0.24
480 0.25
481 0.29
482 0.31
483 0.33
484 0.33
485 0.39
486 0.38
487 0.41
488 0.43
489 0.39
490 0.35
491 0.33
492 0.27
493 0.18
494 0.18
495 0.17
496 0.13
497 0.14
498 0.18
499 0.17
500 0.17
501 0.18
502 0.17
503 0.15
504 0.18
505 0.16
506 0.14
507 0.15
508 0.15
509 0.17
510 0.16
511 0.16
512 0.13
513 0.12
514 0.11
515 0.1
516 0.09
517 0.06
518 0.07
519 0.07
520 0.07
521 0.07
522 0.08
523 0.11
524 0.11
525 0.11
526 0.11
527 0.15
528 0.17
529 0.21
530 0.24
531 0.23
532 0.25
533 0.25
534 0.25
535 0.22
536 0.22
537 0.17
538 0.15
539 0.16
540 0.13
541 0.13
542 0.13
543 0.13
544 0.1
545 0.1
546 0.1
547 0.07
548 0.08
549 0.09
550 0.11
551 0.13
552 0.14
553 0.15
554 0.17
555 0.2
556 0.19
557 0.19
558 0.17
559 0.14
560 0.13
561 0.12
562 0.11
563 0.08
564 0.08
565 0.07
566 0.09
567 0.09
568 0.11
569 0.12
570 0.12
571 0.11
572 0.11
573 0.11
574 0.1
575 0.09
576 0.07
577 0.05
578 0.05
579 0.05
580 0.05
581 0.05
582 0.05
583 0.05
584 0.05
585 0.06
586 0.07
587 0.07
588 0.07
589 0.09
590 0.1
591 0.1
592 0.1
593 0.08
594 0.09
595 0.09
596 0.11
597 0.1
598 0.1
599 0.11
600 0.14
601 0.15
602 0.16
603 0.16
604 0.15
605 0.14
606 0.14
607 0.14
608 0.13
609 0.12
610 0.1
611 0.09
612 0.09
613 0.1
614 0.1
615 0.08
616 0.08
617 0.08
618 0.08
619 0.08
620 0.08
621 0.06
622 0.06
623 0.06
624 0.05
625 0.05
626 0.05
627 0.06
628 0.06
629 0.07
630 0.08
631 0.08
632 0.1
633 0.14
634 0.16
635 0.15
636 0.16
637 0.16
638 0.17
639 0.17
640 0.16
641 0.11
642 0.1
643 0.09
644 0.08
645 0.07
646 0.07
647 0.06
648 0.06
649 0.09
650 0.15
651 0.17
652 0.21
653 0.21
654 0.22
655 0.26
656 0.28
657 0.3
658 0.26
659 0.24
660 0.22
661 0.21
662 0.21
663 0.16
664 0.14
665 0.09
666 0.08
667 0.09
668 0.13
669 0.13
670 0.13
671 0.13
672 0.13
673 0.14
674 0.13
675 0.11
676 0.08
677 0.07
678 0.07
679 0.08
680 0.07
681 0.06
682 0.06
683 0.06
684 0.06
685 0.06
686 0.05
687 0.05
688 0.05
689 0.04
690 0.04
691 0.04
692 0.04
693 0.04
694 0.04
695 0.04
696 0.04
697 0.04
698 0.05
699 0.05
700 0.06
701 0.07
702 0.07
703 0.07
704 0.07
705 0.07
706 0.07
707 0.08
708 0.08
709 0.1
710 0.12
711 0.14
712 0.15
713 0.18
714 0.18
715 0.17
716 0.22
717 0.25
718 0.32
719 0.34
720 0.36
721 0.35
722 0.41
723 0.49
724 0.51
725 0.53
726 0.53
727 0.54
728 0.57
729 0.64
730 0.6
731 0.6
732 0.61
733 0.57
734 0.54
735 0.53
736 0.48
737 0.43
738 0.45
739 0.4
740 0.37
741 0.34
742 0.27
743 0.24
744 0.24
745 0.2
746 0.14
747 0.17
748 0.13
749 0.15
750 0.15
751 0.15
752 0.15
753 0.16
754 0.19
755 0.16
756 0.16
757 0.17
758 0.22
759 0.22
760 0.22
761 0.21
762 0.22
763 0.2
764 0.18
765 0.17
766 0.11
767 0.11
768 0.12
769 0.12
770 0.14
771 0.16
772 0.23
773 0.26
774 0.28
775 0.29
776 0.31
777 0.36
778 0.36
779 0.36
780 0.34
781 0.32
782 0.32
783 0.32
784 0.32
785 0.27
786 0.22
787 0.19
788 0.15
789 0.14
790 0.13
791 0.13
792 0.13
793 0.13
794 0.13
795 0.15
796 0.23
797 0.3
798 0.33
799 0.4
800 0.49
801 0.59
802 0.63
803 0.67
804 0.63
805 0.56
806 0.58
807 0.53
808 0.46
809 0.36
810 0.34
811 0.31
812 0.31
813 0.29
814 0.24
815 0.2
816 0.22
817 0.31
818 0.29
819 0.29
820 0.29
821 0.31
822 0.36
823 0.38
824 0.35
825 0.29
826 0.28
827 0.27
828 0.23
829 0.22
830 0.24
831 0.26
832 0.26
833 0.27
834 0.3
835 0.38
836 0.43
837 0.43
838 0.45
839 0.44
840 0.49
841 0.52
842 0.53
843 0.46
844 0.42
845 0.41
846 0.35
847 0.3
848 0.24
849 0.17
850 0.13
851 0.12
852 0.1
853 0.1
854 0.1
855 0.1
856 0.09
857 0.09
858 0.11
859 0.11
860 0.12
861 0.15
862 0.17
863 0.19
864 0.19
865 0.19
866 0.18
867 0.19
868 0.17
869 0.14
870 0.15
871 0.18
872 0.19
873 0.2
874 0.19
875 0.21
876 0.22