Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C3KIP4

Protein Details
Accession A0A5C3KIP4    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
127-148KTEYSKEKYLKRKEAKYSKVFTHydrophilic
268-290HEVKSDRHKSKLRKRKAINDMLYBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
274-283RHKSKLRKRK
Subcellular Location(s) cyto_nucl 9.833, nucl 9.5, cyto_mito 9.333, cyto 9, mito 8.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR029063  SAM-dependent_MTases_sf  
IPR017423  TRM6  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0031515  C:tRNA (m1A) methyltransferase complex  
GO:0030488  P:tRNA methylation  
Pfam View protein in Pfam  
PF04189  Gcd10p  
Amino Acid Sequences MASTSSRPIIQHGNTVLLRIPNGDLRSVKVEKNATVTIGKFGAFLANDLIGQPYGLTYEIVAKKLKVLPPKTIQEVEDTDATNELINDGQAVQPLTVEEIKALKLAGVHSSDIIQKQVENHANFALKTEYSKEKYLKRKEAKYSKVFTTVEPTIFNVCDYWFNKDQNRIRDLRMDSLAQVLNLANIRPGGRYLVVDDASGLIVAGILNRLGGEGRLLAICDTESPPAFPVLTQMNFTPDIMKPLTSLNWATSQRDYIPVVPPSELPQHEVKSDRHKSKLRKRKAINDMLYSTRDDLFSGEFDSLIIASEYDPSTIIERLSHYLAGSASVVVHSPYIQIVANLQTKLRHEPQFLCPSVTEAWLRQYQVLPGRTHPMMAMSGSGGFILHATKIYDDPSASAPSQERSNTASGVENPIAESSANTMVVDVSND
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.36
2 0.37
3 0.36
4 0.3
5 0.28
6 0.23
7 0.23
8 0.21
9 0.23
10 0.26
11 0.24
12 0.26
13 0.33
14 0.35
15 0.35
16 0.36
17 0.39
18 0.36
19 0.41
20 0.38
21 0.33
22 0.34
23 0.32
24 0.29
25 0.26
26 0.23
27 0.18
28 0.17
29 0.18
30 0.14
31 0.14
32 0.12
33 0.12
34 0.12
35 0.12
36 0.13
37 0.09
38 0.09
39 0.08
40 0.06
41 0.07
42 0.07
43 0.07
44 0.06
45 0.15
46 0.17
47 0.2
48 0.22
49 0.21
50 0.25
51 0.31
52 0.36
53 0.37
54 0.38
55 0.44
56 0.51
57 0.56
58 0.57
59 0.54
60 0.5
61 0.46
62 0.45
63 0.39
64 0.33
65 0.28
66 0.23
67 0.21
68 0.2
69 0.15
70 0.12
71 0.1
72 0.07
73 0.06
74 0.07
75 0.06
76 0.07
77 0.08
78 0.09
79 0.08
80 0.08
81 0.08
82 0.1
83 0.1
84 0.1
85 0.09
86 0.1
87 0.1
88 0.11
89 0.1
90 0.08
91 0.09
92 0.1
93 0.12
94 0.12
95 0.13
96 0.12
97 0.14
98 0.16
99 0.16
100 0.16
101 0.13
102 0.12
103 0.14
104 0.22
105 0.27
106 0.25
107 0.26
108 0.28
109 0.29
110 0.28
111 0.28
112 0.21
113 0.15
114 0.15
115 0.18
116 0.22
117 0.24
118 0.29
119 0.33
120 0.4
121 0.5
122 0.58
123 0.65
124 0.67
125 0.72
126 0.77
127 0.82
128 0.83
129 0.81
130 0.76
131 0.69
132 0.67
133 0.59
134 0.49
135 0.46
136 0.39
137 0.32
138 0.27
139 0.26
140 0.2
141 0.19
142 0.19
143 0.12
144 0.1
145 0.16
146 0.16
147 0.21
148 0.24
149 0.27
150 0.3
151 0.39
152 0.44
153 0.44
154 0.49
155 0.45
156 0.42
157 0.46
158 0.45
159 0.39
160 0.36
161 0.3
162 0.25
163 0.25
164 0.24
165 0.16
166 0.15
167 0.11
168 0.1
169 0.1
170 0.09
171 0.06
172 0.07
173 0.08
174 0.07
175 0.08
176 0.08
177 0.08
178 0.08
179 0.09
180 0.11
181 0.11
182 0.1
183 0.1
184 0.09
185 0.08
186 0.08
187 0.06
188 0.03
189 0.03
190 0.03
191 0.03
192 0.03
193 0.02
194 0.03
195 0.03
196 0.03
197 0.03
198 0.03
199 0.03
200 0.03
201 0.04
202 0.04
203 0.04
204 0.04
205 0.04
206 0.04
207 0.05
208 0.06
209 0.07
210 0.07
211 0.07
212 0.08
213 0.08
214 0.08
215 0.07
216 0.08
217 0.1
218 0.11
219 0.11
220 0.11
221 0.13
222 0.14
223 0.14
224 0.14
225 0.11
226 0.14
227 0.13
228 0.13
229 0.11
230 0.12
231 0.13
232 0.12
233 0.13
234 0.11
235 0.16
236 0.18
237 0.19
238 0.19
239 0.19
240 0.18
241 0.2
242 0.2
243 0.16
244 0.2
245 0.2
246 0.2
247 0.19
248 0.19
249 0.19
250 0.23
251 0.21
252 0.2
253 0.22
254 0.22
255 0.23
256 0.27
257 0.27
258 0.32
259 0.41
260 0.43
261 0.47
262 0.53
263 0.62
264 0.69
265 0.76
266 0.76
267 0.78
268 0.8
269 0.83
270 0.85
271 0.85
272 0.79
273 0.74
274 0.67
275 0.6
276 0.54
277 0.45
278 0.36
279 0.27
280 0.21
281 0.16
282 0.14
283 0.12
284 0.11
285 0.11
286 0.09
287 0.08
288 0.08
289 0.08
290 0.07
291 0.06
292 0.05
293 0.04
294 0.04
295 0.07
296 0.07
297 0.07
298 0.08
299 0.08
300 0.1
301 0.1
302 0.11
303 0.1
304 0.12
305 0.14
306 0.15
307 0.15
308 0.13
309 0.14
310 0.13
311 0.13
312 0.11
313 0.09
314 0.07
315 0.07
316 0.07
317 0.06
318 0.07
319 0.06
320 0.06
321 0.06
322 0.07
323 0.07
324 0.07
325 0.08
326 0.14
327 0.18
328 0.18
329 0.19
330 0.21
331 0.23
332 0.3
333 0.36
334 0.36
335 0.36
336 0.4
337 0.48
338 0.54
339 0.53
340 0.48
341 0.41
342 0.38
343 0.35
344 0.34
345 0.27
346 0.19
347 0.23
348 0.24
349 0.25
350 0.24
351 0.24
352 0.27
353 0.33
354 0.37
355 0.34
356 0.33
357 0.38
358 0.36
359 0.35
360 0.3
361 0.24
362 0.2
363 0.18
364 0.16
365 0.11
366 0.11
367 0.11
368 0.1
369 0.08
370 0.06
371 0.06
372 0.07
373 0.06
374 0.07
375 0.08
376 0.1
377 0.11
378 0.13
379 0.14
380 0.14
381 0.15
382 0.17
383 0.21
384 0.2
385 0.22
386 0.23
387 0.24
388 0.28
389 0.28
390 0.27
391 0.27
392 0.29
393 0.26
394 0.26
395 0.27
396 0.25
397 0.3
398 0.28
399 0.25
400 0.23
401 0.23
402 0.22
403 0.17
404 0.15
405 0.12
406 0.14
407 0.14
408 0.13
409 0.13
410 0.13