Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4T0X6C0

Protein Details
Accession A0A4T0X6C0    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
80-101LNTPTVIQPKKRKSKNAVVIHDHydrophilic
411-431ENTKISKSSKSSKPNSSKYSSHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039024  RTC4  
IPR028094  RTC4_C  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005634  C:nucleus  
Pfam View protein in Pfam  
PF14474  RTC4  
Amino Acid Sequences MSLSNKRMGSLSNSSFNSDDFDDEKSYHNKRKNTFILPPQNNLTKSSRIIQPEPNNWNITSKVRKRKLLVSSGPTPRDSLNTPTVIQPKKRKSKNAVVIHDLKTNEANIPLESGLLTSVSDEVASFFDKVHESPKKAQLDMYVKEKRERDKLKIEDSIDNTITIHDSDTDSDENTTKTIKKFLNSKSSNDTKNQSSDLSLDELIHNKAKLKELVNKCAKTKSYIRPDIIKSLDDIGRIVETYLETVIDILNGVKASYFYTQAKKLQQSSKLLTIKDAEIASLPKETYYGYIGAVRGFHIGKVIESNETLSKLINEKIRYNKVIQFWGVSNFIQYVLVPEVIANLTMKYSKINDIEEAYDEMEETNEYGLYITNAYPLKMNNDDEDDDDNENVDDTDNDIETVEIPDSHPVENTKISKSSKSSKPNSSKYSSTRKLISISDLEVSPPSSPDNLFD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.42
2 0.41
3 0.39
4 0.36
5 0.28
6 0.26
7 0.2
8 0.22
9 0.21
10 0.21
11 0.26
12 0.31
13 0.38
14 0.44
15 0.5
16 0.55
17 0.57
18 0.67
19 0.7
20 0.7
21 0.71
22 0.73
23 0.76
24 0.73
25 0.73
26 0.69
27 0.68
28 0.61
29 0.57
30 0.51
31 0.45
32 0.43
33 0.43
34 0.43
35 0.42
36 0.46
37 0.5
38 0.55
39 0.59
40 0.62
41 0.61
42 0.58
43 0.52
44 0.5
45 0.44
46 0.43
47 0.45
48 0.49
49 0.55
50 0.6
51 0.66
52 0.68
53 0.73
54 0.74
55 0.73
56 0.72
57 0.68
58 0.69
59 0.7
60 0.69
61 0.6
62 0.53
63 0.44
64 0.4
65 0.35
66 0.32
67 0.3
68 0.29
69 0.29
70 0.34
71 0.41
72 0.43
73 0.49
74 0.53
75 0.58
76 0.66
77 0.73
78 0.77
79 0.77
80 0.82
81 0.84
82 0.84
83 0.8
84 0.77
85 0.76
86 0.69
87 0.64
88 0.53
89 0.44
90 0.35
91 0.3
92 0.24
93 0.19
94 0.17
95 0.13
96 0.14
97 0.12
98 0.11
99 0.1
100 0.09
101 0.07
102 0.06
103 0.06
104 0.05
105 0.05
106 0.05
107 0.05
108 0.05
109 0.05
110 0.06
111 0.08
112 0.07
113 0.07
114 0.09
115 0.1
116 0.11
117 0.19
118 0.24
119 0.27
120 0.33
121 0.42
122 0.44
123 0.43
124 0.44
125 0.43
126 0.44
127 0.42
128 0.45
129 0.43
130 0.41
131 0.46
132 0.49
133 0.47
134 0.5
135 0.53
136 0.51
137 0.55
138 0.59
139 0.59
140 0.6
141 0.58
142 0.53
143 0.5
144 0.48
145 0.38
146 0.32
147 0.27
148 0.21
149 0.19
150 0.13
151 0.1
152 0.07
153 0.07
154 0.08
155 0.1
156 0.1
157 0.1
158 0.11
159 0.11
160 0.11
161 0.11
162 0.12
163 0.13
164 0.14
165 0.2
166 0.21
167 0.24
168 0.32
169 0.37
170 0.46
171 0.46
172 0.48
173 0.49
174 0.53
175 0.53
176 0.48
177 0.46
178 0.37
179 0.37
180 0.35
181 0.28
182 0.23
183 0.2
184 0.18
185 0.16
186 0.13
187 0.11
188 0.11
189 0.12
190 0.13
191 0.13
192 0.12
193 0.13
194 0.15
195 0.17
196 0.2
197 0.21
198 0.29
199 0.32
200 0.42
201 0.47
202 0.47
203 0.46
204 0.47
205 0.45
206 0.4
207 0.44
208 0.43
209 0.45
210 0.49
211 0.49
212 0.5
213 0.51
214 0.51
215 0.45
216 0.36
217 0.27
218 0.24
219 0.23
220 0.17
221 0.16
222 0.11
223 0.09
224 0.09
225 0.08
226 0.05
227 0.04
228 0.05
229 0.05
230 0.04
231 0.04
232 0.04
233 0.04
234 0.03
235 0.04
236 0.03
237 0.04
238 0.04
239 0.04
240 0.04
241 0.04
242 0.06
243 0.07
244 0.1
245 0.12
246 0.16
247 0.19
248 0.24
249 0.29
250 0.32
251 0.37
252 0.4
253 0.43
254 0.45
255 0.45
256 0.49
257 0.48
258 0.43
259 0.39
260 0.35
261 0.29
262 0.27
263 0.23
264 0.14
265 0.12
266 0.13
267 0.12
268 0.11
269 0.11
270 0.08
271 0.08
272 0.08
273 0.08
274 0.09
275 0.09
276 0.08
277 0.11
278 0.11
279 0.11
280 0.11
281 0.11
282 0.11
283 0.11
284 0.1
285 0.1
286 0.1
287 0.09
288 0.12
289 0.12
290 0.11
291 0.11
292 0.13
293 0.12
294 0.13
295 0.13
296 0.11
297 0.12
298 0.13
299 0.17
300 0.2
301 0.22
302 0.26
303 0.34
304 0.4
305 0.42
306 0.43
307 0.45
308 0.43
309 0.44
310 0.39
311 0.33
312 0.28
313 0.29
314 0.27
315 0.22
316 0.19
317 0.15
318 0.15
319 0.12
320 0.11
321 0.1
322 0.1
323 0.1
324 0.09
325 0.08
326 0.09
327 0.09
328 0.1
329 0.07
330 0.06
331 0.07
332 0.08
333 0.08
334 0.09
335 0.12
336 0.16
337 0.19
338 0.2
339 0.22
340 0.23
341 0.24
342 0.24
343 0.23
344 0.18
345 0.15
346 0.13
347 0.11
348 0.1
349 0.08
350 0.07
351 0.06
352 0.05
353 0.05
354 0.05
355 0.06
356 0.06
357 0.08
358 0.07
359 0.12
360 0.12
361 0.13
362 0.14
363 0.15
364 0.2
365 0.23
366 0.25
367 0.22
368 0.26
369 0.27
370 0.28
371 0.3
372 0.28
373 0.25
374 0.23
375 0.21
376 0.16
377 0.15
378 0.13
379 0.1
380 0.08
381 0.08
382 0.1
383 0.09
384 0.09
385 0.09
386 0.09
387 0.09
388 0.11
389 0.1
390 0.08
391 0.09
392 0.14
393 0.15
394 0.16
395 0.17
396 0.18
397 0.21
398 0.28
399 0.3
400 0.3
401 0.35
402 0.38
403 0.42
404 0.46
405 0.52
406 0.55
407 0.62
408 0.66
409 0.7
410 0.77
411 0.81
412 0.82
413 0.78
414 0.77
415 0.75
416 0.78
417 0.74
418 0.7
419 0.65
420 0.61
421 0.58
422 0.53
423 0.5
424 0.43
425 0.38
426 0.35
427 0.3
428 0.28
429 0.25
430 0.24
431 0.19
432 0.16
433 0.16
434 0.16